方法学肝癌多组学检测专家共识

方法学肝癌多组学检测专家共识39.0%~53.6%肝癌患者初诊即为晚期，肝癌5年生存率提升缓慢HanB,etal.JNatlCancerCent.2024;4(1):47-53.国家感染性疾病临床医学研究中心等,2023,31(9):910-920.ZengH,etal.JNatlCancerCent.2024;4(3):203-213.原发性肝癌是目前我国第4位常见恶性肿瘤及第2位肿瘤致死病因，2022年中国肝癌新发病例36.8万，死亡病例31.7万；1约39.0%~53.6%的肝癌患者初诊即被诊断为晚期。2中国癌症患者的5年相对生存率呈总体显著增加的趋势，从2008-2010年的38.2%提高到2019-2021年的45.9%；但肝癌的5年相对生存率仅从14.3%提高到15.1%。35年生存率(%)多组学研究系统性解析肝癌发生发展分子机制，提供诊疗新见解基因组学聚焦于全基因组的DNA序列变异，包括单核苷酸变异、拷贝数变异以及结构变异等；肝癌的基因组学研究可用于揭示肝癌驱动基因的致癌作用，对于肝癌的早期诊断、治疗和预防至关重要。表观遗传学研究DNA甲基化、RNA甲基化、组蛋白修饰及染色质可及性等非DNA序列遗传信息，阐明肝癌的表观调控网络；准确识别和筛选有意义的表观遗传学信息可精准预测肝癌治疗的疗效和患者预后。转录组学解析mRNA、lncRNA、miRNA及circRNA等的表达谱，识别异常表达的RNA分子，获得敏感性和特异性更佳的生物标志物，可用于肝癌的早期诊断并可指导肝癌新疗法的开发。蛋白质组学分析蛋白质表达、翻译后修饰及相互作用网络，直接反映功能分子的动态变化；肝癌的蛋白质组学研究可以揭示肝癌发生发展的具体调控机制，识别肝癌诊断和治疗的潜在生物标志物。代谢组学研究肝癌特异性代谢重编程，观察小分子代谢物在肝癌发生发展过程中的动态变化，可为靶向代谢通路的肝癌诊疗提供依据。肝癌多组学检测多组学整合协同分析，可突破单一组学的信息局限，全面揭示肝癌的异质性及分子演化规律，构建肝癌发生发展的全景图谱。ChenF,etal.FrontOncol.2022Feb3;12:822449.CuiD,eta.FrontMed(Lausanne).2021Sep30;8:754709.机遇与挑战并存，规范共识加速多组学研究成果向临床实践转化机遇临床应用前景广阔：可用于肝癌早期筛查、辅助诊断、疗效预测、复发监测、基于人工智能的多组学建模、多组学数据库和可视化平台的搭建等。挑战技术层面限制：多组学检测成本和通量瓶颈、样本前处理复杂、数据质量控制与标准化难题、非肿瘤组织样本检测的技术难题等；临床转化障碍：缺乏大规模临床试验验证、临床多组学结果解读能力不足、医保覆盖与患者经济负担问题、数据库和可视化平台的缺失等。规范共识的制订制订《肝癌多组学检测专家共识》推动多组学研究的标准化与规范化，加速多组学研究成果向临床实践转化应对肝癌临床实践中的多重挑战，提升肝癌综合诊疗水平《肝癌多组学检测专家共识》制订计划文献检索大纲撰写第一次共识沟通会2024.122025.1-102025.112025.122026.01初稿撰写修订稿件定稿第三次专家讨论会待定2025.04.12（线下）投稿共识项目启动共识发布2026.6（预计）第二次专家讨论会2025.11.1（线下）2024.12.1、本指南由CACA肝癌整合防筛专业委员会牵头，成立了撰写工作组,涵盖消化肿瘤内科、肝胆外科、病理科、分子检测实验室等多个学科的专家,根据职责分为执笔专家组和顾问组。所有工作组成员填写了利益声明表,均不存在与本指南直接的利益冲突。2、通过系统检索国内外肝癌组学检测领域已发表的指南和系统评价，工作组初步拟定了撰写框架，分为5大类组学,涵盖7个临床应用领域,具体检索数据库包括PubMed、E、Clinicaltrialgov、CochraneLibrary、WebofScience、中国知网万方数据知识服务平台、维普资讯网和中国生物医学文献数据库。3、本指南已在国际实践指南注册与透明化平台完成注册,注册网址:http://www.guidelines-registrycn/,注册号:xxxx共识制定方法共识制定方法7对检索到的相关文献进行归纳整理及数据提取,使用推荐意见分级的评估、制定及评价(GradingofRecommendationsAssessmentDevelopmentandEvaluation,GRADE)方法对证据质量进行分级。工作组基于证据检索与评价小组提供的国内外证据,同时考虑我国筛查目标人群的偏好和价值观、筛查措施的成本和利弊后,初步拟定了临床问题推荐意见。以德尔菲法通过邮件形式发送至相关专家进行意见征询,在对推荐意见进行了进一步修改后并达成推荐意见推荐强度共识。GRADE证据质量及推荐强度分级标准参见表1。共识制定方法举例说明8推荐意见1:NSCLC靶向治疗相关基因检测中推荐开展的必检基因包括EGFR、间变性淋巴瘤激酶(ALK)ROS1、MET第14号外显子跳跃突变、RET、BRAF和NTRK(GRADE证据分级:高:推荐级别:强推荐);NSCLC靶向治疗相关基因检测中推荐开展的扩展检测基因包括KRAS、HER2突变，MET扩增过表达、NRG1中(GRADE证据分级:中;推荐级别:强推荐)。制定方法依据肝癌多组学研究的文献综述和临床实践经验，通过改良的德尔菲法形成专家共识由XX名临床专家组成本共识专家组（国海补充）——1名专家担任主席——1名专家为主要执笔者专家组对推荐意见进行最多三轮投票——第一轮中未能达到预先设定阈值的推荐意见将根据反馈意见进行修订，然后在下一轮中进行表决；——第一轮投票阈值为90%，即未达到90%的推荐意见都会被考虑是否进行修订，并进行第二轮投票；——第二轮/第三轮投票阈值为≥75%，即达到≥75%的推荐意见将被采纳作为最终的共识意见；第二轮中未达到75%的推荐意见将在修订后进行第三轮投票，若全部推荐意见达到75%，则无需进行第三轮投票。本专家共识进程概述关键文献检索在关键文献的基础上形成证据摘要根据关键文献提供的循证证据形成共识草案介绍专家共识草案专家组成员结合临床实践经验自由讨论对共识草案进行第一轮投票根据投票结果，对未达到专家共识阈值（≥90%一致）的推荐意见进行修订专家组成员对修订后的专家共识进行第二轮投票撰写过程进行投票组建本共识专家团队收集肝癌多组学研究和临床实践中的常见问题组建专家团队有针对性的文献综述形成共识草案第一轮讨论及投票修订共识第二轮讨论及投票共识框架引言肝癌多组学检测的技术与方法1.1基因组学【推荐意见1-3】1.2表观遗传学【推荐意见4-6】1.3转录组学【推荐意见7-9】1.4蛋白质组学【推荐意见10-12】1.5代谢组学【推荐意见13-14】共识分为5个章节，共提出22条推荐意见多组学检测在肝癌诊疗临床实践中的应用2.1早期筛查【推荐意见15】2.2辅助诊断【推荐意见16】2.3指导治疗决策和识别治疗靶点2.3.1指导治疗决策【推荐意见17】2.3.2识别治疗靶点【推荐意见18】2.4复发预测【推荐意见19】2.5预后评估【推荐意见20】2.6基于人工智能的多组学建模【推荐意见21】2.7多组学数据库和可视化平台的搭建【推荐意见22】肝癌多组学检测面临的挑战与限制未来展望情况说明一、如何理解这类专家共识？新兴领域（如新技术、新疾病亚型、跨学科交叉方向）的核心矛盾是“实践需求先于研究证据”——临床/行业亟需指导，但高质量研究（如RCT、系统评价）需要时间积累，此时专家共识的价值在于：对于前沿/新兴领域缺乏现有证据支撑的专家共识，可从学术价值逻辑和期刊接受度两方面理解：1.填补证据空白：通过整合领域内权威专家的临床经验、行业洞察和逻辑推理，为当前无明确证据的问题提供“最合理的临时方案”（而非“最终结论”）；

2.引导后续研究：共识中会明确“证据缺口”（如“本共识基于专家经验，需未来前瞻性研究验证”），为后续科研指明方向；

3.符合学术规律：学术进步本就有“从经验到证据”的过程（如早期抗生素应用、新型靶向药的初始临床指导），规范的专家共识是这一过程的关键桥梁。情况说明二、期刊会有异议吗？期刊的核心关注不是“有没有证据”，而是“共识的形成是否严谨”：对于前沿/新兴领域缺乏现有证据支撑的专家共识，可从学术价值逻辑和期刊接受度两方面理解：

•可接受的情况：若共识遵循规范方法学（如德尔菲法、专家论证会、利益冲突声明）、专家代表性强（覆盖多学科/机构）、明确标注证