分子生物学课程思考题.doc

第二章总结 基因的概念，基因的形式 DNA的一级结构、二级结构、高级结构 DNA复制的基本概念和法则、复制相关的酶、蛋白质 真核生物、原核生物DNA复制的基本过程及其调控 复制的方式（线性、环状DNA） DNA的损伤类型与修复 DNA的重组、同源重组的过程、相关酶、应用 DNA的转座与返座、真核生物原核生物转座元的种类 转座的机制、遗传学效应等Question:1名词：基因、基因组、C值、C值矛盾、splicing gene、 exon、 intron、 DNA的呼吸现象、转座元、返座元、 nick translation、replisome、DNA复制、基因敲除、转座子标签、pseudogene（假基因）、klenow酶2简述DNA复制的基本法则及复制过程中涉及的酶和蛋白质（以E.coli为例）。3基因有哪些存在形式、真核生物DNA序列有哪些种类？4DNA超螺旋的计算。5简述线性和环状双链DNA复制的方式。6试说明DNA损伤的类型及其修复机制。7DNA重组的种类、同源重组的基本过程、相关的酶及其功能。8简述原核及真核生物转座元的种类及其结构。9 果蝇杂种败育的机理。10转座元的应用及其遗传学效应。11生理状态下DNA有哪些二级结构，其特点如何？12简述顺反实验的基本原理及其应用。第三章3.1. Basic concept（转录的基本原则；转录复制的比较）3.2. Trancription survey（转录的基本概况过程、RNApol）3.3. Promoter in Eukaryotes and Prokaryotes（promoter 结构，及各部分的作用；原、真核生物的比较）3.4. Transcription Termination（终止子结构、种类；抗终止作用；极性效应等）3.5. Pre-RNA processing in Eukaryotes（加工rRNA 、tRNA 、hnRNA的加工；原、真核生物mRNA的比较）Question:1 名词：trans splicing 、alternative splicing、 enhancer、 terminator、 promoter、S-D sequence、read through、gRNA、RNA editing、Ribozyme2 转录的基本过程，试比较生物体复制与转录的异同3原核生物RNApol的基本构成及各亚基的功能4真核生物RNApol 的种类及各自的转录产物5原核生物一般的gene promoter结构特点及各部分的功能6真核生物启动子的种类与各自的结构7终止子种类及异同；终止机制如何？8极性效应的产生机理9真核生物、原核生物mRNA的异同10真核生物hnRNA加工的种类11RNA splicing的基本机理（三种）第四章4.1 genetic codons遗传密码的特性、密码子偏爱、密码子配对的摆动性、mRNA的突变4.2 Translation systemtRNA：结构、校正突变、氨基酸的活化Ribosome：构成组分、活性部位及其功能mRNA：结构4.3 Translation mechanism多肽合成的基本过程原核生物多肽合成的机制：定点起始、延伸、终止真核生物：滑动搜索、起始、延伸、终止4.4 Peptide processing & folding蛋白质的运输：翻译后转运（导肽、NLS、NES）、 共翻译转运（信号肽）蛋白质加工：非功能片断切除、修饰、剪接等蛋白质折叠：折叠机制、分子伴侣、PCD等思考题1.名词：密码子家族、同功tRNA、同义密码、错义突变、密码子、 无义突变、同义突变、渗漏突变、S-D序列、Kozake序列、 ORF、 molecular chaperone、多核糖体、蛋白质剪接、intein、extein2.遗传密码的特性3.蛋白质中稀有氨基酸的形成方式有哪些？4.叙述发生在氨酰tRNA合成酶上的两个反应。5.叙述蛋白质合成三个阶段的主要事件6.试比较真核生物、原核生物翻译过程中的异同（起始方式、涉及的蛋白质因子的作用、起始氨酰tRNA等）7.判断下列过程发生在蛋白质合成的哪个阶段/A核糖体亚基与mRNA结合B多肽被正确合成C核糖体沿着mRNA移动D核糖体解离成亚基 8.估计一下原核生物中合成200个AA需要多少个ATP和GTP？9.翻译因子中GTP的作用10.举例说明翻译后的氨基酸修饰11.SD序列和30S亚基的配对为原核提供了识别起始密码子和Met密码子的机制，那么真核如何办呢？ 12.描述SRP的结构和功能13.假设一个典型的分泌蛋白要被分泌到胞外，描述一下细胞内的加工过程。 14.要用一个多肽的一级结构来预测它的高级结构，主要的困难和问题在那里？15.叙述分子伴侣在蛋白质折叠中的作用。16.保证准确翻译的关键是什么？ 氨基酸与tRNA的特异性结合依靠氨酰tRNA合成酶的特异识别作用。密码子与反密码子特异结合，依靠互补碱基配对结合实现，也有赖于核糖体的构象正常而实现正常的装配功能。17.真核生物蛋白质主要有哪些去向？其转运方式有哪些，基本过程如何？18.胰岛素的加工步骤如何？19.mRNA的结构如何影响翻译的调控20.简述蛋白质剪接的基本过程及其应用。 21.（综合）如果得到一个真核生物的基因的ORF，现需要在大肠杆菌中表达，为达到最佳的表达效率，应考虑对该ORF做哪些改造？如果是原核生物基因在真核表达体系中表达呢？（如B.T杀虫蛋白在棉花中表达）22.蛋白质折叠的研究有哪些意义？第五章总结：1原核生物表达调控： 操纵元模型结构、功能、种类及相关概念 各种操纵元的调控方式乳糖、半乳糖、色氨酸、ara等 转录后调控严谨反应、翻译起始的调节、反义RNA、翻译产物的自我调节等 转录调节中sigma因子的作用2、真核生物表达调控 DNA水平的调控甲基化及其效应、活性染色体特点、结构等 反式作用因子的结构、DNA结合结构域的结构 RNA水平的调控RNAi、NMD、ncRNA的种类及其作用 基因与疾病癌症的发生机理及相关基因、基因治疗的原理、流程等思考：1、名词解释cis-acting element,trans-acting factor housekeeping gene,luxury gene,Gratuitous inducer ,inducer,operon,repressor,Corepressor,attenuater,癌基因,抑癌基因,RNAi,gene imprinting,肽核酸(PNA),micRNA,严谨反映,空转反应,互补,regulon,本底组成型表达,LCR,insulator2、下列哪项不是真核生物基因结构的特点 A、庞大 B、分散 C、有内含子 D、90%以上DNA序列编码蛋白质3、属于顺式作用元件的是 内含子 启动子 外显子 增强子4、关于操纵元的正确叙述是 操纵子是一个转录单位，全部DNA序列均可被转录 RNA聚合酶与启动子结合 RNA聚合酶与操纵基因结合 操纵基因控制RNA聚合酶是否通过5、葡萄糖/乳糖共同存在时，细菌优先利用哪一种糖，为什么？6、lac-O存在哪些调控方式？其调节基因的效应物分子是什么？7、试以lac-O为例说明什么是顺式作用元件和反式作用因子；该操纵元在基因工程上有什么应用？8、根据调节蛋白和效应物分子对操纵元转录的作用可分为哪些种类？说明调节蛋白与效应物分子在不同类型的操纵元中的作用。9、操纵元的结构与各部分的功能。10、真核生物活跃转录染色质的结构特点如何？11、甲基化对真核生物DNA的转录活性有什么效应？12、简述RNAi，RNAi的作用特点如何？RNAi的研究有什么意义？13、癌症发生学说有哪些？14、基因治疗的基本原理如何？试说明其基本流程，及操作中应注意的问题。15、试举例说明真核生物个水平的基因表达调控16、转录因子由哪两部分构成？17、反式作用因子的DNA结合结构域有哪些结构？18、组蛋白的修饰有哪些？19、RNA有哪些种类？它们有什么功能？第六章思考：1、名词解释：RFLP、RAPD、AFLP、SNP、变性、复性、Tm值、分子杂交、反向遗传学2、DNA复性时的影响因素有哪些？3、Tm值的影响因素有哪些？4、试说明DNA chip的基本原理及其应用5、核酸分子杂交