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文档简介
ICS 65.020.30 B 40 DB32 江苏省地方标准DB32/T 36862019 山羊副流感病毒 3 型检测技术规程 Technical regulations for detection of Caprine parainfluenza virus 3 2019 -12-03 发布 2019-12-25 实施 江苏省市场监督管理局 发布 DB32/T 36862019 前言本标准按照GB/T 1.12009给出的规则起草。 本标准由江苏省农业科学院提出并归口。 本标准起草单位:江苏省农业科学院。 本标准主要起草人:李文良、毛立、李基棕、郝飞、刘茂军、杨蕾蕾、孙敏。 IDB32/T 36862019 山羊副流感病毒 3 型检测技术规程 1 范围 本标准规定了山羊副流感病毒3型(Caprine paraifluenza virus 3, CPIV3)的病原学检测(病毒核酸 的RT-PCR和荧光定量RT-PCR检测)、血清学检测(血凝抑制(HI)试验)的技术要求。 本标准适用于山羊副流感病毒3型及其感染情况的实验室检测。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。 是注日期的引用文件, 凡仅注日期的版本适用于本文件。 凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修订单)适用于本文件。 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 GB 19489 实验室生物安全通用要求 NY/T 541 兽医诊断样品采集、保存与运输技术规范 3 病原学检测 3.1 材料 微量移液器及吸头、DEPC水处理的离心管、吸头、PCR扩增管、TRIzol试剂、三氯甲烷、异丙醇、 DEPC处理水(用水符合GB/T 6682规定)、反转录酶/Taq DNA聚合酶混合液、2一步法RT-PCR反应缓 冲液、一步法荧光定量RT-PCR试剂盒、TAE缓冲液、琼脂糖、核酸染料、引物MF/MR、引物qMF/qMR 与探针(附录A)。 3.2 仪器设备 PCR 仪、荧光定量 PCR 仪、台式冷冻离心机、电泳仪和水平电泳槽、凝胶成相仪(或紫外透射仪) 。3.3 反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR) 3.3.1 样品处理与 RNA 的提取 采集羊的鼻拭子、气管拭子或肺脏(样品的采集、保存和运输应符合NY/T 541相关规定)。取200 mL待检样品液至无菌无RNA酶的EP管中,使用TRIzol试剂、RNA提取试剂盒或自动化核酸提取仪等方 法提取RNA。 3.3.2 RT-PCR 反应 RT-PCR反应使用20 mL体系:10 mL 2一步法RT-PCR反应缓冲液、引物MF/MR各0.5 mL(10 mmol/L)、0.4 mL反转录酶/Taq DNA聚合酶混合液、4 mL RNA模板,4.6 mL DEPC处理水。反应条件为: 45 反转录30 min;94 预变性2 min;94 30 s,54 30 s,72 30 s,进行35个循环;72 延伸 10 min。 3.3.3 结果判定 取PCR产物10 mL,在1.2%琼脂糖凝胶中进行电泳,在凝胶成像系统中观察结果。样品PCR检测产 物电泳后有大小为346 bp的片段判断为山羊副流感病毒3型核酸阳性,无条带判断为阴性。每次试验应 设置阴阳性对照,阴阳性对照应不出现或出现相应大小的条带。 1DB32/T 36862019 3.4 荧光定量反转录-聚合酶链式反应(荧光定量 RT-PCR) 3.4.1 核酸提取与荧光定量RT-PCR反应 核酸提取同3.3.1。荧光定量RT-PCR反应使用20 mL体系:10 mL 2一步法反应缓冲液,0.4 mL反转 录酶,0.4 mL DNA聚合酶,引物qMF/qMR各0.4 mL(10 mmol/L),0.8mL探针,0.4mL染料,2 mL RNA 模板, mL DEPC处理水。 PCR管置于荧光定量PCR仪器上进行RT-PCR扩增, 5.2 将程序如下: 5 min; 42 95 10 s;95 5 s,60 34 s,共进行40个循环。 3.4.2 荧光定量RT-PCR结果判定 阳性对照扩增曲线呈标准的S曲线,且Ct值30。阴性对照扩增曲线应为基线下的水平线。若样本 曲线呈S形曲线,且Ct值38为阳性;未出现扩增曲线为阴性。 4 血清学检测血凝抑制(HI)试验 4.1 材料 微量移液器及配套吸头、96孔V型微量反应板、 生理盐水、 豚鼠红细胞悬液 1% (配制方法见附录B) 、病毒液(相关试验操作应符合GB 19489的要求)、标准阳性血清、标准阴性血清。 4.2 仪器设备 离心机、恒温培养箱。 4.3 病毒血凝效价测定 每次HI试验前应对病毒血凝效价进行测定,检测与判定方法如下: 在反应板一排各孔中加25 mL 生理盐水; 第一孔中加25 mL病毒分离液,按照1:2倍比稀释,最后一孔不加抗原作阴性对照。每孔中再加 25 mL PBS; 每孔加25 mL 1%豚鼠红细胞液,37 孵育40 min; 当红细胞被凝集时,红细胞均匀分布在反应板底部,反应板倾斜片刻,红细胞不下滑;红细胞 未被凝集时,反应板倾斜片刻,可见沉淀的红细胞向下滑动,形成流线。HA效价为全部红细 胞出现凝集时的最高稀释倍数。 4.4 HI 试验 按如下方法进行 HI 试验: 在 96 孔 V 型微量反应板各孔中加 25 mL 生理盐水; 加 25 mL 经处理的血清于第一孔中,混匀后取 25 mL 加到第 2 孔中,依次倍比稀释,从第 2 孔 加至第 11 孔,第 11 孔混匀后吸取 25 mL 弃去,最后 1 孔不加血清作为对照; 每孔中加 25 mL 4 个 HA 单位的病毒抗原,37 孵育 40 min; 每孔加 25 mL 1%豚鼠红细胞液,37 孵育 40 min。 4.5 结果判定 将反应板倾斜70度左右,若无凝集反应,则沉淀的红细胞向下滑动,呈流线状,记录为抗体阳性。 完全抑制凝集的抗体最高稀释倍数为血清的HI抗体滴度。 抗体滴度大于等于16为阳性,小于等于8为阴性。若检测发病后双份血清(第一份血清应在临床症 状出现后立即采集,第二份血清在两周后采集),抗体滴度上升4倍或4倍以上时,表明羊只近期被感染。 2DB32/T 36862019 附录 A (资料性附录) 引物 A.1 引物序列 表A.1 用于RT-PCR和荧光定量RT-PCR检测的引物、探针 引物 MF MR qMF qMR CPIV3 Probe 靶基因 M 基因 M 基因 M 基因 M 基因 M 基因 序列(5-3) AGTGATCTAGATGATGATCCA GTTATTGATCCAATTGCTGT GCTTGGCTTCTTTGAAATGG GCCTGCAGAAGTTCCTTGTC FAM-CAATCGGACTAGCCAAGTATGGTGG 产物 346bp 150bp GA-TAMRA A.2 引物的溶解 引物MF、MR、qMF、qMR用灭菌的DEPC处理水溶解到浓度为10 mol/L;CPIV3 Probe用灭菌的 DEPC处理水溶解到浓度为10 mol/L。 3DB32/T 36862019 附录 B (资料性附录) 1%豚鼠红细胞的配制 B.1 生理盐水配制方法 氯化钠(NaCl) 0.9 g 去离子水加至100 mL,121 高压灭菌15 m
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