结果报告及异常结果处理

1. 目的实验室所有的工作其目的都是为了得到准确的检验报告，检验报告书实验室与临床医务人员、患者沟通的桥梁，也直接影响临床对于患者所采取的医学干预措施。为确保检验报告的准确及能够被正确解读，特编制此文件对分子诊断与遗传组所有检验报告的编制、审核、发送、修改及异常结果进行规范。2. 定义及适用范围分子诊断与遗传组所有检验报告的编制、审核、发送、修改除了应该遵循TJCL-PF027检验结果的评审程序、TJCL-PF028结果报告程序、TJCL-PF029机密信息管理程序的要求外，还应遵循此文件的要求。3. 职责实验室技术人员按照各检测项目SOP的要求进行常规检验报告的编制、审核及发送。对于有疑问的报告或异常结果应上报给实验台主管，在问题依然没有得到处理或有疑问或意见不能达成一致时需上报给组长或小组负责人。4. 原始数据的审核在检验报告的编制及录入以前，从事实验操作的技术人员应对检测的原始数据进行审核，在确保室内质控制控的情况下审核的内容包括但不限于以下方面：1） 基于核酸杂交技术的检测项目，样本应具有足够的信号强度，若设置有内对照，其内对照的结果应符合预期。2） 基于Real-Time PCR原理的检测项目，若每个样本均含有内对照，则在报告发送时必须审核每个样本的内对照是否符合厂家说明书的要求。3） 基于Real-Time PCR原理的定量检测项目，标准曲线R0.95或error值30，否则应重新进行测序。5） 基于基因芯片的检测项目，适用时应审核每个样本的平均信号强度及探针的正确识别率是否符合厂家建议，如Illumina Iscan检测平台的样本其P95red值应20000，探针正确识别率应95%。6） 适用时应注意审核当前批次所有患者结果的阳性率与以往阳性率是否存在差异，若阳性率差距明显且无法解释原因，该批次样本应重新检测。对于原始数据审核不通过的样本，等同于质控失控进行处理。5. 检验报告的编制一份完整的检验报告至少包括患者信息、样本信息及检测结果这三部分内容。分子诊断与遗传由于其所具有的专业特性，检验报告的内容和格式在满足TJCL-PF028结果报告程序的前提下还应符合以下要求：5.1检验结果的录入对于需手工录入检测结果的报告（包括手工录入结果经LIS发送的报告和所有不经LIS发出的报告），必须由经过授权的双人审核。对于由仪器自动传输结果的报告，此条款不适用。5.2检验结果的书写检验结果的书写应遵循标准术语和行业规范。染色体核型的书写应遵循ISCN的规范，如：arrHg194q21、21q21.23(81,852,970-85,250,734)x1 此结果代表该样本是采用微阵列基因芯片的方法进行检测，所采用的数据库是Hg19，在4号染色体长臂2区1带2亚带1亚亚带至2区1带2亚带3亚亚带检测到了一个基因组片段仅具有一个拷贝，该片段起始位点为81，852，970，终止位点为85，250，734.DNA测序结果的书写应遵循HGVS的规范，如：c.563AG，p.Gln188Arg此结果代表某一基因的cDNA第563位碱基由A变成G，由于该突变导致其第188位的氨基酸由Gln（谷氨酰胺）变成Arg（精氨酸）。5.3检验内容的说明大部分情况下，检测项目能够反映实验室的检测内容。而对于基于测序技术的检测项目，在最终报告中必须对该样本本次实验的检测内容进行声明，如某一基因或某几个基因、某一基因的某几个内含子或某几个外显子。5.4检验结果的解释和讨论对于遗传性疾病或肿瘤性疾病及个体化医疗的检测项目，对于检验结果的解释是必须的。结果的解释内容包括但不限于以下几个内容：杂合性、碱基改变、氨基酸改变、与临床表型或临床医学干预措施之间的相关性、所引用的医学数据库（应注意数据库的更新）等。对于孟德尔遗传病基因测序报告的解读，CAP和ACMG在2015年3月颁布了行业指南，将检测到的基因突变分为致病、可能致病、良性、可能良性、意义未明五种类型，实验室在进行结果解释时可参考该指南的要求。由于基因组的功能研究还有太多未解之谜，部分时候对于遗传性疾病报告或肿瘤性疾病检测报告的解读是非常困难的事情，适当的时候需对结果解释进行讨论，讨论的内容可能包括对该技术和检测内容对于某种疾病诊断的敏感性、阳性结果可能带来的临床结局、疾病的外显率、复发风险等。5.5检测局限性的说明受制于所采用的分子生物学技术，分子诊断的许多检测均匀其固有的局限性，如一代和二代测序对于长片段的缺失和重复不敏感，有时候即使是一个完全阴性的结果也不能排除该患者是一个基因突变的携带者；同时由于基因组的功能研究还有太多未解之谜，对于检测结果的解读也可能存在不准确甚至错误。因此在检验报告上对当前样本该次检测内容或结果解释的局限性进行声明是非常有必要的。申明的内容可能但不限于以下几个方面：该技术和本次实验内容对于某种突变的检出率、该技术和本次实验内容对于何种突变类型和基因组位置漏检的可能性、影响检测结果的因素、报告解释的复杂性和不确定性等。对于采用实验室自建方法进行检测的项目，在最终的报告中应声明该项目所用技术为实验室自己开发，并对检测所使用的检测方法进行说明，适用时还可附上其检测性能特征。6. 检验报告的审核和发送对于遗传性疾病、肿瘤性疾病、个体化医疗检测项目的检验报告，其报告编制或撰写人或报告审核人必须是两个不同的已获得该岗位授权的工作人员，并在最终报告上签名。审核时应注意审核患者信息、样本信息、检测结果、结果解释四部分内容，尤其对于检测结果的解释应重点审核，必要时邀请小组负责人、组长一起参与讨论。7. 患者信息保密分子诊断的部分报告会直接涉及到患者个人的基因组遗传信息，在西方等发达国家，患者非常注重个人遗传信息的保密，甚至有的患者为了抹掉对自己不利的医学遗传嘻嘻而愿意付出额外的代价。因此当结果涉及到患者个人基因组遗传信息时，检验报告的发送除了应遵循当地法律法规、行业规范的要求及TJCL-PF029机密信息管理程序的要求外，还需额外符合下述规定：1） 在没有得到患者知情同意的情况下，禁止将患者样本的检测结果用于期刊文章发表。2） 对于电子报告单，凭患者就诊卡在自助打印机上打印。3） 对于纸质报告单，患者需凭就诊卡到实验室取报告。递出报告时，实验室人员至少应询问患者姓名，并核对其回答与检验报告上的患者姓名是否一致。4） 纸质报告单的运送由实验室专人负责，以避免遗失和患者信息的泄漏。8. 异常结果的处理在此定义的异常结果是指原始数据审核及质控数据审核均通过的样本，但在报告发送的过程中发现问题。8.1 异常结果的识别异常结果的识别可来源于但不限于以下几个方面：a) 检验结果难以判读b) 检验结果与临床诊疗不符c) 检验结果与历史结果不符或差异过大d) 当前项目与其他项目或检测技术的结果相矛盾e) 先症者及其家系的遗传学分析不符合遗传定律结合分子诊断目前所开设的项目及所采用的技术特点，赞将出现下列情况的检测结果定义为异常结果：1） 基于Real-Time PCR的检测项目，样本的S型扩增曲线不典型；电泳条带区分不清楚或扩增出的片段长度不符合预期。2） HBV-DNA检测项目与血清学乙肝两对半的结果不一致：表现为乙肝表面抗体为阳性或5项全阴或单独核心抗体阳性，但HBV-DNA检测结果为阳性；乙肝两对半中E抗原S/CO值，HBV-DNA检测结果为阴性。3） HCV-DNA检测项目与血清学抗体检测结果不一致：表现为抗体定量结果10，但HCV-RNA检测结果为阴性。4） 与历史检测结果不符合或差异过大：患者遗传学检测结果与以往结果不符；HBV-DNA检测结果在三周内发生了阴阳性的转变。5） 对于遗传性疾病的诊断，若同时检测了先症者及其家系的基因组，两者之间的结果存在矛盾不符合遗传学定律。6） 基因芯片对于患者基因组拷贝数变异（CN