总RNA的提取测定及逆转录_第1页
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文档简介

1、总RNA的提取及测定(Trizol法)(1)组织匀浆 取出高温高压消毒后研钵, 切取 50-100mg 冰冻组织置于研钵内, 倒入液 氮,研至粉末状。 每 50-I00mg 匀浆组织标本加入 lml 的 Trizol 继续研磨。(标本的量不能超 过Trizol体积的10%,否则会出现DNA污染。) 将以上匀浆标本转移到1.5ml的EP管中,在15-30E放置5分钟,以彻 底分离核蛋白复合体。 (或 -70°C 过夜后再进行)(2)相分离加入0.2ml的氯仿,加盖好后用手剧烈摇荡巧秒,在 15-30E放置2-3分 钟,然后4C离心12000g, 15分钟。离心后分成3层,下面的红色为酚

2、-氯仿 相, 一个中间层(DNA和蛋白质),上层是无色的水相。RNA只存在于水相中。 水相占总Trizol的60%。RNA沉淀将上层水相转移到另一干净的1.5mlEP管中,加入0.5ml异丙醇,轻柔上 下颠倒混匀,15C-30C静置10分钟,然后4C, 12000g离心10分钟。在管 的侧壁和底部可看到絮状胶样沉淀,这就是 RNA沉淀。RNA洗涤弃上清,加入1ml 75%乙醇洗涤RNA沉淀,轻弹管壁使RNA沉淀漂浮,4C, 7500g 离心 5 分钟。(5)RNA再溶解去上清,置真空或空气中5-10分钟,干燥RNA沉淀,(不能在真空中离心 干燥。注意不能将RNA沉淀完全干燥,这样会极大地降低它

3、的溶解度。)根据 RNA的量,用DEPC*( 20-60卩l)重悬RNA沉淀,用枪头反复吹打几次,静 置 10分钟。测定RNA浓度:2卩l DEPC水 2次调零。2卩l样品测其RNA浓度。A260/A280的值在1.8-2.0 范围视为纯度很高。(RNA于-70° C保存)逆转录(RT)取2卩g总RNA加入1卩l随机引物,用DEPC水补充体积为15卩I70° C反应5分钟,置于冰上。加入以下反应体系:5XM-MLV逆转录缓冲液5ulM-MLV(200U/ ul)1ul4xdNTP(10mol/L)l.25ulRNas in (40U/ ul)0.6ulDEPC水2.25ul

4、总反应体积25ul 置于PCR扩增仪中25T 10分钟,37C60分钟,95C 5分钟终止反应。逆转 录产物加80ul灭菌ddH20混匀并分装,于-20C保存。PCR及琼脂糖凝胶电泳PCR反应体系:TakaRaExTaqDN 聚合酶0.25 ul0.25 ul10XReaetion Buffer5 ul5 ul4XdNTP4 ul4 ulPrimer11 ul0.6 ulPrimer21 ul0.6 ul待测cDNA1 ul1 ul火菌ddH2O37.75 ul38.85 ul总体积50 ul50 ul2%琼脂糖凝胶电泳鉴定产物是否为特异目的片段:称取琼脂糖0.6g放入200ml三角烧瓶中,加

5、入30ml 1xTBE溶液,加热令其 完全溶解,待冷却至约60°C时加入2ul溴化乙锭溶液(10mg/ml),浇板,水平放 置,避光待凝。将已制备的2%琼脂糖凝胶放入电泳槽,加入 1xTBE至高出凝胶表面1mm。10 u1 PCR产物分别和 2 ul 6x加样缓冲液混匀后上样电泳,另取6ul DNALadderMaker作为DNA片段大小的对照。80V-120V电压下电泳20-30分钟。所需试剂(1)RNA(2)(3)(4)1( 5)RNA提取试剂 TRIZOL Invitrogen 公司焦碳酸二乙酯(DEPC: Sigma公司(进口分装) 氯仿异丙醇75%乙醇:无水乙醇加DEP(水配制(6)核糖核酸酶抑制剂(RNAsin):华美生物工程公司(7)随机引物:上海生工生物工程公司(8)dNTP:北京天为时代公司(9)M-MLV逆转录酶:Promega公司(10)M-MLV逆转录缓冲液(11)DEPC水(12)TakaRaExTaq DNA聚合酶:宝生物工程有限公司(13)目的基因引物:上海生工生物工程公司(14)(15)T< (17)(18)10*Reaction BufferdNTP:北京天为时代公司灭菌ddHO 琼脂糖:上海鼎国生物工程公司(

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