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文档简介

RT-PCR步骤RNA提取(-80保存)1. 取50-100mg组织加入1ml Trizol,剪碎,振荡30s2. 转入一新EP管中(1.5ml),室温保存5min3. 加氯仿0.2ml,振荡混合(手摇剧烈),室温放置5min4. 12000 rpm 4离心15min5. 转移上层水相(吸70%)到一新EP管中,加异丙醇0.5ml,振荡混合,室温保存10min6. 12000rpm 4 离心15min7. 倒掉上清,加1ml 75%无水乙醇(4保存),振荡混合,7500rpm 4 离心5min8. 倒掉上清,室温或37放置20min(EP管倒置在滤纸上)使RNA沉淀干燥9. 加20ul DEPC水至EP管中10. 在50孵育3-5min(或手握3-5min),使RNA充分溶解注意:操作过程中带手套口罩,所用到的仪器设备须经去除RNA酶处理(灭菌或DEPC水浸泡)测RNA浓度(以750ul体系为例)11. 调零:750ul DEPC水12. 测量:745ul DEPC水 + 5ul RNA13. 总RNA浓度= OD26040稀释倍数(150倍)ug/ml14. = OD26040150 ug/ml15. = OD2606 ug/ul16. A260/A280应在1.8-2.0之间逆转录(cDNA:一周内-20保存,长期-80保存)方法一:以通用试剂盒为例,反应体系20ul1. RNA短暂离心2. RNA模板0.5-2ug,再加入Oligo(dt) 1ul,加DEPC水补齐至10ul.轻轻混合均匀,短时间离心3. 将反应液置于65 5min 冰上1min,短时间离心4. 按顺序加入:5buffer 4ul200ul核糖核苷酸酶抑制剂 0.5ul 10mm dNTP MIX 1ul逆转录酶 1ulRNase-free H2O 3.5ul 轻轻混合均匀,短时间离心5. 将混合物置于37,60min6. 75加热15min,中止上述反应,置于冰上注意事项1. RNA提取和逆转录时所用器具均应在1DECP水中避光浸泡过夜,再高压烘干2. DECP水配制(先加DEPC,再加水,避光过夜,然后高压)3. 75%无水乙醇配制(DEPC水:无水乙醇=1:3)4. RNA提取和逆转录时应全程佩戴一次性手套和口罩聚合酶链反应PCR(产物-20保存)方法一:125ul的反应体系,冰上操作,稍后短时间离心Template 1ul/3ulPrimer 1 1ulPrimer 2 1ul10*Taq Buffer 5uldNTPs(10mM) 1ulTaq酶 1ulddH2O 补至25ul (9.5ul/7.5ul)2.PCR循环: 94 5min 94 45s Tm+4 45s 72 45s 2 29-34 (从第2步开始循环30-35个循环) 72 10min 4 12hPCR结束后-20保存或置于冰上开始电泳。退火温度计算 2(A T) 4(G C) 正反义平均数,再上下波动度(4,或5)引物

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