重复序列word版

1、单一序歹J （unique sequence）又称非重复序列,在一个基因组中一般只有一个拷贝。真核生物的绝 大多数结构基因在单倍体中是单拷贝或儿个拷贝（15个拷贝）。基因组中有10个到儿千个拷贝的DM序列。重复单元的平均长度约300b 中度重复序列（moderately repetitive sequence ）般是非编码序列，有十 个到几百个拷贝，如rRNA基因和tRNA基因等。这类重复序列的平均长度大 约为300bp ,往往构成序列家族，常以回文序列形式出现在基因组的许多位 置上，有些同单一序列间隔排列。大部分中度重复序列与基因表达的调控有关， 包括开启或关闭基因的活性，调控DNA复制的起

2、始，促进或终I上转录等，它 们可能是与DNA复制和转录的起始、终止等有关的酶和蛋白质因子的识别位 点Po高度重复序列在基因组中重复频率高，可达白万（106）以上，因此复性速 度很快。在基因组中所占比例随种属而异，约占10-60%,在人基因组中约 占20%。高度重复顺序又按其结构特点分为三种。（1）倒位（反向）重复序列这种重复顺序复性速度极快，即使在极稀的血浓度下，也能很快复 性，因此乂称零时复性部分，约占人基因组的5%。反向重复序列山两个相 同顺序的互补拷贝在同一 DA链上反向排列而成。变性后再复性时，同一 条链内的互补的拷贝可以形成链内碱基配对，形成发夹式或“ + ”字形结 构。倒位重复（即

3、两个互补拷贝）间可有一到儿个核昔酸的间隔，也可以 没有间隔。没有间隔的乂称回文（palimdr ome）,这种结构约占所有倒 位重复的三分之一。若以两个互补拷贝组成的倒位重复为一个单位，则倒 位重复的单位约长300bp或略少。两个单位之间有一平均1. 6kb的片段相 隔，两对倒位重复单位之间的平均距离约12kb,亦即它们多数散布非群集 于基因组中。（2）卫星DNA卫星DNA（satelliteDNA）是另一类高度重复序列，这类重复顺序的重复 单位一般111 2-10bp组成，成审排列。山于这类序列的碱基组成不同于其他 部份，可用等密度梯度离心法将其与主体DNA分开，因而称为卫星DNA或 随体D

4、NAo在人细胞组中卫星DNA约占5-6%o按照它们的浮力密度不同， 人的卫星DNA可分为I、II、III、IV四种。果蝇的卫星DNA顺序已经搞清 楚，可分为三类，这三类卫星DNA都是由7bp组成的高度重复顺序：卫星 I为55 AC A ACT 3*,卫星II为5ACAAATT3。而蟹的卫星DNA为只有AT两个 碱基的重复顺序组成。（3）较复杂的重复单位组成的重复顺序这种重复顺序为灵长类所独有。用限制性内切酶Hindlll消化非洲绿猴 DNA,可以得到重复单位为172bp的高度重复顺序，这种顺序大部份山交替 变化的卩票吟和喀唳组成。有人把这类称为a卫星DNAo而人的a卫星DNA 更为复杂，含有多

5、顺序家族。（4）高度重复顺序的功能a. 参与复制水平的调节反向序列常存在于DNA复制起点区的附近。另 外，许多反向重复序列是一些蛋白质（包括酶）和DNA的结合位点。b. 参与基因表达的调控DNA的重复顺序可以转录到核内不均一 RNA分 子中，而有些反向重复顺序可以形成发夹结构，这对稳定RNA分子，免遭 分解有重要作用.c. 参与转位作用儿乎所有转位因子的末端都包括反向重复顺序，长度 由几个bp到1400bpo *于这种顺序可以形成回文结构，因此在转位作用中 即能连接非同源的基因，乂可以被参与转位的特异酶所识别。d. 与进化有关不同种属的高度重复顺序的核昔酸序列不同，具有种属 特异性，但相近种属

6、乂有相似性。如人的a卫星DA长度仅差1个碱基（前 者为171bp,后者为172bp）,而且碱基序列有65%是相同的，这表明它们 来自共同的祖先。在进化中某些特殊区段保守的，而其他区域的碱基序列 则累积着变化。e. 同一种属中不同个体的高度重复顺序的重复次数不一样，这可以作 为每一个体的特征，即DNA指纹。f. Q卫星DNA成簇的分布在染色体着丝粒附近，可能与染色体 减数分裂时染色体配对有关，即同源染色体之间的联会可能依赖于具 有染色体专一性的特定卫星DXA顺序。皿？单一序列单一序列（unique sequence）是复性最慢的部分，一般由单一拷贝基因 或仅重复数次的基因组成，也可称为单拷贝序列（single copy sequence）。原核 生物的大多数基因在单倍体中都是单拷贝的。单一序列最重要的功能是编码蛋白质, 除去极少数蛋白质（组蛋白）的基因属于重复序列的范畴外，目前已知的绝大多 数蛋白质都是由单拷贝序列编码的。单一序列约占貞核生物基因组的40