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文档简介
1、福建医科大学生物化学考试经典总结生物化学导入泛素化:泛素与选择性被降解蛋白质形成共价连接,并使其激活,即泛素化。自噬(autophagy):内质网双层膜包裹细胞内需降解的细胞器、蛋白质等成分形成自噬体(autophagosome),并与溶酶体融合形成自噬溶酶体(autolysosome),降解其所包裹的内容物的生物学过程。未折叠蛋白应答(unfolded protein response,UPR):分泌性蛋白和膜蛋白在内质网腔内未能形成正确折叠,未折叠蛋白的累积,则引发内质网应激(endoplasmic reticulum stress,ERS)。细胞出现的一系列反应,以应对ERS,称为未折叠
2、蛋白应答(unfolded protein response,UPR)蛋白质二硫键异构酶(折叠酶)(protein disulfide isomerase,PDI):蛋白质二硫键的形成影响蛋白质的空间结构和折叠,在细胞内发现催化二硫键的酶也具有异构作用,称为二硫键异构酶。脯氨酰顺-反异构酶(peptide prolyl-cis-trans isomerase, PPI):多肽链中肽酰-脯氨酸间形成的肽键有顺反两种异构体,空间构象差别明显。脯氨酰顺-反异构酶可促进上述顺反两种异构体之间的转换。脯氨酰顺-反异构酶催化这种异构化的过程,可加速蛋白质的折叠。蛋白质质量调控的研究内容及意义研究内容:1.
3、合成正确蛋白质 2.降解异常蛋白质 3.选择结构、功能正确的蛋白蛋白质质量调控意义:1. 细胞维持自稳状态的一种选择性代谢机制。2. 失效的蛋白质质量控制是许多疾病的分子病因。蛋白质折叠模式有哪几种1. 自组装模式(空间结构按等级进行、非极性残基间疏水作用介导、牛胰RNAase恢复天然构象和功能)2. 辅助性蛋白参与(辅助性蛋白、分子伴侣、蛋白质二硫键异构酶(折叠酶)、脯氨酰顺-反异构酶)辅助性蛋白的种类及功能种类:1)分子伴侣 (molecular chaperon) 2)蛋白质二硫键异构酶 (protein disulfide isomerase, PDI) 3) 肽-脯氨酰顺反异构酶(p
4、eptide prolyl-cis-trans isomerase, PPI) 。功能:1)封闭蛋白疏水区段,保护新生肽段;2)构成隔离环境,蛋白质互不干扰进行折叠;3)应激时,使已折叠的蛋白质去折叠,再诱导其正确折叠。4)促进二硫键形成正确的配对。分子伴侣的定义、分类及作用定义为:能够协助其它蛋白质分子,使之折叠成具有天然构象蛋白质的分子。分类:热休克蛋白、伴侣分子、核质蛋白。生物学功能: 辅助蛋白质折叠;直接参与炎症反应、细胞凋亡等。自噬过程1.自噬体膜包裹降解物:在应激时,粗面内质网膜、高尔基膜识别并包裹降解物;2.自噬体形成:自噬体膜延伸、闭合形成自噬体;3.自噬溶酶体形成:自噬体与溶
5、酶体融合形成自噬溶酶体,降解内容物。未折叠蛋白应答(UPR)作用1. 保护细胞存活通过上调细胞存活基因的表达,减少新生肽的合成,增加分子伴侣和折叠酶的产量,以促进蛋白质的正确折叠。2. 激活泛素化,清除未折叠蛋白UPR通过泛素化蛋白途径介导内质网相关蛋白质降解(ER-associated degradation,ERAD),清除未折叠蛋白。3. 促进细胞凋亡UPR通过三种蛋白激酶作用,将持续激活线粒体依赖和线粒体非依赖细胞凋亡途径,清除未折叠蛋白累积的细胞。蛋白质结构与疾病超二级结构:在许多蛋白质分子中,二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个有规则的二级结构组合,被称为超二级
6、结构。模体:在许多蛋白质分子中,二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,具有特殊功能,称为模体。结构域:大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各行使其功能,称为结构域。分子伴侣:是细胞内一类通过提供一个保护环境,可识别肽链的非天然构象、促进各功能域和整体蛋白质的正确折叠的保守蛋白质。热休克蛋白HSP:热休克蛋白属于应激反应性蛋白质,高温应激可诱导该蛋白质合成。热休克蛋白包括HSP70、HSP40和GrpE三族。变构效应(allosteric effect):蛋白质空间结构的改变伴随其功能的变化,称为变构效应。分子病:任何由
7、遗传原因引起的蛋白质功能异常所带来的疾病都是分子病。朊蛋白:又名蛋白质传染因子, 是一种非常特殊的传染病的病原体。蛋白质在生命活动中的作用1. 酶的催化作用2.控制生长与分化3.转化和储存功能4.运动功能5.结构支持作用6.免疫保护作用 7.代谢调节作用 8.接受和传递信息9.生物膜功能10.感染和毒性作用11.其它作用 常见的膜体结构有哪些1. 钙结合膜结构 2.DNA结合膜结构模体(锌指结构)根据结构域可将蛋白分为哪几类1.反平行螺旋结构域(全-结构)2.平行或混合型折叠片结构域(,-结构)3.反平行折叠片结构域(全-结构)4.富含金属或二硫键结构域(不规则小蛋白质结构)分子伴侣的定义及功
8、能分子伴侣是细胞内一类通过提供一个保护环境,可识别肽链的非天然构象、促进各功能域和整体蛋白质的正确折叠的保守蛋白质。主要作用:封闭待折叠蛋白质的暴露的疏水区段;创建一个隔离的环境,可以使蛋白质的折叠互不干扰;诱导错误聚集的肽段解聚诱导二硫键的形成。蛋白质构象改变导致疾病的机制蛋白质错误折叠后相互聚集,聚集蛋白抵抗蛋白水解酶,产生淀粉样纤维沉淀,而致病。“很可能为AD”的新诊断标准核心症状(早期、显著的情景记忆障碍)+至少1项支持特征 存在内侧颞叶萎缩; 脑脊液生物标志物异常; (AD相关蛋白标志物:如淀粉样蛋白42、总tau蛋白及磷酸化tau蛋白) 双侧颞叶糖代谢率降低或其他示踪剂预见的AD病
9、理改变; 直系亲属中有被证实的常染色体显性遗传突变所致AD。新标准强调了早期场景记忆(3W:什么时间、什么地点和发生了什么事)障碍的重要性。脂蛋白与疾病血脂:血浆所含脂质统称血脂,包括:甘油三酯、磷脂、胆固醇及其酯以及游离脂肪酸。脂蛋白:血脂与血浆中的蛋白质结合,以脂蛋白(lipoprotein)形式而运输。脂蛋白受体:血液中脂蛋白可与细胞膜上存在的特异受体相结合,被摄取进入细胞内进行代谢。脂蛋白受体在决定脂类代谢途径、参与脂类代谢、调节血浆脂蛋白水平等方面起重要的作用。清道夫受体:是吞噬细胞表面的一组异质性分子,至少以6种不同的分子形式存在。可识别乙酰化低密度脂蛋白及格兰氏阴性菌LPS,格兰
10、氏阳性菌的磷壁酸等阴离子聚合体,也可识别由细胞膜内侧翻转到膜外的磷脂酰丝氨酸。它们参与对病原体的识别和清除,同时也对丧失唾液酸的陈旧红细胞和某些凋亡细胞的清除。原发性高脂血症:排除由于全身性疾病所致的继发性高脂血症后,所有的血脂升高均统称为原发性高脂血症。这是一类多因素引起的疾病, 是环境因素与遗传基因异常相互作用的结果。继发性高脂血症:继发性高脂血症是指由于系统性疾病或药物所引起的血脂异常。 常见疾病有:甲状腺功能减退症、糖尿病、肾病综合征、肾功能衰竭、肝脏疾病、系统性红斑狼疮、糖原累积症、骨髓瘤、脂肪萎缩症、急性卟啉病等。此外, 某些药物如利尿剂、受体阻滞剂、糖皮质激素等也可引起继发性血脂
11、升高。脂蛋白a /LP(a):主要是在肝脏合成,主要的功能是阻止血管内血块溶解,促进动脉粥样硬化形成,脂蛋白水平持续升高与心绞痛、心肌梗死、脑溢血有密切关系,是冠心病的独立危险因子。脂蛋白代谢的影响因素膳食、职业、营养、代谢、疾病、年龄糖尿病血脂异常的机制1、 胰岛素作用下降2、血脂代谢紊乱3、糖化、氧化应激导致脂蛋白结构异常小而密的LDL致动脉粥样硬化的作用动脉粥样硬化的发病机理引起AS的起始因子是什么?1.损害反应学说认为血小板凝集能力亢进,引起血管壁损害是其起始因子。2.起始因子是使血管内皮细胞层下发生完整的剥脱,并以泡沫细胞为主,外加平滑肌细胞的浸入,使单核细胞在循环血液中发生。3.变
12、性LDL经巨噬细胞清道夫受体结合形成AS,为AS早期起始因子。4.氧化LDL是早期AS的起始,即OXLDL学说;5.LDL的磷脂经氧化产生溶血卵磷脂,成为循环中单核细胞的趋化物,起主要作用。蛋白组与蛋白组学蛋白质:是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物。蛋白质组:一个细胞或一个组织基因组所表达的全部蛋白质。蛋白质组学:指应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴科学,其目的是从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成成份、表达水平与修饰状态,了解蛋白质之间的相互作用与联系,揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。双向凝胶电泳:2DE,利用
13、蛋白质的等电点和分子量大小,结合凝胶化学性质,分别在凝胶二维空间上对蛋白质分子进行等电聚焦和电泳来分离与纯化蛋白质的方法。氨基酸组成分析:通过测定蛋白质中各氨基酸所占摩尔百分数或各氨基酸的摩尔比率,然后与数据库中已知蛋白质的理论值进行比较。简述双向凝胶电泳的原理及其优缺点原理:第一向在高压电场下对蛋白质进行等电聚焦,再在第一向垂直方向上进行第二向SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。优点:1、可分离10-100kD分子量的蛋白质 2.高灵敏度和分辨率 3.便于计算机进行图像分析处理 4.与质子谱分析匹配。缺点:1.极酸、极碱性蛋白质,疏水性蛋白质,极大蛋白质、极小蛋白质、以及低丰度蛋白质用此种技术难于有效
14、分离;2.胶内酶解过程费时、费力,难于与质谱联用实现自动化。试述蛋白质组学常用的研究方法表达模式:1、双向凝胶电泳 2.新型非凝胶技术(蛋白质微量测序、氨基酸组成分析、质谱法MS功能模式:1、酵母双杂交系统 2.噬菌体表面展示技术3.基于质谱的蛋白质相互作用研究技术(亲和层析偶联质谱技术、免疫共沉淀藕联质谱技术、生物传感器耦联质谱技术、串联亲和纯化耦联质谱技术)蛋白芯片技术试举2例叙述蛋白质相互作用研究技术1、酵母双杂交系统;2、噬菌体表面展示技术糖蛋白与糖组学酶学一、名词 酶:由生物活细胞产生的一类能对特定底物起高效催化作用,由蛋白质和/或核酸组成的具有活性中心特定构象的生物催化剂。 米氏常
15、数Km:Km = (K2+K3)/K1,它是ES的分解速度和ES的形成速度的比值,是速度常数K1、K2 、K3的函数,对特定酶反应、特定反应条件(如PH、温度、底物)来说,Km值是酶的特征性常数之一,只与酶的性质有关,和酶的浓度无关。 酶的钝化作用:主要指在某些物理或化学因素作用下酶蛋白分子的次级键受破坏,酶蛋白的空间构象改变,酶蛋白因变性而失去了酶活性,称之酶的钝化作用。 酶的抑制作用:由酶的必需基团或活性部位的化学性质发生改变,引起的酶活性的降低或丧失的作用。这时酶蛋白一般并未变性,可用物理或化学方法使酶恢复活性。能引起这种抑制作用的物质称为抑制剂。 酶的活力单位:1961年国际酶学会统一
16、规定:在特定的条件下,1分钟转化1微摩尔底物的酶量,或转化1微摩尔的底物有关基团的酶量为1个酶的活力单位(国际单位IU)。 酶的比活力:酶的活力与蛋白质的量相联系的1种活力单位。如每mg酶蛋白所具有的酶活力 (单位mg蛋白),每ml酶制剂含有的酶活力(单位m1),或每g酶制剂具有的活力单位(单位g)等。对同一种酶来讲,比活力愈高则酶越纯。 酶活力测定的空白试验和对照试验:空白试验:是指杂质反应和自发反应引起的变化量,它提供的是未知因素的影响。空白值可以通过不加酶,或不加底物,或二者都加(酶预先经过失效处理)。对照试验:是指用纯酶或标准酶制剂测得的结果,主要作为比较或标定的标准。二、问答试述酶的
17、催化作用的独特特点。1. 酶催化反应的高效性 2. 酶催化作用对象的专一性(特异性) 3. 酶的不稳定性(易变性)4. 酶活性的可调节性叙述双底物反应的顺序机制和乒乓机制的特征。顺序机制:(Sequential Mechanism) 底物A和B顺序结合在一个酶的活性部位,形成EAB三元复合物,反应才能进行,然后释放产物。乒乓机制:(Ping Pong Mechanism)是指底物和产物交替进出的机制,两底物不能同时与酶结合形成EAB复合物。酶E转变为修饰形式E。哪些激活剂会影响酶反应速度?1. 无机离子:包括金属离子和非金属离子,常见的有K+、Na+、Mg2+、Zn2+、Fe2+、 Ca2+、
18、Cl-、Br-和H+。葡糖-6-磷酸脱氢酶需要Mg2+,而-淀粉酶需要Cl-。有些离子可相互替代,如Mn2+可取代Mg2+,作为激酶的激活剂。有些离子间有拮抗作用,如Na+抑制K+的激活作用,Ca2+抑制Mg2+的激活作用等。2. 分子:一些有机化合物分子能使酶分子中发挥活性作用的基团保持本身状态,保证和提高酶活性。a、某些还原剂如:GSH,半胱氨酸b、 EDTA(乙二胺四乙酸)能除去酶中重金属离子杂质,从而解除重金属离子对酶的抑制作用。3. 蛋白质:主要指的是酶,能够切断酶原分子中特定肽键,使无活性的酶原转变成有活性的酶。如胰蛋白酶原在肠激酶的作用下,切去酶原中的六肽,转变成胰蛋白酶,肠激酶为胰蛋白酶原的激活
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