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文档简介

1、1 遗传学教学大纲讲稿要点第一章绪论关键词:遗传学 Genetics 遗传 heredity 变异 variation 一遗传学的研究特点1. 在生物的个体,细胞,和基因层次上研究遗传信息的结构,传递和表达。2. 遗传信息的传递包括世代的传递和个体间的传递。3. 通过个体杂交和人工的方式研究基因的功能。“遗传学”定义遗传学是研究生物的遗传与变异规律的一门生物学分支科学。遗传学是研究基因结构,信息传递,表达和调控的一门生物学分支科学遗传 heredity 生物性状或信息世代传递的现象。同一物种只能繁育出同种的生物同一家族的生物在性状上有类同现象变异 variation 生物性状在世代传递过程中出

2、现的差异现象。生物的子代与亲代存在差别。生物的子代之间存在差别。遗传与变异的关系遗传与变异是生物生存与进化的基本因素。遗传维持了生命的延续。没有遗传就没有生命的存在,没有遗传就没有相对稳定的物种。变异使得生物物种推陈出新,层出不穷。没有变异,就没有物种的形成,没有变异,就没有物种的进化,遗传与变异相辅相成,共同作用,使得生物生生不息,造就了形形色色的生物界。二. 遗传学的发展历史1865 年 Mendel 发现遗传学基本定律。建立了颗粒式遗传的机制。1910 年 Morgan 建立基因在染色体上的关系。1944 年 Avery 证明 DNA是遗传物质。1951 年 Watson 和 Crick

3、 的 DNA构型。1961 年 Crick 遗传密码的发现。1975 年以后的基因工程的发展。三. 遗传学的研究分支1. 从遗传学研究的内容划分进化遗传学研究生物进化过程中遗传学机制与作用的遗传学分支科学生物进化的机制突变和选择有害突变淘汰和保留有利突变保留与丢失中立突变 DNA多态性发育遗传学研究基因的时间,空间,剂量的表达在生物发育中的作用分支遗传学。特征:基因的对细胞周期分裂和分化的作用。应用重点干细胞的基因作用。转基因动物克隆动物免疫遗传学研究基因在免疫系统中的作用的遗传学分支。重点不是研究免疫应答的过程,而是研究基因在抗体和抗原形成和改变中的作用。2. 从遗传学研究的层次划分群体遗传

4、学研究基因频率的改变的遗传学分支。2 群体遗传学基因结构和基因率的改变例题群体中存在一个隐性有害基因,基因频率是万分之一。如果实行优生政策,不准该个体结婚或生育。基因率降低到十万分之一时,需要多少代?细胞遗传学研究生物在细胞水平的遗传结构和功能的遗传学分支学科。重点:染色体结构合数目的变化与生物表型的关系。进展:细胞表面抗原的形成和改变,细胞信号传导过程中基因的作用。目前的实验:细胞表达系统。例如:无籽西瓜的染色体组成. 普通西瓜 2n 22 诱变成功的4 倍体作母本 X 2倍体父本杂交,获得3 倍体西瓜,在形成生殖细胞时,不能正常减数分裂,所以成为无籽西瓜。分子遗传学研究生物基因组结构和功能

5、的遗传学分支学科。基因工程生物制药分子生物学技术3. 从遗传学研究的对象划分微生物遗传学以微生物为研究对象的遗传学分支。重点研究病毒,细菌,真菌的基因结构,基因功能。基因工程的载体,受体等人类遗传学研究人类遗传和变异规律的分支科学。人类性状的遗传分析遗传病的分布和发生机理遗传病的诊断基因治疗遗传学疾病人类3 千多种,涉及上万个基因。染色体疾病基因突变疾病,线粒体疾病,孟德尔遗传病,多基因遗传病. 1930 年色盲基因第一个定位,1974 年 kappa 轻链缺乏症基因第一个克隆。目前已定位孟德尔遗传病基因1600 多,克隆了其中的940 多种肿瘤抑制基因(antioncogene) Rb de

6、l 13q14 27个 exon, 12 个 intron 视网膜母细胞瘤克隆的概念与类型四克隆1Clone 源于希腊文klon ,嫩枝的意思, 是指从树上取下嫩枝,栽在地上以成另一棵树。是细胞、植物、动物或人的精确的遗传复制。名词,一群具有相同基因型的微生物。2 哺乳动物细胞克隆技术,又称哺乳动物的核移植或无性繁殖技术;它是通过特殊的人工手段(显微操作,电融合等)对哺乳动物特定发育阶段的核供体(胚胎分裂球或体细胞核),及相应的核受体(去核的受精卵或成熟的卵母细胞)不经过有性繁殖过程,进行体外重构并通过重构胚的胚胎移植,从而达到扩繁同基因型哺乳动物种群的目的。3克隆技术存在的问题动物克隆技术虽

7、然取得了一定的进展,但该技术目前还很不完善。存活率低是当今核移植技术的最大缺陷。克隆羊的端粒较同年羊短。可能会减少寿命。基因组印记现象在哺乳动物的发育中普遍存在,基因组印记与动物克隆技术的成功及不足有何关系值得深入研究。核移植过程中产生的个体突变频率高。第二章基因的概念和结构第一节孟德尔遗传分析关键词:显性 dominant 隐性 recessive 基因型 genotype 表型 phenotype 分离定律 law of segragation 自由组合定律 law of independent assortment 复等位基因( multiple gene)顺反子( cistron)3

8、超基因( super gene)假基因 (pseudo gene) 可动基因 ( mobile gene) 染色体外基因复等位基因( multiple gene)连锁(linkage )交换(crossing over)重组(recombination)?插入序列 inserted sequence,IS ?转座子 transposon,Tn 一. 分离定律实验 : P : 红花 X 白花基因型 CC cc 配子 C c F1代红花基因型 Cc 配子 C,c F2代红花白花基因型 CC ,Cc cc 比例 3 : 1 分离定律 : 杂合体的一对等位基因在形成配子时互相不影响地分到雌雄配子中去的

9、规律。基础概念杂合体( heterozygote) :基因座上两个不同的等位基因的个体。纯合体 (homozygote) :基因座上两个相同的等位基因的个体。回交 (back cross) :杂交的子一代与亲代的交配形式。测交 (test cross) :杂合个体与纯合隐性个体的交配形式。性状 (character):生物的形态,结构,生理功能过程的特征。显性 (dominant) :杂合子生物表现出来的性状隐性 (recessive) : 杂合子生物被掩盖的性状。等位基因 (allile):同源染色体上相对位置上的决定同种性状的基因。表型( phenotype ) :生物个体形成的性状表现。

10、基因型 (genotype) :生物个体的基因组成孟德尔假设1. 遗传性状由遗传因子决定。2. 遗传因子是成对存在得。3. 生殖细胞中具有成对因子中的一个。4. 每对因子分别来自雌雄亲代的生殖细胞。5. 形成生殖细胞时,成对因子相互分离。6. 生殖细胞的结合是随机的。7. 遗传因子有显隐性之分。孟德尔分离比实现的条件1. 杂合体的两种配子在形成配子时数目是相等的。2. 两种配子结合是随机的。3. 子二代基因型个体存活率是相等的。4. 显性是完全的。二. 孟德尔自由组合定律实验:黄,满 X 绿,皱基因型 YYRR yyrr 配子 YR yr F1代黄满基因型 YyRr 配子 YR Yr yR y

11、r F2代黄满黄皱绿满绿皱基因型 Y_R_ Y_rr yyR_ yyrr 4 表型比: 9 : 3 : 3 : 1 孟德尔自由组合定律: 两对非同源色体上的非等位基因在形成配子时,各自独立地分开和组合,形成四种基因型的配子。在杂交时四种配子随机结合,形成四种表型,9 种基因型的群体。多对非等位基因分析例题:?AABBCC X aabbcc 子一代自交,子二代中,表型为A-B-C- 的比例是多少?1. 子一代自交,子二代中,基因型为AaBbCc的比例是多少?2. 子一代自交,子二代中,杂合体的比例是多少?一个基因决定了一个性状。一个性状并不一定由一个基因所决定。事实上,很多性状由一系列基因所决定

12、。当考察性状的遗传方式时,是以在其它基因相同的条件下,仅仅列出了差别的基因。例题一对表型正常的夫妇生有一个有病的孩子和一个表型正常的孩子。1. 再生一个是有病孩子的机会是多少。2. 如果表型正常儿子与一个另一个同样类型的表型正常女子结婚,生有病子女的机会是多少。如果一个表型正常,等位基因是杂合的男子与一个纯合隐性基因的病女子结婚,生有5个孩子,其中无病子女的机会是多少,3 病 2 正常的机会是多少。孟德尔分离定律的普遍性适用于单基因遗传性状的分析例如:人类的白化病; RFLP (DNA限制性内切酶片段长度多态性。) EcoR V 酶切人体基因组DNA ,与苯丙氨酸羟化酶基因探针杂交,获得3Ok

13、b和 25kb 的两种类型,父母是正常表型,两个孩子一个是表型正常30kb/25kb杂合体一个是有病个体,25kb/25kb 纯合体,推测,25kb 可能与有病基因连锁。孟德尔定律数据的统计处理适合度测验 (goodness of fit) 实验实际比数与理论比数适合的程度。卡平方测验适合度孟德尔定律的适用范围?并显性:当一对等位基因杂合时,两个基因所控制的性状同时表达的现象。?外显率带有显性基因个体表现出所控制的性状的实际数与理论数之比。第二节连锁遗传分析 F1杂合子形成配子时,两对基因有保持亲代原来组合的倾向,并且这种倾向与显隐性无关。摩尔根的试验摩尔根根据大量实验结果,提出连锁交换定律,

14、即遗传的第三定律:处在同一染色体上的两个或两个以上基因遗传时,联合在一起的频率大于重新组合的频率连锁(linkage) : 同一亲本的基因趋向于联合交换(crossing over) : 同一亲本的基因相互分开,重新组合重组 (recombination) :由于同源染色体上的不同等位基因间的重新组合,产生不同于亲本的类型重组频率 recombination frequency, RF 重组频率的计算:重组频率( RF) :重组型数目 /( 亲本型数目重组型数目) 1% 重组值为一个单位,称一个厘摩,记作1 个 CM 。基因在染色体上的距离以重组值为根据,画出的基因距离图称遗传学图(genet

15、ic map ) 。三点测交 (three point tess cross) 关于连锁和交换的几个实例用 RFLP做Arabidopsis遗传图:两个亲本分别用不同限制性内切酶做酶切,并分别用探针A(蓝色)和探针B(绿色)5 做 Southern 杂交。若两种 RFLP自由分离, F2代中亲本型和重组型出现频率相同(Case I ) ;否则,若二者紧密连锁,重组型出现频率将大大小于亲本型出现频率(Case II) 根据重组频率可以计算遗传标记RFLP间的图距。应用连锁遗传分析做疾病的产前基因诊断地中海贫血是一种常见的遗传疾病,重症型往往造成死亡。可通过产前诊断预防患儿的出生。利用几种限制酶对

16、几个地中海贫血家系的患者及其父母进行RFLP分析。根据所得结果,可选用特定的探针和限制性内切酶对胎儿做产前基因分析。家系分析用限制性内切酶AvaII和探针 IVS 以及限制性内切酶HindIII和探针 pRK28进行分析第三节血型遗传学复等位基因:一个群体中,存在着2 个以上的等位基因。?ABO血型系统遗传方式A 血型: IA I A ; IAi B 血型: I BIB ; IBi AB 血型: IAIBO 血型: ii 例题?一对分别都是AB 血型的夫妻,所生的子女 A 型, AB 型 B 型?某一人群 B 血型占 0.45 ,O 血型占 0.36 ,计算该群体中A 和 AB 血型的比例。孟

17、买血型和类孟买血型特例:临床中发现有一位病人在验血中确定为B 血型,在接受O 型血的输血后,引起凝血反应。在对供血者血液重新检测时发现,其血细胞在与抗A 血清反应时,初时无反应,2 个小时后呈凝集反应。所以确定供血者为A 型,而不是O 型。有一犯罪嫌疑人在犯罪现场留下的唾液鉴定血型是O 型,但是在重点检查某一嫌疑人时,检测出该人的血型是B 型,在其它举证都确凿的情况下,已经确认该人是犯罪人,为什么会出现体液与血液血型不一致的现象?有一 AB 血型男子与O 血型女子结婚,生了一个O 型孩子,分析其原因。 CIS AB 。 9q34 同源染色体不等交换。二 Rh 血型系统遗传分析恒河猴红细胞(Rh

18、esus monkeys抗原)免疫家兔兔抗猴血清检测人红细胞。85产生凝集反应15无凝集反应定名恒河猴红细胞抗原为Rh抗原。 Rh阳性血型的红细胞带有Rh抗原,无抗体。 Rh阴性血型的红细胞没有Rh抗原,有抗体Rh血型新生儿溶血症Rh阴性血型的母亲怀有Rh阳性血型的胎儿,在母亲胎盘异常情况下,临产时会出现母亲的抗体进入新生儿血液中,与婴儿的抗原产生免疫反应,造成婴儿溶血。Rh血型的遗传机制 Rh抗原受控与3 个紧密连锁的基因座: Cc ; Dd ; Ee 。以单倍型方式传递。当 D基因存在时,为Rh阳性。 d 基因没有相应的抗原,是Rh阴性血型。单倍型:一条染色体上的基因组成。CDE ;CDe

19、 ;CdE ;Cde; cDE ;cDe; cdE; cde; 三人类白细胞抗原(hunman lecucocy antigen,HLA )抗宿主反应:受体抗原供体抗体排斥反应:受体抗体供体抗原6 主要组织相容性抗原系统(major histocompatibility antigen system)主要组织相容性复合体基因(major histocompatibility complex gene , MHC)HLA的遗传机制主要组织相容性抗原按免疫性分为三类:第一类:移植抗原(transplantation antigen), 位于 T 淋巴细胞上,编码基因为: HLA A,B,第二类:免

20、疫反应的信息传递抗原。编码基因为: HLA DR ,DQ ,DP 第三类:补体蛋白,与抗原抗体复合物作用。编码基因为:HLA C2,C4 , Bf 同一条染色体上的基因组成被称为单倍型(haplotype )白细胞抗原的单倍型分析父抗原: A2 ,A 11 ,B13, Bw46母抗原: A3, A 9, B5, B7子 1 抗原: A2 A3 B7 Bw46子 2 抗原: A11 A9 B5 B13子 3 抗原: A2 A9 B5 Bw46子 4 抗原: A3 A11 B7 B13子 5 抗原: A3 A11 B7 Bw46 四 MN血型的遗传分析人群中存在着MN 血型系统,受M和 N两个基因

21、控制,并显性。 M N M MM MN N MN NN MN血型的遗传分析 MNSs是紧密连锁的血型基因单倍型是: MS ; NS; Ms;Ns 基因型有10 种: MS ; NS; Ms;Ns MS S; Ms s S NS; s Ns MS NS; s M ; Ms Ns ;例题:用M和 N血清检查一个家庭,确定父亲基因型是NN,母亲是 MM ,儿子是MM 。结论:儿子不是该夫妻的亲生孩子。但是其它血型和方法证明孩子的确是亲生的。发现了 Mg抗原亚型。 M g 抗体不能与M抗原反应。检测结果,父亲表型是具有Mg和 N抗原,基因型是MgN 。五伴性血型遗传Xg血型的遗传分析Xg抗原是目前发现

22、的第一个与性别有关的抗原基因 :Xga 有 Xg抗原 Xg 无 Xg抗原 Xga对 Xg 显性第四节基因组中的转座成分一转座因子玉米粒颜色的遗传。正常:有色有色异常:有色无色,色斑玉米的转座子?玉米色粒调控元件Ac-Ds 系统第 9 染色体7 C 基因,色素合成基因。Ac 基因,自主移动的调节因子。4.5 kb, 5 个 exon, 编码转座酶。Ds 基因,非自主移动的受体因子。 0.5-4.0 kb, 与 Ac 有同源序列。插入引起色素不能合成。?插入序列 (insertion sequence, IS) 仅含有转座酶基因的简单转移序列。长度多在7001500bp 左右。由末端反向重复序列(

23、IR) ,转座酶基因组成。插入基因组中时,在靶位上生成正向重复序列(DR) 常见的 IS 结构IS 长度末端 IR 靶位 DR 插入选择IS1 768 23 9 随机IS2 1327 41 95 热点IS4 1428 18 11( 12) AAAN20TTT IS5 1195 16 4 热点IS10 1329 22 9 TNAGCN IS50 1531 9 9 热点转座子 (transposon, Tn) ?带有转座酶基因等必需基因及抗药性等与转座无关基因的转座因子。结构特征:两端具有同向或反向插入序列,同时,两端的IS 可能相同或不同。常见的转座子:转座子长度标记末端取向Tn 5 5700

24、KanR IS50 反向Tn10 9300 TetR IS10 反向Tn 9 2500 CamR IS 1 正向反转录转座子(retrotransposon)通过 RNA为中介,反转录成DNA后进行转座的可动元件。病毒超家族( viral super family),可编码反转录酶或整和酶,自主转录。呈DNA时,具有 LTR序列。非病毒超家族(nonviral super family ), 不可编码反转录酶或整和酶,不能自主转录。呈DNA时,无 LTR序列。果蝇的转座子P (P Element) 开放阅读框ORF 0 ORF1 ORF2 ORF3内含子 1 2 3 P因子表达差异: ORF

25、0,1,2 66 KD , 转座阻遏物 ORF 0 ,1 ,2 ,3 87KD , 转座酶P 型细胞质:含66 KD , 阻遏转座酵母的转座子Ty (Transposon yeast)转座引起的遗传效应?插入突变?插入失活?插入带来新的基因?非精确解离形成突变( 缺失,重复,到位) ?插入激活第五节其它基因结构一顺反子( cistron)?早期的基因概念:基因是一个功能单位,重组单位,突变单位。?发展的基因概念: 基因是一个功能单位, 基因内部可突变和重组。一个基因就是一个顺反子。基因的顺式和反式排列?1977 年 Sanger X 174 基因转录起始点不同,但是共用同一段DNA 序列或几个

26、核苷酸的不同基因。二染色体外基因?线粒体基因组8 ?线粒体是真核细胞中的细胞器。每个细胞中含有几十至数千个线粒体。每个线粒体有多个线粒体基因组拷贝。线粒体是非孟德尔式遗传方式,在高等生物中具有母性遗传的特征。mt DNA的遗传特征?母性遗传: mtDNA全部来自母亲,线粒体随机分配到子细胞。?mtDNA无内含子,无修复系统。?mtDNA复制,转录,翻译所需的酶由核基因组提供。?mtDNA一般没有蛋白质保护。?mtDNA合成存在与细胞整个周期。?具有突变和缺失热点。mtDNA致病的遗传机制?线粒体基因组本身突变?线粒体基因组突变可以引起视觉神经和心肌性疾病。点突变:由于mtDNA裸露,易受损伤,

27、且无修复机制。所以突变频率较高。11778 密码突变, arg-his 视觉神经性疾病。缺失:常见5kb, 8470bp-13447bp 7.4kb, 8637bp-16073bp mtDNA插入核基因组溶酶体途径:核酸水解酶下降,mtDNA不能完全消化,片段游离在细胞质中。直接游离: mtDNA复制中同源重组,产生mtDNA断片。线粒体崩解:由于理,化,病等因素,线粒体肿胀破裂,释放出mtDNA. 以上 DNA片段插入核基因组,造成突变。基因的相互作用?互补基因( conplementary genes)修饰基因?修饰基因( modifiers)?上位效应( epistasis)第三章肿瘤的

28、遗传学关键词 : ?细胞周期?癌基因 (oncogene) 病毒癌基因 V-oncogene 细胞癌基因 C-oncogene ?抑癌基因 (antioncogene,tumor suppressor gene) ?肿瘤转移抑制基因(metastasis suppressor gene)一.肿瘤的生物学特征与流行病学肿瘤是基因的疾病,凡是肿瘤, 都与基因组的变异有关。但是,与基因组有关的疾病并不一定都是遗传的。肿瘤有遗传性的,也有非遗传性的( 散发性的 ) 。?单克隆起源(monoclonal theory)一个肿瘤的细胞群体源于一个转化单细胞的不断增殖而成。对细胞群的遗传标记分析,具有高度一

29、致性。例如: 多灶性细支气管肺泡癌(BAC ) , 原发灶,卫星灶, 转移灶中的不同区域的癌细胞k-ras具有相同的突变。肿瘤家族集聚?癌家族:具有较多成员发生肿瘤的家族。 G家族 1895年 1976 年 842 名成员中95 名患癌。特征:发病率高;发病高峰4050 岁;男女比例相等;男多是胃癌,肠腺癌;女多是子宫癌。垂直传递, 72患者双亲之一患癌。符合常染色体显性遗传方式。?家族性癌:在一个家族内多个成员出现的同一种癌。例如:结肠癌,1215有家族史。特征:患者一级亲属发病风险比一般高3 倍。若发病年龄早和双侧性肿瘤,发病风险高30倍。常见的遗传性肿瘤肿瘤易感基因9 在相同环境下发生肿

30、瘤可能性比一般基因组具有更多机会的基因。肺癌易感基因CYP 1A1酶在肺中表达,参与烟草中多环芳烃类物质代谢。该基因具有Msp I 多态, m2m2 基因型具有肺癌易感性。染色体畸变的原因二. 肿瘤的遗传机制?癌基因的异常表达癌基因突变癌基因低甲基化癌基因扩增染色体易位 ( 基因重排,融合基因) ?抑癌基因失活癌基因能在体外引起细胞转化,在体内诱发肿瘤的基因。?细胞内的原癌基因高度保留,从酵母到人都存在,这些基因与细胞生长,增殖,分化有关,并受到精细和严格的控制。?原癌基因具有的生物学功能:生长因子;生长因子受体;参与信号传导的蛋白激酶;核内蛋白等。细胞周期抑癌基因高甲基化调节基因细胞 G1期

31、 S 期癌基因发现?1911 年 Rous 发现鸡肉瘤病毒(RSV )能使鸡胚成纤维细胞转化,也能使鸡诱发肿瘤。?1976 年从 RVS病毒中发现了src 癌基因。克隆了该基因,是第一个Vonc ?1982 年从人膀胱癌细胞中分离出了细胞癌基因ras 基因。是第一个 C-onc 细胞癌基因 (c-onc) 1976 年, Bishop 从 Rous病毒中分离出癌基因src, 并在动物正常细胞中发现有同源序列。 以后在许多病毒癌基因都在细胞中都发现了它的同源序列,这些序列被称为细胞癌基因。病毒癌基因源于细胞癌基因。癌基因致癌机制癌基因突变原癌基因ras 编码 189 个氨基酸的蛋白是一个细胞信号

32、传导中起着开关作用的蛋白,当ras gene 突变时, ras 蛋白一直处于开的状态,细胞生长。ras proto-oncogene 1 12 61 189 gly gln arg ( G C), k-ras oncogene ?ras 附近插入了启动子,启动癌基因表达。?ras 的 CCGG 甲基化程度降低,癌基因异常高表达。DNA的 CpG岛的甲基化,干扰了转录因子与启动子识别位点的结合,降低了基因的表达。癌基因去甲基化,引起高表达致癌。抑癌基因高甲甲基化,引起低表达致癌。肿瘤抑制基因(tumor suppressor gene)一类与细胞周期调控有关的基因,当这些基因正常表达时,具有抑制

33、细胞分裂的功能。这些基因的失活或缺失,会导致细胞非正常的分裂,正常细胞有可能转化为肿瘤细胞。首先发现的肿瘤抑制基因视网膜母细胞瘤发现 Rb基因缺失呈杂合体时,细胞是正常的, 缺失纯合体时细胞转化。显示该基因是纯合隐性致癌。 Rb 纯合缺失后致癌表明Rb 基因存在时对肿瘤细胞有抑制作用,因此Rb是肿瘤抑制基因。 del(13) (q14) 肿瘤抑制基因 (tumor suppressor gene) 抑癌基因 (anti-oncogene) 以参与细胞周期调控的形式,对正常细胞的增殖起负调控作用,抑制细胞的恶性转化。癌基因与抑癌基因比较10 特点 oncogene anti-oncogene 基

34、因属性 cell增殖基因组织分化基因致癌方式激活,异常表达基因丢失或失活诱发机理突变或易位突变或缺失致癌机理显性隐性三. 肿瘤细胞转移肿瘤细胞从原发肿瘤脱落,进入细胞外基质与脉管内,输送至远端适宜的组织中克隆生长。浸润转移是恶性肿瘤的重要特征,也是肿瘤病人死亡的主要原因。用 myc等癌基因染小鼠,可以使小鼠产生癌细胞,但是不转移。说明转化与转移不是同一类基因。肿瘤浸润机制整合素基因 (integrins gene) - 细胞表面粘合受体-细胞基质粘附蛋白- 锚定细胞。肿瘤细胞表达金属蛋白酶- 降解粘附蛋白,使得细胞失去固着作用。正常细胞含有金属蛋白酶抑制因子基因(TIMP gene ), 表达

35、的蛋白能与蛋白酶结合,抑制它的水解功能,从而锚定细胞。肿瘤细胞该基因表达受阻。Metastatic gene and metastatic suppressor gene 转移和抑制转移基因浸润转移: 肿瘤细胞从原发肿瘤中脱落,进入细胞外基质和血管或淋巴管中,迁移到远处其它组织生长的现象。肿瘤转移抑制基因实验:小鼠黑色素瘤k-1735 细胞系中发现,去转染正常小鼠,有高转移和低转移之分。消减杂交法寻找转移相关基因nm23 nm23高表达,肿瘤低转移,反之,高转移。应用:可作转移预测;肿瘤转移抑制。肿瘤基因诊断与治疗?Mic mRNA ?gene knockout oncogene ?转基因 (

36、antioncogene) ?免疫法 ( 淋巴因子基因转入) ?自杀基因自杀基因 (suicide gene) 能够编码产生将非活性或无毒性前体药物转化成活性活毒性药物的酶的基因。HSK-tk/GCV( 胸腺激酶丙氧鸟苷) 系统:细胞中存在着胸腺激酶(HSV-tk), GCV是临床上治疗疱疹病毒的药物。将HSK-tk 基因转入癌细胞后给GCV药,使得GCV在胸腺激酶作用下生成三磷酸GCV ,能阻断细胞DNA合成产生细胞毒作用。第四章基因和染色体关键词:重复 duplication 缺失 deletion 倒位 inversion 易位 translocation 一 . 染色体结构的畸变?染色

37、体基因组结构大片段的改变。?重复:染色体区段增加。?缺失:染色体片段丢失。?倒位:染色体位置颠倒。?易位:非同源染色体片段位置互换。重复 duplication 重复的细胞学和遗传学效应?细胞学效应:减数分裂时,同源染色体配对出现弧状结构。弧状结构是重复的部分。?遗传学效应:出现突变,严重时死亡。基因剂量不平衡造成发育异常. 动态突变( dynamic mutation):DNA序列中由于寡核苷酸拷贝数目的变化,引起生物表型改变的突变,称为动态突变。动态突变通常是由三联体密码子重复数目的增加而形成的。11 X脆性染色体综合症是由于在X染色体 P27.3 位置上 CGG 拷贝数目增加到200 以

38、上, 引起基因的改变, 形成痕迹很重的染色体,突变的部分很容易被打断,所以被称为是脆性染色体。脆性位点是染色体上在特殊条件下易断裂的位点,可能为收缩或缝隙。在人类染色体上已发现一系列的脆性位点。其中研究最详尽的位于 X 染色体上, 目前发现其与智障有关。脆性 X综合症为X连锁遗传, 出现几率在男婴中为 1/2500 ,主要成因可能是因为CGG 三核苷片段重复数目的变化。缺失 deletion: 缺失是指染色体部分片段的丢失。缺失往往不会发生回复突变,从而使得未发生缺失的染色体上的隐性等位基因得以表现,也可能造成表达产物不平衡。缺失的细胞学和遗传学效应: 细胞学效应: 减数分裂时, 同源染色体配

39、对出现弧状结构。弧状结构是正常的染色体部分。遗传学效应:出现突变,严重时死亡。有时会出现拟显性现象。倒位:是指染色体一个片段发生颠倒。倒位往往形成无效的配子,从而使算出的重组频率偏低。倒位的细胞学效应和遗传学效应: ?细胞学效应:倒位杂合体在减数分裂同源染色体配对时,形成倒位环。?遗传学效应:倒位区内重组,形成不可育配子。被称为“抑制重组。”平衡致死系紧密连锁或中间具有到位片段的相邻基因由于生殖细胞的同源染色体不能交换,所以可以非等位基因的双杂合子,保存非等位基因的纯合隐性致死基因,该品系被称为平衡致死系。易位 translocation 易位是指染色体片段的转移,既可发生在非同源染色体间,亦

40、可发生在同一条染色体的不同位置。易位往往造成基因移位或断裂,影响基因功能。易位的细胞学效应和遗传学效应?细胞学效应:易位杂合体在减数分裂同源染色体配对时,形成十字型结构。?遗传学效应:形成不可育和可育配子,各占1/2 。被称为“半不育。”二染色体数目的改变整倍数改变单倍体 n 2 倍体 2n 3 倍体 3n 多倍体 4n,5n.同源多倍体( ABC ) (ABC ) (ABC )异源多倍体( ABC ) (ABC)(ABC)染色体数目的改变?非整倍数改变单体 2n-1 缺体 2n-2 双单体 2n-1-1 表观遗传变异(epigenetic variation))基因的 DNA序列不发生改变,

41、但是由于DNA甲基化, RNA选择性剪接等作用,使得基因表达发生改变的现象,称为表观遗传变异。基因组印记(genomic imprinting)基因在世代传递过程中,由于 DNA的甲基化作用, 来源于父母本的等位基因会有不同的表现。个体表现出上代遗传下来的基因组印记的效应。就好像被打上了父母的印记一样。但是,被打上父母印记的基因在生殖细胞形成时,印记会被抹去,重新打上自己的印记。第五章细菌和染色体的遗传分析关键词:12 ?细菌的 F 因子?细菌的杂交?中断杂交(基因梯度顺序分析)?重组作图?转导?转化?顺序四分子分析?噬菌体基因重组一细菌的遗传分析细菌染色体 : 细菌染色体大多为裸露的环状闭合

42、DNA双链,没有组蛋白和其他蛋白质结合,也不形成核小体结构。(这种结构有利于外源DNA的插入。)E.coli基因组 E.coli的染色体为闭合双链环状DNA ,长约 1333um. 2001年 10 月 15日完成了E.coli K12菌株的基因组全序列测定。总共 4639221 bp,4279 个蛋白质编码基因,115 个编码 rRNA和 tRNA 的基因。F 因子高频重组( high frequency of recombination),Hfr 梯度转移作图中断杂交实验:采用Hfr x F- ,根据染色体上基因进入F-细胞的时间和次序作图。 Hfr thr+ leu+ azir tonr

43、 lac+ gal+ strs X F- thr- leu- azis tons lac- gal- strr重组作图( recombination mapping)转导( transdution)由噬菌体作介导,将基因组DNA转入受体细胞的过程,称为转导。转化( transformation)。没有噬菌体作介导,由DNA直接转入受体细胞的过程,称为转化顺序四分子分析单倍体营养体在营养或生长环境不利时,转入有性生殖。菌丝产生的单倍体分生孢子与另一个菌丝的原子囊果中的单倍体子囊孢子杂交。形成 2 倍体的杂合体, 该 2 倍体经过第一次减数分裂,获得一个细胞内含有4 个单倍体的产物,4 个单倍体产

44、物呈直线排列,称为:四分子,对四分子进行的遗传学研究,称为四分子分析(tetrad analysis)着丝粒作图根据四分子标记基因间的交换,计算着丝粒与标记基因的重组值,被称为: 着丝粒作图。DNA损伤修复?避免差错的修复光复活修复切除修复重组修复?倾向差错的修复应急修复( SOS )光复活与切除修复? 1949年发现紫外线的对DNA的损伤可以通过可见光照射而提高生存率。? 1960年 R.B.Setlow 发现紫外线的对DNA的损伤是形成T T 二聚体。?光复活酶修复:光复活酶基因表达,解开TT二聚体。?切除修复: Uvr A,B,C基因编码的内切核酸酶切除TT两端 1213 个 bp,然后

45、在 DNA多聚酶和 DNA连接酶的作用下,以正常的链为复制模板,合成正常的DNA链。重组修复 :1965 年 A.J.Clark发现 uvr 突变后, E.coli仍可对紫外线造成的损伤进行修复,发现了重组修复机制。参与基因rec A 。DNA复制突变?温度敏感型DNA复制突变型:温度 40 度时,正常细菌还可以DNA复制,但是DNA复制突变型受到抑制。把突变型从许可温度转入非许可温度中培养,一种突变型立刻停止DNA复制,称为 DNA复制快停突变型。一种突变型慢慢停止DNA复制,称为DNA复制慢停突变型。?慢停突变型:13 DNA复制中的发动有关基因的突变,当温度达到突变的敏感温度时,该基因停

46、止发动,但是已经复制的DNA将继续延长,停止在DNA复制终点。?快停突变型: DNA复制中的延长链有关基因的突变,当温度达到突变的敏感温度时,该基因停止转录,表达的蛋白也立即失活,DNA复制不再延长。DNA复制停止在任意阶段。?快停突变型: DNA复制中的启动好有关基因的突变,当温度达到突变的敏感温度时,该基因停止转录,但是已经表到的蛋白将继续发挥复制延长的功能,直到蛋白质用完或失活后,DNA链复制停止。Aems法诱变?沙门式杆菌缺陷型,不能在基本培养基上生长,当培养皿的中间涂上待测的药物时,如果没有回复突变,就没有菌落出现,如果出现突变,在药物周围会有菌落生长。与对照相比,突变频率高,说明待

47、测药物诱变强。突变率 : 生物群体中基因突变的比例。显性基因的突变率计算软骨发育不全症是常染色体显性遗传病。如果在 94075 的婴儿中发现10 例本病患者, 其中有 2 例的亲体也患此病,计算该基因的突变率。(102)/ 2 (94075-2= 4.2 X 10-5细菌突变的检测细菌诱变后,是由于后来培养过程中出现的变异还是诱变时出现的变异?链霉素抗性细菌在含有链霉素的培养基上可以生长,敏感型不能生长,突变型是诱变的,还是筛选的?营养依赖型突变筛选第六章基因组关键词 : 基因组( genomic)定位克隆功能克隆定位候选克隆遗传标记一基因组结构C值悖论?生物体单倍体DNA总量称为 C 值。高

48、等生物具有比低等生物更复杂的生命活动,所以,理论上应该是它们的C值也应该更高。但是事实上C值没有体现出与物种进化程度相关的趋势。高等生物的C值不一定就意味着它的 C值高于比它低等的生物。这种生物学上的DNA总量的比较和矛盾,称为C值悖论。DNA序列的分类?基因序列和非基因序列基因序列:以起始密码子开始, 终止密码子结束的一段DNA序列,称为开放阅读框 (open reading frame, ORF)非基因序列:基因序列以外的DNA序列。?编码序列和非编码序编码序列:编码RNA和蛋白质的DNA序列。非编码序:内含子和基因的间隔序列。?单一序列和重复序列单一序列:基因组中只有一份的DNA序列。重

49、复序列:基因组中重复出现的序列。例如,STR ,SNP ,微卫星DNA等。二寻找基因的思路:功能克隆克隆(致病)基因的一种策略。收集所要克隆的基因的蛋白质产物及其功能的信息,用以分离基因,并对基因进行定位。14 定位克隆利用遗传连锁或细胞学定位技术将致病基因定位于染色体的特定区带主要方法:家系调查法体细胞杂交法核酸杂交技术用遗传标记进行基因定位形态标记 morphological markers 细胞标记 cytological markers 生化标记 biochemical markers 分子标记 molecular markers 分子遗传标记在核酸分子水平,对具有相对差异的等位基因D

50、NA多态性的标记,广泛存在于高等生物编码区和非编码区,又称为DNA分子标记,是DNA水平上遗传变异的直接反映。特点 : 1. 直接以 DNA形式表现,在生物体各发育阶段, 各组织均可检测到。 2.数量多,遍及整个基因组。 3.多态性高,自然界存在许多等位突变,无需专门创造特殊的遗传材料 4. 中性,不影响目标性状的表达,与不良性状无必然连锁 5. 许多分子标记表现为共显性(codominance ) , 能够鉴别出纯合基因型与杂合基因型,提供完整的遗传信息分子遗传标记发展RFLP restrict fragment length polymorphism 限制性片段长度多态性。以DNA酶切片段

51、的长度的不同,形成的多态性。SSLP simple sequence length polymorphism 简单序列长度多态性,又称为VNTR variable number tandem repeat 数目可变的串联重复多态性指重复单位相对较小, 由重复单位的序列差异和数目变化, 可形成丰富的多态性。包括 : 小卫星序列 minisatellite 微卫星序列 microsatellite , ?小卫星 DNA标记 minisatellite,核心序列为1160bp ,主要存在于染色体靠近端粒处,由于其拷贝数变化,在不同个体间中存在串联数目的差异,若在重复序列两侧有限制性内切酶酶切位点,则

52、切下来的片段会呈现出多态性。可用于DNA 指纹, DNA Finger 。?微卫星 DNA标记 microsatellite,指以 27 个碱基为核心单位串联重复而成的一类序列(微卫星DNA microsatellite DNA,又称为 STR short tandem repeat 短串联重复序列),由于核心序列重复数目的变化而在群体中呈现出遗传多态性,但在同一家系内具有高度的遗传保守性,以孟德尔方式遗传。散布于整个基因组中。SNP single nucleotide polymorphism 单核苷酸多态性,是指在基因组内特定核苷酸位置上存在两种不同碱基,其中最少一种在群体中的频率不小于1

53、。SNP分为两种形式:基因编码区的SNP ,称为 cSNP遍布于基因组内的大量单碱基变异SNP分析的特点:(1)SNP数量大,分步密集,平均每1000bp 就有一个SNP (2)SNP比 STR扩增更有效,不会产生假带(3)由于 SNP是二态的,易于自动化批量检测,易于用计算机分析结果SNP与 RFLP和 STR等 DNA标记的主要不同在于:不再以“长度”的差异作为检测手段而是直接以序列的差异作为标记。但 SNP单个基因座的多态性很差,只有二态,为此采用多个SNP基因座进行“单倍型”分析十分重要。AFLP amplified fragment length polymorphism 扩增片段长

54、度多态性通过DNA PCR扩增基因组DNA的模板,随后用电泳将扩增片段分离,通过DNA谱带鉴别多态性。RAPD random amplified polymorphism DNA 随机扩增多态性用于扩增多态性DNA的引物是随机的。在做多态性分析时,用一组引物( 2040 个)在基因组全序列上扫描可获得基因组多态性的丰富信息。SSCP single strand conformation polymorphism 单链构象多态性是基于PCR扩增而新发展起来的DNA多态性分析,利用PCR特异的扩增出基因组的目的DNA片段,变性后形成的单链DNA在自然条件下能形成一定的空间构象,并且这种空间构象由D

55、NA15 链的碱基序列决定,若碱基发生变化,将在电泳图谱上表现出不同生物个体的特异性,即多态性。定位候选克隆?该方法是定位克隆的进一步发展?将疾病相关基因定位于染色体相关区域?该染色体区域得到若干候选基因?进一步分析得到目的cDNA 差异表达原理 : 比较不同个体或不同细胞来源,即通常所指的样本 (tester,) 和参照(driver, ) 的蛋白质或RNA两者之间的差异,如缺失或特异表达部分,从而发现新基因消减杂交( subtractive hybrization)利用目的基因在两种组织或细胞中表达的差异,或者在不同发育阶段、不同状态下表达差异, 通过其 mRNA 或单链 cDNA进行杂交

56、, 除去两者之间相同的基因成分,使表达有差异的基因得到充分富集。它的实质是对两组基因转录本全面比较,去同存异, 分离差异表达基因Subtractive cloning 生物信息学方法: 通过序列的ORF预测?建立 cDNA文库?差减杂交得到均质化文库?cDNA序列测定?生物信息学分析,ORF预测同源性比较,功能预测生物信息学网页:NCBI 界面ORF预测软件: ORF Finder 读框预测实例通过 EST拼接例如:已知小鼠某基因在人当中有高度同源序列?用该小鼠cDNA比对人的EST数据库?得到一簇EST后,将相邻的EST通过相互重叠部分进行拼接。?得到人对应的完整cDNA的序列后, 两端设计

57、引物在cDNA文库中进行PCR ,得到该 cDNA的克隆。?至此,与小鼠对应的人的该基因得以克隆出来。EST拼接实例基因芯片技术的应用?使用传统方法寻找新基因,不仅需要投入大量的资金,而且针对性不强,效率低下,绝大部分工作都是繁琐重复劳动?第七章基因与发育关键词 : 细胞分化 , 细胞凋亡 , 形态建成一. 什么是发育?从生物学角度来说,发育是生物的细胞分裂,分化,形态建成,生长繁殖的一系列过程。?从遗传学角度来说,发育是基因按照特定的时间,空间程序表达的过程。研究基因对发育的调控作用的学科就是发育遗传学(Developmental Genetics) 。发育遗传学的研究特点?发育是生物的共同

58、属性发育是贯穿每个生物体的整个生活史。对有性生殖生物而言,则是从受精卵开始到个体正常死亡。其中早期胚胎发育过程包括受精、卵裂和胚层分化,是发育的关键的阶段, 如哺乳类的早期发育过程二. 发育遗传学的研究特点?发育是基因型与环境因子的相互作用遗传控制发育的图式(pattern) ,发育则是基因按严格的时间和空间顺序表达的结果,是基因型与环境因子相互作用转化为相应表型的过程。发育遗传学的研究特点?发育调控基因具有保守性16 无脊椎动物和脊椎动物,如线虫、果蝇和人类的发育途径基本相同,控制发育的基因在进化上是保守的,在结构和功能上有很高的同源性。发育遗传学的研究特点?发育中基因之间的作用生物发育过程

59、中的基因与基因的相互作用对执行了发育进程的调控。个体发育的生物学功能?细胞分化的多样性功能细胞分化形态建成生长?生命的延续性功能性别分化繁殖细胞定向( commitment )?决定( determination): 早期胚胎期间的全能或多能干细胞在基因的调控下,确定了特定细胞的分化趋势,即指定了这些细胞的分化命运。例如:受精卵分裂成512 个细胞时所有细胞已经定位,并确定了特定细胞的形态建成等命运。?特化( specification) :细胞或组织按照已经被决定的命运自主地进行分化,形成特异性组织或细胞地过程。例如:被决定命运的细胞,按照指令继续分化成特定的组织,形成体节,器官等不同形态。

60、细胞分化的基因作用基因的等价性(genome equivalence)全能干细胞所有基因是一致的,并且基因具有相同表达的能力。细胞的全能性指生物体的每个细胞都具有能重复个体的全部发育阶段和产生所有细胞类型的能力。植物的细胞全能性大于动物细胞。双重开关( binary switch ) :在不同发育途径的决定点上,具有多向分化功能起核心作用的基因。细胞编程性死亡(programmed cell death,PCD)多细胞生物的一些细胞在发育中不再为生物体所需或受到损伤时,会激活遗传控制的自杀机制死亡。这种自我毁灭的死亡称为细胞编程性死亡。细胞凋亡( apoptosis)是编程性死亡的一种方式。细

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