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文档简介
聚类分析和NMDS分析的基本步骤以z q夏季重量为例1.打开primer,选择已经输入为“站位种类渔获率”矩阵的excel文件(图1)。在excel file properties对话框按照默认选项。Sample data properties对话框也按照默认选项,Title可以输入标志此表的名称。2.打开excel文件如图,注意行首名称为“samples”,列首为“variables”。Samples即聚类分析中的样本,variables即聚类分析中的指标。我们就是要把这么多种类的渔获率作为指标来分析站位间的相似性。分析哪个序列的相似性3.生成相似性矩阵。选择datasimilarity,在similarity对话框含义如图。对数据进行转变的方法,李圣法使用四次方根,但我不知道什么原因计算多位空间距离的方法选中表示在分析前对数据进行标准化,建议选中4.相似性矩阵如下:5.聚类分析:选择 analyse cluster, cluster对话框选择如图,聚类按照群组平均值结果:6.NMDS:回到相似性矩阵窗口,选择analyseMDS,全部按照默认值,ok即可。结果如下可以调整字体等来显示结果的初步分析,从cluster图可以看出有四个,那么最后可以在站点图上把每
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