医学文献检索总论.ppt

医学文献检索总论,目录,学习文献检索的意义医学文献检索相关概念医学文献检索医学文献计算机检索计算机检索工具简单介绍,第一部分,学习文献检索的意义,培养信息素质,信息素质定义：信息素质是人们在工作中运用信息、学习信息技术、利用信息解决问题的能力信息素质构成要素：信息意识：（强烈的信息意识对信息敏感。一项有关Medline检索类型的研究提示平均每20分钟的检索可产生有用的信息，而这些信息有助于导致新的或改变临床的决定。）信息能力（信息的搜集获取能力主要包括信息接受力；信息捕捉力；信息吸收力；信息检索力等。其中信息检索力指熟悉各种信息源，掌握信息检索的基础理论和基本技术，熟练地利用各种手工检索工具和计算机检索系统查找所需信息的能力）信息道德,信息素质可分为,工具素质：能用印刷和电子信息资源的有关工具，如计算机、软件等；资源素质：了解信息资源的种类、形式和查找、检索方法；社会结构素质：掌握信息的社会地位、作用、影响；研究素质：掌握利用信息进行有关学科研究的技能出版和传播信息素质：能利用文本或多媒体报告研究结果,美国信息素质能力评价标准,能确定信息资源的特点和范围能有效地获取所需信息能评价信息及其来源，利用其知识基础和价值系统选择适当的信息能有效利用所获得的信息实现特定的目标评价要点包括能运用新的和以前的信息开发新产品或项目；能调整开发产品或项目的过程；能与别人就产品或项目情况进行有效的沟通了解信息使用的经济、法律和社会问题，在信息获取和利用时自觉遵守道德规范和有关的法律。（即在产品或项目开发中能正确使用有关信息资源，如合理使用或引用等）,科研选题和文献检索,科技信息是知识创新的源泉：世界上任何一项科研成果或创新都是在吸取和借鉴前人或他人研究成果的基础上，再加上自己的钻研和创新所获得的。科技信息是科研的先决条件科研选题的步骤一般是：文献调研和实际考察提出选题初步论证评议和确定课题在选题开始时，首先要了解前人的工作和现实的需要，进行文献调研和实际考察。文献调研是为了:考察前人对有关课题已经做过的工作及其经验教训，以免重犯他人已经指出的错误和重复他人已经作过的研究文献调研应查明有关专著和论文，并尽可能追溯其发展的历史，以便继承前人已有的研究成果，在新的起点上，选择研究课题，减少低水平重复。,科研课题申报和成果未获奖原因,科技成果创新不足或者研究项目重复占落选因素首位说明许多科技成果对本领域国内外研究动态与发展水平掌握不够，文献复习差，学习交流不足，造成信息不灵，成果创新不足，重复别人研究过的项目，造成人力、资金浪费,第二部分,文献检索的相关概念,基本概念,1.信息:在自然界、人类社会以及人类思维活动中普遍存在，是物质的一种基本属性，是物质存在方式及其运动的规律、特点的外在表现2.知识:人们通过信息对自然界、人类社会以及思维活动规律的认识与掌握，是人的大脑通过思维重新组合的系统化信息的集合3.文献：以文字、图形、符号、声频、视频等手段记录和传播知识的载体就是文献。,信息与知识的差别,信息是大家的独立于行动和决策独立于环境存在容易转让可复制,知识是个人的与行动和决策密切相关环境改变含义经过学习才能转让无法复制,医学文献的类型,按加工层次划分按载体形式划分按出版类型划分,按加工层次划分,一次文献：二次文献三次文献零次文献,一次文献：即原始文献，是作者根据自己的工作和研究成果而写成的，也可称原始论文。例如：期刊论文、学位论文研究报告、专利说明书等,二次文献：是对一次文献进行收集、分析、整理并按照其外部特征或内部特征（如篇名、作者、刊名、分类号、内容摘要等）按照一定的规则加以编排。是查找一次文献的线索。例如：目录、索引、文摘,三次文献：是针对某一专题检索二次文献，获得与之相关的大量一次文献，对一次文献进行阅读、筛选所需内容，最后归纳、整理、加工、提炼而写成的文献。综述，即review最常见的三次文献，是综合、分析、评论某一专题，能全面反映该课题在国内外发展动态的文章。,零次文献：出现于70年代末我国图书情报界；是形成一次文献之前的信息，是未被记录下来或公开的最原始文献，或没有正式发表的文字材料，如书信、手稿、笔记等，也可是科技人员的口头交流。,按载体形式划分,印刷型缩微型声像/视听型电子数字型,印刷型以纸质材料为载体以印刷为记录手段而形成的文献形式是目前整个文献中的主体也是有着悠久历史的传统文献形式特点不需要特殊设备可以随身携带随处随时阅读但存贮密度小体积大占据空间大不便于保存,缩微型以感光材料为载体以照相为记录手段而形成的一种文献形式包括缩微胶卷、缩微平片、缩微卡片特点体积小便于收藏和保存价格便宜等但阅读需要有较复杂的阅读设备来支持在一般的图书馆入藏较少,声像/视听型以磁性和感光材料为介质记录声音、图像等信息的一种文献形式优点存取快捷可闻其声见其形易理解,电子数字型以计算机处理技术为核心记录信息的一种文献形式特点存贮容量大检索速度快捷、灵活使用方便随着计算机技术特别是网络技术的迅猛发展和普及电子数字型文献的地位越来越受到人们的重视,按出版类型划分,图书期刊资料,图书（Book）是对已发表的科研成果、生产技术和经验的总结性的概括论述。供读者阅读的书籍：如教科书、参考书、专著等供读者检索参考之用的工具书：如字典、百科全书、年鉴等,正式出版的图书，均冠有ISBN号，即国际标准书号（InternationalStandardBookNumber），其定长为10位数字，分为4个部分，即地域号、出版社号、书号及计算机校验号。,中国图书馆分类法分类号,期刊（Periodical）是一种定期或不定期的连续性出版物，每期版式基本相同，有固定的刊名，有连续的年、卷、期号。如：杂志、学报、通报、综述与述评、索引、文摘等,同图书一样，正式出版的期刊也有国际标准连续性出版物编号ISSN（InternationalStandardSeriesNumber），实现对全世界期刊的管理。ISSN号全长8位，前7位是刊名代号，末位是计算机校验号。中间的“-”只是为了便于阅读而设置的。,ISSN0140-6736,核心期刊,核心期刊：刊载某学科文献密度大、载文率、被引用率及利用率较高，深受本学科专家和读者关注的期刊中的精华。确定核心期刊和评价期刊质量的常用方法：载文率法和引文法。评价期刊的常用工具：中文核心期刊要目总览（北大出版社）、中国科技期刊引证报告（中国科学技术信息研究所）、期刊引文报告（JCR）,IF（影响因子）=某年内SCI来源刊引用该刊前二年发表论文总次数/该刊前二年发表论文篇数（前二年某刊被SCI来源期刊引用的总次数）II（当年被引率）=某刊当年发表的论文被SCI来源刊引用的次数/该刊当年发表论文篇数,资料（Material）专利文献科技会议文献科技报告学位论文政府出版物标准文献产品资料技术档案,医学文献的特点,数量多、增长快内容交叉渗透、分散重复语种不断增加失效快、寿命短文献发表的时间滞后严重交流传播速度加快日益向多元化发展,第三部分,医学文献检索,文献检索的概念,文献检索：指从文献信息集合中查找所需文献或文献中包含的信息内容的过程广义的文献检索包括存贮和检索两者的过程和技术而狭义的文献检索是从用户的角度来理解，仅指从已经存贮的具体检索功能的文献信息集合中查询出所需文献的过程。,数据型信息检索（Dataretrieval）直接提供所需的确切的数值性数据。事实型信息检索（Factretrieval）直接提供用户所需的确切的非数值性数据，即事实。如化学式的检索文献型信息检索（Documentretrieval）利用文献的内部和外部特征来查找所需的论文，综述等等。其检索结果是切题文献或相关文献的文献线索或具体的文献。例如，查找国内外有关“PCR诊断病毒性肝炎”方面的研究文献,文献检索的类型,文献检索的意义,促进素质教育，培养信息意识避免重复劳动节省查找文献的时间，提高科研效率促进专业学习,检索语言,一、概念：是文献检索中用来描述文献特征和表达情报提问的一种专门的人工语言，根据文献信息检索的需要而创制。二、检索语言的分类：描述文献外表特征的检索语言：依据文献外表特征（题名、著者、文献序号、引用文献等）作为文献存储标识和文献检索提问的出发点而设计的索引语言描述文献内容特征的检索语言：分类检索语言、主题检索语言、代码检索语言,(一)分类检索语言,分类检索语言：用分类号作为语言来表达各种概念。按学科、专业集中文献，从知识分类的角度揭示多种不同文献在内容上的区别和联系，提供以学科分类为出发点的文献信息检索途径。常用的分类法：美国国会图书馆图书分类法杜威十进分类法国际十进分类法中国图书馆分类法国际疾病分类,(一)分类法语言,如中国图书分类法（简称中图法）R医药卫生R1预防医学卫生学R2中国医学R3基础医学R4临床医学R5内科学R6外科学R71妇产科学R72儿科学R73肿瘤学R74神经病学与精神病学R75皮肤病学与性病学R76耳鼻咽喉科学R77眼科学R78口腔科学R8特种医学R9药学,可细分至六、七级类目，如：R6外科学R65外科学各论R655胸部外科学R655.1胸壁R655.2胸膜R656腹部外科学R656.1急腹症R656.2腹部疝R656.3腹壁R656.31腹壁炎症R656.32腹壁损伤,中国图书馆分类法分类号标记是汉语拼音字母与阿拉伯数字相结合的混合制号码。为了区别于一般图书，对教材、工具书等，在其分类号后加复分号，如R245-61（针灸辞典），R711-43（妇科学教材）。对于临床各科（R5-R8），有专门复分表：01预防、控制和卫生02病理学、病因学03微生物学、免疫学04诊断学05治疗学06并发症07预后08诊疗器械、用具09康复例：R511.3-05天花治疗学,(二)主题检索语言,主题检索语言：以反映文献内容的主题词或关键词作为文献存储和检索的标识。常见主题检索语言：主题词又称叙词法：严格规范化、可进行概念组配、具有完善参照系统、具有范畴索引等关键词法：以出现在文献的标题、摘要或全文中能表达文献实质内容的词或关键性专业名词术语作为检索标识例：关键词（自由词）：carcinoma,tumor,cancer主题词（数据库标引用词）：neoplasms关键词：先天性心脏病主题词：先天性心脏病（包括：先天性心脏病，先天性心脏缺损，心脏畸形，先天性心脏异常，异位心等）,主题词相对于关键词的优势,主题词：又称叙词，是以规范化的词汇来表达文献内容的主题。主题词语言也叫人工受控语言所谓规范化也就是说它经过了人工规范化处理，即对文献中的同义词、近义词、多义词等加以规范，使得同一主题概念的文献相对集中在一个主题词下，同时在主题词表中采用参照系统间接反映主题概念之间与文献内容之间的关系，从而体现了主题词的单一性例如：癌（非主题词）cancer,tumor,carcinoma见肿瘤（主题词）Neoplasms采用主题词语言进行检索，能较好地实现较高的查全率和查准率，缩短机时，节省费用，是提高检索技能的关键。主题词可以集中语言表达不同但是相同概念的文献命中的文献比关键词准确,医学主题词表（MeSh),医学主题词表(MedicalSubjectHeadings，简称MeSh)，是美国国立医学图书馆编制的权威性主题词表。它是一部规范化的可扩充的动态性叙词表。美国国立医学图书馆以它作为生物医学标引的依据，编制医学索引（IndexMedicus）及建立计算机文献联机检索系统MEDLINE数据库。MeSh汇集约18,000多个医学主题词。MeSh在文献检索中的重要作用主要表现在两个方面：准确性（准确揭示文献内容的主题）和专指性。标引（对文献进行主题分析，从自然语言转换成规范化检索语言的过程）人员将信息输入检索系统以及检索者(用户)利用系统内信息情报这两个过程中，以主题词作为标准用语，使标引和检索之间用语一致，达到最佳检索效果,医学主题词表（MeSh),在进行检索时，用户输入一个主题词后，系统会自动显示该主题词所能组配的副主题词。MeSh有一个副主题词表，1989-1990年IM使用的副主题词是77个，1991-1994年是80个，每年略有变化。目前IM使用的副主题词是92个。副主题词(Subheadings)又称限定词(Qualifiers)，与主题词进行组配，对某一主题词的概念进行限定或复分，使主题词具有更高的专指性。如诊断（Diagnosis，DI）、药物治疗（DrugTheray，DT）、血液供给（BloodSupply，BS）等。正确选择副主题词也很关键。例如肺发育不全，输入主题词“肺”后，在副主题词菜单中选择“畸形”表示发育不全；再例如，双子宫用子宫/畸形检索,医学主题词表（MeSh),在医学主题词注释字顺表MeSHAAL中，对每个范畴类目的主题词和副主题词的组配原则进行了严格规定，组配时要按照规则进行。例如，副主题词治疗therapy与疾病主题词组配，可用于综合疗法。例如，消化性溃疡的心理疗法，用消化性溃疡/治疗；心理疗法副主题词治疗应用therapeuticuse与药物、生物制品和物理作用物主题词组配。指用于预防和治疗疾病，包括兽医用药。例如，红霉素治疗链球菌感染，用红霉素/治疗应用；链球菌感染/药物疗法。,医学主题词表（MeSh),MeSH附有各种参照和注释，它是对生物医学文献进行标引和检索的依据。例如，在医学主题词注释字顺表MeSHAAL中，该表的参照系统：用代参照，用“See”表示。指引检索者将非正式主题词用正式主题词。例如，CancerSeeNeoplasms。通过用代参照处理，从若干同义关系的词或词组中，选定一个科学而通用的名称作为主题词，供检索文献用相关参照：用相关参照“Seerelated”表示。目的是指引检索者从一个主题词去参考有关的其他主题词，以扩大选词范围。例如，检索Alopecia（脱发）这一概念时，要把它的相关参照AlopeciaMucinosa（斑秃）、Baidness（脱发）、HairDiseases（毛发疾病）Hypotrichosis（毛发稀少）等4个相关参照词下的内容看清楚，才能达到查全的目的,医学主题词表（MeSh),为了使主题词具有系统性，MESH引入范畴表(CategoriesandSubcategories)的概念。范畴表又称树形结构(TreeStructure)，是将字顺表中的主题词(主要叙词)、次要叙词按其学科性质、词义范围的上下类属及派生关系，分别划为15大类。在15个类目中，有9类又分若干子类目，子类目下面又分若干更小的类目，这就是通常供检索使用的主题词，共一万六千多个，都按其医学概念的性质分别列入各自所属的类目之下。例如：GASTROINTESTINALNEOPLASMS胃肠道肿瘤INTESTIINALNEOPLASMS肠肿瘤CECALNEOPLASMS盲肠肿瘤APPENDICEALNEOPLASMS阑尾肿瘤COLONICNEOPLASMS结肠肿瘤COLONICPOLYPS结肠息肉,医学主题词表（MeSh),查全率与查准率是文献检索的两大要素，这两者关系到词表的科学设计医学主题词表通过“字顺表”反映主题词之间的横向关系通过“树状结构”揭示词与词之间的纵向隶属关系两个表相互配合，形成一个功能完善的检索体系，以满足检索者对文献查准与查全要求,代码检索语言,代码检索语言：用代表事物的代码作为标识系统的索引语言。（化合物分子式索引、环状化合物环系索引、化学物质号索引等）,文献检索方式,手工检索：人工查找文献信息的检索方式，检索过程主要是利用各种印刷型检索工具。计算机检索：根据信息特定的需求，利用计算机从相关数据库中识别并提取所需要的信息过程。网络信息检索：通过互联网上提供的网络信息查询工具，从网上获取和享用电子信息服务。,医学文献检索的基本方法,一、常用法1.顺查法2.倒查法3.抽查法二、追溯法三、分段法四、浏览法,常用法,顺查法按照时间顺序由远及近逐年查找文献的方法。一般用于重大课题和各学科发展史以及新兴学科等方面的研究课题的全面检索，一般已知课题开始年代。如查找“有关SARS的文献”。查新规定检索十年或十五年的文献倒查法按照时间顺序由近及远回溯性逐年查找文献的方法。科研人员常用的检索方法。适用于一些新课题或有新内容的老课题，或在确认某项成果是否有创新时，也适合采用倒查法抽查法针对某学科或某课题研究的特点，根据文献资料发表集中的年代或时期，抽出其中一段时间进行文献检索的方法。多用于写专题调查报告。,医学文献检索的基本方法,追溯法利用参考文献查找文献的方法。此法在没有检索工具或检索工具不齐备时常用。分段法应用“常用法”与“追溯法”进行交替查找的一种综合性文献检索方法。浏览法为及时获得最新文献，利用最新期刊目录进行浏览，查找所需文献的方法。,医学文献检索途径,主题途径关键词途径分类途径著者途径书（刊）名途径其它途径,主题途径,如果要查找专指性很强的某一方面的文献，或不了解所要查找文献的类属关系，或虽然知道其类属关系，但并非广泛收集资料，则可通过主题途径检索由主题词、副主题词和顺序号组成。根据所查课题内容选准主题词，必要时应以副主题词加以限定，缩小检索范围；利用关键词查找时，应注意查全同义词、近义词，以免文献漏检,主题途径,CBMDisc采用中国医学科学院医学信息研究所翻译的1999年版医学主题词注释字顺表（MeSHAAL）（电子版），中医学文献采用中国中医研究院编制的中医药学主题词表Medline则使用美国的MeSH词表按每篇文献的内容，选定其研究报道的主要论点标引一个或多个规范化的主题词，主题词采用倒置形式。例：贫血贫血，难治性贫血，再生障碍性,为了加强主题词的专指性，采用规范化的限定词即副主题词加以组配。例：贫血流行病学贫血，难治性病理学主题词均按汉语拼音字顺排列主题词前冠有英文字母，均按汉字排列，顺序排在同音主题词之前，并忽略倒装符号。例：淋巴细胞B淋巴细胞T淋巴细胞T淋巴细胞，辅助诱导T淋巴细胞，细胞毒性,主题途径,主题途径,主题词前冠有拉丁字母或希腊字母，在电脑中排在汉字主题词之前。例：胡萝卜素胡萝卜素数字和英文字母，用来排列已被指定使用的外文缩写或新药，排列顺序是：数字、英文字母、汉字。例：DNA、HIV、IGA、IGE、RNA等,关键词途径,也叫自由词可输入任意的数字、字母、单词、词组或它们之间的组合可使用截词符（）、通配符（？）等符号例：comput*可检出computer,computers,computerized,etccolo?r可检出color,colour一些数据库如CBMDisc和Medline备有索引，可列出数据库中全部记录的所有可以检索的词不熟悉主题词途径的读者可以非常容易地使用自由词途径进行检索,分类途径,如果对某一课题的文献作比较全面的资料积累，或已知所需文献的类属关系，使用分类途径检索文献利用分类途径查找文献，要求了解检索工具或数据库所采用的分类体系，熟悉欲查文献所属的学科分类，选准大类类目，再逐层深入直到查到合适的类目CBMDisc按中国图书资料分类法第三版R类进行学科分类，一些非R类的类目，如Q5生物化学、Q6生物物理学等使用R34、R35的交替类目,分类途径,一些文献涉及两个以上主题时，均依主要内容分类。如：“糖尿病性骨关节病”入R587.2而不入R684R5内科学R58内分泌腺疾病及代谢病587胰岛疾病R587.2糖尿病性昏迷及其他并发症R684关节病及损伤狼疮性肾炎，归入R593.24红斑狼疮而不入R692.3肾炎R2中国医学类目下只限纯中医学名词术语的文献。例：崩漏入R271.12功能性子宫出血入R711.52,著者途径,根据已知著者姓名（个人和团体著者）检索文献的途径。检索外文著者索引时应注意以下几点：姓名次序欧美人姓名习惯是名在前，姓在后，一个人的姓只有一个，名可不止一个。但检索工具中