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文档简介
实验室常用配制之二2007-06-0109:40:53大中小六、核酸及蛋白质常用数据1核苷三磷酸的物理常数化合物 分子量 max(pH7.0) 1摩尔溶液(pH7.0)中max时的最大吸收值 OD280/OD260ATP 507 259 15400 0.15CTP 483 271 9000 0.97GTP 523 253 13700 0.66UTP 484 262 10000 0.38dATP 494 259 15200 0.15dCTP 467 271 9300 0.98dGTP 507 253 13700 0.66dTTP 482 267 9600 0.712常用核酸的长度与分子量核酸 核苷酸数 分子量DNA 48502(双链环状) 3.0107pBR322 4363(双链) 2.810628SrRNA 4800 1.610623SrRNA 3700 1.210618SrRNA 1900 6.110519SrRNA 1700 5.51055SrRNA 120 3.6104tRNA(大肠杆菌) 75 2.51043常用核酸蛋白换算数据(1)重量换算1g=10-6g 1pg=10-12g1ng=10-9g 1fg=10-15g(2)分光光度换算:1A260双链DNA=50g/ml1A260单链DNA=30g/ml1A260单链RNA=40g/ml(3)DNA摩尔换算:1g 100bp DNA=1.52pmol=3.03pmol末端1g pBR322 DNA=0.36pmol1pmol 1000bp DNA=0.66g1pmol pBR322=2.8g1kb双链DNA(钠盐)=6.6105道尔顿1kb单链DNA(钠盐)=3.3105道尔顿1kb单链RNA(钠盐)=3.4105道尔顿(4)蛋白摩尔换算:100pmol分子量100,000蛋白质=10g100pmol分子量50,000蛋白质=5g100pmol分子量10,000蛋白质=1g氨基酸的平均分子量=126.7道尔顿(5)蛋白质/DNA换算:1kb DNA=333 个氨基酸编码容量=3.7104MW蛋白质10,000MW蛋白质=270bp DNA30,000MW蛋白质=810bp DNA50,000MW蛋白质=1.35kb100,000MW蛋白质=2.7kb DNA4常用蛋白质分子量标准参照物(1)高分子量标准参照 (2)中分子量标准参照(3)低分子量标准参照肌球蛋白 分子量 磷酸化酶B 97,400 碳酸酐酶 31,00肌球蛋白 212,000 牛血清白蛋白 66,200 大豆脻蛋白酶 21,500-半乳糖甘酶B 116,000 谷氨酶脱氢酶 55,000 抑制剂 磷酸化酶B 97,400 卵白蛋白 42,700 马心肌球蛋白 16,900牛血清白蛋白 66,200 醛缩酶 40,000 溶菌酶 14,400过氧化氢酶 57,000 碳酸酐酶 31,000 肌球蛋白(F1) 8,100醛缩酶 40,000 大豆脻蛋白酶 21,500 肌球蛋白(F2) 6,200 抑制剂 肌球蛋白(F3) 2,500 溶菌酶 14,400 5常用DNA分子量标准参照物DNA/Hind DNA/EcoR /Hind+EcoR pBR322/Hae23130 21226 21227 587 1239416 7421 5148 405 1046557 5804 4973 504 894361 5643 4268 458 802322 4843 3530 434 642027 3530 2027 267 57564 1904 234 51125 1584 213 21 1375 192 18 974 184 11 831 124 7 564 125 续上表pBR322/Hinf 174/Hinf 174/Hae 174/Tap1631 726 140 1353 2914517 713 118 1078 1175506 553 100 872 404396 500 82 603 327344 417 66 310 231298 413 48 281 141221 311 42 271 87220 249 40 234 54154 200 24 194 3375 151 118 20 72七、常用凝胶的技术参数1葡聚糖凝胶的某些技术数据种类干颗粒直径()分子量分级范围床体积毫升/克干分子筛得水值 溶胀最少平衡时间(h)柱头压力(kPa)(2.5cm直径柱)肽及球形蛋白质 葡聚糖(线性分子) 室温 沸水浴Sephadex G-10 40 120 700 700 2 3 1.00.1 3 1 Sephadex G-10 40 120 1500 1500 2.53.5 1.53.5 3 1 Sephadex G-25 粗级 100300(5100目) 中级 50150(100200目) 1,0005,000 1005,000461.50.262细级 20800(200400目) 超细 1040 Sephadex G-50 粗级 100200 中级 50150 1,500 500 细级 2080 30,000 10,000 911 5.00.3 6 2超细 1040 Sephadex G-75 40120 3,000 1,000 超细 1040 70,000 950,000 1215 7.50.5 24 3 3.9215.86Sephadex G-100 40120 4,000 1,000 超细 1040 1,500,000 150,000 1520 10.01.0 48 5 2.359.41Sephadex G-150 40120 5,000 1,000 2030 超细 1040 400,000 150,000 1822 15.01.5 72 5 0.883.53Sephadex G-200 40120 5000 1000 3040 1040 800,000 200,000 2025 20.02.0 72 5 0.391.572.聚丙烯酰胺凝胶的技术数据型号 排阻的下限(分子量) 分级分离范围(分子量) 膨胀后的床体积(ml/g干凝胶) 膨胀所需最少时间(室温,h)Bio-gel-P-2 1,600 2002,000 3.8 24Bio-gel-P-4 3,600 5004,000 5.8 24Bio-gel-P-6 4,600 1,0005,000 8.8 24Bio-gel-P-10 10,000 5,00017,000 12.4 24Bio-gel-P-30 30,000 20,00050,000 14.9 1012Bio-gel-P-60 60,000 30,00070,000 19.0 1012Bio-gel-P-100 100,000 40,000100,000 19.0 24Bio-gel-P-150 150,000 50,000150,000 24.0 24Bio-gel-P-200 200,000 80,000200,000 34.0 48Bio-gel-P-300 300,000 100400,000 40.0 483琼脂糖凝胶的技术数据型号 琼脂糖含量%(W/W) 排阻的下限(分子量) 分级分离的范围(分子量) 生产厂家Sepharose 4B 4 0.31063106 PharmaciaSepharose 2B 2 210625106Sagavac 10 10 2.5105 11042.5105SeravacSagavac 8 8 7105 2.51047105Sagavac 6 6 2106 51042106Sagavac 4 4 15106 210515106Sagavac 2 2 150106 510515107Bio-gel A-0.5M 10 0.5106 11040.5106Bio-RadBio-gel A-1.5M 8 1.5106 11041.5106Bio-gel A-5M 6 5106 11045106Bio-gel A-15M 4 15106 410415106Bio-gel A-50M 2 50106 110550106Bio-gel A-150M 1 150106 11061501064各处凝胶所允许的最大操作压凝胶 最大静水压(kPa)Sephadex G-10 9.8G-15 9.8G-25 9.8G-50 9.8G-75 4.95琼脂糖凝胶浓度与线性DNA分辨范围凝胶浓度(%) 线性DNA长度(bp)0.5 1000300000.7 800120001.0 500100001.2 40070001.5 20030002.0 5020006染料在变性聚丙烯酰胺凝胶中的迁移速度凝胶浓度(%) 溴酚蓝 二甲苯青FF50 35bp 140bp60 26bp 106bp80 19bp 75bp100 12bp 55bp200 8bp 28bp7染料在非变性聚丙烯酰胺凝胶中的迁移速度凝胶浓度(%) 溴酚蓝 二甲苯青FF3.5 100bp 460bp5.0 65bp 260bp8.0 45bp 160bp12.0 20bp 70bp15.0 15bp 50bp20.0 12bp 45bp七、氨基酸的特性氨基酸名称 三字母缩写 单字母缩写 质量 侧链电离的pHa值 结构式丙氨酸(alanine) Ala A 89.09 精氨酸(arginine) Arg R 174.2 12.48 天冬酰氨(asparagine) Asn N 132.1 天冬氨酸(aspartic acid) Asp D 133.1 3.86 半胱氨酸(systeine) Cys C 121.12 谷氨酰胺(glutamine) Gln Q 146.15 谷氨酸(glutamic acid) Glu E 147.13 4.25 甘氨酸(glycine) Gly G 75.07 组氨酸(histidine) His H 155.16 6.0 异亮氨酸(isoleucine) lle I 131.17 亮氨酸(leucine) Leu L 131.17 赖氨酸(lycine) Lys K 146.19 甲硫氨酸(methionine) Met M 149.21 苯丙氨酸(phenylanaline) Phe P 165.19 脯氨酸(proline) Pro P 115.13 丝氨酸(serine) Ser S 105.06 苏氨酸(threonine) Thr T 119.12 色氨酸(tryptophan) Trp W 204.22 酪氨酸(tyrosine) Tyr Y 181.19 10.07 缬氨酸(valine) Val P 117.15 八、遗传密码密码子的第二位密码子的第一位(5端) U C A G 密码子的第三位(3端)U UUU Phe UCU Ser UAU Tyr UGU Gys UUUC Phe UCC Ser UAC Tyr UGG Gys CUUA Leu UCA Ser UAA 终止(赭石) UGA 终止(乳白) AUUG Leu UGG Ser UAG 终止(琥珀) UGG Trp GC CUU Leu CCU Pro CAU His CGA Arg UCUC Leu CCC Pro CAC His CGC Arg CCUA Leu CCA Pro CAA Gln CGA Arg ACUG Leu CCG Pro CAG Gln CGC Arg GA AUU Ile ACU Thr AAU Asn AGU Ser UAUC Ile ACC Thr AAC Asn AGC Ser CAUA Ile ACA Thr AAA Lys AGA Arg AAUG Met ACG Thr AAG Lys AGC Arg GG GUU Val GCU Ala GAU Asp GGU Gly UGUC Val GCC Ala GAC Asp GGC Gly CGUA Val GCA Ala GAA Glu GGA Gly AGUG Val GCG Ala GAG Glu GGG Gly G九、常用酸碱技术参数1常见的市售酸碱的浓度溶质 分子式 分子量 mol/L g/L 重量(%) 比重配制mol/L溶液的加入量(ml/L)冰乙酸 CH3COOH 60.05 17.40 1045 99.5 1.050 57.5乙酸 60.05 6.27 376 36 1.045 159.5甲酸 HCOOH 46.02 23.40 1080 90 1.200 42.7盐酸 HCl 36.50 11.60 424 36 1.180 86.2 2.90 105 10 1.050 344.8硝酸 HNO3 63.02 15.99 1008 71 1.420 62.5 14.90 938 67 1.400 67.1 13.30 837 61 1.370 75.2高氯酸 HclO3 100.50 11.65 1172 70 1.670 85.8 9.20 923 60 1.540 108.7磷酸 H2PO4 80.00 18.10 1445 85 1.700 55.2硫酸 H2PO4 98.10 18.00 1776 96 1.840 55.6氢氧化铵 NH4OH 35.00 14.80 251 28 0.898 67.6氢氧化钾 KOH 56.10 13.50 757 50 1.520 74.1 1.94 109 10 1.090
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