SciFinder的检索和使用介绍(10年12月).ppt

科研工具SciFinder使用及检索介绍,刘盈盈CAS中国代表处Telxt801Email：yelena,提纲,1、SciFinder背景及内容介绍2、SciFinder中的文献检索与分析3、SciFinder中的物质检索与分析4、SciFinder中的反应检索与分析5、SciFinderWeb介绍,ChemicalAbstractService化学文摘社今天：,全球最大的学协会组织本部拥有1000多博士从事文献编辑工作为全球超过1500多个学校提供SciFinder桌面检索平台,CAplus(1907-至今)包含了CA纸本和光盘的所有内容。涵盖了98%世界化学化工文献。10000多种期刊和61个专利发行机构的专利（含专利族）。除此之外，会议记录、技术报告、图书、学位论文、评论、会议摘要、电子期刊、网络预印本；每天更新Registry世界上最大的物质数据库5500万个物质；6200万个序列有机、无机、聚合物、混合物、核酸蛋白质序列所有CASRegistryNumber物质日更新12000多个物质,SciFinder中最重要的三个数据库,CASReact（1840至今）期刊，专利中涉及的有机、有机金属、无机、生化反应。2800万单步，多步反应。周更新3万-5万条单步、多步反应。,文献,反应,物质,SciFinder中最重要的三个数据库,Medline(1950年以来）美国国立医学图书馆出品临床报告、期刊文献免费数据库ChemList查询备案/管控化学信息的工具。Chemcats4400万化学物质提供商的联系信息、价格情况、运送方式、质量等级等信息。,SciFinder中其他三个数据库,提纲,1、SciFinder背景及内容介绍2、SciFinder中的文献检索与分析3、SciFinder中的物质检索与分析4、SciFinder中的反应检索与分析5、SciFinderWeb介绍,SciFinder中的文献检索与分析,物质,反应,文献,主题词、作者、机构,文献标识符,浏览核心期刊,获得卟啉类化合物应用的参考文献porphyrinswithusing,1、主题词检索,“Concept”表示做了同意词的扩展“Closelyassociatedwithoneanother”表示同时出现在一个句子中“werepresentanywhereinthereference”表示同时出现在一篇文献中,获取文摘,获取全文,用蓝色显示出现的是命中的词条，这里可以看到很多同义词，近意词都被检索出来；那是SciFinder能够自动识别同义词，近义词，缩写等功能,获得引文，被引文，文献中的物质，反应,分析限定,分类功能,Analyze下的分析工具,一共11种分析手段,在这些分析工具中，索引词（IndexTerm）：可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解学科分析（CASectionTitle）：可以帮助我们对文献进行学科分类,作者、CAS号、期刊名称、索引词、出版年限等,可以选择不同的排列方式，可以看到该研究方向谁的研究成果最多,Analyzeby-AuthorName,Analyze-IndexTerm,索引词可以帮助我们了解文献中出现的重要概念,Analyze-JournalName,Refine下的限定工具,7种限定工具,限定时间-获得来自2008年以后的文献,通过限定出版时间用于查新了解最近几年的热点,Categorize-系统分类工具,一级目录,二级目录,选中感兴趣的二级分类，在这里可以出现一些索引词条,选中感兴趣的内容，点击GetReference,金属卟啉类化合物,保存,SaveAs存储为*.rtf文件，可打印、修改类似word文档单次存储文献数量要50，千万不要过量下载存储文件名称，所属文件夹都要为英文,*.RTF,将结果保存成书签，可以使用SF再次打开，继续进行检索，也可以对同类的书签进行COMBINE操作,*.SFR格式,获得引文,获得被引文,文献中的物质,文献中的反应,2、作者名检索举例,2010年诺贝尔化学奖得主之一RichardHeck发表的文章,姓：写全；首字母要大写,名：只写首字母,在列表中将所有的可能性的名字都选中,继续使用Analyze和Refine功能，依据该作者的工作学习经历来获得他所发表的文献,3、单位名称检索,继续使用Analyze和Refine功能，得到你想要的信息,中国所有机构的文章,4、通过文献标示符去找文献,5、浏览核心期刊搜索文献,SciFinder文献检索小结,主题检索时，使用介词ofwith等作为连接尽量选择包含Concept和CloselyAssociatedwith的候选项通过SciFinder的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用，会有更多的收益使用Categorize可以让系统来实现自动分类注意作者名检索时的输入规则通过GetRelated来获得更多的信息，可以实现从文献到物质，反应，引文的链接,提纲,1、SciFinder介绍2、SciFinder中的文献检索与分析3、SciFinder中的物质检索与分析4、SciFinder中的反应检索与分析5、SciFinderWeb介绍,精确结构检索亚结构检索相似结构检索,物质名称、CAS登记号,结构亚结构相似结构,SciFinder物质检索与分析,分子式,物质,文献,反应,可以输入物质名称、CAS号、俗名、商品名等,用SciFinder来搜索TBHQ,1、通过物质名称、CAS登记号等检索物质,通过这种方式，可以实现从物质到文献，或者从物质到反应的连接,在SciFinder中任意的有结构的界面，右击这个物质，都可以直接将这个物质复制到画图版中,一种快速获得物质结果的方法,2、通过结构式和分子式去找物质,结构检索举例,工具栏,铅笔,元素周期表,可变基团,重复基团工具,结构模版,橡皮,正电子,选择工具,原子锁定工具,碳链工具,常用基团,R基团定义工具,可变位置连接工具,多元环工具,旋转工具,负电子,环锁定工具,索套选择工具,精确结构检索,通过物质类别，来限定检索物质的种类，不选，则返回全部物质,最后这个结构就是我们想要的物质结构,精确结构检索，可以检索到物质的盐，聚合物，混合物，配合物等,R1、R2、R3=任意基团,查询包含以下通式结构的物质,亚结构检索,得到297种物质的修饰信息,亚结构能帮您检索到所有的修饰物信息,6大分析功能,分析功能提供6大功能，其中真实原子附属分析（Real-atomattachments):能够分析出原子的修饰情况可变基团分析（VariableGroupcomposition）：能分析结构中定义的可变基团R基团分析（R-GroupComposition）：可以分析结构中定义的R基团环骨架分析（RingSkeletons）：可以分析结构的环结构，包括环上的原子和环上的单双键。,7大限定功能,限定功能提供结构再次限定，同位素是否包含限定，金属是否包含限定，理化性质限定等。通常可以通过结构的再次限定（ChemicalStructure）去对结构再次修饰或者通过理化性质（PropertyDate）去找到符合理化性质要求的物质,可以通过分析工具来分析每个开放位点R1，R2，R3的修饰情况,使用Real-AtomAttachment分析衍生物的结构,分析完所有位点上的信息，要求6元环上的S没有修饰，同时羰基碳接碳的物质,使用Refine功能来修正结构,修正结构,注意：一般先使用分析工具，然后根据分析结果来修正结构,对所得结果再次使用真实原子附属性分析,结构类似物查询举例,SciFinder只能给出与母体结构相似度在60分以上的物质，通过选择不同阶段的分数，来获得物质。,区别：取代基不同取代基位置不同母体结构略有不同,精确结构检索，获得物质的盐，聚合物，混合物，配合物等；母体结构不能修改，不能修饰亚结构检索，所画的结构必须存在，母体结构可以被修饰，但不可以被修改相似结构检索，获得相似度在60分以上的结构，母体结构可以修改，也可以被修饰，用相似度来控制获得的结果,SciFinder结构检索小结,3、通过分子式检索检索物质,分子式输入规则,对于含C物质，CH写在前面，其他按照字母顺序。对于不含C的物质，按照字母顺序书写。对于多组分物质，用“.”将不同的组分分开，聚合物括号表示，括号外用n表示的是终产物的重复结构单元，括号外用x表示起始物，区分大小写,淀粉或纤维素成分（C6H10O5)nABS树脂(C8H8.C4H6.C3H3N)x,SciFinder中的物质检索小结,物质名称、CAS登记号、俗名、商品名等、分子式（注意输入规则）精确结构检索亚结构检索相似结构检索,重点理解三种结构检索的异同点及使用条件,提纲,1、SciFinder介绍2、SciFinder中的文献检索与分析3、SciFinder中的物质检索与分析4、SciFinder中的反应检索与分析5、SciFinderWeb介绍,精确反应检索,结构亚结构,SciFinder反应检索与分析,官能团,反应,物质,文献,SciFinder中的反应检索方式及分析,反应位置标记工具,反应箭头,反应官能团列表,反应原子标记工具,反应角色工具,与反应有关的功能键,1、检索特定物质之间的反应,使用精确反应检索获得特定反应,精确反应检索,Analyze的分析工具,共10种分析工具,Refine的限定工具,一共4种限定工具,点击，可以直接获得包含这条反应的记录,点击，可以直接获得这些反应的记录，实现从反应到文献的连接,获得符合要求的反应类型,右击物质，可以直接进行物质结构或者反应检索，或者查看该物质的属性等等，实现从反应到物质的连接,2、官能团之间的反应,假如我们只想得到一步反应,假如我们规定反应物必须是苯乙酮肟,那么如何获得不是从苯乙酮肟出发的反应呢？让我们先返回初次检索到的2284条反应。,再按照上面的检索获得从苯乙酮肟出发的反应，一共102条,运用Combine功能将不需要的答案集排除,这里可以看到保存过的标签的详细信息,选择集合操作类型,COMBINE可以对于任意两个同类型的集合进行AND,OR,NOT的操作,将结果保存成书签，可以使用SF再次打开，继续进行检索，也可以对同类的书签进行COMBINE操作,*.SFR格式保存,3、反应检索举例-检索类似物的反应,想获得一步合成该物质的反应,必须的条件：羟基接的碳必须是CH2整个碳链不允许是某个环结构的部分结构其余的三个碳原子链接什么基团对反应没有影响,据此我们修改我们的检索方式,使用亚结构反应检索来扩大检索范围,亚结构反应检索,用环锁定功能锁定碳链，保证其不成为环结构的一部份,用原子锁定功能锁定碳原子，保证碳原子不被取代,看到类似的反应都查询出来,SciFinder反应检索小结,多用Analyze/Refine，来获得催化剂，溶剂，产率等信息如果反应只涉及基团之间的变化，用官能团反应可以获得更多的参考信息当无法找到具体反应，或者检索结果并不满意，尝试用亚结构反应查询，可以获得更多的参考信息更多有关结构和反应的说明，请参考,提纲,1、SciFinder介绍2、SciFinder中的文献检索与分析3、SciFinder中的物质检索与分析4、SciFinder中的反应检索与分析5、SciFinderWeb介绍,SciFinderWeb介绍,SciFinderWeb是通过Web来访问SciFinder数据库的方式友好的用户界面更加详尽的文献信息和详尽的物质信息即时跟踪特定研究领域的全球最新动态永久的信息分享链接,SciFinder通过帐号密码来控制用户使用,登陆网址：S,友好的用户界面,文献，物质，反应检索入口，默认开始检索文献,更加详尽的文献信息和详尽的物质信息,对于二茂铁这个物质，在哪些文献类型中有过报道,对于二茂铁这个物质以及它的衍生物，在专利和非专利文献中都存在那种研究报道,设定Email提醒，一旦有新的记录，会发邮件通知,设置提醒文件名和失效时间,可以通过历史导航条返回历史检索界面,即时跟踪特定研究领域的全球最新动态,永久的信息分享链接,提纲,1、SciFinder介绍2、SciFinder中的文献检索与分析3、SciFinder中的物质检索与分析4、SciFinder中的反应检索与分析5、SciFinderWeb介绍,请合理使用SciFinder!,千万不要过量下载!只下载自己要看的记录（缩小范围）不要用“迅雷”，“快车”之类的工具下载记录不使用请关闭客户端程序,一旦发生过量下载，CAS将视情节严重采取不同的限制措施全IP范围内取消全部下载功能，包括*.SFR格式的下载全IP范围内取消部分检索功能情况严重的，将暂定SciFinder的使用,大量的记录的时候,思考一下：这些记录都是我们想要的吗？如果我要全部看完的话需要多长时间？所以希望大家能多用Analyze/Refine功能去分析限定文献；遇到较多文献时请使用*.SFR格式保存。,可能