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文档简介
1、SFRP4过表达对结肠癌细胞株过表达对结肠癌细胞株HCT116基因表达谱的影响基因表达谱的影响 复旦大学附属肿瘤医院病文科黄 丹研研 究究 背背 景景研讨背景CA Cancer J Clin. 2021; 58: 161-179 结直肠癌的发病率结直肠癌的发病率研讨背景Wnt信号通路信号通路 分泌型卷曲相关蛋白分泌型卷曲相关蛋白SFRP 一组分泌型糖蛋白家族 SFRPs有五个家族成员在人类组织中表达 定位于染色体8p 1211.1 包括一个特有的同源半胱氨酸富含域CRD的N-末端和一个C-末端。 除SFRP3以外研讨背景分泌型卷曲相关蛋白分泌型卷曲相关蛋白SFRP经过与经过与Wnt信号的蛋白质
2、相互作用以阻止它信号的蛋白质相互作用以阻止它们结合到们结合到Fz蛋白或与蛋白或与Fz构成无功能复合物构成无功能复合物而妨碍而妨碍Wnt信号信号 研讨背景研研 究究 目目 的的检测SFRP4基因转染肠癌细胞株HCT116后基因表达谱的变化,深化讨论SFRP4在结直肠癌发生中的作用机制。 技术道路技术道路pcDNATM 3.1-SFRP4重组质粒基因芯片检测Pathway分析双酶切鉴定WB鉴定SFRP4表达转染HCT116后挑选稳定表达株结果结果pcDNATM 3.1-SFRP4质粒的构建及稳定转染株的鉴定芯片生物信息学分析RT-PCR验证部分基因芯片的结果pcDNA3.1载体大小为5500bp,
3、SFRP4基因片段大小为1056bp EcoRI和HindIII双酶切重组质粒后凝胶电泳图 Western Blot 检测pcDNATM 3.1-SFRP4质粒稳定转染HCT116细胞后SFRP4的表达 0道为pcDNA3.1空载体,1和2道为pcDNA3.1-SFRP4 pcDNATM 3.1-SFRP4质粒的构建及稳定转染株的鉴定芯片生物信息学分析RT-PCR验证部分基因芯片的结果GenBank ID Gene nameCommentsInduction-fold NM_001040056MAPK3丝裂素活化蛋白激酶34.3NM_001006617MAPKAP1丝裂素活化蛋白激酶相关蛋白1
4、5.0NM_002756MAP2K3MAPKK32.3NM_007181MAP4K1MAPKKKK12.8NM_021970MAP2K1IP1MAPKK1相关蛋白12.3NM_021284MEK蛋氨酸脑啡肽3.0上调的MAPK家族基因 下调的TNF家族基因GenBank ID Gene nameCommentsInduction-foldNM_006291TNFAIP2肿瘤坏死因子,alpha-诱导蛋白20.25NM_006290TNFAIP3肿瘤坏死因子,alpha-诱导蛋白30.38NM_014350TNFAIP8肿瘤坏死因子,alpha-诱导蛋白80.25NM_003844TNFRSF1
5、0A肿瘤坏死因子受体超家族10A0.44NM_003840TNFRSF10D肿瘤坏死因子受体超家族10D0.5凋亡相关基因的改动GenBank ID Gene nameCommentsInduction-foldNM_000875IGF1R胰岛素样生长因子受体4.9NM_000043FASTNF受体超家族成员62.6NM_006538BCL2L11Bcl2-L110.13pcDNATM 3.1-SFRP4质粒的构建及稳定转染株的鉴定芯片生物信息学分析RT-PCR验证部分基因芯片的结果1,细胞转染SFRP4前;2,细胞转染SFRP4后。-actin作为对照。 RT-PCR验证基因芯片结果讨论讨论 我们经过基因芯片技术对基因组进展高通量的研讨,经过生物信息学分析,我们挑选出比较重要的p38MAPK信号通路相关基因、TNF家族基因和凋亡有关基因的变化来讨论SFRP4对肿瘤细胞的作用机制。讨论讨论 MAPK信号通路参与细胞增殖、分化及凋亡的调控,并在细胞恶性转化的病理过程中发扬重要作用 肿瘤坏死因子TNF家族是一类具有广泛生物学活性的分子,具有抗肿瘤、调理细胞生长分化等
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