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文档简介

1、实验 质粒 DNA 的提取及电泳检测一 实验目的通过本实验学习掌握碱裂解法提取细菌质粒DNA。二 实验原理1. 细菌中有两种 DNA,即染色体 DNA和质粒 DNA。2.质粒 DNA的提取方法有三种:碱裂解法,煮沸法,去污剂(如Triton和SDS)裂解法。3.碱裂解法比较剧烈,可破坏碱基配对,使宿主细胞DNA变性,共价闭合环状 DNA由于空间缠绕, 两条链不会彻底分开。当外界条件到达复性条件时,质粒 DNA的双链又迅速恢复原状,而较大的线性染色体DNA难以复性。三 实验材料 :转化后的细菌 ( 含有质粒的大肠杆菌 )四、实验用具和药品1. 实验用具 :摇床,离心机,移液器及枪头,玻璃试管(1

2、5mL)及塞子,离心管( 1.5mL)2.实验试剂:( 1)溶液I50 mmol/L25 mmol/L10 mmol/L葡萄糖三羟甲基氨基甲烷( Tris )Tris乙二胺四乙酸( EDTA)(pH8.0)HCl( pH8.0)( 2)溶液II0.4mol/L NaOH,2%SDS,用前等体积混合( 3)溶液III5 mol/L乙酸钾60ml冰乙酸11.5ml水28.5ml( 4) TE 缓冲液10 mmol/L TrisHCl( pH8.0)1 mmol/L EDTA(pH8.0)( 5) 70%乙醇(放 - 20冰箱中,用后即放回)( 6)加样缓冲液( 6X): 40%蔗糖、 0.25%溴

3、酚兰( 7)电泳缓冲液:0.045mol/L Tris-硼酸0.001mol/L EDTA(0.5X TBEbuffer )电泳缓冲液贮存液: 5X:54g Tris 碱、27.5g 硼酸、20ml 0.5mol/L EDTA( pH8.0)五 实验步骤(一)细菌繁殖挑取白色的单菌落若干,转移到3mL 液体LB 培养基 ( 附加100mg/mlAmp ),37 过夜振荡( 200r/min )培养。(二)菌体收集将过夜培养的菌体转入1.5mL 离心管,离心30sec 5000r/min ;弃上清提取质粒(三)质粒提取方法一:碱裂解法提取质粒DNA1. 将上述沉淀重悬于250L冰预冷的溶液中,剧

4、烈震荡;2加入 250L溶液,盖紧管口,快速颠倒离心管510 次;3加入 350L冰预冷的溶液,盖紧管口,温和地颠倒离心管510次;9000r/min离心 5min 上清转移到另一新1.5mL 离心管中;4加等体积氯仿,振荡混合,静置,9000r/min离心 5min,上清转移到另一新1.5mL 离心管中;5加入 1/10 体积 3mol/L 的醋酸钠和 2 倍体积的乙醇,充分混匀,静置5min;9000r/min 离心 5min;6弃上清,用 70 ethanol 洗涤;7加 30LTE溶解, - 20 保存。方法二:试剂盒提取方法1. 离心收集的菌体中加入含 RNAase的溶液 250L,

5、重悬菌体,不应留有小的菌块;2. 加溶液 250L,轻轻颠倒离心管 4-6 次,使菌体充分裂解,至溶液澄清;3. 加入 350L冰预冷的溶液,温和并充分地上下翻转混合6-8 次;4. 12000r/min 离心 10min;5. 将上清转移到 DNA结合管(置于 2 ml 离心管中), 12000r/min 离心 1min,弃滤液;6. 将制备管置回离心管,加入去蛋白试剂 500L, 12000r/min 离心 1min,弃滤液;7. 将制备管置回离心管,加洗涤液 700L, 12000r/min 离心 1min,弃滤液;以同样的方法再用 700L洗涤液洗涤一次,弃滤液。8. 将制备管置回 2 ml 离心管中, 12,000 g 离心 1 min ,去除残余的洗涤液;10 将 DNA结合柱放入另一个新的 1.5mL 离心管中,在制备管膜中央加 60-80 L 洗脱液或去离子水,室温静置 1 min 。12,000 g 离心 1 min 。(四)检测提取DNA质量的电泳检测。取 4ul 质粒 DNA+2ul加样缓冲液 +6ul ddH2O;配制 1%的琼脂糖凝胶电泳 30min, EB染色,拍照。注意事项:氯仿对眼睛、皮肤、粘膜及呼吸道都有刺激作用,它是致癌剂并可损伤肝脏和肾脏,操作时需戴手套、口罩。六 实验作业1. 思考本实验的关键步骤是什么?2. 琼脂糖电泳鉴

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