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文档简介

1、实验一植物基因组DNA的提取一、实验目的掌握植物总 DNA 的抽提方法和根本 原理。学习根据不同的植物和实验要求设 计和改进植物总 DNA 抽提方法。二、实验原理通常采用机械研磨的方法破碎植物 的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多 种酶类 尤其是氧化酶类 对 DNA 的抽提产 生不利的影响,在抽提缓冲液中需参加抗 氧化剂或强复原剂 如巯基乙醇 以降低这 些酶类的活性。在液氮中研磨,材料易于 破碎,并减少研磨过程中各种酶类的作 用。十二烷基肌酸钠sarkosyl、十六烷基 三 甲 基 溴 化 铵 hexadyltrimethyl ammomum bromide ,简称为 CTAB、 十二 烷基硫

2、酸钠 sodium dodecyl sulfate ,简称 SDS等离子型外表活性剂,能溶解细胞膜 和核膜蛋白,使核蛋白解聚,从而使 DNA 得以游离出来。再参加苯酚和氯仿等有机 溶剂,能使蛋白质变性, 并使抽提液分相, 因核酸DNA、RNA冰溶性很强,经离心后 即可从抽提液中除去细胞碎片和大局部 蛋白质。上清液中参加无冰乙醇使 DNA 沉 淀,沉淀DNA溶于TE溶液中,即得植物 总 DNA 溶液。三、实验材料冰稻幼叶四、主要试剂配方2% CTAB 抽提缓冲溶液 : CTAB 4g NaCl 16.364 g 1M Tris-HCl 20ml0.5MEDTA 8ml,先用 70ml ddH2O

3、 溶解,再 定容至 200ml 灭菌 , 冷却后 % 2-巯基乙醇 400ul氯仿 -异戊醇 24:1:先加 96ml 氯仿, 再加 4ml 异戊醇,摇匀即可。五、实验步骤1. DNA 的提取(1) 2%CTABJ由提缓冲液在65 C水 浴中预热。(2) 取少量叶片(约 1g)置于研钵 中,用液氮磨至粉状;(3) 参加700ul的2%CTAB抽提缓 冲液,轻轻搅动;( 4) 将磨碎液分倒入 ml 的灭菌离 心管中,磨碎液的高度约占管的三分之)(5)置于65 C的水浴槽或恒温箱中, 每隔 10 min 轻轻摇动, 40 min 后取出;( 6)冷却 2 min 后,参加氯仿 -异戊 醇( 24:

4、1 )至满管,剧烈振荡 23 min, 使两者混合均匀;( 7)放入离心机中 10 000 rpm 离心10 min,与此同时,将600卩的异 丙 醇 加 入 另 一 新 的 灭 菌 离 心 管 中;8)10 000 rpm 离心 1 min 后,移 液器轻轻地吸取上清夜,转入含 有异丙醇的离心管内,将离心管 慢慢上下摇动30 sec,使异丙醇与 水层充分混合至能见到 DNA 絮状 物; 910000 rpm 离心 1 min 后,立即 倒掉液体,注意勿将白色 DNA 沉 淀倒出,将离心管倒立于铺开的 纸巾上;1060 sec 后,直立离心管,参加720 的75%乙醇及80卩I 5 M勺 醋酸

5、钠,轻轻转动,用手指弹管 尖,使沉淀与管底的 DNA 块状物 浮游于液体中;11放置 30 min ,使 DNA 块状物 的不纯物溶解; 12 10000 rpm 离心 1 min 后,倒 掉液体,再参加800卩175%的乙 醇,将 DNA 再洗 30 min;(13) 10000 rpm 离心 30 sec 后,立即倒掉液体,将离心管倒立于铺 开的纸巾上;数分钟后,直立离 心管,枯燥 DNA (自然风干或用 风筒吹干);(14) 参加 50 卩 I x TE(含 RNase缓 冲液,使DNA溶解,置于37 恒 温箱约15 h,使RNA消解;(15) 置于-20r保存、备用。2. DNA质量检

6、测琼脂糖电泳检测,原理和方法见实验二。六、考前须知(1)叶片磨得越细越好。(2)移液器的使用。( 3 )由于植物细胞中含有大量的 DNA 酶,因此,除在抽提液中参加 EDTA抑制 酶的活性外,第一步的操作应迅速,以免 组织解冻,导致细胞裂解,释放出DNA酶,使 DNA 降解 思考题:1. 本实验中所用到的各试剂的作用是什 么 CTAB, 氯 仿 , 异 丙 醇 , 75% 乙 醇 , EDTA2提取基因组 DNA 的方法有哪些各有何 优缺点实验二 多聚酶链式反响(polymerase chain reaction, PCR)基因扩增及 琼脂糖凝胶电泳检测一、实验目的通过本实验学习 PCR 反响

7、的根本原 理,掌握PCR的根本操作技术以及琼脂糖 凝胶电泳技术。二、实验原理PCR用于扩增位于两端序列之间的DNA 区段,即通过引物延伸而进行的重复 双向 DNA 合成。根本原理及过程如下:PCR 循环过程中有三种不同的事件发 生:1模板变性;2引物退火;3 热稳定 DNA 聚合酶进行 DNA 合成。1 变性:加热使模板 DNA 在高温下94-95 C变性,双链间的氢键断裂而形 成两条单链,即变性阶段。2. 退火:在体系温度降至 37-65C, 模板 DNA 与引物按碱基配对原那么互补结 合,使引物与模板链 3端结合,形成部 分双链DNA,即退火阶段。3. 延伸:体系反响温度升至中温 72C,

8、 耐热 DNA 聚合酶以单链 DNA 为模板,在 引物的引导下,利用反响混合物中的 4 种 脱氧核苷三磷酸dNTP,按5到3方向 复制出互补DNA,即引物的延伸阶段。上述 3 步为一个循环,即高温变性 、低 温退火 、中温延伸 3 个阶段。从理论上讲, 每经过一个循环, 样本中的 DNA 量应该增 加一倍,新形成的链又可成为新一轮循环 的模板,经过2530个循环后DNA可扩 增106109倍。典型的PCR反响体系由如下组分组成:DNA 模板、反响缓冲液、 dNTP、 MgCl2、 两条合成的DNA引物、耐热DNA Taq聚合 酶。琼脂糖凝胶电泳的原理:琼脂糖是一种 天然聚合长链状分子,沸水中溶

9、解,45 C开始形成多孔性刚性滤孔,凝胶孔径的大 小决定于琼脂糖的浓度。 DNA 分子在碱性 环境中带负电荷,在外加电场作用下向正 极泳动。 DNA 分子在琼脂糖凝胶中泳动 时,有电荷效应与分子筛效应。 不同 DNA, 其分子量大小及构型不同,电泳时的泳动 率就不同,从而分出不同的区带。琼脂糖 凝胶电泳法别离DNA,主要是利用分子筛 效应,迁移速度与分子量的对数值成反比 关系。溴化乙锭EB为扁平状分子,在 紫外照射下发射荧光。 EB 可与 DNA 分子 形成EB-DNA复合物,其发射的荧光强度 较游离状态EB发射的荧光强度大10倍以 上,且荧光强度与 DNA 的含量成正比。 用 肉眼观察,可检

10、测到 5 ng 以上的 DNA。三、实验材料及相关试剂基因组DNA,基因特异性引物,PCR 扩增相关试剂,等四、实验步骤1 模板 DNA 的抽提:实验一所得的水稻 基因组 DNA。2. PCR操作(在冰上操作):(1) PCR反响混合液的配制:反响体系 25卩L在无菌的mL离心管中按以下操作 程序加样:反响物加样体积/ |iL顺序终浓度ddH2O1x n10 x Buffer2x n1 x25mmol/L3xnmmol/LMgCl210mmol/L4xn200dNTPp mol/L10 pM上游引51 x np mol/L物10 pM下游引61 x np mol/L物DNA Taq聚合7x n

11、1 U酶(2) 将反响混合液混匀,然后每个PCR 管中分装24卩反响混合液,再加1卩模 板DNA,最后加1滴石蜡油,防止水分蒸 发,然后稍离心。(3) 将PCR管放到PCR热循环仪中, 按以下程序开始循环:94 C 4 min | (预变性)194 L 30 sec,60C 30 sec, 72C 2 min72 C 7 min35个循环(4) 考前须知由于PCR灵敏度非常高,所以应当采取 措施以防反响混合物受痕量 DNA 的污染。a. 所有与 PCR 有关的试剂,只作 PCR 实验用,而不挪作它用。b. 操作中所用的PCR管、离心管、吸管 头等都只能一次性使用。c. 每加一种反响物,应换新的

12、枪头。3. PCR产物的检测:琼脂糖浓度%; EB浓度5卩I /100 ml TBE 1制胶以 150 mL 为例a. 称取 1.8 g 琼脂糖,参加 150 mI 的TBE缓冲液pH,摇匀, 用电子天平称三角瓶的总重 量。b. 电炉上加热, 至琼脂糖完全溶解; 然后在天平上加蒸馏水至原重量 ;c. 用凝胶将制胶板两端封好,插 入适当的梳子,将溶解的琼脂糖(约50C),倒入其中,直 至厚度为46 mm (如有气泡 要把气泡赶出) ,在室温下冷却 凝固 (约 30 45 min);d. 将制胶板置于电泳槽中,小心垂直 向上拔出梳子,以保证点样孔完好。( 2 )点样a. 将卩I溴酚蓝参加到PCR产

13、物中, 然后稍微离心;b. 每孔点样 yj蓝色样品混合物将 沉入点样孔下部。( 3 )电泳翻开电源开关,调节电压至 35V/cm(约100 V),可见到溴酚蓝条 带由负极向正极移动,约 1 小时 后即可观察。( 4)染色将电泳好的凝胶放入含EB的水溶液中 , 染色 15-20 分钟5观察将电泳好的胶置于紫外透射检测仪 上,戴上防护观察罩,翻开紫外灯,可见 到橙红色核酸条带,根据条带粗细,可粗 略估计该样品 DNA 的浓度。如同时有 分子量的标准 DNA 进行电泳,那么可通过线 性 DNA 条带的相对位置初步估计样品的 分子量。6考前须知a. 煮胶时,胶液的量不应超过三角 瓶容量的 1/3,否那

14、么易溢出。b. 煮好的胶应冷却至 50 C左右时 再倒,以免制胶板变形,并减少漏胶的机 会。c. 倒胶注意厚度4-6 mm,充分凝 固后再拔出梳子,以保持齿孔形状完好。 也可待胶稍凝固后,放入4C冰箱10多分 钟,以加速胶的凝固。d. 加样前赶走点样孔中的气泡,点 样时吸管头垂直,切勿碰坏凝胶孔壁,以 免使带型不整齐。e. 一般情况下不必每点一个样品都 换枪头,吸电泳缓冲液洗几次即可再点下 一个样品。凝胶中含有EB,切勿直接用手 接触胶,废弃胶应集中处理,勿乱丢。思考题 :1 PCR 反响液中主要成分是哪些在 PCR 反响过程中各起什么作用2. 为什么在PCR反响过程中,使用三个 不同的温度变

15、化3. 用PCR扩增目的基因,要想得到特异 性产物需注意哪些事项实验三植物总RNA的提取一、实验目的通 过 本 实 验 学 习 从 植 物 组 织 中 提 取 RNA 的方法二、实验原理RNA 是一类极易降解的分子, 要得到完 整的RNA,必须最大限度地抑制提取过程 中内源性及外源性核糖核酸酶对 RNA 的 降解。高浓度强变性剂异硫氰酸胍,可溶 解蛋白质,破坏细胞结构,使核蛋白与核 酸别离,失活 RNA 酶,所以 RNA 从细胞 中释放出来时不被降解。细胞裂解后,除 了 RNA,还有DNA、蛋白质和细胞碎片, 通过酚、氯仿等有机溶剂处理得到纯化、 均一的总 RNA。三、仪器、药品与试剂配方一仪

16、器1 低温离心机2 分光光度计3 琼脂糖胶电泳系统, 用前先用 1% NaOH溶液浸泡过夜,之后再用DEPC水浸 泡冲洗。4 高压灭菌锅5 研钵、剪刀、一次性手套等(二) 药品1. 焦碳酸二乙酯 (DEPC)2. 吗啉代丙烷磺酸 (MOPS)3. 异硫氰酸胍4. 醋酸钠 (NaAc)5. 氯仿6. 苯酚7. 甲醛8. 乙醇9. 乙二胺四乙酸 (EDTA)10. 琼脂糖11. 异丙醇(三 ) 试剂配方1. % DEPC水0.1ml DEPC 参加 100 ml 三蒸水中,振 摇过夜,再湿热灭菌。2. 2 mol/L NaAc、 mol/L EDTA、4 mol/L 异硫氰酸胍、 4 mol/L

17、LiCl 等均用DEPC水 配制。3. 5X MOPS电泳缓冲液pHMOPSmol/LNaAc 40 mmol/LEDTA 5 mmol/L四、实验步骤 一 总 RNA 的提取方案一1. 实验前 10 天左右播种水稻种子,在3-4 叶期,剪取 1.2 g 幼叶。放入研钵, 在液氮中研磨成粉末状, 移入 10 mL 离心管。参加4 mol/L 异硫氰酸胍4mL苯酚3 mL2 mol/L NaAc (pHmL氯仿mL混匀,冰浴放置 30 min 。2. 4C,8000 r/min ,离心 13 min 。3. 弃沉淀,取上清至另一干净无菌离心 管中。4. 参加2倍体积无水乙醇,-70C, ho5.

18、 4C, 8000 r/min,离心 13 min。6. 弃上清,在沉淀中参加 1 mL 4 mol/L LiCI,使其溶解。7. 移入 mL 离心管中,冰浴 2 ho8. 4C, 13000 r/min ,离心 15 mino9. 弃上清,在沉淀中参加 400 uL DEPC 水,再参加400 uL氯仿,混匀。10. 4C, 13000 r/min ,离心 6 mino11. 取上清 ,并参加 1/10 体积 3 moI/L NaAcpH , 2 倍体积无水乙醇, -20C 放置 30 min。12. 4C, 13000 r/min ,离心 20 mino13. 将沉淀RNA用70%乙醇洗涤

19、2次。14. 将沉淀RNA室温下稍枯燥。15. 加 30 uL DEPC水溶解,-70C保存。二 总 RNA 的提取方案二利用TRIzol提取液抽提RNA,具体 步骤如下:1. 取幼叶约 250 mg 在液氮中研磨至细 粉,转入预冷的 ml 离心管;2. 参加1 ml TRIZOL提取液震荡摇匀;3. 室温放置 5 min 后,参加 ml 的氯仿, 剧烈摇动离心管 5 min;4. 在8 C条件下,12000 rpm 离心15 min;5. 溶液分为两层, 下层为酚氯仿浅 红色液层,将上层液体移入干 净离心管, 参加 ml 异丙 醇在1530C条件下,沉淀10 min;6. 然后在,28C条件

20、下,12000 rpm离 心 10 min, RNA 沉淀管壁和底部;7. 去掉液体局部, 参加 1 ml 75%酒精洗2 次;8. 风干后,参加25 pl DEPC处理过的水溶解RNA,储藏于-80 C冰箱备用(三) 甲醛变性琼脂糖凝胶电泳分析总RNA1配制 %变性琼脂糖凝胶 (40 mL)称取0.48 g,参加DEPC水 mL,5X电泳缓冲液 4 mL, 加热使溶解,稍冷却加 入甲醛 mL, 混匀,室温凝固 h.2. RNA 电泳检测样品制备RNA2 卜1甲醛|11甲酰胺口110X MOPS2 口1RNA Loading 2 口1Buffer灭菌的DEPC 4 口1水混合液轻轻混匀并离心,

21、放于65 r下 温育 5 min 后,置于冰上。3. 电泳检测将%变性琼脂糖凝胶放入水平电泳槽中,加1 x MOPS电泳缓冲液,覆盖凝胶 约1 mm。将RNA样品加到凝胶点样孔中, 在 5 V/cm 条件下电泳 30 min ,然后在 EB 中染色 15-20 min ,在紫外灯下观察提取的 RNA的质量。五、考前须知1 在研磨过程中,利用液氮时刻使 组织保持冰冻状态。2RNA 酶是一类生物活性非常稳定 的酶类, 除了细胞内源 RNA 酶外,外界环 境中均存在 RNA 酶,所以操作时应戴手 套,并注意时刻换新手套。思考题:1. 实验中所用到的各试剂的作用是什么 焦碳酸二乙酯 (DEPC), 吗

22、啉代丙烷磺 酸 (MOPS), 异硫氰酸胍 , 醋酸钠 (NaAc), 氯仿,苯 酚 , 甲 醛 , 乙 醇 , 乙 二 胺 四 乙 酸 EDTA, 异丙醇动植物组织 mRNA 提取实验方法一、材料水稻叶片或小鼠肝组织。二、设备 研钵,冷冻台式高速离心机,低温冰 箱,冷冻真空枯燥器,紫外检测仪,电泳 仪,电泳槽。三、试剂1、无 RNA 酶灭菌水:用将高温烘烤 的玻璃瓶180C 2小时装蒸馏水,然 后参加的DEPC体积/体积,处理过夜 后高压灭菌。2、75%乙醇:用DEPC处理水配制75% 乙醇,用高温灭菌器皿配制 ,然后装入 高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。3、1层析柱加样缓冲液;20mm

23、ol/LTris Cl; L NaC, 1mmol/L EDTA, % SDS4、 洗脱缓冲液:10mmol/L Tris C-l ,1mmol/L EDTA ,% SDS。四、操作步骤(一)动植物总 RNA 提取 -Trizol 法Trizol 法适用于人类、 动物、植物、 微 生物的组织或培养细菌,样品量从几十毫 克至几克。用 Trizol 法提取的总 RNA 绝无 蛋 白 和 DNA 污 染 。 RNA 可 直 接 用 于 Northern 斑点分析,斑点杂交, Poly(A)+ 别离,体外翻译, RNase 封阻分析和分子 克隆。1、将组织在液 N 中磨成粉末后,再 以 50-100m

24、g 组织参加 1ml Trizol 液研磨, 注意样品总体积不能超过所用 Trizol 体积 的 10%。2、研磨液室温放置 5 分钟,然后以 每 1mlTrizol 液参加的比例参加氯仿, 盖紧 离心管,用手剧烈摇荡离心管 15 秒。3、取上层水相于一新的离心管,按 每 mlTrizol 液加异丙醇的比例参加异丙 醇,室温放置10分钟,12000g离心10分 钟。4、弃去上清液,按每 ml Trizol 液加 入至少 1ml 的比例参加 75%乙醇,涡旋混 匀,4C下7500g离心5分钟。5、小心弃去上清液,然后室温或真 空枯燥 5-10 分钟, 注意不要枯燥过分, 否 那么会降低 RNA

25、的溶解度。然后将 RNA 溶 于水中,必要时可 55C -60C水溶10分 钟ORNA可进行mRNA别离,或贮存于70% 乙醇并保存于 -70C。注意 1、整个操作要带口罩及一次性 手套,并尽可能在低温下操作。2、加氯仿前的匀浆液可在-70 C保存 一个月以上,RNA沉淀在70%乙醇中可在 4 C保存一周,-20 C保存一年。(二) mRNA提取由于mRNA末端含有多poly(A)+,当 总RNA流径oligo(dT)纤维素时,在高盐缓 冲 液 作 用 下 , mRNA 被 特 异 的 吸 附 在 oligo(dT)纤维素柱上,在低盐浓度或蒸馏 水中, mRNA 可被洗下,经过两次 oligo

26、(dT) 纤维素柱,可得到较纯的 mRNA。1、用 L NaOH悬浮-1.0g oligo(dT)纤维 素。2、将悬浮液装入灭菌的一次性层析 柱中或装入填有经 DEPC处理并经高压灭 菌的玻璃棉的巴斯德吸管中,柱床体积 为,用 3 倍柱床体积的灭菌水冲洗柱床。3、用 1x 柱层析加样缓冲液冲洗柱床, 直到流出液的 pH 值小于。4、将一中提取的 RNA液于65C 温育 5 分钟后迅速冷却至室温,参加等体 积 2x 柱层析缓冲液, 上样,立即用灭菌试 管收集洗出液, 当所有 RNA 溶液进入柱床 后,参加 1 倍柱床体积的 1x 层析柱加样 溶液。5、测定每一管的 OD260,当洗出液 中 OD

27、 为 0 时,参加 2-3 倍柱床体积的灭 菌洗脱缓冲液, 以 1/3 至 1/2 柱床体积分管 收集洗脱液。6、测定OD260,合并含有 RNA的洗 脱组分。7、参加 1/10 体积的 3M NaAc, 倍体 积的冰冷乙醇, 混匀,-20 C 30分钟。8、4C下12000g离心15分钟,小心 弃去上清液,用70%乙醇洗 涤沉淀,4C 下 12000g 离心 5 分钟。9、小心弃去上清液,沉淀空气枯燥10 分钟,或真空枯燥 10 分钟。10、用少量水溶解 RNA 液,即可用于 cDNA 合成(或保存在 70%乙醇中并贮存 于-70C)。注意1、mRNA在70%乙醇中-70C 可保存一年以上。

28、2、oligo(dT)纤维素柱用后可用I NaOH 洗净,然后用层析柱加样缓冲液平衡,并 参加叠氮钠(NaN3)冰箱保存,重复使用。 每次用前需用 NaOH 水层析柱加样缓冲液 依次淋洗柱床。RNA提取流程RNA( total RNA)和信使 RNA(mRNA的抽提RNA的提取RNA和无RNA酶的环境原核生物能产生功能上截然不同的三种 RNA,信使RNA(mRNA)核糖体RNA (rRNA),转运RNA(tRNA)而真核生物那么能产生四种,还有一种为真核生物所持有的 小是由基因转录而来的,它运送编码蛋白所需的信息由于mRNA代表了基因表 达的水平,因此mRNA的别离,定量和检测极为重要.应用R

29、NA对细胞和分子生物学的各个方面进行研究非常普遍.RNA存在于从简单的逆转录病毒到哺乳动物细胞的所有的生命形式之中 .由于当前没有一种方法能 够直接扩增RNA,因此,RNA的别离通常是决定实验结果质量的第一步,也是关键 的一步.提取RNA过程中防止RNA酶的污染所采取的步骤RNA别离的实用方法既有简单直接的方法(如别离rRNA和tRNA)也有困难和涉 及复杂步骤的方法(如别离mRNA).在无细胞体系中克隆基因的体外转录非常有 用,它可以产生足量的同源RNA分子用作探针或模板以识别和测定表达基因的量 或用于RNA的生化研究,处理RNA样品时必需仔细小心,其程度取决于样品的用 途和来源由于RNA酶

30、存在于所有的生物中并且能够抵抗诸如煮沸这样的物理破 坏,固此建立一个无RNA酶的环境对于制备优质 RNA很重要.对于制备mRNA来 说这些预防措施尤其重要 .工作区域应与进行普通微生物实验的区域别离好 ,特别是那些用于细菌接种 ,培 养基和试剂配制的区域,那些培养基和试剂用于从细菌和动物细胞中进行DNA的制备和操作.通常认为这些区域富含RNA酶.如有可能,使用标有无RNA酶的商品试管,吸头,溶液和水.通常新的无菌处理过 的塑料试管和吸管无RNA酶,3双蒸水ddH20和溶液应该用RNA酶的抑制剂DEPC焦碳酸二乙酯进行处理: 每100mL溶液或水中参加DEPC原液,放在摇床上充分混匀并在37 C

31、下作用数小 时.然后将溶液高压灭菌15min使DEPC失活.4用分子级的试剂和DEPC处理过的水配制的溶液通常没有 RNA酶.5别离RNA以前将一些实验室玻璃制品置于烤箱在 300 C烘烤4h以灭活核酶. 如有可能 ,将其他设备也灭菌处理 .从组织中提取RNA那么要注意:动物器官的解剖器械 存放组织块的玻璃器皿 冻存组织块所用的器皿组织器官的冲洗液人汗含有RNA酶,故在所有步骤中均应戴手套并经常更换. 记住我们的周围环境含有大量的微生物和气雾 ,它们来自吸液操作或来自我们自 己的呼吸.这些可能造成RNA酶的污染一些组织像脾脏可能比其它组织含有更多的RNA酶.细菌比哺乳动物细胞中有更多的RNA酶

32、.因此从这些细胞中制备 RNA应采取更严格的预防措施.别离后的RNA通过琼脂糖凝胶电泳再经溴化乙锭染色后便可检查其是否完整.rRNA18s和28s条带模糊可能说明由RNA酶引起的RNA的降解. 一步法别离 RNA应用从组织或细胞中别离细胞的总 RNA 从液体样品中别离 RNATRI REAGENT Tripure是一种用于RNA别离的商品溶液.该法源于chomc- zynski的RNA别离一步法.它更便于使用并且结果更加可靠.对于来源有限的样 品,我们推荐使用这种试剂.这种试剂能从同一样品中同时别离 RNA, DNA蛋白质.用I mL Tripure/50-100mg 组织匀浆组织样品.对于细

33、胞,每10cm2面积贴壁的单 层细胞或每106个细胞细胞沉淀使用1mL.将样品转至管中.-70 C可保存1月 室温下放置样品5min.每1mL Tripure中参加氯仿并摇动15s,置于室温下 215min.4 C下 12000g 离心 15mi n.将水相上部转至一个新EP管.每1mL Tripure参加异丙醇沉淀RNA将样品置于室温下 510min.4 C ,12000g离心10min.凝胶样沉淀物为 RNA.吸出上清并用1mL 75%乙醇在涡旋振荡器上洗涤 RNA沉淀一次,4 C , 7500g离 心 5min.晾干RNA沉淀.然后用无RNA酶的水,甲酰胺或 的SDS容液溶解沉淀.RNA

34、的检测:将样品稀释液于三处波长处读取 OD 值.记录0D值,通过计算确定RNA浓度或纯度.公式如下对于 ssDNA:ssDNA=33X (OD26一 OD310)淋释倍数 对于 dsDNA:dsDNA=50X (OD26OD 310)稀释倍数 对于 ssRNA:ssRNA=40X (OD26一 OD310H稀释倍数 以上浓度单位为 ug/mL.考前须知1) OD310值是背景,假设盐浓度较高,OD310值也高.2) OD260/OD280对DNA而言其值大约为,高于有RNA污染.低于那么有蛋白质污染.3) OD260/OD280.对RNA而言其值大约为.小结所有可能与RNA接触的器材均得用DEPC处理.操作过程中应带口罩 ,手套.DEPC有致癌之可能,尽量防止接触皮肤 提取的RNA应尽早逆转录成 cDNA.逆转录聚合酶链式反响(RTPCR)RTPCR间接用来扩增从RNA分子今得到的一段特异序列.RNA首先被逆转录为 cDNA用位于一段特异序列或者

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