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文档简介

1、锐基HPV试剂盒操作流程及注意事项一、 试剂组成成分1 DNA萃取试剂(4保存):(1)A:DTAB Solution B:CTAB Solution C:Dissolving Solution 2 扩增反应组试剂(-20保存):A:Pre-Mix B:HPV positive control(105 copies/l) C:Yeast tRNA D:IQzyme DNA Polymerase E:6X Loading Dye F:DNA Marker二、 模板制备1 不同组织的取样:A:虾苗检体(1)取约 30只的检体。(PL期之前的虾苗约需50只左右,PL前期 ( PL12) 约需30只;

2、进入PL12 30期的幼虾(体长1 cm以上)仅取头部即可。)(2)将其放入含600l DTAB Solution的1.5 ml 离心管中。(3)用研磨棒将虾眼磨碎至溶液呈雾状。B:肝胰腺(1)取约20 mg的样品,放入含 600l DTAB Solution的1.5 ml 离心管中。(2)用研磨棒将其磨至呈雾状。C:种虾粪便(1)取长约1cm的样品,放入含600l DTAB Solution的1.5ml 离心管中。(2)用研磨棒将其磨至雾状。注意:离心管要提前在管盖和管壁上用记号笔做好标记,整齐放置于离心管架上;先用眼科剪剪取一定组织,再用牙签小心挑取所需要的量,放于对应的离心管中。切忌取太

3、多,否则影响DNA萃取质量;每取一个样品均需更换完剪刀、手套、保鲜袋和牙签后,再进行下一个样的取样;研磨时需小心,别将裂解液溅出,最好每研磨好一个离心管后更换一副手套。2 DNA萃取步骤(1)将完成取样步骤的样品置于75金属浴中,5分钟后取出置于室温下。(可提前打开金属浴让其升温至所需温度)(2)冷却后稍微振荡,加入700l 氯仿,振荡并充分混合20秒以上,再以12000 g离心5分钟。(3)取上层液加入含100l CTAB与900 l ddH2O的全新2 ml 离心管中,振荡器混合均匀后,置于75金属浴5分钟。(注意:取上层液时,必须非常小心,不可吸到接口处的白色物质,大约能取400l。另可

4、少取,都不要碰,否则会使下一步溶液变得混浊。在上一步离心时,可往新离心管中加入相应所需溶液。)(4)取出置于室温下,冷却后以12000 g离心10分钟。(5)小心倒去上层液,加入150 l 的 Dissolving Solution,置于 75金属浴5分钟,然后冷却至室温。(6)以12000 g离心5分钟,以去除不能溶解的杂质,并将澄清的溶液吸入另一全新并含有300 l 95% 酒精的离心管中。(在上一步冷却时,可往新离心管中加酒精。)(7)振荡混合均匀之后,以12000 g离心5分钟,使DNA沉淀下来,之后将酒精小心倒去。(8)加入200l 70% 酒精,振荡之后,以12000 g离心3分钟

5、。之后倒去酒精进行风干。风干程度为不见水珠为止,时间灵活撑握。(风干时,可配PCR反应液。)(9) 溶解DNA沉淀。如果样品取的是鳃,就加400l ddH2O;如果是其它组织,就加200l ddH2O。三、PCR扩增1 阳性对照的制备:用2对18的比例配制。即先取2l 105 HPV的阳性样品,再取18l的灭菌水,振荡器混合均匀后,以4000g离心20s,此操作重复两次。依此方法,配制104、103、102的阳性样品。(注意小心操作,以免发生污染。操作熟练后,可不配102 阳性样品。)2 反应液配制:反应液:Pre-Mix reagent 12.5 l IQzyme DNA Polymeras

6、e 0.5 l(1)按此比例算出样品与阴、阳性对照所需的各种试剂的总体积,然后将各总体积相加,再乘以1.1倍,即是所要配的总体积。(2)先加Pre-Mix reagent,再加IQzyme DNA Polymerase,且每种试剂的量一定要加足够。配好后再在振荡器上混合均匀,放于4冰箱待用。(注意:拿出的试剂要放在冰盒上让其完全解冻,振荡离心两次后再加,加完各种试剂后,要马上将试剂放回冰箱。操作熟练后,可不配102 阳性样品。)3 对PCR反应管做好相应标记,先往每管中加反应液13l,再加2l模板或对照,阳性对照最后加。加完后将PCR反应管盖子盖好,再在微量振荡器上振荡约5s,放入PCR仪进行

7、PCR扩增。扩增程序为: 94 20s 55 20s循环35次 72 30s 72 30s 20 30s四、 配制1%的胶进行电泳1 称取0.4g琼脂糖放于锥形瓶中,再量取40ml的0.5TBE溶液混合,放于微波炉中煮沸,至溶液清彻透明为止,大约需1分40秒。2 冷却到60时(放于掌心,能感觉到汤但又能忍受。)加2l核酸染料,摇匀。3 组装好制胶器,并调至水平。将胶倒于制胶器中,插好梳子。待40分钟胶冷却凝固后,就可放于倒好电泳缓冲液的电泳槽中进行点样。4 取5-10l样品溶液,加1-2l 6loading Dye,混合均匀后进行点样。每排点样孔要点一个5l的Marker。5 点完后,调电泳仪

8、各参数进行电泳:U:80V;A;200A;T:40min。五、结果判定1 下图为各种不同浓度的标准品,以及实际检体的实验结果。 1 2 3 4 5 6 7 MLane 1: WSSV标准品1, 20000 copies/reaction Lane 2: WSSV标准品2, 2000 copies/reaction Lane 3: WSSV标准品3, 200 copies/reaction Lane 4: HPV的阴性对照Lane 5: 中度感染HPV的样品Lane 6: 轻度感染HPV的样品Lane 7: HPV阴性样品Lane M: 分子量标记, 848 bp, 630 bp, 333 bp2 阴性的虾类检体会在730 bp处形成唯一的亮带,此亮带为内控制组的PCR产物。3 判读步骤:(1)在339 bp或339 bp 与553 bp处同时形成亮带:阳性(2)在

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