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文档简介
Internet 生物医学信息资源及其检索,主要内容,概述 类型 特点 指南及引擎 2.Internet生物医学数据库及其检索,1.Internet生物医学信息资源,INTERNET,概述,Internet上的信息资源极其丰富,内容及表现形式多样化; Internet上的生物医学信息资源占30左右; Internet上的信息资源的分布方式: E-mail、 WWW 、 FTP及Gopher,INTERNET,类型,根据以下四种分类标准进行划分: 1按内容的组织和表现形式分: 2按提供网络服务的方式分: 3按信息资源的来源分: 4按生物医学主题(学科或疾病)划分:,INTERNET,Internet生物医学信息资源的特点,1.信息源丰富; 2.组织形式多样化; 3.更新速度快; 4.检索方式灵活; 5.动态变化,管理困难; 6.规范化程度不高。,INTERNET,Internet信息资源检索的方法,人们已经考虑到了网络资源的特点,在Internet上建立了各类资源导航或指南或专门帮助用户查找网上资源的搜索工具搜索引擎(Search engines)。 搜索引擎:是一种能够通过Internet接受用户的查询指令,并向用户提供符合其查询要求的信息资源网址的系统。,INTERNET,一般主题指南及引擎,大部分搜索引擎既允许用户按它们对WWW资源的分类一层一层地浏览网上信息,还允许用户输入任意检索词检索网站及文献,所以这些搜索引擎兼备导航和检索的双重功能。 1.Alta Vista () 2.Yahoo () 3.Google () 4.SCIRUS ( 5.Webcrawler ( 6.搜狐(SOHU) () 7.天网 ( 8.百度 (),INTERNET,医学主题指南及引擎,Internet上除提供大量的一般主题指南和搜索引擎外,还有许多站点专门提供医学主题指南和搜索引擎。当然,一般主题指南和引擎也可用于检索或浏览Internet上的医学信息资源的站点。 1.MedScape ( 2.MEDguide () 3. Natural healthweb ( 4. MedExplorer () 5.Medwebplus (),INTERNET,Google简介,由两个斯坦福大学博士生Larry Page与Sergey Brin于1998年9月发明。 约搜索30亿张网页,包括35个国家和地区的资源。 已占有全球搜索市场的80%。Google 在中国的搜索市场的市场份额也已突破30%,并且增长速度迅猛,在中文搜索市场有举足轻重的作用。 -(mcculloch pitts 1943),文献类型,Google特点,布尔逻辑:+;-;OR 高级搜索:site,link,intitle,allintitle , inurl,allinurl 。 查找PDF文件,filetype:pdf 每日要点、本地搜索、查询优化、参考工具、按数字搜索、选择关键字 使用帮助中借助“Google大全”,Google Scholar学术搜索,Google 学术搜索提供可广泛搜索学术文献的简便方法。Google 学术搜索可帮助您在整个学术领域中确定相关性最强的研究。 优点:学科范围广、检索方便灵活、链接功能强 缺点:检索功能比不上数据库。,.hk/,Google Scholar文献类型,期刊论文 学位论文 专业图书 预印本 文摘 技术报告,Google Scholar检索方法,简单检索 高级检索,简单检索,高级检索,高级操作符,“+” 操作符:确保您的搜索结果中包括 Google 学术搜索技术通常忽略的普通字词、字母或数字,如+de knuth; “-” 操作符:排除所有包括搜索字词的结果,如 Flowers -作者:Flowers ; 短语搜索:包括这一确切短语的结果,如 “非小细胞肺癌“; “OR” 操作符:包括搜索字词之一的结果,如 哮喘 OR 咳嗽; “标题”操作符:如在标题:mars 得到的结果只包括文件名中的搜索字词。,Google Scholar其它检索功能,判断文献的学术参考价值 判断学科的研究现状及趋势 追踪学者的科研活动,对其学术地位进行评价,INTERNET 生物医学数据库,Internet生物医学数据库,一次文献数据库:电子期刊全文数据库 二次文献数据库:PubMed 循证医学数据库:Cochrane library 生物信息学数据库:,INTERNET,PubMed,数据库概况 数据来源 数据库检索原理 检索方法及技巧,INTERNET,PubMed概况,1.创建机构:美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI) 2.类型:Web数据库 3.网址: 4.特色:具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点,部分文献还可在网上直接免费获得全文。 5.与Medline光盘数据库的区别:检索机制、检索界面、检索方法以及收录文献数量不同。,INTERNET,PubMed数据来源,1.MEDLINE:包括OLDMEDLINE 2.In Process Citations:每天收录,尚未经规范处理的数据。 3.Publisher-Supplied Citations:由出版商提供的电子文献,每条记录标有PubMed-as supplied by Publisher。,INTERNET,PubMed检索机制,1自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping) 对于输入的检索词,PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换,再进行检索。词表匹配转换顺序是:MeSH表(MeSH Translation Table)、期刊刊名表(Journal Translation Table)、短语表(Phrase list)、作者索引(Author Index)。如果在以上4个表中都找不到相匹配的词,PubMed将把短语分开,以单词为单位,分别重复以上的过程,检索时各个词之间是AND逻辑关系。 2短语检索(Phrase Searching) 也可称为强迫词组检索,即,如果要将短语作为一个词组进行检索,可用双引号“ ”将其引起来。如:“drug therapy”作为词组进行检索的词,系统不进行自动转换匹配,也不进行MeSH词的扩检。,INTERNET,1.逻辑运算符: 逻辑与:AND,逻辑或:OR,逻辑非:NOT。当一个检索表达式中同时含有三个运算符时,运算顺序从左至右,括号可以改变运算顺序。 2.截词符:*,一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符,chem*表示用词根进行检索。 3.双引号:“ ”,表示对引号中的短语进行检索。 4.检索字段标识符:tag,tag为字段名称。 ti,au,ta,so,la,pt。,PubMed检索运算符,INTERNET,常用字段组成,标识符 字段名称 TI Title AU Author AD Affiliation AB Abstract DP Publication Date EDAT Entrez Date SO Source TA Journal Title Abbreviation MH MeSH Terms PT Publication Type,INTERNET,检索界面,基本检索界面 高级检索界面,INTERNET,高级检索,附加功能,PubMed检索方法,1.基本检索:在基本检索界面下完成的检索方法 2.高级检索:主要完成特定文献、限定检索、特定字段、其他资源的检索方法,INTERNET,基本检索,1.关键词、词(词组)或短语: 2.作者:Smith JS 或 Smithau 3.期刊刊名:GENE THERAPYTA,JAMATA 4.截词:CHEMO* 5.复杂表达式:CANCER AND THERAPY,INTERNET,基本检索,INTERNET,INTERNET,1.修改检索式: (1)直接在检索词输入框中换检索词 (2)在检索结果右侧区, 区来进行修改后,再检索,高级检索,1.检索历史显示 2.特定文献检索 3.限定检索 4.特定字段索引检索 5.其它资源,INTERNET,检索历史显示,特定文献检索,限定检索,1.全文、摘要的限定 2.特征词(人类、动物、性别、年龄) 3.文献类型 4.语种 5.数据库子集,INTERNET,限定检索,限定检索,日期没有限定选项,可通过字段标识符实现 Date of publicationDP原始文献出版日期 Entrez DateEDAT文献首次录入PubMed日期 MeSH DateMHDA文献被MeSH词条标引日期,INTERNET,特定字段索引检索,其他检索功能,1.预检索及浏览索引检索:Preview/Index 2.主题词浏览检索:MeSH Database 3.引文匹配器(Citation Matcher) 4.临床查询(Clinical Queries),INTERNET,预检索,INTERNET,主题检索,从基本检索界面和高级检索界面选择 MeSH Database或MeSH,在线查找主题词,主题词输入检索,主题检索中-组配后检索,检索结果,主题检索小结,1.可以同时选择多个主题进行逻辑组配检索 2.每个主题词逐个检索,并可选择好福主题词进行组配,添加到检索框中 3.有两个主题词组配检索时,注意选择Send to 4.点击 按钮才能进行主题检索,INTERNET,检索结果,显示 保存 打印,INTERNET,显示格式选择,保存检索结果,检索策略的存储和调用,使用My NCBI(Cubby) 首先要登记注册 保存检索策略 定期浏览新的检索结果,INTERNET,其它功能,全文链接 相关文献链接 相关数据库的链接 RSS阅读器的使用,INTERNET,检索练习,1.题目中有青霉素G的原文为英文的综述文献 2.眼结核引起失明的文献(比较基本检索和主题词检索的结果) 3. 微量元素缺乏与皮肤病发病关系研究 4.查找韩济生老师发表在神经科学上发表的文章,INTERNET,Internet网免费的 开放电子期刊,开放获取的概念,OPEN ACCESS(OA)的定义: 任何人都可以即时、免费、不受任何限制地通过互联网获取各类文献,包括经过同行评议的期刊文章、参考文献、技术报告、学位论文等等的全文信息,用于科研、教育及其他目的。,学术论文的出版模式,1. 2. / 3.美国国家科学数字图书馆(The National Science digital library,NSDL,/) 4.法国国家图书馆的数字图书馆Gallica 2000 (http:/gallica2.bnf.fr/?&lang=EN ) 5. 乌利希国际期刊指南 6./(新英格兰医学杂志的主页) 7.http:/www.cmaj.ca(加拿大医学会期刊) 8. 9. http:/www.medical- 10. 11.科学公共图书馆(Public Library of Science,PLoS) 12.瑞典Directory of Open Access(DOAJ) 13.日本电子科学与技术信息集成JSTAGE(http:/www.jstage.jst.go.jp/browse/-char/en ),常用免费获取期刊全文的网址,freemedicaljournals, 收录了1825种期刊,按照学科分73个类目,字顺和语言进行查找文献。,斯坦福大学,/ 检索方法: 1.快速检索:作者、关键词及年、卷期页码 2.学科分类浏览 3.刊名字顺浏览,美国国家数字图书馆,法国国家图书馆数字图书馆项目,乌利希期刊指南,科学公共图书馆 医学类,日本开放获取期刊,查阅全文的方法,首先利用google来查询,方法:直接输入论文题目 1. Yurong Hu, Kun Li, Lei Wang, et al. Pegylated immuno-lipopolyplexes: A novel non-viral gene delivery system for liver
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