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文档简介
1、第七章:一般线性模型7.1 两因素方差分析7.1.1 univarate 对话框界面说明7.1.2 结果解释7.2 协方差分析7.2.1 分析步骤7.2.2 结果解释7.3 多元方差分析7.3.1 分析步骤7.3.2 结果解释一般线性模型包括的内容非常多,究竟我们用到的哪些分析会包含在其中呢?简而言 之:凡是和方差分析粘边的都可以用他来做。比如成组设计的方差分析(即单因素方差分析)配伍设计的方差分析(即两因素方差分析)、交叉设计的方差分析、析因设计的方差分析、 重复测量的方差分析、协方差分析等等。因此,能真正掌握 GLM菜单的用法,会使大家的统计分析能力有极大地提高。一般线性模型的能力如此强大
2、,下属的四个子菜单各自的功能如下:? Univariate 子菜单:四个菜单中的大哥大,绝大部分的方法分析都在这里面进行。? Multivariate子菜单:当结果变量(应变量)不止一个时,当然要用他来分析啦!? Repeted Measures子菜单:顾名思义,重复测量的数据就要用他来分析,这一点 我可能要强调一下,用前两个菜单似乎都可以分析出来结果,但在许多情况下该结 果是不正确的,应该用重复测量的分析方法才对(不能再讲了,再讲下去就会扯到 多水平模型去了)。?Variance Components子菜单:用于作方差成份模型的,这个模型实在太深,不是 一时半会说的请的,所以我在这里就干脆不
3、讲了。§ 7.1 两因素方差分析例7.1对小白鼠喂以A、R C三种不同的营养素,目的是了解不同营养素增重的效果。 采用随机区组设计方法,以窝别作为划分区组的特征,以消除遗传因素对体重增长的影响。现将同品系同体重的 24只小白鼠分为8个区组,每个区组 3只小白鼠。三周后体重增量结 果(克)列于下表,问小白鼠经三种不同营养素喂养后所增体重有无差别?区组号A营乔素B吕乔系C营养素150.1058.2064.50247.8048.5062.40353.1053.8058.60463.5064.2072.50571.2068.4079.30641.4045.7038.407 61.9053.0
4、051.208 42.2039.8046.20根据统计分析的要求,我们建立了三个变量来包括上述信息,即 group表示区组, food代表使用的营养素,weight表示最终的重量,即:group food weight1150.011 258.20依此类推。1.1.1 univarate 对话框界面说明这里只有一个结果变量 weight ,要采用univarate 对话框,对话框内最常用的按钮有:Dependent Variable 框、Fixed Factors 框、Model 钮、Post Hoc钮,下面我们来一一解释。【Dependent Variable 框】选入需要分析的变量(应变量
5、),只能选入一个。这里我们的应变量为weight ,将他选入即可。【Fixed Factors 框】即固定因素,说的通俗一些,就是一一哎呀,我都不知道怎么解释好了,这样,如果你搞不明白,那么绝大多数要分析的因素都应该往里面选。这里我们要分析的是group和food两个变量,把他们全都给我抓进去!固定因素指的是在样本中它所有可能的取值都出现了,比如例中的food,只可能有1、2、3这三个值,并且都出现了,就被称作固定效应;而相对应的随机效应的因素指的是所 有可能的取值在样本中没有都出现,或不可能都出现,如本例中的group ,实际上总体中当然不可能只有这8窝,因此要用样本中group的情况来推论
6、总体中 group未出现的那些取值 的情况时就会存在误差,因此被称为随机因素。我这里让group也选入固定框是基于下面的 事实:这样做统计分析的结论是完全相同的。不同的只是推论的那部分。【Random Factors 框】用于选入随机因素,如果你弄不明白,假装没看见他就是了。【Covariate框】用于选入协方差分析时的协变量,现在还用不到。【WLS Weight框】即用于选入最小二乘法权重系数。【Model钮】单击后出现一个对话框,用于设置在模型中包含哪些主效应和交互因子,默认情况为 Full factorial ,即分析所有的主效应和交互作用。我们这里没有交互作用可分析,所以要改一下,否则
7、将作不出结果来。将按钮切换到右侧的custum ,这时中部的 Build Term下拉列表框就变黑可用, 该框用于选择进入模型的因素交互作用级别,即是分析主效应、 两阶交互、三阶交互、还是全部分析。这里我们只能分析主效应: 选才I main ,再用黑色箭头将group 和food选入右侧的 model框中。该对话框中还有两个元素:左下方的Sum of squares框用于选择方差分析模型类别,有1型到4型四种,如果你搞不清他们之间的区别,使用默认的3型即可;中下部有个Includeintercept in model复选框,用于选择是否在模型中包括截距,不用改动,默认即可。【Contrast钮
8、】弹出Contrast对话框,用于对精细趋势检验和精确两两比较的选项进行定义,在这里,该对话框比单因素方差分析的时候还要专业,使用频率也更少,反正我都没用过,就干脆就不介绍了。【Plots钮】用于指定用模型的某些参数作图,比如用food和group来作图,用的也比较少(指国内,因为它主要是用来做模型诊断用的)。【Post Hoc钮】该按钮弹出的两两比较对话框和第7章单因素方差分析中的一模一样,不再重复。本题又food作两两比较,方法为 SNK法。【Save钮】将模型拟合时产生的中间结果或参数保存为新变量供继续分析时用,可保存的东东有 预测值、残差、诊断用指标等。Options 钮】当然是定义选
9、项啦!可以定义输出哪些指标的估计均数、并做所选择的两两比较,还 有其他一些输出,如常用描述指标、方差齐性检验等。好了,都解释完了,再重复以下,我们所作的操作为:1. Analyze=>General Lineal model=>Univariate2. Dependent Variable 框:选入 weight3. Fixed Factors 框:选入 group 和 food4. Model钮:单击5. Custom单选钮:选中6. Model 框:选入 group 和 food7. 单击OK8. Post Hoc 钮:单击9. Post Hoc test for框:选入 fo
10、od10. SNK复选框:选中11.单击OK12.单击OK7.1.2结果解释按照上题的操作,结果输出如下:Univariate Analysis of Variance这是一个所分析因素的取值情况列表,没有什么不好懂的。现在大家看到的是一个典型的方差分析表,只不过是两因素的而已,我来解释一下:首先是所用方差分析模型的检验, F值为00.517, P小于0.05,因此所用的模型有统计学意 义,可以用它来判断模型中系数有无统计学意义;第二行是截距,它在我们的分析中没有实际意义,忽略即可;第三行是变量 GROUP可见它也有统计学意义,不过我们关心的也不是他;第四行是我们真正要分析的FOOD非常遗憾,
11、它的 P值为0.084 ,还没有统计学意义。尽管不太愿意,我们的结论也只能是:尚不能认为三种营养素喂养的小白鼠体重增量有差别。上表的标题内容翻译如下:变异来源III 型方差SS自由度均方MS;统计量FP值校正的模型2521.2949280.14411.517.000截距74359.534174359.5343056.985.000GROUP2376.3767339.48213.956.000FOOD144.917272.4592.979.084误差340.5431424.324合计77221.37024校正的合计2861.83623Post Hoc TestsFOODHomogeneous S
12、ubsets现在是两两比较的结果,方法为SNKt,由于前面总的比较无差异,所以这里三种食物均在一个亚组内,检验无差异,P值为0.121。前面方差分析 FOO而P值不是0.084吗?这里又是0.121 ,究竟哪个为准?两两比较只是近似的比较结果,应以前面方差分析的P为准,不过这两个 P值不会在检验结果上发生质的冲突,一般只是大小不同而已。好了,上面是正确的结果,如果 model选择是采用Full factor 又如何呢?会得出方 差分析表如下:看到了吗?由于所谓的交互作用将自由度给全部“吃”掉了,没有误差可用于统计分 析,什么结果也做不出来。§ 7.2 协方差分析例7.2 某医生欲了解
13、成年人体重正常者与超重者的血清胆固醇是否不同。而胆固醇 含量与年龄有关,资料见下表。正常组超重组年龄(X1)胆固醇(Y1)年龄(X2)胆固醇(Y2)483.5587.3334.6414.7515.8718.4435.8768.8444.9495.1638.7334.9493.6546.7425.5656.4404.9396.0475.1527.5414.1456.4414.6586.8565.1679.2我们这里建立三个变量:GROUP!示组另LAGE代表年龄,CHO则表示胆固醇。7.2.1分析步骤由于协方差分析涉及到许多较深的统计理论,这里我只好采用照本宣科的方法,告诉 大家如何作,而不作过
14、多解释,首先应进行预分析,了解资料是否符合协方差分析的要求,最重要的一点就是看age的影响在两组中是否相同,这可以用age与group是否存在交互作用来表示。对该问题,粗 糙的方法可以是作分组散点图,差不多就可以,也可以进行预分析,看交互作用有无统计学意义,这里用后一种方法中最为精确的步骤来讲解。预分析步骤:1. Analyze=>General Lineal model=>Univariate2. Dependent Variable 框:选入 chol3. Fixed Factors 框:选入 group4. Model钮:单击5. Custom单选钮:选中6. Model框:
15、选入 group、age和group*age(后者用interaction方法就可选入)7. Sum of squares列表框:改为 Model I8. 单击OK9. 单击OK该步骤用于判断group和age间是否存在交互作用,如存在,则协方差分析的条件不 满足,分析不能继续。注意这里选择了Model I ,从而拟合结果和模型中变量的引入顺序有关,即侧重点在group对chol的影响大小和交互作用上。10. .2结果解释预分析步骤的结果如下:Univariate Analysis of Variance上表显示交互作用无统计学意义,而且 P值非常大,因此交换 group和age多半交互 作用
16、也无统计学意义,因此可以不继续作预分析了,当然,严格的步骤应当交换两者的顺序继续进行预分析。正式分析步骤:1. Analyze=>General Lineal model=>Univariate2. Dependent Variable 框:选入 chol3. Fixed Factors 框:选入 group4. Model钮:单击5. Custom单选钮:选中6. Model 框:选入 group、age7. Sum of squares列表框:改为 Model III8. 单击OK9. Options 钮:单击10. Displsy means for 框: 选入 group1
17、1. Compare mean effects 复选框:选中(下面的区间调整方法就用 LSD(none)即可)12. 单击OK13. 单击OKUnivariate Analysis of Variance这是正式的统计分析结果,显示group和age都对胆固醇含量有影响,P值分另U为0.038 和小于0.001。Estimated Marginal Means这是两组的修正均数及相应的可信区间,显然超重组的胆固醇均值较高。下方的提示表明该修正均数是按年龄为50.2308岁的情形计算的。§ 7.3 多元方差分析所谓的多元方差分析,就是说存在着不止一个应变量,而是两个以上的应变量共同反映
18、了自变量的影响程度。比如要研究某些因素对儿童生长的影响程度,则身高、体重等都可以作为生长程度的测量因子,即都应作为应变量。7.3.1 分析步骤为了方便起见,我们这里直接利用SPSS自带的数据集plastic.sav,彳矍设 tear_res 、 extrusn 和gloss和opacity都使反应橡胶质量的指标(不要笑,是假设),现在要研究 additive 对橡胶的质量影响如何,则应采用多元方差分析。选择 Analyze=>General Linear Model=>Multivariate ,则弹出 Multivariate 对话 框,请注意,除了没有random effect外,它的所有元素都是和u
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