分子生物学名词解释2nd(1)

1、分子生物学名词解释 田麟分子生物学名词解释分子生物学名词解释 1Chapter 1 DNA and the Molecular Structure of Chromosomes 2Chapter 2 Definitions of Gene 3Chapter 3 Replication of DNA and Chromosomes 3Chapter 4 RNA Transcription and RNA Splicing 5Chapter 5Translation 7Chapter 6Genomics 8Chapter 7 Transposable Genetic Elements 9Chapt

2、er 8Regulation of Gene Expression in Prokaryotes and Their Viruses 10Chapter 9Regulation of Gene Expression in Eukaryotes 12Chapter 10 The Genetic Control of Animal Development 13说明：黄色背景的考试不会考， 但对理解相关过程极为重要； 灰色背景的是 Molecular Biology of Gene 6e 上的原文解释，可供大家参考。1分子生物学名词解释 田麟Chapter 1 DNA and the Molecul

3、ar Structure of ChromosomesDNA 脱氧核糖核酸； 组成基因、携带有遗传信息，由脱氧核糖核苷酸单体组成，由磷酸二 酯键键连成的长链。supercoil 超螺旋； 包含有额外扭转的 DNA 分子，从而形成附加绕组（正超螺旋）或者管底 卷绕（负超螺旋） 。haploid/monoploid 单倍体； 指一个个体或一个细胞仅含有一组完整的染色体或基因组。 haploid 特指在配子体形成过程中， 而 monoploid 指在原核生物中只有一份遗传信息的拷贝。nucleus 细胞核； 真核生物中包含染色质的那一部分。通过核膜与细胞质隔开。nucleoside 核苷； 与碱基共

4、价相连的核糖或者脱氧核糖。nucleosome 核 小 体 ； 真 核 细 胞 染 色 质 的 螺 旋 亚 基 ， 由 一 个 组 蛋 白 八 聚 体 核 心（2H2A,2H2B,2H3,2H4）和146个核苷酸缠绕组成。nucleotide核苷酸；DNA或RNA的结构单位，由磷酸基团，五碳糖和含氮碱基组成。centromere 着丝粒； 染色体在细胞有丝分裂中期与纺锤体结合的区域。telomere 端粒； 在真核生物染色体末端发现的特异结构（例如 t-loop 以及四股螺旋结构） 。satellite DNA卫星DNA;含有短串联重复序列，可以通过密度离心与整个基因组上其它DNA分开的成分。

5、scaffold 脚手架； 高度缠绕折叠的染色体的核心骨架，主要由非组蛋白构成。denaturation变性；大分子失去天然构象以及生物活力的过程。DNA变性指两条原本互补配对的脱氧核糖核酸双链分开。renaturation 复性； 指分子回复原来天然构象的过程，在核酸生物化学中，复性指两条完全 互补的单链分子形成双螺旋的过程。hybridization杂交；指来源不同的核酸单链，在合适条件下根据碱基互补配对原则形成双链 的过程（可以是 DNA-DNA, RNA-DNA, RNA-RNA）。Chapter 2Defin iti ons of Genecis heterozygote顺式杂合子；

6、指一个杂合子的两个突变基因同时位于一条染色单体，对应的野生型基因位于另一条染色单体。（a+b+|ab）cistron（gene）顺反子（基因）；能够表达一定基因产物的核酸序列。基因产物包括RNA和蛋白质。Chapter 3Replicati on of DNA and Chromosomescis acting sequenee顺式作用元件； 一段只可以影响同一条染色体上基因表达的DNA序列。primer: template junction引物：模板连接体；既包含双链又包含单链的DNA区域，可以作为DNA聚合酶的底物。其中引物可以是 RNA或者DNA但是必须比模板短并且引物上含有3'

7、游离的羟基。An arran geme nt of nu cleic acids in cludi ng double-stra nded and sin gle-stra nded regi ons that acts as a substrate for a DNA polymerase. The primer can be either RNA or DNA but must be shorter tha n the template and have a 3 -OH that is adjace nt to a regi on of ssDNA.exo nuclease核酸外切酶；能够

8、消化DNA或者RNA的一种酶，其消化方式是从链的缺口末端 开始的。endonuclease核酸内切酶；从双链内部将DNA打断，在重组DNA技术中起重要作用。holoenzyme全酶；多聚体酶的一种存在形式，这种形式包含了组成该酶的所有多肽链。leading strand先导链；在复制过程中合成是连续的那条DNA模板链。lagging strand滞后链；在复制过程中合成是不连续的那条DNA模板链。primosome引发体；在复制过程中，解旋酶和引发酶非共价结合形成的蛋白复合体，能够使 冈崎片段开始合成。replisome复制体；形成于复制叉上，所有参与复制过程的酶，使得半保留复制得以发生。DN

9、A helicase DNA解旋酶；参与DNA双链分开过程的酶，通常是一个环状六聚体，DNA的滞后链穿过解旋酶的中心。DNA ligase DNA连接酶；在DNA 一条链链缺口上，使两个相邻碱基形成磷酸二酯键的酶。DNA gyrase DNA促旋酶；在E.coli中的一种DNA拓扑异构酶，功能类似于真核生物中的DNA拓扑异构酶，通过引入负超螺旋从而使DNA双链保持松弛状态。A specialized DNA topoisomerase that can use the energy of ATP binding and hydrolysis to addnegative supercoils

10、to DNA even when it is relaxed.DNA primase DNA引发酶；能够借助单链 DNA上的GTA三聚体合成一个短链 RNA的酶，合 成的RNA即作为引物为DNA复制提供3'游离的羟基。klenow fragment klenow片段；指DNA聚合酶I的较大的那个片段（68Kb）,具有3 '-5核酸 外切酶的功能以及聚合酶的功能。DNA polymerase I (DNA Pol I)DNA聚合酶I;有聚合酶的活性但主要行使5'-3'核酸外切酶和3-5'核酸外切酶的功能，具有校正DNA配对以及替换RNA引物的功能。An E

11、. coli DNA polymerase that also includes a 5'-3'exonuclease and a 3 -5' (proofreading) exon uclease. This form of DNA polymerase is specialized for Okazaki fragme nt repair.DNA Pol III holoenzyme DNA聚合酶 川全酶；由多个亚基结合而成，有3'-5'核酸外切酶的活性但主要行使聚合酶的功能。在复制过程中不断分散再聚合。A multi-enzyme complex

12、found in E. coli cells that includes two copies of DNA polymerase III and one copy of the E. coli sliding DNA clamp loader ( -complex). This complex facilitates that simulta neous replicatio n of the lead ing and laggi ng stra nds of DNA.DNA topoisomerase DNA拓扑异构酶； 分为两种，DNA拓扑异构酶I不需ATP,使Lk值引入 一个负值；DN

13、A拓扑异构酶II需要ATP,可引入两个负值。能消除在复制过程中DNA双链形成的正超螺旋，从而使 DNA复制得以继续。telomerase端粒酶；一种特殊的DNA聚合酶，自身含有一段RNA作为模板，可以延长端粒的3'单链DNA的末端。A specialized DNA polymerase that extends the 3 'single-stranded DNA end of telomeres.thymine dimer胸腺嘧啶二聚体；由于紫外照射使得相邻的两个胸腺嘧啶在各自嘧啶环的5号和6号位共价相连形成环丁烷环。An adduct created betwee n a

14、djace nt thy mines in DNA in resp onse to ultraviolet light. The two thymines are covalently joined at the 5 and 6 positions by a cylobutane ring.photoreactivation光修复；一种简单的修复 DNA损伤的机制，通过DNA光解酶吸收光波从而使胸腺嘧啶二聚体恢复成两个胸腺嘧啶的过程。A simple repair system in which DNA photolyase captures energy from light to reve

15、rse the formatio n of pyrimidi ne dimers.mismatch repair system错配修复系统；一种通过检查新合成的DNA链来发现是否有错配核苷酸产生的机制。A repair system that scans newly synthesized DNA for the incorporation of a mismatched nu cleotide.excision repair systems切除修复机制；通过移除并置换受损核苷酸或者碱基的修复机制。Repair pathways for remov ing and replaci ng dam

16、aged nu cleotides or bases in DNArecomb in atio nal repair重组修复；修复发生于两条参加重组的DNA双链间，其中一条有一缺口，通过重组的过程，该DNA链上的缺口被修复。The recomb in ati on react ion is in itiated at a double-stra nded DNA break on one of the two DNAduplexes that participate in the react ion. The break is sealed in the processes.Chapter 4

17、 RNA Tran scription and RNA Splici ngabortive initiation无效起始作用；发生在转录起始的早期，即当RNA聚合酶合成一系列的短的转录本，这些转录本和之后的真正转录的RNA 一样都是从+1位开始转录的。Occurs as an early stage in transcription initiation when RNA polymerase synthesizes a series of short tran scripts, each start ing from the +1 start moter启动子；通常指启动子的

18、核心区域，但有时候也包括参与调控的序列。Usually refers to the core promoter, but can sometimes be used to in elude the regulatory seque nces as moter elements启动子作用元件；位于启动子中分散的，明确的区域。Discrete, defi ned regi ons of DNA seque nee within the promoter.enhancer增强子；位于启动子上游或下游，和其他参与调控的DNA序列一起增强某一基因转录的几率。在高等真核生物中，增强子可以和

19、被转录的基因相隔几千个碱基的距离。Collectio n of regulatory bin di ng sites on DNA that together trigger activati on of a gene.Enhancers are found in higher eukaryotes and can work from dista nces many kilobases from the target gene.transcription initiation转录起始；由一系列的步骤组成，包括RNA聚合酶结合到启动子上，开放复合体的形成（原核不需要 ATP真核需要ATP）,在聚

20、合酶脱离启动子之前的无效起始 以及最后进入转录的延伸这些时期。The series of steps in volved in RNA polymerase binding thepromoter, isomeriz ing to the ope ncomplex, and undergoing abortive infection before escaping the promoter and entering the elongation phase of the transcription cycle.TBP： TATA-binding factor. Together with th

21、e TAFs, this makes up the transcription factor TFIID.TAFs TBP-associated factors. Together with TBR these make up the transcription factor TFIID.TFIID： Tran scription factor made up of TBP and TAFs.pre-mRNA前mRNA;被剪接之前的RNA转录本，因此含有内含子和外显子。又被称为核不均一 RNA（ hnRNA）。An RNA transcript prior to being spliced a

22、nd thus containing its introns as well as its exons.RNA splicing RNA剪接；指内含子从初转录本（前mRNA）被剪切形成成熟 mRNA的过程。The process whereby introns are removed from the initial transcripts （pre-mRNAs） to produce mature mRNAs.small nuclear ribonuclear protein （snRNP）小核内核糖蛋白；组成剪接体的一个亚基。每个snRNP都由蛋白以及 RNA组成，其中的RNA又被称为小核

23、 RN（由RNA Polimerase III转录）。A sub un it of the spliceosome. Each snRNP contains both a prote in and an RNA comp onent, thelatter being called a small nu clear RNA.spliceosome剪接体；一种由蛋白质和 RNA组成的复合物用于催化 pre-mRNA的剪接。剪接 体的组成随着剪接过程的进行不断发生变化，即一些亚基在某一时期离开， 另一些亚基在另一时期进入，许多亚基都是 sn RNP。The protein and RNA compl

24、ex that catalyzes splicing of pre-mRNAs. The makeup of the spliceosome varies duri ng the splici ng react ion as sub un its come and go. Many of the sub un its are sn RNPs.Chapter 5Tran slati onTran slation翻译；根据遗传密码的特殊序列，遗传信息从mRNA翻译成相应的氨基酸多肽链的过程。The genetic information in mRNA molecules is translate

25、d into the amino acid sequences of polypeptide accord ing to the specificati on of the gen etic code.ribosome binding site (RBS)核糖体结合位点；又称SD序列，在许多细菌 mRNA起始密码子之前的一小段序列。这一段序列通过与16S rRNA上的序列部分互补从而招募核糖体的小亚基。A short sequence motif found in many bacterial mRNAs near the start site of translation. This seq

26、uence recruits the small subunit of the ribosome to the mRNA by base pairing to the 16S rRNA. Also called the Shine Dalgar no seque nce.synonyms同义密码子；对应相同氨基酸的简并密码子。Dege nerate codo ns that specify the same amino acid.open reading frame (ORF)开放阅读框；mRNA编码蛋白的区域。每一个开放阅读框具有一个 起始密码子和一个终止密码子以及之间一连串参与编码多肽链的

27、密码子。The protein coding region(s) of an mRNA. Each open reading frame is defined by a start codon followed by a variable nu mber of codo ns and a stop codo n.aminoacyl-tRNA synthetase氨酰tRNA合成酶；催化将一种氨基酸结合到与之对应的一系列 tRNA过程的酶。An enzyme that couples a specific amino acid to the appropriate set of tRNAs.de

28、coding center编码中心；位于核糖体小亚基上，在这一活性区域，tRNA与mRNA结合,即tRNA阅读mRNA上的密码子。The region of the ribosome in which tRNAs hybridize to and read or decode the mRNA. This part of the ribosome is located in the small sub un it.peptidyl transferase center肽酰转移酶中心；在核糖体大亚基上，是肽键形成的部位。This is the site with in the ribosome

29、where peptide bond formati on occurs.ribosome cycle核糖体周期；指每一次核糖体参与翻译一条mRNA链时所发生的一系列过程（eg：大小亚基的结合与分离）。The seque nee of events that occur each time a ribosome tran slates an mRNA.polyribosome多聚核糖体；同时翻译同一条 mRNA的一连串核糖体，又称为 polysome。A series of ribosomes translating the same mRNA. Also called a polysome.

30、IF1:One of three bacterial translation initiation factors. IF1 binds to the portion of the smallribosomal sub unit that will become part of the A site.IF2：One of three bacterial tran slati on in itiati on factors. IF2 is a GTPase that in teracts with thecharged in itiator tRNA and escorts it to the

31、small sub un it.IF3：One of three bacterial translation initiation factors. Binding of IF3 to the small ribosomalsub un it preve nts binding to the large ribosomal sub un it.release factors (RFs)释放因子；一类翻译过程中起辅助作用的蛋白，促使翻译的终止。A class of auxiliary tran slati on factors that stimulate the term in ati on

32、of tran slati on. Class I release factors recognize stop codons and stimulate hydrolysis of the polypeptide chain from the peptidyl-tRNA. Class II release factors facilitate the release of class I release factors from the ribosome.Chapter 6Geno micscis-acting elements顺式作用元件； 对DNA转录有影响的一段 DNA序列，例如启动子

33、，增强 子以及沉默子等等。“元件”不是基因，但其中可能包含有基因（例如转座元件）。trans-acting factors反式作用因子； 对DNA转录有影响的一种或者一类起调控作用的蛋白，例如转录因子等等。genome基因组；一套从亲本得到的完整的染色体组（或全套基因） 。genetic map遗传图谱；一种基于重组率的染色体图谱，单位为 cM （厘摩）。physical map物理图谱；通过DNA分子数来构建的染色体图谱，单位为bp （碱基对）、kb或mb。cytological map细胞图谱；根据染色体上的带型对染色体进行绘图的一种方法。positional cloning定位克隆；根据

34、基因组在图谱上的位置分离得到一个基因的过程。STSs （sequence-tagged sites）序列标签位点； 基因组中短的、序列特异性的DNA片段（通常200 500bp），可以通过PCR扩增，用于联系物理图谱和遗传图谱。ESTs丄expressed二sequence_tags表达序列标签；短的cDNA序列用于联系物理图谱和遗传图谱。VNTRs （variable number tan dem repeats）可变数量串联重复； 一段有很高拷贝数的短串联重复 DNA序列。Chapter 7Tran sposable Gen etic Eleme ntstransposable genet

35、ic element转座遗传元件； 一种DNA元件，可以从基因组的一个位置移动 到另一个位置。transposons转座子；可以从DNA分子的一个位置移动到另一个位置的DNA元件。transposase转座酶；在一个DNA分子中催化一段 DNA序列从一个位置转移到另一个位置的 酶。IS element（insertion sequenee） IS元件（插入序列）；在细菌中发现的一段短的 DNA序列（800 1400bp ），能够转移到基因组其它的位置。 如果其它DNA序列连有IS元件，那么这段DNA 序列也可能具有转座的功能。composite transposon复合转座子；当两个完全相同或

36、基本相同的转座元件插入到一段非转 座序列两端形成的转座子。例如，细菌的Tn5转座子。cointegrate共整合；由两个不同的 DNA分子融合形成一个 DNA分子，这一过程通常由转座 元件介导。retrotransposon逆转录转座子；一类转座元件，通过从RNA到DNA的逆转录而产生新的拷贝。retroposon反转座子；逆转座子的一种，通过从 RNA到DNA的逆转录而产生新的拷贝，但 是与retrovirus-like transposon不同，该转座元件缺少末端重复序列。LTR(long terminal repeats)长末端重复；在逆转录转座子两端存在的同向重复DNA序列(注意同其它

37、转座元件末端反向重复方式不同，该元件的重复方式是同向的)。LINEs(lo ng in terspersed nuclear eleme nts)长末端散在元件；真核生物中最广泛存在的一类转座元件，长度约为 6500bp，属于反转座子，完整的长末端散在元件有两个ORF ORF1编码结构蛋白，ORF2编码反转录酶以及一个具有内切酶性质的酶。(与书本解释有所不同，根据自己理解)。SINEs(short jnterspersed nuclear elements)短末端散在元件；真核生物中广泛存在的一类转座 元件，约为150300bp，该类转座元件已经失去转座能力，只有借助LINEs才能发生转座，人

38、类中有三类 SINEs元件，其中研究最为透彻的SINEs是 Alu家族(只有 Alu家族具有转座能力)。Chapter 8 Regulation of Gene Expression in Prokaryotes and Their Virusesconstitutive enzyme构成性酶；无论在何种生长条件下，在细胞内都被不断合成的酶。inducible enzyme诱导性酶；只有在一种称为诱导子的底物的存在下才会在细胞内被合成的酶。repressible enzyme 抑制性酶； 在一种调控分子的作用下，在细胞内合成被终止的酶。negative control system 负反馈调控

39、机制； 在基因表达机制中， 调控蛋白用于关闭基因表达的 机制。positive control system 正反馈调控机制； 在基因表达机制中，调控蛋白用于打开基因表达的 机制。repressor 阻遏子； 通过结合到 DNA 上，使相关的基因表达关闭。effector molecule 效应物分子； 一种能够影响调控蛋白性质的分子，通过使调控蛋白异构转 换，进而影响基因的表达。inducer 诱导子； 一种低分子物质，通过结合到阻遏子上，促使阻遏子从操作子上解离，从 而使受调控的基因表达。co-reppressor 共阻遏子； 一种效应物分子， 通过与阻遏子形成复合物从而关闭一个或者一系

40、列基因的表达。operon 操纵子； 由一组基因构成的调控单元。这一单元包括一个操作子，一个启动子，以 及一系列结构基因。operator 操作子； 操纵子的一部分，通过结合阻遏蛋白来调控结构基因的表达。attenuation 衰减作用； 原核生物基因调控的一种机制， 通过提前形成转录终止信号从而使转 录停止。attenuator 衰减子； 原核生物中，转录成的 mRNA 中通过提前形成一种类似于转录终止信号 的二级结构从而使转录停止。feedback inhibition(end-product inhibition) 反馈调控； 生化途径的最终产物的积累终止了生化 途径中的其余产物的合成，

41、即一个晚期代谢物可以调控早期代谢的合成。negative autogenous regulation(negative self-regulation) 反馈自调控； 一个或者一系列协同调控 的基因表达被其中某一个基因的产物抑制。Chapter 9 Regulation of Gene Expression in Eukaryotestranscriptional factor 转录因子； 一种能够调控基因转录的蛋白。homeodomain 同源异型域； 在不同的基因中有一段共同的DNA 序列，这段序列参与动物器官组织的分化，这一 DNA 序列称为同源异形框，同源异形框通常与一段多肽链结合，这段 多肽链就称为同源异型域。helix-loop-helix(HLH) 螺旋环螺旋； 存在于许多基因调控蛋白中的 DNA 结合结构基序， 其结构 为一个短的a螺旋通过一个结构灵活的环与另一个较长的a螺旋。这一结构使得两个HLH结构形成二聚体从而能够结合到 DNA 上。螺旋环螺旋与螺旋转角螺旋有明显不同。helix-turn-helix 螺旋转角螺旋； 存在于许多基因调控蛋白中的 DNA 结合结构基序，其结构为 两个 a 螺旋通过一个结构固定的氨基酸链连接而成。 含有此种基序的调