常用专业性软件在化学化工中的应用.doc

常用专业性软件在化学化工中的应用 姜红波( 宝鸡文理学院 地理科学与环境工程系，陕西 宝鸡 721013)摘 要 针对目前多种化学化工软件，简单介绍常用的化学办公、绘图、数据处理、图谱解析等软件在化学化工方面的应用。关键词 化学化工 软件 应用计算机作为一种化学化工教学和研究的重要的工具，在当今社会具有不可替代的作用，在信息技术 飞速发展的今天，有关化学化工的软件非常多，涉及 到化学化工的各个方面，简单介绍常用的化学办公、 绘图、数据处理、图谱解析等软件的应用。轮廓图及分子轨道特性分析，并和数种量子化学软件结合在一起。由于 Chem3D 提供完整的界面及功能， 已成为分子仿真分析最佳的前端开发环境1。ChemFinde 模块 化学信息搜寻整合系统，可以建 立 化 学 数 据 库、储 存 及 搜 索，或 与ChemDraw、Chem3D 联合使 用，也可以使用现成的 化 学 数 据 库。ChemFinder 是一个智能型的快速 化 学 搜 寻 引 擎，所 提供的 ChemInfo 信息系统是目前世界上最丰富的数 据 库 之 一，包 含 ChemACX、ChemINDEX、ChemRXN、ChemMSDX，并不断有新的 数 据 库 加 入。ChemFinder可以 从本机或网上搜寻 Word、Excel、Powerpoint、 ChemDraw 和 ISIS 格式的分子结构文件。还 可 以 与 微软的 Excel 结合，可连结的关连式数据库包括 Ora- cle 及 Access，输入的格式包括 ChemDraw、MDL ISIS SD 及 RD 文件。有关化学办公软件市面上很多，各有其优缺点，当前国内外流行的 Chem Office 系 列 软 件，美 国 剑 桥 公司最 新 版 本 ChemOffice Ultra 2008 是 世 界 上 最 优 秀的桌面化学办公软件，集强大的应用功能于一身，该软件主要包括 ChemDraw( 化学绘图) ，Chem3D( 化学分子模拟及仿真) 、ChemFinder( 化学信息搜寻整合 系统) 等一系列完整 的 软 件。 此 外 还 加 入 了 E Notebook Ultra 10 0，BioAssay Pro 10 0，量 化 软 件的 界 面，ChemSAR，MOPAC、GaussianGAMESS和Server Excel，CLogP，CombiChem / Excel 等 等，Che-mOffice Pro 还 包 含 了 全 套 ChemInfo 数 据 库，有 Che- mACX 和 ChemACX SC，Merck 索引和 ChemMSDX。 其中 ChemDraw 具 有 简 单 易 懂、画 图 快、结 构 精 确特点，是世界上最受欢迎的 化学结构绘图软件之 一，是各种期刊杂志要求的化学结构绘图软件，可以 将化合物名称直接转为结构图，省去绘图的麻烦; 也可以对已知结构的化合物命名，给出正确的化合物名称; Chem3D 分子轮廓及分子轨道特性 分 析，可 以 和 多种离子化软件结合使用; 提供工作站级的 3D 分子Visio2003 是一种专业的化工绘图软件，它 可 以帮助用户创建系统的业务和技术图表，说明复杂的流 程或设想，展示结构或空间图，此软件可将用户的信 息形象化、并能简单有效的输出。Visio2003 中文版软件可以直接读入的图件 ( 笔者将图形和图像合称为图件) 类型主要有 vsd ( Visio文件) 、svg ( 可缩放的向量 图 形) 、dwg ( AutoCAD 绘 图) 、jpg( JPEG 文件交换格式) 、tif ( Tag 图像文件格式) 、bmp ( Windows 位图) 、png ( 可移植网络图形) 、收稿日期: 2011 01 062化工绘图软件1化学办公软件gif ( 图形交换格式) 、emf ( 增强型图元文件) ; 但在实际操作中，由于不同版本软件不完全兼容，并且许多 作者常将 各 种 类型的图件混排于 Word 文 档 中，而 Visio 与 Word 软件之间具有良好的兼容性，所以常用 “复制粘贴法”把图件读入到 Visio 中。此外，由于系 统共用一个剪贴板，所以对于只能用其他专业软件打 开的图件也可用“复制粘贴法”将选中的图件直接读 入到 Visio 中，在任何图件被读入 Visio 后，右键点击 图件，将指针指向快捷键对话框中的“形状”，并在下 一级选项中选择“取消组合”，将该图件各元素分开， 以便于逐个 编 辑2。Visio 自 带 的 图 形 模 板 库 绘 制， 点击标题栏中的“文件”指向“新建”，在其下一 级 选 单中可看到各种模板，选中所需要的模板图形，按住 鼠标左键直接将其拖曳到工作区界面，就可很方便地 进行绘制或修改各类图件。价方法，因而在解析大分子结构时比传统的基于 FFT法的大分子解析方法要慢得多，适于所有的空间群和 各种类型的结构。极性轴限制与特殊位置限制可以 自动的产生。该程序可以处理孪晶、复杂无序、绝对 构型判定、CIF 和 PDB 文件输出，还可以为困难精修 控制提供大量不同的限制方法。SHELXPRO 界面程 序可以输出大 分 子 的 PS 格 式 图 片 产 生 map 和 其 他 广泛大分子 程 序 采 用 的 格 式。辅 助 程 序 CIFTAB 利 用 cif 文件产生小分子结构精修结果列表。在收集参考文献过程中，采用文献管理系统可有效的收集、整理、插入参考文献，提高文献利用率，常 用的有 EndNote4、Reference Manager 和 ProCite 等。EndNote4 是著名的参考文献查找和引用管理软 件，拥有上百万用户。能实现主题书目在线查找，灵 活的图片管理5。该软件支持 Palm OS，以灵活移动 收集的参考文献。此软件的优点: 根据杂志的要求自 动生产参考文献，所以在写文章的时候你再也不要考 虑如何根据杂志的要求进行排版了; 随时调整参考文 献的格式。使用这些软件可以在需要的时候随时调 整参考文献的格式; 方便自己查找文献。可以把自己 读过的参考文献全部输入到 Endnote 里头，这样在查 找的时候就非常方便。计算机软件的应用是计算机学科在化学化工领 域中的最主要应用之一，它不仅解决了化学计算中的 复杂问题，而且利用虚拟的程序把化学世界的微观结 构、光谱形态等形象地展现出来，为人们提供了直观 展示出来。化学化工数据处理软件种类繁多，不同的数据可采用不同的 处 理 软 件，如 Origin、Sigm aPlot 等，其 中 应用最广泛 的 是 Origin 系 列，目 前，Origin 最 新 版 本 为 8 0。该软件主要特点: 使用简单，采用直观的、图 形化的、面向对象的窗口菜单和工具栏操作，全面支 持鼠标右键、支持拖方式绘图等。两大类功能: 数据 分析和绘图。数据分析包括数据的排序、调整、计算、 统计、频谱变换、曲线拟合等各种完善的数学分析功 能。准备好数据后，进行数据分析时，只需选择所要 分析的数据，然后再选择响应的菜单命令就可3。Origin 的绘图是基于模板的，Origin 本身提 供 了 几 10 种二维和三维绘图模板而且允许用户自己定制 模板。绘图时，只要选择所需要的模版就行。用户可 以自定义数学函数、图形样式和绘图模板; 可以和各 种数据库软件、办公软件、图像处理软件等方便的连 接; 可以用 C 等高级语言编写数据分析程序，还可以 用内置的 Lab Talk 语言编程等。参考文献1曾炜，孙延辉，李红霞 ChemOffice 2008 实用教程: 化 学结构绘图、分子模拟、数据整合M 北 京: 化 学 工 业 出 版社，2009彭智，陈悦 化学化工常用软件实例教程M 北京: 化 学工业出版社，2009方安平 Origin 8 0 实用指南M 北京: 机械工业出 版 社 2009陈昊鸿，译 晶体结构解析晶体 学 者 的 SHELXL 软 件指南M 北京: 高等教育出版社，2010吕维忠，刘 波，韦 少 慧 化学化工常用软件与应用技术 M 北京: 化学工业出版社，200623红外、核 磁、质谱及晶体等专用的解析软件，如SHELXL、Wingx、Chem NMR 等，SHELXL 是为晶体结 构精修而编写的程序，虽可以解析尺寸在 0 25 nm 及 更大的大分子化合物数据的结构，但主要是为了处理 小分子结构而编写的4。由于采用综合结构因子评454解析软件3数据处理软件5文献管理软件file:/D|/我的资料/Desktop/新建文本文档.txtAppliance Error (configuration_error)Your request c