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文档简介

1、第二章第二章 dna与遗传信息传递与遗传信息传递o dna双螺旋结构双螺旋结构碱基碱基 - 核苷核苷 - 核苷酸核苷酸o 碱基碱基 / dna双螺旋结构双螺旋结构o 三联密码子三联密码子(triplet condon)o dna半保留复制半保留复制o 分子杂交分子杂交dna双螺旋结构与转录因子双螺旋结构与转录因子dna序列的类型序列的类型o 基因基因 (gene ) vs. 非基因非基因 (non-gene )序列序列o 编码编码 (coding) vs.非编码非编码 (non-coding)序列序列o 单一单一 (unique) vs.重复重复 (repetitive) 序列序列基因基因 v

2、s. 非基因序列非基因序列o 基因序列基因序列 基因组中决定蛋白质的基因组中决定蛋白质的dna序列序列 atg至终止密码至终止密码 可读框可读框 (orf, open reading frame)o 非基因序列非基因序列 基因组中除基因以外的全部基因组中除基因以外的全部dna序列序列 基因间基因间(intergenic) dna序列序列编码编码 vs. 非编码序列非编码序列o 编码序列编码序列 编码编码rna和蛋白质的和蛋白质的dna序列序列 基因中的外显子基因中的外显子(exon)序列序列o 非编码序列非编码序列 基因中的内含子基因中的内含子(intron)序列序列+基因间序列基因间序列单一

3、单一 vs. 重复序列重复序列o 单一序列单一序列 在基因组中只出现过一次的在基因组中只出现过一次的dna序列序列 50,多数为基因序列,多数为基因序列o 重复序列重复序列在基因组中重复出现的在基因组中重复出现的dna序列序列 轻度:轻度:210个拷贝;个拷贝; 中度:中度:10数百个拷贝,常为非编码序列;数百个拷贝,常为非编码序列; 高度:数百数百万个拷贝,高度:数百数百万个拷贝,trna、rrna等。等。重复序列重复序列o 串联串联重复序列重复序列(tandem repetitive sequence) 不同数目的核苷酸重复拷贝串联在一起的高度重复序列。不同数目的核苷酸重复拷贝串联在一起的

4、高度重复序列。 2200bp,主要为卫星,主要为卫星dna。o 分散分散重复序列重复序列(interspersed repetitive sequence) 分布于基因组内散在的重复序列,一般为中等重复序列。分布于基因组内散在的重复序列,一般为中等重复序列。o卫星卫星dna:在氯化铯密度梯度离心时,因为:在氯化铯密度梯度离心时,因为dna中中gc和和at含量的含量的差异,在形成主带之外还形成小的卫星带,这种带的差异,在形成主带之外还形成小的卫星带,这种带的dna中中gc含量含量少于主带,少于主带,构成着丝粒、端粒和构成着丝粒、端粒和y染色体长臂的染色质区染色体长臂的染色质区。o小卫星小卫星dn

5、a (minisatellite dna): 625个核苷酸单元重复组成。个核苷酸单元重复组成。o微卫星微卫星dna (microsatellite dna): 26个核苷酸单元重复组成。个核苷酸单元重复组成。o短串联重复序列短串联重复序列(str, short tandem repeat) 作为遗传标记,具有多态性,与疾病有关。作为遗传标记,具有多态性,与疾病有关。 卫星卫星(satellite)dnao 卫星卫星(satellite)dna分散重复序列分散重复序列o 短分散核酸元件短分散核酸元件 (sine) 500 bp, 10万拷贝;万拷贝; 如:如:alu序列。序列。o 长分散核酸元

6、件长分散核酸元件 (line) 50007000bp, 102104拷贝;拷贝; 如:如: kpn i家族;家族; 构成转座元件。构成转座元件。o 断裂基因断裂基因(split gene)结构结构o 基因基因是具有功能的是具有功能的dna序列片段。序列片段。o 外显子外显子是基因内的编码序列,是基因内的编码序列,内含子内含子是基因内的非编码序是基因内的非编码序列,列,侧翼序列侧翼序列是基因两侧非编码区。是基因两侧非编码区。o gt-ag法则:法则:每个内含子的每个内含子的5端两个核苷酸都是端两个核苷酸都是gt,3端两个核苷酸都是端两个核苷酸都是ag,这种连接方式称为,这种连接方式称为gt-ag

7、法则,法则,是基因表达时剪接的共同机制。是基因表达时剪接的共同机制。o 基因家族基因家族 (gene family):基因组中来源相同、结构相基因组中来源相同、结构相似、功能相关且常成簇存在的一组基因。似、功能相关且常成簇存在的一组基因。o 假基因假基因(pseudogene):具有部分基因结构,但在进化具有部分基因结构,但在进化中由于突变而不能活性表达产生蛋白。中由于突变而不能活性表达产生蛋白。o 外显子外显子/内含子内含子o gt-ag法则法则o 基因家族基因家族/基因簇基因簇o 珠蛋白基因家族和假基因珠蛋白基因家族和假基因o 基因表达基因表达o mrna加工过程加工过程o 加帽加帽 (c

8、apping)o 剪接剪接 (splice)o 加尾加尾 (polyadenylation)转录调控转录调控o 顺式作用元件顺式作用元件(cis-acting element) 是基因是基因(dna)的一部分,的一部分, 直接作用。直接作用。o 反式作用因子反式作用因子(trans-acting factor) 即即转录因子转录因子(transcriptional factor),是一类蛋白,是一类蛋白质,通过与靶序列结合质,通过与靶序列结合或或 基因表达。基因表达。顺式作用元件顺式作用元件o启动子启动子 (promoter) 常位于转录起始点上游常位于转录起始点上游100200bp内,是内,

9、是rna聚合酶结合部位,并相互作用启动基因的转录。聚合酶结合部位,并相互作用启动基因的转录。 tata box 2530bp,转录起始点准确定位;,转录起始点准确定位; caat box 7580bp,定量高效转录;,定量高效转录; gc box 结合结合sp1激活转录。激活转录。o增强子增强子 (enhancer) 包括启动子上下游的一段包括启动子上下游的一段dna序列,能增强基序列,能增强基因转录,其作用不受距离和序列方向的影响。因转录,其作用不受距离和序列方向的影响。o 终止子终止子 (terminator) 由一段回文结构和特定的由一段回文结构和特定的5-aataaa-3序序列组成,是

10、转录终止和加尾信号。列组成,是转录终止和加尾信号。o 顺式作用元件顺式作用元件o 转录因子转录因子ap-1nf-kb基因突变:基因突变:dna水平遗传物质的变化水平遗传物质的变化自然界自自然界自发发 或或 实验室实验室诱发诱发生物进化生物进化 遗传病遗传病/常见病常见病基因突变基因突变 (mutation)o 点突变点突变 (point mutation): 单个碱基置换。单个碱基置换。 转换转换/颠换颠换(1) 同义突变:不改变氨基或蛋白功能;同义突变:不改变氨基或蛋白功能;(2) 错义突变:改变氨基酸和蛋白功能;错义突变:改变氨基酸和蛋白功能;(3) 无义突变:突变成终止密码子,产生截短蛋

11、白。无义突变:突变成终止密码子,产生截短蛋白。o 移码突变移码突变 (frameshift mutation): 碱基的插入或缺碱基的插入或缺失失 下游密码子组成框改变。下游密码子组成框改变。o 动态突变动态突变 (dynamic mutation): 三核苷酸重复拷贝三核苷酸重复拷贝数数。同义突变同义突变 (same sense mutation)o 野生型:野生型: agt cag cag cag ttt tta cgt aac ccg dna met gln gln gln phe leu arg asn pro o 突变型:突变型: agt cag cag cag ttt ttg cg

12、t aac ccg dna met gln gln gln phe leu arg asn pro错义突变错义突变 (missense mutation)o 野生型:野生型: agt cag cag cag ttt tta cgt aac ccg dna met gln gln gln phe leu arg asn pro o 突变型:突变型: agt cag cag cag ttt tca cgt aac ccg dna met gln gln gln phe ser arg asn pro无义突变无义突变 (nonsense mutation)o 野生型:野生型: agt cag cag

13、 cag ttt tta cgt aac ccg dna met gln gln gln phe leu arg asn proo 突变型:突变型: agt cag cag cag ttt tga cgt aac ccg dna met gln gln gln phe 终止终止移码突变移码突变 (frame shift mutation)o 野生型:野生型:agt cag cag cag ttt tta cgt aac ccg dna met gln gln gln phe leu arg asn proo 突变型:突变型:agt cag cag cag ttt tac gta acc cgt

14、 dna met gln gln gln phe tyr val thr arg动态突变动态突变 (dynamic mutation)o 野生型:野生型: agt cag cag cag ttt tta cgt aac ccg dna met gln gln gln phe leu arg asn proo 突变型:突变型: agt cag cag cag cag cag cag cag cag dna met gln gln gln gln gln gln gln glno动态突变:动态突变:邻近基因或位于基因序列中的三核苷酸重复拷贝数,在一代代邻近基因或位于基因序列中的三核苷酸重复拷贝数,在一代代传递过程中发生明显的增加。传递过程中发生明显的增加。o可遗传,多引起神经系统疾病,如脆性可遗传,多引起神经系统

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