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文档简介

主要比对 环状环形RNA是mRNA在剪接的exon的5’端与下游exon的3’端剪接到一起，从而形成的首尾相接circRNA特大多数定位于细胞质比线性RNA更稳定许多circRNA表达水平与线性RNA的表达水平相当,一些circRNA的表达水 大部分是非编码RNA(noncodingRNAncRNA)circRNA功与miRNA相互作circRNA通过碱基互补配对直接调控其他RNA水平circRNA能与蛋白质结合,抑制蛋白质活性、募集蛋白质复合体的组分或调一些circRNA可作为翻译的模板指导蛋白质环状 (RNAsequencing,RNA-seq)和生物信息学技术的快速发展,使大规三种rRNARNaseRcircRNA建库类型选rRNA劣势：假阳性高;无法获得circRNA序列全长；RNaseR处优势：排除线性RNA干扰circRNA高度富集circRNA鉴环状rna数据circBase合并并统一了成套circRNAs，并且能够在 主要比对 Fasq：a是 术一种反映 序列碱基质文格式。第一行以“@符号开，后面紧跟一个序列的描述信；第二行是该序列的内以后面可以是该序列的描述信，也可省略；而第四是第二行的序列内每个碱基所对应的 质量。数据库准备

fastq数"lungcancerrna-seq"-->Nucleotidesequences(74)SRA-->"lungcancerrna-seq"质fastqcERR499.read1.fqERR499.read2.fq-t2-o质质质过过滤NLow过滤主要比对 比对 bwaindex-abwtswbwamem-T19S1.clean1.fqS1.clean2.fqTheBWA-MEMalgorithmperformslocalalignment.Itmayproducemultiplealignmentsfordifferentpartofaquery环状rna鉴定环状rna鉴2-8328,+构建--2000-+0020-+0200-+0200-+0030--0002--0200--2400-+5233-+2000circBase注--2000-+0020-+0200-+0200-+0030--0002--0200--2400-+5233-+2000主要环状RNA简比对 差异n00-2.36E

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