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第十章 酶作用的结构基础,第一节:酶活性中心结构: 一、酶活性中心概念: 二、酶活性中心组成: 结合中心:结合基团微环境 催化中心:催化基团微环境 三、酶活性中心的测定: 化学修饰法: 反应动力学法: 光谱法: 专一性抑制剂研究法: 差示标记法: 亲和标记法: X光衍射分析法:,第二节:酶和底物结合机理: 一、锁钥学说: 二、三点附着理论:,三、诱导契合学说: Induced-fit hypothesis,第三节、酶催化反应机理: 一、催化剂降低反应活化能的方式: 1. 中间态稳定化作用 2. 过渡态去稳定化作用:,1. 中间态稳定化作用,2. 过渡态去稳定化作用:,二、酶作用机理: 1.邻近效应和定向效应: 2.底物形变: 3.酸碱催化作用: 4.亲和亲电催化: 5.微环境的效应,一、邻近效应Proximity 、 定向效应Orientation,底物分子A、B 结合在酶活性中心,失去活动自由能, A、B反应 进入过渡态所需的能量大大降低。,a: 反应物的反应基团和催化基团不靠近,也 不彼此定向 b: 两个基团虽靠近, 但不定向,还不利反应 c: 两个基团即靠近又定向,有利于反应,c,化学反应分子轨道理论: 对称性匹配最高占据电子轨道 HOMO最低非占据电子轨道 LUMO能量相当、重叠最大、对称性允许酶催化反应:酶分子的参与,导致底物敏感键基团电子云密度增加或减少,改变敏感键电子组态,使敏感键产生电子张力,发生形变。酶分子构象也发生变化,形成酶底物复合物。适合于诱导契合学说。,二、底物形变(Distortion) 产生张力(Strain),底物发生形变,底物分子和酶分子都发生变化,三、酸碱催化和质子转移通路,酸碱催化:Acid-Base catalysis 狭义的酸碱催化剂(Specific acid-base catalyst): H+、OH- 广义的酸碱催化剂(General acid-base catalyst): 质子供体和质子受体的催化,电子受体和电子供体的催化。 Lewis 酸 和 Lewis碱的催化 咪唑基: 氨基: -NH3+ -NH2 + H+ 羧基: -COOH -COO- + H+ 巯基: -SH -S- + H+ 羟基: -OH -O- + H+ 酚基: -C6H4-OH -C6H4-O- + H+,羧基咪唑基磷酸之间质子转移通道:,四、共价催化:Cavalent catalysis 亲核反应:Nucleophilic reaction 亲电反应:Electrophilic reaction 酶的亲核催化作用:,丝氨酸酶:与底物酰基形成酰基酶 巯基酶:巯基与底物形成硫酯键 组氨酸类酶:咪唑基被磷酸化 赖氨酸类酶:氨基与底物的羰基形成西佛碱中间物,酶的亲电催化作用:,五、酶活性中心微环境的影响 酶活性中心的特殊环境,低介电常数的介质有利于电荷之间相互作用。 有利于酶底物中间
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