LAMMPS如何在windows编译步骤.doc

LAMMPS如何在windows编译步骤（翻译 整理 Lammps 上海大学上海市应用数学与力学研究所，版权所有，据最新版06年6月份的，原说明在SRC/MAKE/WINDOWS目录下）2004/11/20（该方法由Jin Ma（Okalahhoma State University ）给出，联系Jin.M）编译环境为微软windows的VC+6.0，不带MPI（并行处理）和FFT算法。创建一个空的win32控制台工程（win32 console project），添加Src目录下所有的.h文件和.cpp文件到工程。1.变量的重定义问题代码中约有80处地方，变量出现重定义问题。大部分都出现在循环过程中，可以很容易修正。例如这样的循环： for （int i=0; i5; i+） something for (int i=0; i5 ;i+ something else 这种情况在Linux下的g编译环境中是允许的，但是在VC环境中会认为第二次循环时变量i被重定义，因此变量的范围是不同的。这在代码中有很多，因此在编译错误修正时只需要把定义整形变量i的定义放在语句中，而不是放在循环体中。2.fft问题在文件fft3d.h的开头增加#ifndef FFT_NONE#define FFT_NONE#endif取消FFT功能的编译，即不编译文件3. input文件的修改在input文件中修改下面的语句/#include unistd.h (注销)#include direct.h （增加）4. 处理MPI问题把文件mpi.h 和 mpi.cpp（在STUBS目录内）包括进工程中来，并且在mpi.cpp文件中注释掉语句/#include （和Linux系统下的取时间有关，windows不支持）同时注释调所有和时间有关的语句，即函数MPI_Wtime()中的原始代码，保持函数格式，让内容为空，并给予返回值为0(return 0;)5. 创建系统文件system.cpp的修改由于输入说明列表在linux和windows下的某些不同，在文件中system.cpp作如下修改行 83 : int iarg = 2; （修改，默认输入的问题）行 172 : inflag=1;（增加改行 不知道原因暂时）（原因：因为在dos行命令下运行程序时，给出的变量数目在G+环境和VC+环境中有所不同，也可能和MPI相关，这个不同只是其中之一，一旦上面说的修改成功，程序输入命令的个数才正确）之后2005年1月修改。4-a 输入文件问题(由Tim Lau补充, MIT, 在variable.cpp文件中进行修改头文件/#include unistd.h#include direct.h#include windows.h另外修改 usleep(100000)为 Sleep(100)修改说明：因为当Sleep发生在毫秒时而usleep发生在微妙，所以这个值被1000分开。（不明白何意思）7. 新版erfc错误新版本的LAMMPS程序会调用下列函数而报错double erfc(double)，该函数属于GNU 的C库函数，在VC环境是不存在的。有三种修改方法： 一从其他的库中寻找到函数erfc() 二是因为该函数是被pair_modify 表选项调用的，我们可以在该函数的表选项中把值设为0,避免调用该函数 三是自己动手写该函数补充：在新版的目录下有这样的两个文件erfc.h, erfc.cpp已经被加入到工程中，只需要在所有使用到erfc()函数的文件头中增加调用命令#include erfc.h即可。注意这两个函数为经仔细测试，需谨慎使用。8. 重建工程，指定正确的输入文件运行程序，windows下的结果可能会和unix环境的结果有所不同，请注意。（Jin Ma Oklahoma State University March 7, 2005）最近增加：如果要增加MPI和FFT，则如下(由Timothy Lau 联系ttlMIT.EDU给出，相关步骤参考之前的说明如果你想使用FFT，先在载源码FFTW 2.1.5，然后解压（dump）全部的文件到和LAMMPS相同的目录下，然后包括所有FFTW的文件（.c文件和.h文件）到工程中，接下来修改上述第三个关于FFTW的问题。在文件fft3d.h中修改为#ifndef FFT_FFTW#define FFT_FFTW#endif你必须小心的检查visual stidoe 编译中关于 “WIN32”变量的定义，尽管visual studio可能会自动定义它，涉及到文件 fftw.h的行137处。如果你还要增加MPI功能，即在微软visual vistdo环境下的，多核处理器或者windows结点结构（cluster）并行机上运行程序。已经知道MPICH 2（至少是IA32版）在visual环境下可以和lammps编译成功。代替上述步骤中第5个问题的修改，用户可以增加MPICH2include目录（该目录在用