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大生物学的“组学” 之谜.doc

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大生物学的“组学” 之谜.doc

大生物学的“组学”之谜李升伟/编译●自从有了人类基因组计划(HGP)以来,现在已有数以千计的“组”计划。《自然》杂志对其中五个引人注目的新组学进行了评述。或许,它们代表了科学的一种新境界。目前生物学中最时髦的科学,毫无疑问当数组学了。去年,《纽约时报》和《华尔街时报》对以“组”字结尾的、不断扩增的相关科学名词进行了检索,发现已经多达数千个了。一位科学家开发的一种简易的组学生成器,可以随机地在一张清单的生物学术语后面加上“组学”这个后缀,可以生成浅显易懂的主题词用于科学论文的写作和发表(例如,“对抑菌剂组进行测序”提示对进化和环境的关系问题进行新的研究和发现)。加州大学戴维斯分校的一位微生物学家乔纳森施耐德(MichaelSnyder)将他的基因组、转录本组、蛋白质组和代谢组数据整合在一起,发表了他的个人整合组(尽管他称其为一项“综合性个人组学表达谱”,其他人则称之为自恋组)。基因组学表达谱提示施耐德有一种糖尿病的风险变异本:在研究期间他被诊断出了这种疾病,并有两种病毒感染,这反映在一些与炎症相关联的基因的活性增加;各种组数据还提示一些以前与糖尿病或感染不相关的通路的改变。施耐德说:“如果你只分析了转录本组或蛋白质组数据,你就只了解了故事的一部分。”格斯坦认为对数据集进行整合是前进的必由之路。他说:“未来将属于将这些东西放在一个网络里以理解个人基因组。”但是,他对“整合组”却不以为然。他解释说:“什么是一个整合组?所有整合的总体?我不这么认为。整合是一个动词,其他组的大多数都是名词的集合呀。”“组”词的扩增反映了科学的发展步伐。麦克格雷对构成有用的“组”词提出了一些指导规则:有意义、听起来令人愉快并且易于为受过教育的读者所理解。但是,要想让许多科学家都关心这些规则,是不太可能的。语言一般的变化是很慢的,但是后缀“组”和“组学”的快速传播“在过去十年中达到了正常情况下五十年的规模,它反映出大量的人力财力物力投入到了这个领域中。”[资料来源:Nature][责任编辑:则鸣]

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