毕赤酵母的密码子用法分析.pdf

卷 期 年 4 2 0 等非常规酵母表达系统 其中尤以3 0 4 密 码子有效数 A 89 B C 8 D E 9 F 0的计 算 相 对 同 义 密 码 子 用 法 G 8 A 8F 9 9 C B F E 9B F H 8 6 的计算和高表达优越密码子的 确定方法参见文献 6 0 0 7 2 0 I 6顺序信息库检索得到35 4 5 4 2 0 目前已知的3 2个蛋白编码基因的密码子用法 发现它与35 4 5 4 2 0 中分别以J Q 7 J J J 7 6 7 7 6 J J 6 7 Q J J 7 J J 为多数 这一现象与两者的 7RJ S值是一致的 已知在 5 4 2 0 中 7RJ S大于5 4 2 0 中占优势的含有更 多的嘌呤 对65 0 8 9 1 C 9 C E C 3 F G A 4 B B 5H H A 2 A M K A F N B 8 H A II 6 57 N 2 0 1 2 3 3 3 4 6 8 5 I 8M C 3 O K A 4 6 8 5 I 87 5 H7 A 2 B 3 6 A A H 3 3 P 0 3 A 8 B B 6M Q N N A N N N6 8 57 2 A 7 8 5 A 3 3 3 R A3 C S E J 9 R A A A N 5A A H N7 2 7 B 5 7 B 3 3 F AF T 9 P 3 9 4 A 7 A 6 58 7 7 8 2 N 0 8 3 7 7 3 3 3 U I 3 U I V 6 6 I I 5A A 5 57 8 2 8 G F N A H A H 85 N H7 8 2 H 7 8 B I H 3 3 4 7 H I A N 9 T T T 4 7 H I A NA N A I N 2 6456 8 7 A 7 8 A 3 3 3 0 A W 3 0 A L 8 B H 8 BI 6 7I N 2 H 8 A A R U 0 3 W 0 3 W 0 7 N 7 8 IB A 7I A 2 N 787 7 8 9 4 A N H 7 N 3 3 3 W 0 5 33 W 0 5 3 L H 5 H 7 I7 5 6I 6 2 N9 3 E J F N 6 A B H B B BI 7 2 6 7 787 7 4 7 8 N B 3 3 4 A 6 I A A4 E X C Z T 3 7 3 3 U 7 4 A 6 I A A6 N II 7 2 I 787 7 8 3 6 A 8 I 3 3 4 B N N 5 B3 3 J A 3 3 W L A 4 B N N 5 B 8 AI 7 2 B 0 1 2 3 3 3 4 B N N 5 53 3 J A N 3 3 W L A N 4 B N N 5 57 6 NI I 2 I9 3 A N 3 U A N 1 Z 5 6 B I 3 3 3 U 6 33 U 6 3 V B 6 H N7 I 5I B 2 6 0 1 2 3 3 3 4 5 H A B N AM T Z 9 9 I E 9 9 T Q N N A N N N6 85 N 2 N 7 8 5 A C T E 1 9 P P 7 5 N A 2 8 AA 2 B A 2 8 A 9 P I A H A 2 H A 2 B 6 2 N I P I 6 6 A 2 A A 2 6 IA 2 6 B 9 P 7 H H A 2 8 86 2 I6 2 H I P 6 7 7 N 2 H IN 2 H 5A 2 A 8 6 8 7 N 2 H 8N 2 H BN 2 8 B 7 7 5 N 2 H N 2 B IN 2 B A 5 N 2 I 6N 2 5 I N 2 P A 7 7 N 2 I 7N 2 5 5N 2 7 A 6 5 H N 2 H N 2 H IN 2 8 6 9 C I H 5 A 2 A BA 2 7 5A 2 I 8 7 A 2 N 2 5 7N 2 I 6 P A 8 6 N 2 B N 2 5 IN 2 5 A 7 5 N 2 A BN 2 IN 2 6 5 7 A N 2 8 N 2 I 7N 2 7 6 8 AN 2 N 2 BN 2 6 G29 U 2 1 3 2 9 5 9 9 9 9 9 C 9 5 9 9 G 8 B 9 5 9 5 5 9 9 5 5 9 5 8 A9 9 4 8 9 5 B 8 9 B 8 9 8 A9 9 4 8 9 5 B 8 9 9 C9 8 A5 9 97 05 5 9 5 9 5 9 8 A5 9 57 05 5 5 5 5 5 5 8 A5 9 7 05 5 D E5 5 8 A5 9 7 05 5 D E5 5 F D 8 9 9 9 5 9 E 94 8 9 F D 8 9 5 9 5 5 E 5 4 8 5 F D 8 9 9 5 G 8 B 9 9 5 H I D 9 9 D I 5 9 C 9 D 9 H I D 9 5 D I 5 5 C 5 D 5 H I D 9 D I 5 D A D H I D 9 D I 5 D A D P C B J I D M 0 N 0 E 生物工程学报 卷 压力要避免引入稀有密码子以防在翻译过程中产生 瓶颈效应 在低表达样本组 高 值 中包括 8 4 6 8 3 A B B C 3 A D E 7 8 6 结束语 在本工作中 我们对 0 1 中目前已知的 基因进行了筛选和分析 在有关的分析工作中产生 了 5 0 3 UL L S WX 4 X 8 2 2 1 A 1 2 2 0 1 A B 1 C 2 2 2 1 D C E 1 3 2 0 1 8 6 C A 8 6 8 A K 6 4 G 6 7 6 8 4 7 B 8 6 E 8 K 6 K 1 F 1 0 1 C G 6 7 6 84 B 8 C B E G B R G 3 G 4 3 7 8 7 G 6 7 6 8 C Y Q 7 6 Q B 6 E B K 3 G 6 7 6 8 I 9 C 4 3 C 6 R C E C G 6 7 6