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生物医学工程进展试题库1.试述组织光透明技术在生物医学成像的作用及应用前景？作用：生物组织属于浑浊介质，具有高散射和低吸收的光学特性，这种高散射特性限制光在组织的穿透深度和成像的对比度，使得很多光学成像技术只能用于浅表组织，制约了光学手段检测诊断及治疗技术的发展和应用。生物组织光透明技术的作用就是通过向生物组织中引入高渗透、高折射、生物相容的化学试剂，来改变组织的光学特性，以此来暂时降低光在组织中的散射、提高光在组织中的穿透深度，从而提高光学成像的成像深度，推动成像技术的发展和新方法的产生。前景：1、应用骨组织使得骨组织变得光透明，进而对骨组织下的组织成像，避免手术开骨窗照成的伤害，如应用于颅骨，用得当的成像方法获得皮层神经亚细胞结构与微血管信息；2、解决皮肤角质层的天然阻挡作用，促进透皮给药系统的研究和应用；3、皮肤光透明剂的发展推动光学相干断层成像技术的发展；4、光透明剂使得光辐射能在生物组织达到一定深度之后，可以极大地推动光学显微成像、光学手段检测诊断及治疗技术的发展和应用。推进无损光学成像技术在临床上的发展。2. 请结合图示，描述如何通过单分子定位的方法，实现超分辨光学显微成像。要通过单分子定位实现超分辨光学显微成像，首先需要利用光激活/光切换的荧光探针标记感兴趣的研究结构。成像过程中，利用激光对高标记密度的分子进行随机稀疏点亮，进而进行单分子荧光成像和漂白；不断重复这种分子被漂白、新的稀疏单分子不断被点亮、荧光成像的过程，将原本空间上密集的荧光分子在时间上进行充分的分离。随后，利用单分子定位算法对采集到的单分子荧光图像进行定位，可以准确得到分子发光中心位置；最后，利用这些分子位置信息，结合图像重建算法，获得最终的超分辨图像。超分辨图像质量的关键在于二点：一是找到有效的方法控制发光分子的密度，使同一时间内只有稀疏的荧光分子能够发光；二是高精度地确定每个荧光分子的位置。以分辨两个相距 20nm 的点光源为例。如下图 7, 当两个点光源相距 20nm 时，由于衍射极限（一个理想点物经光学系统成像，由于衍射的限制，不可能得到理想像点，而是得到一个艾里斑，这样每个物点的像就是一个弥散斑，两个弥散斑靠近后就不好区分，这样就限制了系统的分辨率，这个斑越大，分辨率越低）的限制，使得每一个点光源经过显微系统所成的像为一个光斑。为了简化起见，假定光斑为一个半径 300nm 的圆斑（实际情况下，光斑不是均匀分布的，而是满足方程(1)）。则在荧光显微镜下，两个点光源所成的像为图 7（a）所示。在这个时候，两个点光源 r1，r2 由于半径都在 300nm，是无法区分的，几乎重叠在一起。所以分辨率为 300nm。但是如果第一时刻，只有 r1 光源发光，如图 7（b）所示，这时，r1 是可以分辨的，我们可以对 r1 这个光源做中心定位，算出 r1 实际的位置如图 7（C）。此时相当于排除了衍射极限的限制，得到了点光源 r1 的较精确的位置，如图 7（d）。这时，设法使 r1 不再发光（进入暗态），并使得 r2 光源发光，其发光所成的像为一个圆斑（与图 7（b）形状相同，位置偏移了约 20nm），这时点光源 r2 是可分辨的。我们再用同样的方法可以得到点光源 r2 的位置，从而得到了以上两个点的位置，如图 7（f）。这时两个点就可以分辨出来。3.简述组织工程的原理，并举例说明在组织工程中运用数字化制造技术的优势。 组织工程基本原理和方法：是将体外培养扩增的正常组织细胞吸附于一种具有优良细胞相容性并可被机体降解吸收的生物材料上形成复合物，然后将细胞生物材料复合物植入人体组织、器官的病损部位，在作为细胞生长支架的生物材料逐渐被机体降解吸收的同时，细胞不断增殖、分化，形成新的并且其形态、功能方面与相应组织、器官一致的组织，从而达到修复创伤和重建功能的目的。组织工程主要包括两方面内容：（1）构建具有良好组织相容性的生物学支架， 以提供移植细胞定向生长和器官修复的微环境。（2） 将细胞在体外扩增并使其在新生组织中进行定向分化与生长。例如快速原型（RP）技术：与传统工艺相比，快速原型技术可以在较短的时间内完成，过程中无需人工参与，患者也可以在几个小时后看到相应的修复体的形态，节省了时间，提高了效率。另外，工程师利用CAD软件可以很快设计一个产品，而RP设备的快速性允许设计师在很短时间内多次验证并修改其设计，这样就在设计过程中节约了时间和金钱从而实现高通量的“面向市场设计”。再者，运用RP技术，设计师可以根据特定病人的CT或MRI数据而非标准的解剖学几何数据来设计并制作种植体，减少出错空间的同时，为患者提供了适合他本身解剖结构的更好的手术，也为外科医生缩短手术时间给予了有力的保证。总的来说RP技术提高了诊断和手术水平，提高了效率，节省了金钱和时间。组织工程中运用数字化技术的优势包括：快速、高效、高通量、更精密、低成本、可以为不同患者定制专属治疗等。4.光学分子成像的特点是什么？可用于活体小动物光学成像的技术主要有哪几种？主流的分子成像技术有哪些？结合自己的研究方向，描述分子成像在本领域的应用及其发展前景。光学成像具有分辨率高、灵敏度高、价格低等优点,特别是近红外线(near infrared, NIR)荧光成像分辨率12 mm,可以穿透厚8 cm的组织,荧光成像信号强,可直接发出明亮的信号。此外,光学对比剂发展迅速,特别是随着纳米技术的深入,基于纳米颗粒、纳米壳和量子点研发出各种生物特异的分子探针。这些都使得光学分子影像学在生物学、医学和药学领域中有广泛的应用。活体小动物体内光学成像主要采用生物发光与荧光两种技术。生物发光是用荧光素酶(luciferase)基因标记细胞或DNA，而荧光技术则采用荧光报告基团(GFP、RFP、Cyt 及dyes 等)进行标记。利用灵敏的光学检测仪器，可以直接检测活体生物体内的细胞活动和基因行为。分子影像技术主要有磁共振成像(magnetic resonance imaging, MRI)、核医学成像和光学成像三种成像方法。近年来,光学分子影像学被用来研究在体情况下胚胎发育过程中的细胞和分子变化,通过揭示这些变化,可以直观地看到胚胎在经历细胞迁移和细胞分化过程中的细胞分子层面的变化。一些自发荧光蛋白已经被用作报告基因来跟踪发育过程中的表达类型。一个荧光蛋白家族可以被激发发射出各种不同波长的光从而可以实现多标记。另外荧光染料和量子点等也被用来在这些研究中提供对比。转基因检测可利用分子成像技术开发合适的新探针,对转基因动物体内的转基因表达或内源性基因的活性和功能进行检测,可以对启动子或增强子的组织特异性及可诱导性进行评价5. 请论述纳米光学探针在活体动物成像中的应用纳米光学探针中的如随着小动物成像技术的发展，成像探针种类越来越多，功能越来越强大。其中的量子点荧光标记是纳米技术和体内荧光成像技术结合的一种新技术，将直径只有15纳米的荧光粒子附着到DNA的特殊部分，随后分析荧光信号的强度以及其它特性。这些粒子称为量子点，具有独特的光电性质，使其比生物医学研究中常用的传统荧光标签更易检测到。NIST 的研究小组证明量子点释放的信号强度比另外两种传统荧光标签强2到11倍，暴露于光下时稳定性也更好。除了能够对活细胞进行长时间动态荧光观测与成像，对细胞间、细胞内及其细胞器间的各种相互作用的原位实时动态示踪外，还可以标记在其他需要研究的物质上，在长时间生命活动监测及活体示踪上有独到的应用优势。与传统的荧光标记方法比较，该方法在稳定性、灵敏度、应用范围等方面都有重要突破。6. 请举例论述荧光蛋白标记技术在神经科学中应用的原理。荧光蛋白的出现使得进行非侵入性的活体细胞成像成为了可能。使用这种荧光蛋白标志物，我们可以研究目的基因的表达情况，蛋白质运输情况以及各种细胞内动态的生物化学信号通路。使用经过遗传修饰的小分子有机荧光标志物构建的混合系统，我们还可以对蛋白质的寿命进行研究，如果再结合电镜技术和快速光淬灭技术（rapidphotoinactivation）还可以对蛋白质的定位情况进行研究。荧光蛋白标记如GFP，在神经标记中的运用原理。GFP是源于水母的生物发光蛋白，其野生型GFP基因由3个外显子组成。GFP在紫外光或蓝光激发下发出绿色荧光的最大吸收峰在395纳米，另一小的吸收峰为470nm，其荧光发射峰为509nm。利用DNA重组技术，将GFP基因嵌入质粒，并以病毒为载体，得到GFP基因重组病毒，然后将带有GFP基因的病毒注入动物脑内的某一区域，使病毒增殖，GFP基因随之到达感染神经元的胞体和突起，并表达出附着于细胞膜的GFP，再经固定和切片后便可在荧光显微镜、激光共聚焦显微镜下观察，从而显示神经元完整轮廓的目的。7. 三维超声有哪些成像方式？每种方式的主要优缺点是什么？三维超声成像分为静态三维成像和动态三维成像， 动态三维成像在静态超声成像的基础上加上时间因素。成像的基本原理主要有立体几何构成法、表现轮廓提取法和体元模型法。立体几何构成法是将人体脏器假设为多个不同形态的几何组合，需要大量的几何原型，因而对于描述人体复杂结构的三维形态并不完全适合，现已很少应用。表面轮廓提取法是将三维超声空间中一系列坐标点相互连接，形成若干简单直线来描述脏器的轮廓。体元模型法是目前最为理想的动态三维超声成像技术。在体元模型法中，三维物体被划分成依次排列的小立方体，一个小立方体就是一个体元，一定数目的体元按相应的空间位置排列即可构成三维立体图像，重建得到体元的值就可得到结构的所有组织信息。三维超声成像方法有散焦镜法、计算机辅助成像和实时超声束跟踪技术。(一)散焦镜方法也称厚层三维图像，方法简单，费用低。装置仅需在凸阵或线阵探头上套上一个散焦镜。用此方法可以对胎儿进行实时观察，然而胎体紧贴宫壁时图像就会重叠，使胎儿图像辨别困难。(二)计算机辅助成像 是目前首选的三维成像方法，成像处理过程包括：获取三维扫查数据；建立三维容积数据库；应用三维数据进行三维图像重建。(三)实时超声束跟踪技术 是三维超声的最新技术，其过程类似于三维计算机技术但可以立即成像。仅仅需要定下感兴趣部位的容积范围就可以住扫查过程中实时显示出三维图像，可以提供连续的宫内胎儿的实时三维图像，例如可以看到胎儿哈欠样张口动作等。 基本原理 三维超声成像分为静态三维成像(staticthree2 dimensionalimaging)和动态三维成像(dynamicthree2dimensionalimaging),动态三维成像由于参考时间因素(心动周期),用整体显像法重建感兴趣区域准实时活动的三维图像,则又称之为四维超声心动图。静态与动态三维超声成像重建的原理基本相同。 111 立体几何构成法 该法将人体脏器假设为多 个不同形态的几何体组合,需要大量的几何原型,因 而对于描述人体复杂结构的三维形态并不完全适合,现已很少应用。112 表面轮廓提取法 是将三维超声空间中一系列坐标点相互连接,形成若干简单直线来描述脏器的轮廓的方法,曾用于心脏表面的三维重建。该技术所需计算机内存少,运动速度较快。缺点是:(1)需人工对脏器的组织结构勾边,既费时又受操作者主观因素的影响;(2)只能重建比较大的心脏结构(如左、右心腔),不能对心瓣膜和腱索等细小结构进行三维重建;(3)不具灰阶特征,难以显示解剖细节,故未被临床采用。113 体元模型法(votelmode) 是目前最为理想的动态三维超声成像技术,可对结构的所有组织信息进行重建。在体元模型法中,三维物体被划分成依次排列的小立方体,一个小立方体就是一个体元。任一体元(v)可用中心坐标(x,y,z)确定,这里x,y,z分别被假定为区间中的整数。二维图像中最小单元为像素,三维图像中则为体素或体元,体元素可以认为是像素在三维空间的延伸。与平面概念不同,体元素空间模型表示的是容积概念,与每个体元相对应的数V(v)叫做“体元值”或“体元容积”,一定数目的体元按相应的空间位置排列即可构成三维立体图像。描述一个复杂的人体结构所需体元数目很大,而体元数目的多少(即体元素空间分辨率)决定模型的复杂程度。8.结合所熟悉的研究方向，谈谈你对于生物医学工程专业的认识与了解。生物材料与组织工程是学校重点建设的新型交叉学科，以提高人类生活质量为目标。学科组与基础医学、临床医学等学科的研究人员和专家医生紧密合作，发挥理、工、生、医相结合的优势，开展高分子生物材料、先进药物释放系统、纳米材料、组织工程与再生医学、生物分子工程领域的基础和应用研究，培养跨学科高水平研究和开发人才。学科组特别重视在物理、化学、材料、生物、医学、工程交叉领域的原始创新性基础和应用研究，重视有产业化前景和社会价值的高技术开发。 包括生物可吸收内固定材料、防术后组织粘连材料、聚电解质复合物、生物活性组织工程支架、高分子水凝胶、生物纤维，以及具有特殊功能的不可吸收高分子生物材料，包括整形弥补材料、高透氧隐型眼镜材料。9. 请简述PET成像原理和过程？在这个过程中，如何从获得的信号中去除散射事件和随机事件？PET 其全称是：正电子发射型计算机断层扫描显像仪（positron emission tomography ，简称PET）由探头、数据处理系统、图像显示及检查床组成。PET 使用正电子示踪剂，核素衰变过程中正电子从原子核内放出后很快与自由电子碰撞湮灭, 转化成一对方向相反、能量为511 keV 的 光子。在这光子飞行方向上对置一对探测器，便可以几乎在同时接受到这两个光子， 并可推定正电子发射点在两探头间连线上，通过环绕360排列的多组配对探头，得到探头对连线上的一维信息，将信号向中心点反投射并加以适当的数学处理，便可形成断层示踪剂分布图像。凡代谢率高的组织或病变， 在PET 上呈明确的高代谢亮信号，凡代谢率低的组织或病变在PET 上呈低代谢暗信号。见13题如何去除散射事件和随机事件。10.试简答神经成像的主要仪器及其原理神经成像(Neuroimaging)泛指能够直接或间接对神经系统（主要是脑）的功能，结构，和药理学特性进行成像的技术。根据成像的模式，神经成像可以分为结构成像，用来展现脑的结构，从而辅助对一些脑疾病（例如脑肿瘤或脑外伤）的诊断。功能成像，用来展现脑在进行某种任务（包括感觉，运动，认知等功能）时的代谢活动。功能成像主要用于神经科学和心理学研究，不过近来正逐步成为医学神经科诊断的新途径。计算机断面成像:计算机断面成像（CT）的基本原理是利用不同方向上的X射线。计算机用来对这些来自不同方向的数据进行整合，来重建断面内的图像。这类图像内的数值反应的是物质对X射线的通透率。CT技术主要用来对脑进行快速成像，来观察外伤引起的组织水肿和脑室扩张。扩散光学成像:扩散光学成像（Diffusion Optical Imaging, DOI）是一种利用近红外光的神经成像方法。这种方法主要基于血红蛋白对近红外光的吸收。该方法可通过测量吸收光谱来计算血液中的氧含量。该技术可以用来测量脑组织对外部刺激或在执行某种功能时的代谢变化，称为事件相关光学信号（Event-related Optical Signal，EROS）。EROS的长处在于它较高的空间（毫米量级）和时间（毫秒量级）分辨率，缺点在于它无法观测深部脑组织的活动。核磁共振成像:核磁共振成像（MRI）的基本原理是对原子核自旋的射频激发以及对随后弛豫过程中的射频信号的采集和处理。MRI设备有一个大磁体产生的较大静磁场，使得样本原子核（主要是氢原子核）磁矩排列一致。设备的射频线圈在Larmor频率激发这些原子核，使它们偏离这个方向，并随后发生弛豫现象。接受线圈可以拾取弛豫过程中产生的电磁信号。设备的梯度磁场用来产生随空间变化的磁场强度，从而实现空间编码。通过二维傅立叶变换等方法，计算机可重建样本的图像。MRI图像中的数值的含义（即对比度）由于MRI激发和采集模式的不同而不同。常用的对比度有T1对比度，T2对比度，T2*对比度等。不同对比度的图像有不同的生理学或解剖学含义。MRI可以产生脑的高清晰度结构或功能图像。MRI结构图像可用于神经科对于脑肿瘤，脑血管疾病（例如中风）等的诊断。功能核磁共振成像（Functional Magnetic Resonance Imaging, fMRI）的基本原理是氧化血红蛋白和去氧血红蛋白在磁性质上的差别以及伴随脑神经活动的脑血流变化。fMRI可以用来展现各种感觉，运动，和认知活动过程中的激活脑区。目前fMRI的空间分辨率多在2-3毫米左右。脑磁图:脑磁图（Magnetoencephalography，MEG）的基本原理是脑的神经活动时产生的电信号所产生的磁信号。超导量子干涉设备（SQUID)可以用来测量这种微弱的磁信号。与fMRI不同，MEG直接测量神经活动。fMRI测量的是伴随神经活动的代谢变化。而且磁信号基本不受周边组织的影响。正电子发射成像:正电子发射成像（Position Emission Tomography, PET）使用人工引入的放射性代谢物质。这种放射性代谢物质被注射入血管。PET设备检测改物质在脑内衰变时产生的正电子，来产生脑功能图像。常用的放射性标注物质包括含氧-15的水和含氟-18的氯代脱氧葡萄糖。单光子发射计算机断面成像:单光子发射计算机断面成像（Single photon emission computer tomography, SPECT）的基本原理与PET相似，但是改技术检测的是放射性物质衰变时产生的伽玛射线。与MRI相比，PET和SPECT的共同缺点是较低的空间分辨率，以及对放射性物质的使用。他们的主要优点在于使用不同放射性标注物质的灵活性。11生物材料区别于其它材料的一个显著特征是什么？简述生物材料与组织工程、再生医学的联系与区别。生物材料用于人体组织和器官的诊断、修复或增进其功能的一类高技术材料，即用于取代、修复活组织的天然或人造材料，其作用药物不可替代。生物材料能执行、增进或替换因疾病、损伤等失去的某种功能，而不能恢复缺陷部位。生物医用材料最基本的要求是它必须与生物系统直接结合,生物医用材料都必须具备生物学性能,即生物相容性, 尽量将受体对植入器械的异物反应降到最低，这是生物医用材料区别于其它功能材料的最重要的特征，并且要求这种材料不会因与生物系统直接结合而降低其效能与使用寿命。再生医学是利用人类的自然治愈能力，使受到巨大创伤的机体组织或器官获得自己再生能力为目的的医学，主要包括干细胞与克隆技术、组织工程、组织器官代用品、异种器官移植。新的生物材料具有生物活性和降解两种性能，在植入体内后可促进机体的再生能力，从而达到治疗效果。干细胞具有很强的分化能力，再生性强；同时由于处于低分化状态，它还具有分化成多种细胞、组织和器官的能力。再生医学，利用机体细胞重新制作损伤的组织、器官，使其恢复自然状态。即通过干细胞移植，将胚胎干细胞或多能干细胞移植于体内损伤部位从而达到组织器官重建和再生的目的。新一代的生物材料将生物活性材料与可降解材料这两个独立的概念结合起来，在可降解材料上进行分子修饰，引起细胞整合素的相互作用，诱导细胞的增殖、分化，以及细胞外基质的合成与组装，从而启动机体的再生系统，属于再生医学的范畴。组织工程是应用生命科学与工程的原理和方法构建一个生物装置,来维护、增进人体细胞和组织的生长,以恢复受损组织或器官的功能。组织工程的核心就是建立细胞与生物材料的三维空间复合体，即具有生命力的活体组织，用以对病损组织进行形态结构和功能的重建并达到永久性替代。组织工程的基本原理和方法是将体外培养扩增的正常组织细胞吸附于一种具有优良细胞相容性并可以被机体降解吸收的生物材料上面形成复合物，然后将细胞(生物材料复合物植入人体组织、器官的病损部位，在作为细胞生长支架的生物材料逐渐被机体降解吸收的同时细胞不断增殖、分化，形成新的并且其形态、功能方面与相应组织、器官一致的组织，从而达到修复创伤和重建功能的目的。13. 在PET系统中，需要对数据进行多种校正？请列举至少两种校正方法，给出他们的名称，校正的目的和实现的原理？包括：探测器灵敏度校正（归一化），同位素时间衰变校正，死时间校正，随机符合校正，散射符合校正，衰减校正，几何校正及其他校正等。同位素时间衰变校正：正电子类核素的寿命都非常短（如18F为110分钟），放射性衰变会使药物的强度随指数规律逐渐降低。特别是对于动态采集、全身扫描、门控采集和定量研究则必须考虑该项校正。根据指数衰变规律，注射时放射性强度为A0、衰变系数为 的药物经过时间t1采集到某一帧的时候，放射性强度下降到A(t)=A0e-t1，据此，不难通过采集时刻的计数率求出注射时刻的药物强度。把et1作为刻度因子乘以该帧各个像素的计数值，就能将图象归一到注射时刻的情况。至于每一帧之间的差别，如果各帧的采集时间比药物的半衰期短，则可以忽略在每帧采集过程中放射性强度的变化。但在计算标准摄取值时，需根据帧采集周期的大小将计数率校正到药物注射时刻。死时间校正：系统的死时间（dead time）是指系统处理每个事件所需的时间，它取决于探测器与电子学的时间特性以及数据处理器的速度、随机缓存器的性能等诸多因素。如果在后一个湮灭事件发生之前来不及处理完前一个事件，这两个事件就会丢失，这就是死时间损失。PET出厂前都要进行死时间损失测量：根据测量结果画出计数率药物强度曲线。在强度低的时候，计数率随药物强度正比增加，呈直线上升，当药物强度增加到某一限度后，曲线逐渐弯曲，它与直线的距离就是丢失的计数率，可以据此计算与记录校正参数以便进行死时间校正。死时间校正是有范围的，例如当上述曲线随药物强度呈下降趋势时，无法再进行校正。事实上有效评估PET计数特性的是噪声等效计数（NEC）。NEC定义为在无散射和偶然符合计数条件下达到同样的信噪比所需的真符合计数，由于散射和偶然符合的存在，使NEC先于计数率而饱和，因此要注意死时间校正的有效范围。偶然符合校正：是指两个或两个以上没有关联的光子被同时探测到而造成的符合计数，也叫随机符合（random coincidence），它与活度的平方成反比，它增加图像的噪声，影响图像的对比度。偶然符合校正硬件方法是使用延迟符合电路。只要延迟时间大于两倍的符合电路时间窗宽度，就能保证该符合电路输出中没有真的湮灭符合事件而只有偶然符合计数，然后再从总计数中减去。该方法简明有效、实时在线、速度快，易于实现，商用PET多采用这种方法。散射符合校正：主要是指组织中正电子湮灭产生的两个光子在到达探测器之前其中之一或全部发生了康普顿散射而偏移了原来的运行轨迹，且无法用能量窗方法有效去除，造成错误的符合信息（如图4所示）。散射符合影响图像的对比度。散射校正有多种硬件与软件的校正方