5个不同产地克氏原螯虾形态差异分析

5个不同产地克氏原螯虾形态差异分析

元宝虾和元宝虾通常被称为小龙虾，具有美丽的肉质和丰富的营养。它是中国重要的水产养殖产品(。关于种群鉴定,基于形态学及遗传多样性的研究手段是常用的两种方法。形态学研究以传统形态测量法为主(传统形态测量法具有线性距离的同源性、具有相同距离数据的不同形态等问题(1材料和方法1.1实验材料本研究选取上海、江苏、江西、河南、湖北5个不同群体克氏原螯虾,每个群体选取规格相近雌雄各10尾进行形态学研究,群体详细信息见表1。1.2图像处理和图像采集将所采集到的克氏原螯虾进行形态固定,利用相机获取其图像。样本与相机应保持垂直平行,样本方向,相机方位等均应保持一致(1.3实验方法1.3.1传统形态聚类分析运用tpsDig32软件测量每尾虾的全长(totallength)、体长(bodylength)、头胸甲长(carapacelength)、腹部长(lengthofabdomen)、头胸甲宽(carapacewidth)、腹部宽(segmentheight)、尾扇长(lengthoftail-fan)(图1),测量标准参考求出10项形态比例参数的平均值,采用欧式距离系统聚类法对这些平均值进行聚类分析;将数据进行校正,对5个不同产地克氏原螯虾群体形态比例参数进行主成分分析,将第1、2主成分绘制主成分散点图,以便对不同群体进行形态归类;运用逐步判别分析法进行判别分析,从判别分析中筛选出贡献较大的参数建立判别函数,判别准确率的计算参照1.3.2克氏原螯虾群体tps软件模拟地标点选取标准、TPS系列软件使用方法同郑朝臣等(2017)。根据地标点的同源性,运用TPS系列软件从克氏原螯虾背面选取了36个地标点,确定每个地标点的x、y坐标值(2D),建立数据文件。其中Ⅰ型地标点:2—5、11、17、23—26;Ⅱ型地标点:6—10、13、15、18—22、27—36;Ⅲ型地标点:1、12、14、16(图2)。运用TPS系列软件检验所有地标点的有效性,计算平均形(meanshape)和相对扭曲主成分得分(relativewarpsscores),描绘出克氏原螯虾背面和腹面的网格图,比较其与平均形的形态差异,实现克氏原螯虾群体间的形态差异可视化。根据克氏原螯虾各样本的相对扭曲主成分得分,采用欧式系统聚类法对相对扭曲主成分得分平均值进行聚类分析,建立Bayes判别函数,用逐步判别法进行判别分析,运用SPSS23软件,进行统计分析。2结果2.1地也线型分析结果本文测定了克氏原螯虾雌雄群体切空间距离(distanceintangentspace,y轴)和普氏距离(procrustesdistance,x轴)的回归分析系数均为0.996,说明所选取的地标点符合地标点分析要求。克氏原螯虾雌雄群体平均形及所有地标点重叠后的效果如图2。群体间形态差异分析结果见图3,雌雄群体相对网格平均形而言,形态差异主要体现在头胸甲及腹部部位的Ⅱ型地标点,具体为地标点4—6、22—24、28—32、35、36变形最大。从以上分析可以得出克氏原螯虾头胸甲和腹部部位的各地标点是其形态差异的主要来源。2.2形态差异的主要来源将不同产地克氏原螯虾10个形态比例参数进行主成分分析,雌雄群体前2个主成分累计贡献率均超过50%(表3),解释了主要形态差异。在雌性群体中,第1主成分X地标点法相对扭曲主成分分析,雌雄群体前两个主成分累计贡献率分别为73.04%、54.75%(表4),超过了50%,代表其形态差异的主要部分。克氏原螯虾雌雄群体Ⅰ型地标点累计贡献率分别为16.69%、20.10%;Ⅱ型地标点累计贡献率分别为78.39%、72.70%;Ⅲ型地标点累计贡献率分别为4.93%、7.20%(表5),表明Ⅱ型地标点是克氏原螯虾形态差异的主要来源,Ⅱ型地标点代表克氏原螯虾头胸甲及腹部的形态特征,此结果与传统形态测量法结果相同。图4为两种方法雌雄群体第1、2主成分散点图。从图4a、b中可看出各产地雌雄群体形态比例参数主成分重叠程度较大,不易区分。相对扭曲主成分散点图(图4c,4d)显示雌雄群体散布趋势相似,上海、江西、河南、湖北重叠程度较大,江苏群体与其他群体重叠较少。2.3男性群体聚合回归本文分别对克氏原螯虾群体形态比例参数平均值、相对扭曲主成分得分平均值作聚类分析,结果如图5。形态比例参数平均值聚类分析将群体分为两支,雌性群体中江苏、河南群体欧氏距离最短,首先聚为一支,之后与江苏、湖北群体聚为一支,江西群体单独聚为一支(图5a)。雄性群体与雌性群体聚类结果相似,上海、河南群体欧氏距离最短,首先聚为一支,之后与江苏、湖北群体聚为一支,江西群体单独聚为一支(图5b)。相对扭曲主成分得分平均值聚类分析,雌性群体与雄性群体结果相似(图5c,5d),均为江苏群体单独聚为一支,此聚类结果与相对扭曲第1、2主成分散点图结果相同。2.4各变量主成分得分综合判别准确性比较克氏原螯虾5个地理群体判别分析中,F检验判别效果均较好(P<0.01)。雌雄群体相对扭曲主成分得分综合判别准确率分别为100%、94%(表6)。而形态比例参数主成分得分综合判别准确率较低均为56%(表7)。利用基于地标点法的几何形态学测量可以有效判别不同产地克氏原螯虾,判别效果较传统形态测量法好。3讨论3.1基于力学特征的群体评价通过形态学及遗传多样性两种方法来对不同地理群体间进行种质鉴定已在多个物种中应用。3.2形态特征差异由于地理隔离的原因,使得同一亲本在不同地理环境下其形态、生理甚至遗传结构会出现一定的差异(两种方法均显示5个群体形态特征差异体现在克氏原螯虾头胸甲及腹部部位。传统形态测量法中,雌雄群体前两个主成分贡献较高的分别是X3.3采用这两种方法进行评估和比较、3.4蟹的形态特征利用地标点法对长江水系的八个自然水域的中华绒螯蟹形态上的差异进行分析,相对扭曲主成分的判别分析对雄性以及雌性蟹背甲的判别准确率均为100%。且所提取的地标点中Ⅱ型地标点贡献率较高作用较大。4地标法与高效方法的比较本研究分别采用地标点法和传统形态测量法对我国五个不同产地