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文档简介

1、常见引物序列及相关数据所属类别名称序列53长度/bpmwtm/crdp匹配情况非特异细菌8fagagtttgatcatggctcagagagtttgatcctggctcagagagtttgatcmtggctcag202020612557.821114/690149112729/706103147961/83681427f27fmagtttgatcatggctcagagtttgatcctggctcagagtttgatcmtggctcag181818548555.0227693/690149139957/836814167795/83681450faacacatgcaagtcgaacgacacat

2、gcaagtcgaacgaacacatgcaagtcgaacacacatgcaagtcgaac19181817125623/690149148982/70610325951/690149145627/690149338factcctacgggaggcagc18482403/706103341fcctacgggaggcagcag17523954561521/836814357fctcctacgggaggcagcag19481725/706103517fgccagcagccgcggtaa17520054499021/706103cagcagccgcggtaatac18460959/706103ac

3、tcctacgggaggcagcag20480068/706103968faacgcgaagaaccttac17227055/7061031055fatggctgtcgtcagct16198160/706103341rctgctgcctcccgtagg17516454561521/836814513rcgcggctgctggcacgta18245632/706103517rttaccgcggctgctggc1754585412/836814518rattaccgcggctgctgg17545228/836814519rgtattaccgcggctgctg1853541216/836814907

4、rccgtcaattcctttgagtttccgtcaattcatttgagtttccgtcaattcmtttgagtttccgtcaattcctttaagtttccgtcaattcatttaagtttccgtcaattcmtttragttt20202019306382/ 70610356371/7061032707/690149116/690149tgaattgacgggggcccg1066racatttcacaacacgagctg2021273/706103 -proteobacteria特异性1330rtagcgattccgacttca1789082/7061031385rcggtgtg

5、tacaagaccc1746267/7061031392racgggcggtgtgtac15463256.3196284/6901491401rcggtgtgtacaagaccc1746267/7061031492racggataccttgttacgacttgttaccttgttacgacttgctaccttgttacgacttghtaccttgttacgactt1818543550.530582/70610352362/7061031495rctacggctaccttgttacga20604557.810129/6901491513rtacggttaccttgttacgacttcggttac

6、cttgttacgactttacggttaccttgttacgacggttaccttgttacgacggttaccttgttacgacggttaccttgttacgactgttaccttgttacgacttttaccttgttacgacttgttaccttgttacgact22201818181818171710033/69014913181/70610310268/70610312207/70610313266/70610329502/70610330582/70610334392/70610330687/7061031521raaggaggtgatccagcc17522557.013792

7、/706103放线菌act243fggatgagcccgcggccta188519/706103-115341fcctacgggaggcagcag1751252/66797357fctcctacgggaggcagcag1941992/54945- 439732act513rccgcggctgctggcacgta1939303/54945-206008act704rtctgcgcatttcaccgctac2023525/54945-5812古菌a21fttccggttgatcctgccgga202899/34593-1a21f-2ccggttgatcctgccgga184227/34593-1a

8、21f-3cggttgatcctgccgga174316/34593-1a25fctggttgatcctgccag17976/34593-0a109faccgctcagtaacacgtactgctcagtaacacgtactgctcagtaacacgctgctcagtaacacgtctgctcagtaacacg1717161615446/338904192/338904371/338904227/338904406/33890a112fgctcagtaacacgtgg169898/34593 -6a333ftccaggccctacgggg169024/34593-1a533ftgccagccg

9、ccgcggtaa1815551/34593-2176a856ftaaaaggaattggcggggga2034/34593-0a934rgtgctcccccgccaattcctgtgctcccccgccaattcctgctcccccgccaattcctgctcccccgccaattcctgtgctcccccgccaattc201919181817658/34593-1517758/34593-1519404/34593-1519591/34593-1917815/34593-15a1354rtgacgggcggtgtgtgcaag202709/34593-21793真菌ns1fgtagtca

10、tatgcttgtctc (1938)ccagtagtcatatgcttgtc (1736)1920478973/279,8628048？atcaatgtcttcggactctt (222241)？ctgccttccttggatgtggt (407426)ns2rggctgctggcaccagacttg (反向，与ns3 互补)205834765/279,862ns3fcaagtctggtgccagcagcc (554573)20582656ns4rcttccgtcaattcctttaag (反向，与ns5互补)2048ns5fcttaaaggaattgacggaag (11311150)20

11、48ns6rgcatcacagacctgttattgcctc (反向，与ns7互补)cagacctgttattgcctc24185748ns7fgaggcaataacaggtctgataacaggtctgtgatgcgaggcaataacaggtctgtgatgc (14121436)18182448465717364ns8rtccgcaggttcacctacgga (17691788)gcaggttcacctacgga201756494324ef4fggaagggrtgtatttattagggaagggatgtatttattagggaaggggtgtatttattag202020265630

12、36fung5rgtaaaagtcctggttcc173257ef3rtcctctaaatgaccaagtttg21fungattccccgttacccgttg18ff1aacttaaaggaattgacggaag22fr1gcatcacagacctgttattgcctc24its1ftccgtaggtgaacctgcgg19its4rtcctccgcttattgatatgc20gc clampcgcccgccgcgccccgcgcccgtcccgccgcccccgcccgcgcccgccgcgccccgcgcccggcccgccgcccccgcccccgcccgccgcgcgcggcgggc

13、ggggcgggggcacgggggg404040muzyermw=a碱基数312c碱基数288g碱基数328t碱基数30361。rag，yct，mac，kgt，scg，wat，hact，bcgt，vacg，da / g / t，n=acg / t。古菌域包括嗜泉古菌界（crenarchaeota）、广域古菌界（euryarchaeota）和初生古菌界（korarchaeota）；细菌域包括细菌、放线菌、蓝细菌和各种除古菌以外的其它原核生物；真核生物域包括真菌、原生生物、动物和植物。nuclear primers - 18s rrnanameprimer sequencetmns1gtagtc

14、atatgcttgtctc49cns1gagacaagcatatgactactg55ns2ggctgctggcaccagacttgc65gcaagtctggtgccagcagccns3gcaagtctggtgccagcagcc65ns4cttccgtcaattcctttaag62ns5aacttaaaggaattgacggaag55ns6gcatcacagacctgttattgcctc72ns7gaggcaataacaggtctgtgatgc72ns8tccgcaggttcacctacgga59tw9taagccatgcatgtcttw10gcggtaattccagctcctw11ggagtg

15、gagcctgcggcttw12aagtcgtaacaaggttt53ctw12aaaccttgttacgactt53ns17catgtctaagtttaagcaa55ns18ctcattccaattacaagacc60ns19ccggagaaggagcctgagaaac74ns20cgtccctattaatcattacg61ns21gaataatagaataggacg50ns22aattaagcagacaaatcact57ns23gactcaacacgggaaactc64ns24aaaccttgttacgactttta58ns25gtggtaattctagagctaatactcns25atg

16、tattagctctagaattaccacns26ctgccctatcaactttcgacns26tcgaaagttgatagggcagns1.5rtctagagctaatacatgc(t/c)g52ns2.8rggccctcaaatctaaggatt53cns2.8raatttgcgcgcctgctgcaa57ns3.2rcgtatattaaaattgttgac45cns3.3rgactacgagctttttaacgt51cns3.5rtttcgcagtagtttgtctta49ns3.6rcaaactactgcgaaagcatc53cns3.6raatgaagtcatccttggcag53 forward primerforward matchesreverse primerreverse matches

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