马铃薯品种遗传多样性分析

作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2017 43 5 718 729 http zwxb chinacrops org ISSN 0496 3490 CODEN TSHPA9 E mail xbzw 本研究由国家科技支撑计划项目 2012BAD02B05 和国家现代农业产业技术体系建设专项 CARS10 资助 The work was supported by the National Key Technology Support Program of China 2012BAD02B05 and the China Agriculture Research System CARS10 通讯作者 Corresponding author 金黎平 E mail jinliping 第一作者联系方式 E mail duanshaoguang Received 收稿日期 2016 10 18 Accepted 接受日期 2017 01 21 Published online 网络出版日期 2017 02 20 URL DOI 10 3724 SP J 1006 2017 00718 马铃薯品种遗传多样性分析 段绍光 金黎平 李广存 卞春松 徐建飞 胡 军 屈冬玉 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 农业部薯类作物生物学和遗传育种重点实验室 北京 100081 摘 要 为解析一套 559 份 从世界各国收集的马铃薯种质资源的遗传多样性 用 16 个表型性状和 36 个 SSR 标记进 行了聚类和多样性参数分析 对 454 份表型数据完整材料的 UPGMA 聚类分析表明 在欧氏距离 14 66 处被聚成 2 个类群 A1和 A 其中 A1在欧氏距离 12 74 处被分为 A11和 A12亚群 454 份材料在欧氏距离 11 73 处被划成 9 个类 群 包括 4 个小类 A B C 和 H 和 5 个大类 D E F G 和 I 其中类群 I 所包括的材料占总数的 57 5 该结果 较好地揭示了马铃薯种质材料之间的形态差异 区分生态类型不同和遗传差异明显的亲本 36 个 SSR 标记在 559 份 材料中共检测出 134 个多态性位点 每对引物检测 1 7 个等位变异 平均 3 72 个 引物多态性信息量 PIC 为 0 1545 0 7743 平均为 0 5783 说明品种间有丰富的遗传多样性 NJ 系统进化树分析表明 559 份材料可分为 3 个大 群 类群 I 为一个混合群 各地区品种均有分布 包括 133 份马铃薯材料 占总数的 23 8 类群 II 中欧洲 北美及 中国东北和西北地区的材料所占比重较大 数量为 187 占 33 5 类群 III 中北美 南美以及中国东北和西南地区马 铃薯材料所占比重较大 包含 239 份材料 占 42 8 表型性状聚类与 SSR 分子标记聚类结果相似 均与地理位置有 很大相关性 应结合共同用于评价马铃薯品种遗传多样性 关键词 马铃薯 种质资源 农艺性状 SSR 遗传多样性 Genetic Diversity Analysis of Potato Varieties DUAN Shao Guang JIN Li Ping LI Guang Cun BIAN Chun Song XU Jian Fei HU Jun and QU Dong Yu Institute of Vegetables and Flowers Chinese Academy of Agricultural Sciences Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Tuber and Root Crop Ministry of Agriculture Beijing 100081 China Abstract This study aimed at disclosing the genetic diversity of 559 potato accessions that were collected from different coun tries The UPGMA cluster analysis was conducted in 454 accessions according to 16 phenotypic traits All the accessions were grouped into clusters A1 and A at the Euclidean distance of 14 66 The cluster A1 was further grouped into subclusters A11 and A12 at the Euclidean distance of 12 74 The 454 accessions were grouped into nine clusters A B C H D E F G and I at the Euclidean distance of 11 73 in which the biggest one cluster I accounted for 57 5 of 454 accessions The clustering analysis showed diverse morphology and ecological distribution in this set of potato materials particularly distinguished the parental ma terials with obvious genetic difference The whole 559 accessions were also analyzed with 36 pairs of SSR primers and a total of 134 polymorphic alleles were amplified A single SSR marker detected 1 7 alleles with the mean of 3 72 The polymorphic in formation content value PIC ranged from 0 1545 to 0 7743 with the mean of 0 5783 indicating abundant genetic diversity in this set of potato germplasm In the phylogenetic tree based on Neighbor Jointing method the 559 accessions were clustered into three groups Group I was a mixed collection with 133 accessions 23 8 from various regions Group II 187 accessions 33 5 was gathered mainly by accessions from Europe North America and Northeast and Northwest China Group III consisted of 239 ac cessions 42 8 mainly from North America South America and Northeast and Southwest China In this study geographic distributions of the 559 potato accessions are clear and consistent in clustering analyses by morphologic and SSR markers there 第5期 段绍光等 马铃薯品种遗传多样性分析 719 fore the combination of phenotypic traits and molecular markers are recommended in evaluating genetic diversity of potato re sources Keywords Potato Germplasm Agronomic trait SSR maker Genetic diversity 马铃薯及其近缘种分布于美国南部到南美洲南 部的广大地区 1 3 拥有极其庞大的次级基因库 倍性 从二倍体到六倍体均有覆盖 种质资源十分丰富 4 我 国初期的马铃薯资源引进 搜集始于 20 世纪 30 年 代 5 随着与国外合作的日益深入 我国的马铃薯种 质资源数量和种类得到了很大的改善 中国农业科 学院蔬菜花卉研究所保存了 1500 余份马铃薯材料 包括马铃薯审定品种 国外引进品种 育种品系 野生种和二倍体单株等种质资源 基本可以代表我 国整体的马铃薯种质资源组成 当今作物育种工作因遗传基础狭窄已进入瓶颈 从长远的角度来讲 如果不改变这种局面 作物会 更易遭受病虫害的侵袭 6 7 农艺性状和分子标记是 育种家获取不同马铃薯资源间遗传差异的两种途 径 其中 形态学水平上的变异是最易观察的 对农 艺性状的观察和分类在早期的马铃薯种质资源研究 中是马铃薯分类学的主要研究方法之一 目前 中 国的 马铃薯 DUS 测试指南 仍以形态性状测试为 主 该书详细规定了用于品种鉴定的表现型及其观 测时期 当前马铃薯育种以形态评价为主 分子标记 辅助选择仅在少数抗病性状上使用 8 因此 开展马 铃薯种质资源表型性状亲缘分析的研究是必要的 基于 PCR 的 SSR 标记以其数量丰富 共显性遗 传 多态性丰富等优点现已被广泛应用于马铃薯的 品种鉴定 遗传关系分类 核心种质资源搜集评价 等领域 如段艳凤 9 利用 11 对 SSR 引物构建了 217 份中国育成马铃薯品种的指纹图谱 并进行了遗传 多样性分析 Haan 等 10 利用 15 对 SSR 引物对比了 989 份来自秘鲁中部的地方品种和 173 份外迁地方 品种 共检测到 173 个等位位点 其中 129 个为 2 个 群体所共享 占总数的 74 6 Sharmab 等 11 结合使 用 SSR RTN 等 3 种 DNA 分子标记 对 47 份马铃 薯品种进行多态性分析比较 表明 3 种标记均可区 分 47 份品种 然而 存在的问题或是上述研究所用 的材料数量少 或是对当前的马铃薯资源组成不具 有系统的代表性 本研究利用保存的包括国内育成品种以及从欧 洲 北美和 CIP 等地区和国际研究机构引进的 559 份材料 从表型性状聚类及分子标记检测等两方面 系统研究 了解中国现有马铃薯栽培种的遗传多样 性 为拓宽我国马铃薯育成品种遗传基础提供参考 1 材料与方法 1 1 试验材料 共收集马铃薯品种材料 559 份 包括中国育成 品种 239 份 来自北美 美国和加拿大 的马铃薯品 种 101 份 来自欧洲的育成品种 75 份 来自国际马 铃薯中心 CIP 的材料 108 份 选取小叶子 米拉 燕子 卡它丁 疫不加 早玫瑰 中薯 18 DM1 3 516 R44 等 8 个由系谱分析获得的遗传差异大且具 有广泛代表性的品种进行 SSR 引物筛选 于河北省 张北县试验基地种植 每份材料 5 株 株行距为 30 cm 75 cm 559 份材料用于 SSR 标记分析 16 个表型性状较全的 454份材料用于表型性状的亲缘 分析 1 2 田间性状调查 田间调查 16 项性状 包括叶片性状 复叶大小 小叶密集程度 小裂叶数量 叶片颜色深浅 小叶 大小和小叶宽度 花冠性状 花冠大小 花冠花青素 和花冠形状 块茎性状 薯形 表皮颜色 薯肉颜色 和芽眼深浅 块茎品质 比重和炸片颜色 和成熟 期 参考 马铃薯 DUS 测试指南 的分级标准 表 型性状数据经标准化处理后 用 SPSS11 0 软件进行 UPGMA 聚类分析 1 3 马铃薯基因组 DNA 的提取与扩增 采摘新鲜的 未感病虫害的马铃薯幼嫩叶片 采用改良的 CTAB 法提取基因组 DNA PCR 扩增体 系为 10 L 包括模板 DNA 2 L 10 缓冲液 1 L dNTPs 10 mol L 1 each 0 2 L 上下游引物各 0 2 L Taq 酶 0 2 L ddH2O 6 2 L 扩增程序为 94 预变性 5 min 94 变性 30 s 退火 30 s 72 延伸 20 s 30 个循环 72 延伸 7 min 用 6 非变性聚丙 烯酰胺凝胶电泳检测扩增产物 并用硝酸银染色观 察结果 采用 0 1 系统记录谱带位置 观察某一扩 增条带的有无 有带记为 1 无带记为 0 1 4 SSR 引物来源与筛选 所用 SSR 引物共 975 对 其中一部分来自于公 开发表的文献 另一部分根据已经完成的马铃薯全 基因组序列设计开发 根据引物序列信息比照测序 基因组数据对所有引物进行染色体定位 选取能够 720 作 物 学 报 第 43 卷 定位到马铃薯 12 条染色体上的引物 利用 8 份遗传 差异大并具有广泛代表性的材料进行筛选 选择谱 带清晰 多态性较高的 SSR 引物进行后续的自然群 体筛选 引物均由上海生工生物工程技术服务有限 公司合成 1 5 数据处理和分析 根据 SSR 标记数据 利用 NTSYS 2 11 软件 采 用 Jaccard s 相似系数计算两两品种间的遗传相似系 数 得到相似系数矩阵 利用 NTSYS pc 2 11 软件分 析遗传多样性 Simpson s 多样性指数也称位点多态 信息量 PIC PIC 1 fi2 每个位点的有效等位基因 数为 Ne 1 Pi2 fi为基因座位上第 i 个等位基因变异 出现的频率 借助生物分析软件 PowerMarker V 3 25 构建临接系统进化树 Neighbor joining Tree NJ 参 数为缺省 2 结果与分析 2 1 基于表型性状的聚类分析 根据 454 份国内外马铃薯材料 16 个表型性状的 UPGMA 聚类结果 图 1 在欧氏距离 14 66 处所有 参试材料可以被聚成 2 个类群 类群 A1是一大类 包括 452 份材料 类群 A 只包括无花和甘农薯 2 号 在欧氏距离 12 74 处类群 A1又可以被分为 2 个亚群 A11和 A12 在欧氏距离 11 73 处全部参试材料可以 被聚成 9 个类群 包括 4 个小类 A B C 和 H 和 5 个大类 D E F G 和 I 其中类群 I 所包括的材料 占总数的 57 5 在欧氏距离 8 65 处该类群又可分 为 7 个亚类 I1 I7 其中较大的亚类 I2在欧氏距离 7 34 处又可以进一步分为 7 个组 I VII 引自国际 马铃薯中心的 105 份材料中的 10 份被集体聚于类群 E 35 份被集体聚于类群 D 而且被聚于这 2 个类群 内的材料距离都很近 49 份被集体聚于类群 I 且多 数材料在数量上呈现两两及以上扎堆存在的局面 且来源于国际马铃薯中心引进材料的合作系列品种 合作 001 合作 001 合作 003 和合作 23 与国际马 铃薯中心 CIP 材料的距离也较近 而类群 F 以西南 品种为主 中原二作区等早熟品种主要聚在类群 I 结果表明聚类分析可以较为准确地揭示马铃薯不同 材料之间的形态差异 进而区分生态类型不同和遗 传差异明显的亲本 2 2 SSR 标记多态性分析 经过对 SSR 引物的比对 975 对引物中的 332 对 成功地被定位到马铃薯的 12 条染色体上 采用染色 体位置明确的 332 对 SSR 引物 对遗传背景和田间 性状差异较大的 8 个品种材料进行初步筛选 得到 36 对扩增谱带清晰 条带差异明显的 SSR 引物 36 对引物均匀分布于马铃薯 12 条染色体上 每条染色 体上引物数量 2 5 对 表 1 使用筛选出的 36 对 SSR 引物 对 559 份马铃薯 材料进行 SSR 分析 扩增结果显示 36 对引物共检 测出 134 个等位变异 引物等位位点数为 1 7 平均 每对引物 3 72 个 其中 引物 PM0890 有效等位基 因数最多 最少的为引物 STM1049 和 SSR15406 36 对引物扩增的产物大小为 106 308 bp 多态性信 息量 PIC 的变化范围为 0 1545 0 7743 平均值为 0 5783 其中引物为 SSR15406 的 PIC 最低 引物 PM0890 的 PIC 最高 PIC 值所对应的引物和多态性 位点所对应的引物是一致的 可以反映较丰富的遗 传多样性信息 2 3 基于 SSR 标记的聚类分析 图 2 所示 559 份不同来源的马铃薯品种总体分 为 3 个大群 类群 I 是一个混合群 各地区品种均有 分布 包括 133 份马铃薯材料 占总数的 23 8 类 群 II 中欧洲 北美以及中国东北和西北地区的材料 所占比重大 该类群包括的材料数量为 187 所占比 例为 33 5 类群 III 中北美 南美以及中国东北和 西南地区马铃薯材料所占比重大 其包含的 239 份 材料占供试 559 份材料的 42 8 以上 3 个大的类 群又可以细分为数量不同的小类群 类群 I 可以再 分为类群 I 1 和类群 I 2 类群 II 可以再分为类群 II 1 类群 II 2 和类群 II 3 类群 III 可以再分为类群 III 1 类群 III 2 和类群 III 3 类群I 1是一个小的混合群 含有31份材料 各 地区材料占比比较均匀 代表品种为鄂马铃薯 4 号 类群 I 2 是一个大的混合群 含有 102 份材料 各地 区材料占比比较均匀 代表品种为燕子 虎头 坝薯 10 号均聚在这一类 而中国的中原二作区和冬作区 早熟品种多聚在这一类 如费乌瑞它 郑薯 2 号 春秋 7 号 克新 18 等 中国农业科学院蔬菜花卉研 究所育成的中薯系列品种也多聚在这一类 包括中 薯 1 号 中薯 5 号 中薯 6 号 中薯 9 号 中薯 17 和中薯 19 类群 II 1是北美加工类群 包含45份材料 代表 品种为 Belchip 美国和加拿大的多份加工品种 系 均聚在这一类 类群 II 2以欧洲以及中国东北和西 北的育成品种 系 为主 包含91份材料 世界范围内 第5期 段绍光等 马铃薯品种遗传多样性分析 721 图 1 722 作 物 学 报 第 43 卷 图 1 第5期 段绍光等 马铃薯品种遗传多样性分析 723 图 1 参试 454 份马铃薯材料基于 16 个表型性状的聚类结果 Fig 1 Dendrogram of 454 materials based on 16 phenotype traits 724 作 物 学 报 第 43 卷 第5期 段绍光等 马铃薯品种遗传多样性分析 725 726 作 物 学 报 第 43 卷 图 2 供试 559 份材料的 SSR 临接系统进化树 Fig 2 Neighbor Joining tree based on dissimilarity matrix of 559 potato accessions examined with 36 microsatellite primer pairs 北美 欧洲 CIP 其他 中国东北 中国华北 中国西北 中国西南 中国冬作中原 IVF North America Europe CIP Others Northeast China North China Northwest China Southwest China Winter cropping Central Plain IVF 很多育成的重要品种均聚在这一类 如早玫瑰 抗 疫白 克疫 白头翁 克新 1 号 东农 303 陇薯 3 号 青薯 2 号等 类群 II 3 为南美和欧洲类群 包含 51 份材料 代表品种有米拉和 Spunta 等 类群 III 1 是南美和北美类群 这一群含有南美 48 份材料 代表品种 392633 54 B3C1 和 Snowden 另外具有 CIP 血缘的冀张薯 8 号 中薯 20 合作 002 合作 23 云薯 401 鄂马铃薯 5 号 川凉薯 5 号等 均聚在这一类 类群 III 2 为北美 欧洲和南美类群 这一群含有北美 29 份材料 代表品种小叶子 夏波 蒂 大西洋 Red Pontiac 和欧洲的 Pentland Dell 类 群 III 3 是中国的东北和西南类群 包含 63 份材料 代表品种有火玛 卡它丁 春薯 2 号 内薯 7 号 云 薯 101 凉薯 30 以及一些老品种 如圆叶青 一墩 青 系薯 1 号等 3 讨论 3 1 马铃薯表型性状聚类分析的总体评价 从本研究的结果来看 表型性状的聚类分析可 以较为准确地揭示马铃薯不同材料之间的形态差异 进而区分生态类型不同和遗传差异明显的亲本 这 与徐敏 13 的研究结果相似 例如 类群 D 中的材料 绝大多数的成熟期很晚 花冠的性状为近五边形 小叶比较大 类型 E 中材料的复叶较大 花冠大小 第5期 段绍光等 马铃薯品种遗传多样性分析 727 中等 小裂叶数量多等 因此 在马铃薯杂种优势 的利用过程中 对于杂交组合双亲表型性状不同的 配制方式来说 表型性状聚类分析具有一定的参考 价值 马铃薯的表型性状是由其遗传信息和生长环境 条件共同决定的 且易受后者的影响 且马铃薯同 源四倍体高度杂合的特性也决定了表型聚类分析只 能从一定程度上反映不同材料的形态差异 并不能 从本质上体现马铃薯的遗传差异 在本研究中得到 了很好体现 如云薯系列中的云薯 101 云薯 102 云薯 201 和云薯 302 是全同胞的关系 均是杂交组 合 S95 105 内薯 7 号的后代 但这 4 个品种之间的 距离并没有预期那样近 前三者虽然均被聚在了 I 这一大类群的 I2亚类群 但却均不属于同一组 云薯 101 属于 III 组 云薯 102 属于 IV 组 云薯 201 属 于 II组 而云薯 302甚至没有被聚在类群 I 而是被 聚在了距离很远的 F 组 此外 考虑到可供调查的 马铃薯表型性状很多 不同的研究采用不同性状进 行聚类分析时 得到的结果也可能是不同的 从系谱 来看 威芋 3 号和凉薯 14 的亲缘关系很近 徐敏 13 利用调查得到的 20个表型性状的数据 部分表型性 状与本研究不同 确实将这 2 个品种聚在了一起 而且距离很近 相邻 但在本研究中 2 个品种却分 别被聚在了类群 I 中的亚类群 I2和亚类群 I3 由此 可见 该种聚类方法难以确定马铃薯品种间的遗传 本质 前人在其他作物的研究中也得到了类似的结 果 14 15 另外 对于诸如形状大小和颜色深浅等这 样的性状 调查者的主观因素比较大 容易产生误 差 进而产生不同的聚类结果 因此 表型性状聚类 分析可以作为分子标记聚类分析的互补而发挥应有 的作用 3 2 SSR 标记马铃薯资源聚类分析的总体评价 考虑到多态性信息量 PIC 对于衡量 SSR 引物 多态性高低的重要性 Botstein 等 16 通过将 PIC 数值 划分为 3 个区间 PIC 0 5 0 25 PIC 0 5 和 PIC 0 25 来对应引物多态性程度的高 中和低 以此来衡量 基因变异程度的高低 本研究从 332 对引物中筛选 出 36 对 其 PIC 值变幅为 0 1545 0 7743 其中引物 SSR15406 和 STM1049 的 PIC 小于 0 25 为低度多 态性信息引物 STM1058 STG0026 PM0938 STM2022 STM1106 PM0355 和 PM0678 等 7 对引 物 PIC 值在 0 25 0 50 之间 属于中度多态性信息引 物 其余 27 对引物的 PIC 值均大于 0 5 属于高度多 态性信息引物 比例占到了 75 表明本研究所筛 选得到的 36 对引物能较高信息量地反映中国马铃 薯资源整体的基因型多样性水平 再加上这些引物 均匀地分布于马铃薯基因组的 12 条染色体 反映了 其整套染色体的遗传信息 16 因此 该 36 条 SSR 引 物可以作为系统分析马铃薯种质资源遗传多样性的 有效分子标记 作为对比 Ghislain 等 17 采用 156 对 SSR 引物对属于 8 个分类群的 930 份马铃薯栽培种 材料进行了遗传多样性分析 其 PIC 的变幅为 0 280 0 892 即是以 PIC值这单一指标粗略对比 也 能够说明四倍体马铃薯栽培种的基因池并没有因为 现代育种的影响而变窄 这在之前的研究中也有提 及 18 结合系谱分析和 SSR 分子标记分析 除了可以 明显区分马铃薯栽培种和野生种 同时还可以将多 数具有血缘关系的材料划分到一个类群 同一系列 的品种 中薯系列多数分布在 I 2 类群 克新系列多 数分布在 II 2 类群 云薯系列多数分布于 III 3 类群 亦趋向于分布在同一类群 这说明各育种单位对某 些具有优良祖先亲本的品种利用频率过于集中 造 成育成的品种亲缘关系较近 遗传基础狭窄 应加 强品种亲本的多样性 当然 这其中也存在一些品 种聚类与已知系谱数据不一致 如中薯 5 号是从中 薯 3 号实生种子选育而来 但二者并没有在同一类 群 这可能是由于36对SSR引物位点对于整个基因组 而言很有限 应用更多的标记将会减少这种不一致性 同时这还可能是由马铃薯栽培品种之间的遗传基础狭 窄造成的 19 21 相对于传统的系谱分析 19 22 23 应用分 子标记来估计遗传关系将为马铃薯育种提供更多的 信息 本研究中 按照材料的来源我们将材料区分成 了北美 欧洲 CIP和中国国内等4个主要的地区 参 照中国马铃薯品种审定的区域试验地域的划分及育 种单位的分布 将中国材料的来源又分为东北 华 北 西北 西南 冬作 中原和中国农业科学院蔬菜 花卉研究所 6 个区域 SSR 标记分析结果将所有材 料分为了 3 个大类群 又细分为 8 个小的类群 但 我们发现除了欧洲地区之外 所有区域内的材料基 本是在 1 2 个大类群内或是 1 4 个小类群内扎堆出 现 基本没有在8个类群较均匀分布的情况 这也说 明马铃薯资源的遗传基础相对狭窄 马铃薯育种中 应注重利用具有遗传多样性丰富的种质资源 并在 亲本选配时选择遗传距离较远且综合性状差异大的 728 作 物 学 报 第 43 卷 种质材料 24 3 3 表型性状聚类与 SSR 标记聚类结果比较 本研究结果表明 表型性状聚类与 SSR 分子标 记聚类结果相似 均与地理位置有很大相关性 例 如来自 CIP 的类群 D 主要就聚在了类群 III 1 中 来 自中原二作区的早熟品种如早中薯 5 号 中薯 6 号 鲁马铃薯 3 号 德薯 2 号和春秋 7 号等表型聚类在 类群 F SSR分子标记聚类在类群 I 2 但表型聚类与 SSR 聚类结果又有一定差异 如同样多是来自 CIP 的材料在表型聚类中被聚在类群 E 在 SSR 聚类中 却被分散在各个类群中 产生这种结果的原因可能 是由于表型性状是基因表达和所处环境共同作用的 结果 表型聚类的原始数据随环境因素不同易出现 变化 且数据采集过程中人为因素也会产生误差 因此表型性状不能完全真实反应物种的遗传多样性 而 SSR 标记则是以基因组为研究对象 不受环境影 响 相对稳定 因此表型性状与分子标记的结果存 在一定差异 但表型差异与遗传信息又具有一定的 相关性 可以结合共同用于评价马铃薯品种遗传多 样性 4 结论 表型聚类准确地揭示了马铃薯不同品种间的形 态差异 区分了生态类型不同和遗传差异明显的亲 本 SSR 遗传多样性分析反映了品种间较丰富的遗 传多样性 表型性状聚类与 SSR 分子标记聚类结果 相似 均与地理位置有很大相关性 应结合共同用 于评价马铃薯品种遗传多样性 References 1 Hawkes J G Hjerting J P The potatoes of Bolivia Their Breeding Value and Evolutionary Relationships Oxford Oxford University Press 1989 2 Bamberg J del Rio A Accumulation of Genetic Diversity in the US Potato Genebank Am J Potato Res 2016 93 430 435 3 Spooner D M Species delimitations in plants lessons learned from potato taxonomy by a practicing taxonomist J Systematics Evol 2016 54 191 203 4 Machida Hirano R Diversity of potato genetic resources Breed Sci 2015 65 26 40 5 孙慧生 陈伊里 叶超龄 种质资源与品种选育 见 黑龙江 省农业科学院马铃薯研究所主编 中国马铃薯栽培学 第4章 北京 中国农业出版社 1990 pp 78 127 Sun H S Chen Y L Ye C L Germplasm resources and breeding In Potato Research Institute of Heilongjiang Academy of Agri cultural Sciences eds Chinese Potato Cultivation Chapter IV Beijing China Agriculture Press 1990 pp 78 127 In Chinese 6 Ullstrup A J Evolution and dynamics of corn diseases and insect problems since the advent of hybrid corn In Walden D B eds Maize Breeding and Genetics New York Wiley Interscience 1978 pp 283 297 7 Petra O Catherine C B Ralf S P A genetic analysis of quantita tive resistance to late blight in potato towards marker assisted selection Mol Breed 1999 5 399 415 8 Hamilton J P Hansey C N Whitty B R Stoffel K Massa1 A N van Deynze A De Jong W S Douches D S Buell C R Single nucleotide polymorphism discovery in elite north american potato germplasm BMC Genom 2011 12 302 9 段艳凤 中国马铃薯主要育成品种 SSR 指纹图谱构建与遗传 关系分析 中国农业科学院硕士学位论文 北京 2009 Duan Y F Construction of Fingerprinting and Analysis of Genetic Relationship with SSR Markers for Main Potato Cultivars So lanum tuberosum L in China MS Thesis of Chinese Academy of Agricultural Sciences Beijing China 2009 in Chinese with English abstract 10 Haan S N ez J Bonierbale M Ghislain M van der Maesen J A simple sequence repeat SSR marker comparison of a large in and ex situ potato landrace cultivar collection from Peru reaffirms the complementary nature of both conservation strategies Diver sity 2013 5 505 521 11 Sharmab V Nandineni M R Assessment of genetic diversity among Indian potato Solanum tuberosum L collection using microsatellite and retrotransposon based marker systems Mol Phylogenet Evol 2014 73 10 17 12 Herrera M R N ez J Guzman F Ghislain M Spooner D M A new potato genetic identity kit of 24 SSR markers for high throughput fingerprinting of large collections In VI International Solanaceae Conference Madison 2006 13 徐敏 中国马铃薯审定品种系谱分析及遗传多样性研究 中 国农业科学院硕士学位论文 北京 2007 Xu M Pedigree and Diversity of Approved Potato Cultivars So lanum tuberosum L in China MS Thesis of Chinese Academy of Agricultural Sciences Beijing 2007 in Chinese with English abstract 14 王胜军 陆作楣 万建民 采用表型和分子标记聚类研究杂交 釉稻亲本的遗传多样性 中国水稻科学 2006 20 475 480 Wang S J Lu Z M Wan J M Genetic diversity of parental lines in indica hybrid rice based on phenotypic characters and SSR cluster analysis Chin J Rice Sci 2006 20 475 480 in Chinese with English abstract 15 Jansky S H Dawson J Spooner D M How do we address the disconnect between genetic and morphological diversity in germ plasm collections Am J Bot 2015 102 1213 1215 16 Ghislain M Spooner D M Rodriguez F Villamon F Nunez J Vasquez C Waugh R