医学文献检索与利用

医学文献的获取与利用,浙江大学医学院附属第一医院 邢美园Email:电话讲座主要内容,基础知识信息资源类型机检基本知识文献信息线索的获取中国生物医学文献数据库CBMMedline和Pubmed数据库全文资料的获取全文数据库及免费资源搜索引擎馆际互借,题录或文摘,刊名、年、卷、期、页,信息（文献）获取流程,期刊、图书,线索,全文,什么是真正的文献检索?,检索(retrieve)查找(search, find)有四层含义: 如何有效查找到所需文献 如何查全,查精所需文献 如何整理、归纳文献 从文献中得出有意义的结论,5S检索新理念,Select-选择合适的数据库Search-如何精确查找文献Sort-文献的筛选与归类Systematize-文献管理软件的使用 Strategy-如何从文献中发现idea?,基础篇,信息资源类型机检基础知识检索结果范围的控制,信息资源的类型,按数据类型划分：题录、文摘型数据库 如CBM、MEDLINE、PubMed等全文数据库 如万方数据库、重庆普维全文数据库、清 华学术期刊网,按载体划分印刷型检索工具： 如中文科技资料目录.医药卫生，美国医学索引等光盘数据库： 如CBM、MEDLINE等网络数据库： 如中国生物医学数据库（网络版）、万方数据库、重庆普维全文数据库、清华学术期刊网、PubMed等,信息资源的类型,按信息发布类型划分：图书期刊特种文献： 会议文献、专利文献、学位论文、标准文献、政府 报告等,信息资源的类型,2、机检基本知识,逻辑运算符运算规则检索结果范围的控制,2.1 逻辑运算符,AND, *, 与,且,并且 A AND B表达意义：检出文献中同时包含A和B的文献记录,A,B,OR ,+, 或者,或,包含 A OR B A OR B表达意义：检索文献中包含A或B，或者同时包含A和B的文献记录,A,B,A,B,2.1 逻辑运算符,NOT,-,非, 不包含 A NOT B 表达意义： 检索文献中包含A但不包含B的文献记录,A,B,2.1 逻辑运算符,2.2 运算规则,一个检索策略需多个检索词表达时，可同时运用多个逻辑符号;多个逻辑符号同时运用遵循一定的运算顺序： NOT AND OR可用（）来改变这种运算顺序.,2.3 检索结果范围的控制,扩大检索范围 多用同义词（采用OR连接） 主题词检索，采用扩展检索 检索词后加*，词中、尾加？缩小检索范围 采用NOT、AND等逻辑符号 主题词检索时选择副主题词,信息线索获取篇,中国生物医学文献数据库MEDLINE和PubMed数据库,常用的文摘型医学数据库(select),中国生物医学文献数据库（CBM）PubMed(偏重北美)Embase(偏重欧亚)Web of Science(SCI)Scifinder Scholar(CA)Biosis Preview(BA),如何确定检索词(Search),什么是主题词？为什么要用主题词？ 哪些数据库有主题词检索功能？什么是关键词？如何灵活使用关键词和主题词？,1.什么是主题词,主题词是能够表达文献主要内容的规范化名词术语.特点是采用的词语有较严格的限定。通过对一个概念的同义词、近义词及拼法变异词等进行“规范”，以保证词语与概念的一一对应，是典型的规范化语言。医学主题词表(MeSH) , 中医药学主题词表,癌,癌症,肿瘤,Cancer,cancersTumor,tumorsCarcinoma,carcinomasSarcoma,sarcomasNeoplasm,neoplasms,实体部位肿瘤:肺肿瘤肝肿瘤镜下微观:鳞状细胞癌导管癌,neoplasmscarcinoma,2.为什么要用主题词,主题词是规范化语言 ,不必操心漏检 主题词检索途径提供扩展检索功能 胰腺肿瘤腺瘤, 胰岛细胞 (+ 1)癌, 胰岛细胞 (+ 4)癌, 胰腺管主题词检索还能通过副主题词将检索词限定在某个方面,腺瘤, 胰岛细胞胰岛素瘤,癌, 胰岛细胞 胃泌素瘤 胰高血糖素瘤 生长抑素瘤 胰腺瘤,妇科主题词的扩展,流产, 人工流产, 优生流产, 合法流产, 治疗性 (+ 1)妊娠减少, 多胎,接生, 产科剖宫产术 (+ 1)会阴切开术取胎术, 产科 (+ 1)家庭分娩引产自然分娩剖宫产后阴道分娩倒转术, 胎位,3.哪些数据库有主题词检索功能,中国生物医学文献数据库MEDLINE（OVID检索平台）PubMed数据库,4.什么是关键词,关键词是能够表达文献主要内容的非规范化名词术语，通常取自原文，不作规范化处理，没有特别的限定，因而能直接取自最新文献，即时反映科学领域的新观点、新方法、新发现以及新的名词术语。缺点：但由于一个概念的不同表达多种多样，不加以限制，会使同一类文献分散，如果不能找全同义词，则很容易造成漏检。如：检索有关艾滋病的预防和控制方面的文献，艾滋病一词即存在多个同义词：爱滋病、AIDS、获得性免疫缺陷综合症，要查全艾滋病的文献，就需同时对这些词进行检索，才能保证较高的查全率。,中国生物医学文献数据库 -CBM,-数据库结构,字段 CBMdisc的记录包括以下30多个可检索字段，每个字段包含相应的内容，如地址字段，提供的是某论文第一著者的地址，根据这些字段记录内容的特色，用户可进行特定字段的检索。,文献记录示例,CBMdisc01 187/325流 水 号：2001068693分 类 号：R195; R363.273; R730.261; R739.802; R739.805.3; R977; R978.1; R979.标 题：影响平阳霉素对口腔鳞癌化疗疗效的相关临床和病理因素分析英文标题：Analysis of clinical and pathological factors for tumor response to pi ngyangmycin chemotherapy in patients with oral squamous cell carcinoma著 者：薛振恂; 张永宽; 毛天球; 顾晓明; 韩志辉; 刘桂才著者单位：西安第四军医大学口腔医学院口腔颌面外科 710032国省市名：陕西中文摘要：目的:分析影响平阳霉素对口腔鳞癌化疗疗效的相关临床和病理因素,指导临床合 理用药。方法:从我院近16年来接受平阳霉素化疗的病例中,筛选出接受平阳霉素 治疗前未接受过化疗或放疗的病例共73例,按WHO化疗疗效标准,分为有效组(38例 )与无效组(35例),对两组患者的年龄、性别、体重、肿瘤的生长部位、病理分级 、生长方式、临床分期、平阳霉素的总剂量和给药方式等进行统计分析。结果:( 1)两组患者的年龄、性别、体重、肿瘤的病理级级、生长部位、临床分期、 平阳霉素的总剂量和给药方式无显著性差异(P0.05);(2)两组病变的生长方式对 化疗疗效具有显著性差异(P1992 出版年1992 =(大于等于) PY=1992 出版年=1992 (指定范围) PY=19901992 出版年=1990-1992,(3) 范围算符,-主题词检索,医学主题词表收录了美国国立医学图书馆医学主题词表(即MeSH词表)，中国中医研究院图书情报研究所出版的中医药学主题词表中的所有词条。基于主题概念检索文献，利于提高查全和查准率,主题词选择,“副主题词”对话框,烧伤/护理的检索结果,-期刊表检索,通过“期刊导航”逐级浏览、或者直接从刊名、出版地、出版单位及期刊主题词等入口检索到期刊，即可浏览该刊的基本信息并进行检索。,期刊基本信息,投稿指南的制订,-定题检索,-检索史,实例分析,请检索浙江大学医学院附属医院发表的有关急诊护理方面的文献。（地址、主题词/副主题词，关键词）2001年以来有关临床护理路径的文献。(年份,关键词) (py=2001 and 护理路径）请检索有关视网膜脱离的手术治疗方面的文献。（主题词）请检索有关弱视的中医疗法方面的文献。（主题词）请检索有关乙型肝炎预防和控制的综述文献 肝炎，乙型扩展全部树/预防和控制 and 综述 in pt,MEDLINE光盘数据库,MEDLINE概况：美国国立医学图书馆编制，国际上最权威的医学类文摘型数据库三部分：国际护理学索引（International Nursing Index)、口腔文献索引（Index to Dental Literature)和美国医学索引（Index Medicus) 组成1994年开始，在互联网的NLM门户网站上提供了免费检索服务（PubMed)，目前网上共有30几个网站提供该数据库的免费检索服务。,PubMed数据库,数据库概况：网址：/PubMed 由美国NLM的生物技术信息中心（NCBI）开发 免费使用 部分检索结果有全文链接包括以下三部分内容： MEDLINE PubMed:indexed for medline PreMEDLINE PubMed in process 出版商提供尚未被MEDLINE和PreMEDLINE收录的数据PubMed - as supplied by publisher,Pubmed文献数据类型,检索区支持布尔逻辑符：AND、OR、NOT支持截词符*：resistan*,Pubmed使用指南,Pubmed配套检索工具,Pubmed其它资源,基本检索_ 检索规则,关键词自动匹配功能：Mesh Translation Table: MeSH转换表Journals Translation Table: 刊名转换表Phrase List: 短语列表Author Index: 著者索引字段限制检索:liver neoplasmsmesh,基本检索_检索方法,关键词检索 著者检索 刊名检索 日期检索,关键词检索,单个词或词组: stomach, stomach cancer多个词或词组: stomach cancer or stomach tumor逻辑组配: and、or、not“”、*关键词匹配转换（自动进行）字段限制检索：检索词字段名,Pubmed检索系统字段名称,格式： 姓（全称）+名（缩写） 如： Smith J,teng ls,ma zm 系统能识别该格式，并自动与著者索引进行匹配检索,著者检索,格式：刊名全称 如:American Journal of surgery刊名简称（参照IM的收编期刊表） 如: Am J Surg期刊ISSN号 如: 1002-3240系统能自动将刊名与刊名转换表进行匹配，从刊名字段中找出相匹配的记录,刊名检索,高级检索_检索实例1,肝癌肝动脉栓塞术（TACE）治疗的meta分析Hepatocellular cancerTACEMeta-analysis,读者使用的检索方法,Hepatocellular cancer and tace问题1：用词正确吗？问题2： 假如这个检索方法没问题，检索结果能表明目前这方面的meta分析尚未有人发表？,问题1,Hepatocellular cancer keyword有多少同义词没考虑到？如何查全？,主题词Liver neoplasms,问题1,TACE有全称吗？ Transcatheter Arterial Chemoembolization还有其它表达用词吗？ TAE，Transcatheter Arterial embolization有主题词吗？无,问题1,如何得到某检索词的主题词？中国生物医学文献数据库（CBM）的主题检索功能PUBMED数据库检索结果的details或search detailsPubmed有自动转换功能，如果检索词本身在主题词库中存在对应的主题词，系统会自动转换成主题词进行检索,问题2,忽略了可能已经有“关于肝癌的动脉栓塞化疗文献的meta分析”方面的研究成果#1 meta-analysis#2 systematic reviewAll Fields #3 #1 or #2,字段限定检索,高级检索_检索实例2,2000年以后用日文发表的有关Crohn病药物治疗研究的文献,综述,免费全文,检索策略详解,全文链接,甲状腺乳头状癌行甲状腺全切除术后用同位素I131治疗对血钙的影响,甲状腺全切 total thyroidectomy同位素I131 I131 imaging ，治疗 therapy血钙 calcium甲状腺乳头状癌 thyroid papillary carcinoma,Total Thyroidectomy and I131 and calciumThyroidectomy and I131 and calciumThyroidectomy and I131 and hypocalcemiaThyroidectomy and Iodine Radioisotopes and hypocalcemia,甲状腺切除术 thyroidectomy同位素I131 Iodine Radioisotopes治疗 therapy血钙 calcium甲状腺乳头状癌 thyroid papillary carcinoma甲状旁腺疾病/病因学 Parathyroid Diseases/etiologyThyroidectomy and Iodine Radioisotopes and Parathyroid Diseases/etiology,1,2,检索结果处理,File: 保存Collections:保存到My NCBIClipboard:存放到粘贴板Email:发送到邮箱Order:订购全文,系统用检索策略,定期浏览某期刊的最新目录、文摘,同理,可定期检索浏览某主题某机构的文献,全文资料获取篇,全文数据库及免费资源搜索引擎馆际互借,1、全文数据库及免费资源,电子图书重庆维普：中文科技期刊数据库万方数据资源系统：数字化期刊子系统清华同方：中国期刊网，中国知网,电子图书(select),MD CONSULTNAP电子图书可免费在线浏览下载 2500 多种电子图书NetLibrary电子图书全文内容不能下载，但允许复制和打印（一次一页） OCLC FirstSearch数据库 Ebooks Springer科技期刊和图书 (30多种),电子图书(select),Thieme彩图医学电子丛书 (43种)World Scientific 电子书(医学43种)超星电子图书 (医药卫生类近千种,较新,护理1325种):可下载到本地机或其它阅读器上方正Apabi教参书 (医药卫生类97种,旧)书生之家(护理学89种)读秀学术搜索(医药类资源丰富,护理学也挺多),书生之家,期刊全文的获取,CNKI、重庆维普、万方,EBSCO、Elsevier、 Springer,HIGHWIRE、BMC、OPEN ACCESS,PUBMED、WEB OF SCIENCE、SCOPUS,GOOGLE SCHOLAR,全文文献,中文科技期刊数据库,数据库简介： 中国科技住处研究所重庆分所研制 下属重庆维普咨讯有限公司发行 综合性文献数据库 学科范围：理、工、医、农及社会科学 收录范围：1989至今 ,个人、单位用户登录，不受IP限制,单位用户登录，受IP限制,检索途径,同义词列表,肝癌的检索结果,万方数据资源系统,数据库简介：中国科技信息研究所与万方数据公司开发，是一个综合性信息服务系统。由商务信息子系统、科技信息子系统、数字化期刊子系统和医药子系统等四个子系统组成数字化期刊子系统目前已收集了5大类70多个类目3000余种期刊的全文 网址： /,学科选择,检索命令输入区,中国期刊全文数据库,CNKI（中国知识基础设施工程）工程的一部分/目前世界上最大的连续动态更新的中国期刊全文数据库产品形式: WEB版（网上包库）、镜像站版、光盘版、流量计费 该网站提供多个数据库的免费题录检索服务,定义时间范围,定义刊源、基金资助、作者等范围,通过被引频次和下载频次的多少可以了解某篇文章学术价值！,根据学科将检索结果进行划分,只有HTML格式无PDF格式,搜索引擎,百度,“百度”二字源于中国宋朝词人辛弃疾的青玉案诗句：“众里寻他千百度”，象征着百度对中文信息检索技术的执著追求。李彦宏、徐勇于2000年1月创立2009年3月，中国互联网络信息中心(CNNIC)在京发布2008年中国搜索引擎市场广告主研究报告和2008年中国搜索引擎用户行为研究报告，其结果显示，76.9%的用户首选百度，首选谷歌的用户16.6%，雅虎的首选率仅为1.6%。,1 基本搜索,单词搜索：搜索框内输入需要查询的内容，敲回车键；或点击搜索框右侧的百度搜索按钮，就可以得到最符合查询需求的网页内容。,-基本搜索,多词搜索：不同检索词之间用一个空格隔开，多词检索可以获得更精确的搜索结果。,胃肠起搏器治疗胃食管返流病方面的相关信息,2 高级搜索,百度首页的基本检索界面，通过检索词与高级搜索语法相结合实现。需要熟练掌握百度各种查询语法及其应用（要求较高）高级搜索语法:把搜索范围限定在网页标题中（intitle），例：intitle:脑肿瘤 把搜索范围限定在特定网站中（site）， 例：护理 site:把搜索范围限定在url链接中（inurl）， 例：护理 inurl:peixun精确匹配双引号和书名号 例：“浙江大学医学院”、外科学要求搜索结果中不含特定查询词（-） 例：人猪链球菌感染 四川,/gaoji/advanced.html,高级搜索语法,对百度各种查询语法不熟悉，可以使用百度集成的高级搜索。,关键词选项,限制选项,逻辑关系说明,包含以下全部的关键词：and包含以下完整的关键词：精确检索包含任意一个关键词：or不包含以下关键词：not,限制选项,时间可以控制网页出现的时间段，选项有一天、一周、一月、一年或全部时间；语言可以选择网页的语种，有全部语言、简体中文、繁体中文三个选项；文档格式可以对检索结果的文件类型进行限制，文件类型有WORD、PDF、EXCEL、PPT等；关键词位置是限制检索词在网页中出现的位置，有任何地方、网页标题、网页URL中等；站内搜索可以把检索结果限定某个指定的网站。,高级检索可以去掉大量无用的信息，能精确地找到所需信息，提高检索效率。,文档搜索,可针对特定文档格式进行搜索文档：WORD(.doc)、PDF(.pdf)、EXCEL (.xls)、Powerpoint(.PPT)、RTF文件(.rtf),百度文档(/),论文题目,文档所在网址,文档搜索:语法,直接命令：检索词+filetype:文档格式 如: 护理教育 filetype:pdf,急诊护理的PPT课件,图片搜索(/),点击百度首页的“图片”进入Baidu图片页面输入检索词，回车如： 肝肿瘤（或肝癌）的MRI图像,百度百科,一部由全民共同撰写的百科全书。它始于2006年4月，到2009年底已收录词条1944442个。用户可以按分类浏览词条，也可以输入关键词进行查询。设有精采词条、热门词条、待创见/完善词条等栏目。,Google Scholar & SFXzjulib: Full Text,收录来自学术出版商、专业协会、预印本库和大学等方面的学术信息资源，内容覆盖同行评论的文章(peer-reviewed papers)、论文(theses)、图书(books)、预印本(preprints)、摘要(abstracts)、技术报告(technical reports)等学术文献加入计划图书馆所属的大学校园内访问 Google 学术搜索，这些链接就会自动出现。