「如何查看一段序列的蛋白质结构」.doc_第1页
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文档简介

1. 首先，根据所获得基因序列在/orffinder/上查找相关的阅读框2. 选择ORF1后进行标记，直接点击下载相关序列，获得的相关序列后在/interactive上同源比对，上传后直接build model即可。3.这个是你自己的序列产生的3d图，在右上角下载的文档里面是不包含的，需要自己下载。比对后，可以直接下载pdb文件，也可以在邮箱中把整套文件下下来。Pdb文件可以用swiss-pdbviewer直接打开查看，可以看到该蛋白序列的3d简单的结构，在这里可以对蛋白质进行各种调试和修改，具体个人慢慢摸索即可。3. 在这里我们可以利用软件查找蛋白质结构上的位点，在edit-searcher for parasite patterns即可得到该蛋白质所含的位点。在wind，将control panel调出来后，点击proslist的相关位点就可以查看其在蛋白质中的位置以及在序列的位置。3仅供借鉴
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