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文档简介

1、蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设和新型溶栓药物的设计与研制计与研制分子医学教育部重点实验室分子医学教育部重点实验室2005-6-15蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制复制复制翻译翻译蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质结构转换为计算机语言蛋白质结构转换为计算机语言 计算机作结构分析和处理计算机作结构分析和处理 (最简单、唯一的方式进行表达最简单、唯一的方式进行表达)蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制编

2、码方式不编码方式不足以表达蛋足以表达蛋白质分子空白质分子空间结构间结构蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制计算机工作站计算机工作站 软件软件 连接表连接表(PDB数据库数据库) (蛋白质分子三维结构图蛋白质分子三维结构图)蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质分子蛋白质分子成为间谐振成为间谐振动力学模型动力学模型 Hook 定律计定律计算原子势能算原子势能蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的

3、设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制非键作用:力场方法非键作用:力场方法计算计算成键作用:量子化学成键作用:量子化学计算计算蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白分子对接:蛋白分子对接:1、实时图形对接、实时图形对接2、自动对接、自动对接蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶

4、栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制t-PA 和 新型 t-PA蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制t-PA t-PA:PAIPAI-1PlasminogenPlasminPlasmin: Anti-plasmin 2-APFibrin Fibrinogen Fibrin ThrombinFibrin Degradation Products蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的

5、设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制 蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物

6、的设计与研制葡激酶和新型葡激酶葡激酶和新型葡激酶蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制 蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制 Groups n % wt-Sak 20 16 4 75 RGD-Sak 20 2 18 10蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制Sak versus t-PA: similar fibrinolytic potential superior fibrin-specificity much cheaper ( $200:$2000 )Sak versus SK: more efficiency more fibrin-specificity蛋白质构效关系和新型溶栓药物的设计与研制Two functions:Antiplatelet Agg

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