酶切位点识别序列

1、酶切位点识别序列PBST108ument serial number一段碱基的特定序酶切位点(Restriction Enzyme cutting site ) : DNA Jt列，能够识别出这个序列并在此将序列切成两段。可能存在同尾酶，不同酶的识别序列不同，有的可能能识别多个酶切位点比方 STY1识别序列有WWPCR引物设计时酶切位点的保护碱基表不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数 U的要求在本表中没有列岀的 酶，那么通 常需在识别位点两端至少加上6个保护碱基，以确保酶切反响的进行。 保护碱基：半酶 切位点在双链DNA的尾端时，限制性内切酶经常不能成功切断简单的 想象为酶遇到识别 位点之后

2、从旁边掉下去了二一二所以经常在引物设计时，在末 端的限制性内切酶识 别位点之后再加上2、3个碱基以确保成功酶切。比方你的引物是 5 ' GCTAGCNNNNN3'可以改成5 ' CAGGCTAGCNNNN.N3'呃CAG是我随便加的，你可以考虑一下CG/AT含量切割率酶寡核昔酸序列链长2 hr20 hrGGTCGACC800Acc ICGGTCGACCG1000CCGGTCGACCGG1200CACATGTG800Afl IIICCACATGTGG10>90>90CCCACATGTGGG12>90>90GGCGCGCC8>90>

3、;90Asc IAGGCGCGCCT10>90>90TTGGCGCGCCAA12>90>90CCCCGGGG850>90Ava ICCCCCGGGGG10>90>90TCCCCCGGGGGA12>90>90CGGATCCG81025BamH ICGGGATCCCG10>90>90CGCGGATCCGCG12>90>90CAGATCTG800Bgl IIGAAGATCTTC1075>90GGAAGATCTTCC1225>90GGCGCGCC800BssH IIAGGCGCGCCT1000TTGGCGCGCC

4、AA1250>90BstE IIGGGT(A/T)ACCC9010AACTGCAGAACCAATGCATTGG2200BstX IAAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA242550CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT2725>90CATCGATG800GATCGATC800Cla ICCATCGATGG10>90>90CCCATCGATGGG125050GGAAATTCC8>90>90EcoR ICGG'AATTCCG10>90>90CCGG'AATTCCGG12>90>90GGGGCCCC8

5、>90>90Hae IIIAGCGGCCGCT10>90>90TTGCGGCCGCAA12>90>90CA"AGCTTG800Hi nd IIICCA"AGCTTGG1000CCCA'AGCTTGGG121075GGGTACCC800Kpn IGGGGTACCCC10>90>90CGGGGTACCCCG12>90>90GACGCGTC800Mlu ICGACGCGTCG102550CCCATGGG800Neo ICATGCCATGGCATG145075CCATATGG800CCCATATGGG1000Nde

6、 ICGCCATATGGCG1200GGGTTTCATATGAAACCC1800GGAATTCCATATGGAATTCCGGGAATTCCATATGGAATTCCC20227575>90>90GGCTAGCC800Nhe ICGGCTAGCCG101025CTAGCTAGCTAG121050TTGCGGCCGCAA1200ATTTGCGGCCGCTTTA161010Not IAAATATGCGGCCGCTATAAA201010ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT242590AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA2825>90Xsi ITGCATG

7、CATGCA1210>90CCMTGCATTGGTTCTGCAGTT22>90>90TTAATTAA800Pac IGTLUTTAAC10025CCTTAATTAAGG120>90GTTTAAAC800GGTTTAAACC10025Pme IGGGTTTAAACCC12050AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG2475>90GCTGCAGC800TGCACTGCAGTGCA141010Pst IAACTGCAGAACCAATGCATTGG22>90>90AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA24>90>90CTGCAG

8、AACCAATGCATTGGATGCAT2600CCGATCGG800Pvu IATCGATCGAT101025TCGCGATCGCGA12010Sac ICGAGCT'CG81010GCCGCGGC800Sac IITCCCCGCGGGGA1250>90Sal IGTCGACGTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC2800GCGTCGACGTCTTGGCCATAGCGGCCGCGGACGCGTCGACGTCGGCCATAGCGGCCGCGGA30A 3210105075Sea IGAGTACTC81025AAAAGTACTTTT127575CCCGGG6010CCCCGGG

9、G8010Sma ICCCCCGGGGG101050TCCCCCGGGGGA12>90>90GACTAGTC810>90GGACTAGTCC1010>90Spe ICGGACTAGTCCG12050CTAGACTAGTCTAG14050GGCATGCC800Sph ICATGCATGCATG12025ACATGCATGCATGT141050AAGGCCTT8>90>90Stu IGAAGGCCTTC10>90>90AAAAGGCCTTTT12>90>90CTACTAGAG800GCTACTAGAGC10>90>90Xba ITGCTACTAGAGCA1275>90CTAGT'CTAGACTAG1475>90CC"TCGAGG800Xho ICCLTCGAGGG101025CCGC'TCGAGCGG121075CCCCGGGG800CCCCCGGGGG102575Xma ICCCCCCGGGGGG1250>90TCCCCCCGGGGGGA14>90>9