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文档简介
从细胞中提取RNA的方法1.加入800ul的Trizol将细胞悬浮起来,在室温下(15-30C)用手摇均,放置5分钟以上;2.涡旋30秒后,将样品轻离至底部,加入160ul的氯仿,再涡旋30秒,室温放置2-5分钟;3. 用4C离心机,13000rpm离心15分钟,使样品分层;4. 将最上面的水相溶液层转移到新的1.7ml离心管中,加入2ul的糖原Glucogen;5. 再加入400ul冰上预冷的异丙醇 Isopropanol,摇均。-20C放置1小时或过夜;6. 用4C离心机,13000rpm 离心15分钟,弃上清;7. 加200ul 75% 无RNase酶的酒精洗RNA,13000rpm离心15分钟;8. 弃上清,尽量不要碰到RNA Pillet;9. 在超净台上,干燥大约8分钟;10. 用无RNase酶的去离子水或是DEPC Water溶解RNA,在室温下静置10分钟,待RNA完全溶解,保存在-80C(或是立刻做RT-PCR,翻转成cDNA保存在-20C)。注:In 1ml Trizol 5-10 x 106 cells; 1 x 107 bacterial cells.At RT, lysis 5 mins.特点Trizol试剂可以快速提取人、动物、植物、细菌不同组织的总RNA,该方法对少量的组织(50-100 mg)和细胞(5106)以及大量的组织(1 g)和细胞(107)均有较好的分离效果。TRIZOL试剂操作上的简单性允许同时处理多个的样品。所有的操作可以在一小时内完成。TRIZOL抽提的总RNA能够避免DNA和蛋白的污染。故而能够作RNA 印迹分析、斑点杂交、poly(A)+ 选择、体外翻译、RNA酶保护分析和分子克隆。如果是用于PCR,当两条引物位于单一外显子内时,建议用级联扩大的DNase I(Cat. No. 18068)来处理抽提的总RNA。并且利用DNA、RNA和蛋白质在不同溶液中的溶解性质,可以通过分层分别将不同层中的RNA( 上层)、DNA(中层)、蛋白质(下层)分离纯化出来,效率极好。Trizol试剂能促进不同种属不同分子量大小的多种RNA的析出。例如,从大鼠肝脏抽提的RNA琼脂糖凝胶电泳并用溴化乙啶染色,可见许多介于7 kb和15 kb之间不连续的高分子量条带,(mRNA和hnRNA成分)两条优势核糖体RNA条带位于5 kb (28S)和2 kb (18S),低分子量RNA介于0.1 和 0.3 kb之间 (tRNA, 5S)。当抽提的RNA用TE稀释时其A260/A280比值1.8 折叠 编辑本段 使用方法1.样品的制备 当样品富含蛋白质,脂肪,多糖或是细胞外物质例如肌肉,脂肪组织和植物的块茎部分时可能需要一额外的分离步骤。匀浆化后在28C的条件下以12,000g的离心力离心10分钟,移除匀浆中不溶解的物质,余下的沉淀中包含有细胞外膜,多糖,以及高分子量DNA,而上层的超浮游物含有RNA。在来自于脂肪组织的样品中,大量的脂肪漂在最上层因而应该除掉。在每一个个案中,将清亮的匀浆溶液转移到一干净的试管中加入氯仿并继续进行下述的分离步骤。 2. 分离阶段 将匀浆样品在1530C条件下孵育5分钟以使核蛋白体完全分解。每1 ml TRIZOL加0.2 ml氯仿。盖紧样品管盖,用手用力摇晃试管15秒并将其在30C下孵育23分钟。在28C下以不超过12,000g的离心力高速冷冻离心15分钟。离心后混合物分成三层:下层红色的苯酚-氯仿层,中间层,上层无色的水样层。RNA无一例外地存在于水样层当中。水样层的容量大约为所加TRIZOL容量的60%。 3. RNA的沉淀 将水样层转移到一干净的试管中,如果希望分离DNA和蛋白,有机层同样要予以保留。通过将水样层和异丙醇混合来沉淀RNA。最初均化时的每1 ml TRIZOL对应0.5 ml异丙醇。将混合的样品在1530C条件下孵育10分钟并在28C下以不超过12,000g的离心力高速冷冻离心10分钟。RNA沉淀在离心前通常不可见,形成一胶状片状沉淀附着于试管壁和管底。 4 .RNA的洗脱 移去上层悬液。用75%的乙醇洗涤RNA沉淀一次,每1 ml的 TRIZOL至少加1 ml的75%乙醇。旋涡振荡混合样品并在28C下以不超过7,500g的离心力高速冷冻离心5分钟。 5. RNA的再溶解 在操作的最后,简单干燥RNA沉淀(空气干燥或真空干燥510分钟)不要在真空管里离心干燥RNA。尤为重要的是,不能让RNA沉淀完全干燥那样会极大地降低它的可溶性。部分溶解的RNA样品其A260/280比值 1.6。用移液管尖分几次移取无RNA酶的水或0.5% SDS溶液来溶解RNA,并在5560C下孵育10分钟(当RNA以后要用于酶切反应时,避免使用SDS。)RNA还能被100%甲酰胺(除去离子)再溶解并保存在70C。折叠 编辑本段 使用TRIzol注意事项TRIzol对人体有害,使用时应戴一次性手套,注意防止溅出。样品的制备当样品富含蛋白质,脂肪,多糖或是细胞外物质例如肌肉,脂肪组织和植物的块茎部分时可能需要一额外的分离步骤。匀浆化后在28C的条件下以12,000g的离心力离心10分钟,移除匀浆中不溶解的物质,余下的沉淀中包含有细胞外膜,多糖,以及高分子量DNA,而上层的超浮游物含有RNA。在来自于脂肪组织的样品中,大量的脂肪漂在最上层因而应该除掉。在每一个个案中,将清亮的匀浆溶液转移到一干净的试管中加入氯仿并继续进行下述的分离步骤。分离阶段将匀浆样品在1530C条件下孵育5分钟以使核蛋白体完全分解。每1mlTRIZOL加0.2ml氯仿。盖紧样品管盖,用手用力摇晃试管15秒并将其在30C下孵育23分钟。在28C下以不超过12,000g的离心力高速冷冻离心15分钟。离心后混合物分成三层:下层红色的苯酚-氯仿层,中间层,上层无色的水样层。RNA无一例外地存在于水样层当中。水样层的容量大约为所加TRIZOL容量的60%。RNA的沉淀将水样层转移到一干净的试管中,如果希望分离DNA和蛋白,有机层同样要予以保留。通过将水样层和异丙醇混合来沉淀RNA。最初均化时的每1mlTRIZOL对应0.5ml异丙醇。将混合的样品在1530C条件下孵育10分钟并在28C下以不超过12,000g的离心力高速冷冻离心10分钟。RNA沉淀在离心前通常不可见,形成一胶状片状沉淀附着于试管壁和管底。4.RNA的洗脱移去上层悬液。用75%的乙醇洗涤RNA沉淀一次,每1ml的TRIZOL至少加1ml的75%乙醇。旋涡振荡混合样品并在28C下以不超过7,500g的离心力高速冷冻离心5分钟。RNA的再溶解在操作的最后,简单干燥RNA沉淀(空气干燥或真空干燥510分钟)不要在真空管里离心干燥RNA。尤为重要的是,不能让RNA沉淀完全干燥那样会极大地降低它的可溶性。部分溶解的RNA样品其A260/280比值1.6。用移液管尖分几次移取无RNA酶的水或0.5%SDS溶液来溶解RNA,并在5560C下孵育10分钟(当RNA以后要用于酶切反应时,避免使用SDS。)RNA还能被100%甲酰胺(除去离子)再溶解并保存在70C。RNA抽提注意事项1.从少量的组织(110 mg)或细胞(102104)中分离RNA 样品:往组织或细胞中加入800 l TRIZOL。待样品裂解后,加入氯仿并进行步骤2中的抽提操作。在用异丙醇沉淀RNA之前,加入510g无RNA酶的脂质体(Cat.No 10814)作为水样层的载体。为降低其黏度在加入氯仿前用26号注射器抽吸两次以切断基因组DNA。脂质体会留在水样层中并和RNA共析出。在浓缩到4 mg/m
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