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文档简介
9 沉降系数和密度梯度离心对于一个质量为m的颗粒(蛋白质或核酸等其他生物分子),当放在离心力场中,例如角转头中,受到一个离心力作用fc:fcm(1v)2r其中r为处于离心管中的颗粒到转头中心的距离。为角速度(弧度/s)(2/60)RPM),RPM为转头每分钟的转数。(1v)为浮力因子,为溶液密度,而v为偏微比容(mL/g),定义为一克干物质置于无限大体积的溶剂中时溶液体积的增量。一般认为v等同于1/p,p是颗粒的有效密度。如果p等于,则没有净的力作用于颗粒上,这样的颗粒将不会沉降。颗粒的运动受到阻力(frfv)的影响,v是运动速度,而f为摩擦系数。当沉降速度达到稳定状态时,frfc,fvm(1v)2r变换一下方程,用场强去除速度,得到:Sv/2r=m(1v)/ fM(1v)/ fN其中M为分子量,N为阿伏伽德罗数,即MmN。S称为沉降系数,其单位为秒。典型的S值一般在1013s,所以该数值命名为1 Svedberg单位,简写为S,纪念离心机研究先锋Theodor Svedberg。例如,核糖体的沉降系数为701013,或简写为70S。很清楚,S值随着颗粒质量的增加而增加,但其关系不是线性关系,因为,摩擦系数与颗粒质量大小和形状都有关系。用S可以近似表示分子量。 处于离心场中的固定角转头中颗粒的受力情况由于不同大小的颗粒或分子的S不同,所以可以利用离心沉降技术将它们分开。如果是只是简单地将大的颗粒和沉淀物从分子溶液中除去,只需使用角转头低速离心就可实现。如果要将几类大分子通过离心分开,就要用蔗糖梯度离心技术。首先在离心管中制作一个蔗糖溶液的梯度,然后将样品加到梯度溶液的上面,经离心,样品中的几个成分按照它们的密度被分开。最后在离心管底部穿个孔,分部收集。 密度梯度离心22、滚环复制这种复制机制主要存在于噬菌体(如X174)中,噬菌体复制时其单链的基因组(链)在引发酶和DNA pol III作用下合成互补链(链)转换成双链环状分子,称为复制型DNA。然后复制型DNA又作为滚环复制(rolling-circle replication)的模板,生成新的单链DNA分子(图17.12)。通过这一机制合成的单链DNA被整合进新的噬菌体颗粒内。X174的DNA复制就是滚环式复制。首先一个引发体组装在模板链()链上 ,开始合成RNA引物,然后在DNA pol III作用下,引物延伸生成一个互补链()链,生成的双链DNA分子通过一个噬菌体编码的内切酶在()链上的特定部位制造一个缺口。最后在DNA pol III作用下,()链从暴露出的3羟基延伸,取代原来的()链,使()链游离出来,相当于生成一个()链的拷贝。23、D-环复制线粒体DNA的复制采取的是一种特殊的D-环(取代环)复制方式。环状双螺旋DNA在某一点解旋,开始复制。但前导链和滞后链的起点不在同一位点。首先合
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