细菌的分类与命名

1、细菌的分类与命名 第一节细菌分类原则 细菌分类学（bacterial taxonomy）是对细菌举行分类命名与鉴定的一门学科。它既是一门古老而传统的学科，又是一门现代化的和不断进展的学科。 一、分类等级 分类等级又称分类单元。细菌的分类单元和其他微生物相同，种及其以上的系统分类单元自上而下依次分为七级： 界（kingdom，拉丁文regnum) 门（division，拉丁文divisio；或phylum，拉丁文phylum) 纲（class，拉丁文classis) 目（order。拉丁文ordo) 科（family，拉丁文familia) 属（genus，拉丁文genus) 种（species

2、，拉丁文species) 细菌的分类单元有界、门、纲、目、科、属、种，但是最重要、最基本的单元是种（species) ,第二是属（genus)。科及其以上的划分在细菌学不太完美，而且随着讨论的深化，科、属的划分会有变动。 1属（genera，单数genus）是性状相近、关系疏远的若干菌种的组合，应与其他属有显然的差异。不同属之间的16s rrna序列有较大的差异，但尚未提出差异的量化标准。 2种（species）是细菌学分类的最基本单元。目前公认的种的定义为由同一起源而来的菌株所构成的集合，且同种菌株间的相像性高于非同种菌株间的相像性。同一菌种的各个细菌，虽然性状基本相同，但在某些方面仍有一定

3、差异，差异较显然的称为亚种或变种，差异小的则为型（type)。在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株（type strain）作为它的详细代表，这种典型菌株就称为模式种（type species）或标准菌株(standard strain)。例如，在两歧双歧杆菌（bifidobacterium bifidum）的大量菌株中，惟独“atcc29521”才是它的标准菌株。在细菌的分类、鉴定和命名时均以模式菌为依据，也可将其作为质量控制的标准。 3菌株（strain)是不同来源的某一种细菌的纯培养物。同一种细菌可有许多菌株，其主要性状应彻低相同，次要性状可稍有差异。菌株的名称没有统一的规定，通

4、常用地名或动物名的缩写加编号作为菌株名。 对于更高等级如属、科和目，目前尚缺乏统一的分类方针，但实际操作中，高等级的分类单位人多数用16srdna序列相像性和族群稳定性来描述。 二、细菌命名法 细菌的命名依据国际细菌命名法典(the international code of nomenclature of bacteria）的规定，学名用拉丁文，遵循“双名法”。所谓“双名法”就是每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分构成，属名在前，是名词，第一个字母必需大写，其余均应小写，即使种名是以人名或地名命名的，种名头一个字母也用小写。囫囵属名及种名在出版物中应排成斜体。细菌的中文译名与拉丁名正巧相

5、反，将种名在前，属名在后，例如：mycobacterium tuberculosis（结核分枝杆菌）、salmonella typhi（伤寒沙门菌）。常见细菌命名中一些规章和应注重的事项如下。 (1）浮现在分类学文献中的细菌拉丁文学名，在属名和种名之后，往往还要加上首次定名人（加括号）、现名定名人和现名定名年份，这些均用正体排字。但在普通兽医学及医学微生物学文献中，属名和种名之后的部分均予省略。例如大肠埃希菌的学名全名是escherichia coli (migula 1895) castellani et chalmers 1919，指的是migula于1895年命名此菌为bacillus

6、coil,castellani及chalmers于1919年改为现名的。 (2)拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规章读念，但因为受英语的影响，不少人是按英语的读法来读细菌拉丁文名的，这在国际学术沟通中经常碰到。 (3)只确定属名、未确定种名的某一株细菌，其拉丁文学名可在属名之后加sp.（正体字）；假如同属未定种名的若干菌株，则用spp取代、p. , spp为species复数的简写。 (4)假如是新种，在新种的拉丁文学名之后还要加上“sp.nov.”, nov是novel的缩写。 (5）亚种用subsp.（正体字）表示，这是subspecies的缩写，例如pasteurella multocid

7、a subsp. septic，中译名为多杀性巴氏杆菌败血亚种。 (6)少数拉丁文学名会因讨论的发展等缘由而转变，比如clostridium welchii（魏氏梭菌）、aeromonas punctata（斑点气单胞菌）等是曾用名，现今的国外文献已不再沿用，分离改为clostridiuni perfringens（产气荚膜梭菌）和aeromonas caviae（豚鼠气单胞菌）。 (7)细菌的拉丁文学名在翻译为中文时，因为译者不同，往往同物异名，可造成不须要的混乱，为此应尽可能采纳公认的译名。 (8)译名应尽可能精确，例如edwardsiella tarda，应译为迟缓爱德华菌，tarda有迟缓或迟钝之意，该菌有动力，并不迟钝，但生长缓慢。 (9)根据国家出版局的规定，细菌名称中涉及外国人名译为汉语时，除极少数特殊闻名、沿用已久者外，均省略“氏”字，除非取词头字母发音。例如brucella译为布氏杆菌属，yersinia译为耶尔森菌属；pasteurella译为巴氏杆菌属，listeria译为李氏杆菌属。 (10）根据国际细菌命名规矩，属以下（包括属）无统一语尾，属以上有