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精品文档一RNA条带分析:要知道RNA电泳的理想带型是:1. 完整的RNA琼脂糖电泳会有三条带,某些试剂盒可能会有两条带(没有最下面的5S条带)。2. 上面两条带应该最亮,分别代表28S和18S rRNA,且第一条带(28S)亮度应为第二条(18S)亮度的约2倍。最下面一条带最淡,为5S条带。3. 如果你发现最下面一条带很亮而上两条带很淡甚至没有,那就说明你的RNA发生了严重的降解。只能重新提取了。4. 但如果仅仅是为了检测RNA的质量,没有必要进行如此麻烦的实验,用普通的琼脂糖胶就可以了。5. 一般的,如果28S和18S条带明亮、清晰、条带锐利(指条带的边缘清晰)6. 电泳的目的在于检测28S和18S条带的完整性和他们的比值,或者是mRNA smear的完整性。我们认为RNA的质量是好。二.检测RNA溶液的吸光度核酸分子中含有碱基使核酸在260nm下有最大吸收。紫外吸收是嘌呤环和嘧啶环的共轭双键系统所具有的性质,含有嘌呤和嘧啶的物质,不论是核苷、核苷酸或核酸都有吸收紫外光的特性。1.280、320、230、260nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白等有机物的值。2.一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)。a当R1.82时,说明RNA中蛋白或者其他有机物的污染是可以容忍的,不过要注意,当用Tris作为缓冲液检测吸光度时,R值可能会大于2(一般应该是2.2的)。b当R2.2时,说明RNA已经水解成单核酸了。三生物体内一般含三种主要的RNA :核糖体RNA(rRNA)、信使RNA(mRNA)、转运RNA(tRNA),其中rRNA含量最多,提取组织总RNA所得最多的就是rRNA。真核生物中含有5S、5.8S、18S、28S,原核生物中有5S、16S、23S;而植物组织中一般较多的为5S、18S、28S5S、18S、28S分别具有120、1900和4700个核苷酸。四RNA含量测定蛋白质由于含芳香族氨基酸,因此也能吸收紫外光,通常蛋白质在280nm波长有特异吸收。因此核酸在A260及A260、A280测定的比值(A260/A280)可以反映样品中核酸的含量及纯度。RNA在A260/A280的比值在2.0以上;DNA在A260/A280的比值为1.8左右。当样品中蛋白质含量较高时比值即下降。DNA浓度 (mg /ml) = A260 50 mg/ml 稀释倍数RNA浓度 (mg /ml) = A260 40 mg/ml 稀释倍数根据 DNA 或 RNA 浓度计算 DNA 或 RNA 总量 (mg),即DNA或 RNA 浓度 (mg /ml) 总体积 (ml)
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