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儿童良性癫痫伴中央颞区棘波的临床研究及血样DNA的质量控制

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儿童良性癫痫伴中央颞区棘波的临床研究及血样DNA的质量控制

分类号R725.1密级单位代码10422学号201013242⑧∥羹办呈硕士学位论文论文题目儿童良性癫痫伴中央颞区棘波的临床研究及血样DNA的质量控制THECLINICALRESEARCHANDDNAQUALITYCONTROLOFTHEBLOODSAMPLEONTHEBENIGNCHILDHOODEPILEPSYWITHCENTROTEMPORALSPIKES作者姓名学院名称专业名称指导教师合作导师李婧医学院儿科学王纪文教授2013年5月10日原创性声明本人郑重声明所呈交的学位论文,是本人在导师的指导下,独立进行研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的科研成果。对本文的研究作出重要贡献的个人和集体,均已在文中以明确方式标明。本声明的法律责任由本人承担。论文作者签名冱蟠日期塑兰£关于学位论文使用授权的声明本人完全了解山东大学有关保留、使用学位论文的规定,同意学校保留或向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅;本人授权山东大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文和汇编本学位论文。保密论文在解密后应遵守此规定论文作者签名蕉查茎导师签名銎£兰羹ET期趁垦垒旦目录中文摘要..1英文摘要..3符号说明..6第一部分儿童良性癫痫伴中央颞区棘波不典型表现的临床研究前言7再U百,材料与方法8结果9讨论..14参考文献.17第二部分儿童良性癫痫伴中央颞区棘波血样蜊A的质量控制前言..19日U舌L了材料与方法..2L结果..29讨论..30附图..35参考文献.36第三部分儿童良性癫痫伴中央颞区棘波的研究进展综述..38参考文献.47致谢。.51攻读学位期问发表的论文..52CATALOGUECHINESEABSTRACT................................................1ENGLISHABSTRACT..................................................3SIGNDEMONSTRATION...............................................;PARTITHECLINICALSTUDYONTHEATYPICALPRESENTATIONOFBENIGNCHILDHOODEPILEPSYWITHCENTROTEMPORALSPIKESINTRODUCTION....................................................7MATERIALSANDMETHODS............................................8RESULTS.........................................................9DISCUSSION.......................................14REFERENCES17PARTIITHEDNAQUALITYCONTROLOFTHEBLOODSAMPLEONTHEBENIGNCHILDHOODEPILEPSYWITHCENTROTEMPORALSPIKESINTRODUCTION........19MATERIALSANDMETHODS.....................I.......................11RESULTS....29DISCUSSION.30FIGURES35REFERENCES.36PARTLIIRMERESEARCHPROGRESSOFBENIGNCHILDHOODEPILEPSYWITHCENTROTEMPORALSPIKESREVIEW........38REFERENCES......47ACKNOWLEDGEMENTS.50TLLESIS52山东大学硕士学位论文第一部分儿童良性癫痫伴中央颞区棘波不典型表现的临床研究研究生李婧导师王纪文教授中文摘要目的探讨儿童良性癫痫伴中央颞区棘波BECT的不典型临床表现、脑电图特点、治疗及预后。方法收集2006年至2012年在齐鲁医院就诊的122例BECT患儿,对病程中出现其不典型症状的11例BECT患儿进行动态脑电图或视频脑电图监测,并对其临床表现、神经心理学损伤及对抗癫痫药物治疗的反应进行分析和随访。结果11例患儿病程中均出现发作形式的改变或脑电图恶化。2例丙戊酸钠治疗有效,4例丙戊酸钠加氯硝西泮治疗有效,3例托吡酯治疗有效。2例经多种抗癫痫药物治疗后,仍存在睡眠期脑电图癫痫性电持续状态。结论BECT存在不典型表现,病程中可出现不同的发作形式,同时伴有脑电图的恶化及认知行为等方面的缺陷,发作相对难以控制。关键词良性癫痫;不典型表现;儿童山东大学硕士学位论文第二部分儿童良性癫痫伴中央颞区棘波血样DNA的质量控制研究生李婧导师王纪文教授中文摘要目的探讨儿童良性癫痫伴中央颞区棘波BECT的遗传学因素,对BECT全基因组关联研究中的部分血样DNA进行初步质控。方法于山东大学齐鲁医院儿科门诊,采集31例BECT患儿的血样。其中男性17例,占54.84%;女性14例,占45.16%;年龄19岁,将经过处理的DNA样品与高通量的单核苷酸多态性SNP分型芯片进行杂交并通过特定的扫描仪扫描芯片信息;在制备MSA3以及完成碱变性一基因组全扩增的基础上,利用微量分光光度仪NANODROP和荧光染色PICOGREEN两种方法对DNA的浓度进行质量控制,并对SNP分型样本和SNP位点的检出率CALLRATE值进行检测。得出的最终数据由ILLUMINA基因工作室进行分析。结果1齐鲁医院31例BECT患儿的血样DNA中,PICOGREEN染色法得到的DNA浓度最大值为153.3CONCNG/UL,最小值为56CONCNG/UL】,平均值为105.4290323NG/UL;NANODROP检测中最大值为614.45NG/UL,最小值为70.67CONCNG/UL,平均值为134.7929032NG/UL。2SNP位点的CALLRATE值最高为0.9977756,最低为0.9875269,平均值为0.99567989,DNA检出率较高;结论利用NANODROP和PICOGREEN法对血样DNA进行质控,得到高质量的血样DNA,以及SNP位点的高检出率为随后的关联分析及第二阶段更大样本的基因分型和关联分析奠定了基础。关键词BECT;遗传学;质量控制1PARTI山东大学硕士学位论文THECLINICALSTUDYONTHEATYPICALPRESENTATIONOFBENIGNCHILDHOODEPILEPSYWITHCENTROTEMPORALSPIKESPOSTGRADUATELIJINGSUPERVISORPROF.WANGJIWENABSTRACTOBJECTIVETOEXPLORETHEATYPICALCLINICALPRESENTATION,ELECTROENCEPHALOGRAPHYEEGCHARACTERISTICS,TREATMENTANDPROGNOSISOFBENIGNCHILDHOODEPILEPSY晰TILCENTROTEMPORALSPIKESBECT.METHODSWECOLLECTED122CASESOFBECTCHILDRENINQILUHOSPITALFROM2006TO2012,ANDAMBULATORYEEGORVIDEOEEGMONITORINGWASPERFORMEDFOR11CASESBECTCHILDRENWHOHADSOMEATYPICALSYMPTOMS.THESEIZURESEMEIOLOGY,NEUROPSYCHOLOGICALIMPAIRMENTSANDRESPONSETOANTIEPILEPTICDRUGSWEREANALYZEDANDFOLLOWEDUP.RESULTSALL11CASESHADTYPECHANGESOFSEIZUREOREEGDETERIORATION.SODIUMVALPROATEWASONLYEFFECTIVEIN2CASES.VALPROATECOMBINED、析ⅡLCLONAZEPAMWASEFFECTIVEIN4CASES.TOPIRAMATEWEREEFFECTIVEIN3CASES.THEREWASSTILLELECTRICALSTATUSEPILEPTICUSDURINGSLEEPAFTERVARIOUSANTIEPILEPTICDRUGTHERAPYIN2CASES.CONCLUSIONBECTHADATYPICALPRESENTATIONSANDSOMEDIFFERENTSEIZURESEMEIOLOGY.THECLINICALPRESENTATIONSWEREASSOCIATEDWITHEEGDETERIORATIONANDCOGNITIVEDEFICITS.THESEIZURESWERERELATIVELYDIFFICULTTOCONTR01.KEYWORDSBENIGNEPILEPSY;ATYPICALPRESENTATIONS;CHILDRENPARTⅡ山东大学硕士学位论文THEDNAQUALITYCONTROLOFTHEBLOODSAMPLEONTHEBENIGNOBIECTIVECHILDHOODEPILEPSYWITHCENTROTEMPORALSPIKESPOSTGRADUATELIJINGSUPERVISORPROF.WANGJIWENABSTRACTTOEXPLOREGENETICFACTORSOFBENIGNCHILDHOODEPILEPSYWITHCENTROTEMPORALSPIKESBECT,ANDCARRYOUTTHEPRELIMINARYDNAQUALITYCONTROLFORSOMEBLOODSAMPLEOFBECTGENOMEWIDEASSOCIATIONSTUDIES.METHODSWECOLLECTEDSAMPLESFROM31CASESOFBECTCHILDRENINQILUHOSPITALOFSHANDONGUNIVERSITY,17CASESOFMEN,WHOACCOUNTEDFOR54.84%;WOMEN14CASES,ACCOUNTINGFOR45.16%;AGED1TO9,CARRIEDOUTHYBRIDIZATIONBETWEENTHEPROCESSEDDNASAMPLESANDHIGHFLUXSINGLENUCLEOTIDEPOLYMORPHISMSSNPSPARTINGCHIPSANDCOMPLETEDINFORMATIONACQUISITIONOFTHESNPCHIPSTHROUGHASPECIFICSCANNER.WEPROCEEDQUALITYCONTROLWITHTHESPECTROPHOTOMETERINSTRUMENTNANODROPANDFLUORESCENCESTAININGPICOGREENTWOMETHODSFORTHECONCENTRATIONOFDNAONTHEBASISOFFINISHINGTHEPREPARATIONOFMSA3ANDALKALIDENATURATION.WHOLEGENOMEAMPLIFICATION,ANDDETECTEDCLASSIFICATIONSAMPLESANDTHECALLRATEVALUESOFSNPSLOCI.THEFINALDATAWASANALYZEDBYILLUMINAGENESTUDIO。RESULTS1IN31CASESBLOODSAMPLEOFQILUHOSPITALBECTCHILDREN,DNAPICOGREENDYEDETECTION,THEMAXIMUMOFDNACONCENTRATIONIS153.3CONCNG/UL,THEMINIMUMIS56CONC119/UL,THEAVERAGEIS105.4290323NG/UL;NANODROPDETECTION,THEMAXIMUMVALUEIS614.45NG/UL,THEMINIMUMVALUEIS70.67CONCNG/UL,THEAVERAGEVALUEIS134.7929032NG/UL.2THEHIGHESTCALLRATEVALUEOFSNPLOCIINDNAIS0.9977756,THELOWESTIS0.9875269,THEAVERAGEVALUEISO.99567989,DNADETECTIONRATEISHIGHER.CONCLUSIONTHEDNAQUALITYCONTROLOFBLOODSAMPLEWITHNANODROPANDPICOGREENMETHOD,THEHIGHQUALITYDNASAMPLE,ANDTHEHIGHDETECTIONRATEOFSNP4山东大学硕士学位论文LOCILAIDAFOUNDATIONFORSUBSEQUEMANALYSISANDGENOTYPINGANDCORRELATIONANALYSISINSECONDPHASEFORMORESAMPLE.KEYWORDSBECT;GENETICS;QUALITYCONTROL5

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