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文档简介

1、1. 一、PDB数据库中查找蛋白质结构数据/pdb/home/home.do查找蛋白质结构,在检索框输入关键字或名称。LXWsplnvillw*DflwnlortriFik*-QShon*itiisPsge,.在线观看三维数据结构Sunnimnry3DViewSequerKeT/mnotaliarisSeasimilarityT3D5inilarityLfteratureTBioL&Cham.Mefttio-dETGeometrM1TLinksCrystalstructureofhumancytoglobinat1.68angstromsresolution

2、DOI:10.3310-moliitiDnviiniirtiimofhruvriidncytoqlcxtairk:itiEntilicarliMiiolextrflM-tandClerminiteiindMakiM.SuMlfirrHitQ,H.SwaLFLF、Kawada,N.rYDshizato.K.5hhror-iMTMh(70M)电登0白切心gr,昏巳d用书”67iST7PiibMd:?DOI:I0.1197/SaiM74d49MU1301JC?PflFirhRrlfllPdArtidlfInPubMwi-PubHr4Cvto0k)bin(Cgb厦取山meniberofthe典女hoi

3、nidcnt.iirHnQglobinTmlbTinescifuctu倍ofaiei儿就mlEmnw骚由ruimanCgb隹pmeC2wasdeteimnedatarescluLaflrrjofl_6aAngstroFTtiersuitgtneprsence.,.职用Mure&EeardiPubMedJStbslrddEs|选择3Dview,可视化蛋白三维结构视图呈现。由于是远程计算机服务器进行图型构建,且数据量较大,需要较长的时间才能在窗口显示。4. 蛋白结构显示的参数设定:SlTiictijri?EMm眠OBtQl.jig顷nblGiobi岛二SVniFifltFVT用&SvmmiStfv

4、StoichiometrY脚本选项:、下载三维数据文件1.在查询结果窗口的右边找到以下图型。2DC3蔺DisplayFiles1DownloadFiles5tiareihisPage如图:选择DownloadFiles。2.确定下载的文件类型,一般根据你要使用蛋白质结构数据而定。closeFAST*SaquncQputHlc;TcO:UhI-le:DZnvnClFFilefeltHelaz;:口EML/JCMLH岫PDBMLAMLHiegbtrjcturflI-artcc(lextjtrutnjrei-actw(o?)选择PDBFile(Text).2. BiologicalAsantibly

5、:时悟顽用写字板打开PDB文件,可以看到蛋白质数据库文件实质也是文本文件。拒曲0CCWGilgMGLTEAl洒IT2J-WC-C5球7ITUCR馈fclSTWC1TRE!呻H1WAH浒*#&,H1诉;E01STin.12UESCLECliXHPE?BlIh.lQ:L2BXK1XE;CTOCWKIIOjlFKj3CBiXNLi.Ba0:iPK-ICfKKbDBIN,HCI;ST1LLA7B3L1第CWIE)5tZSXLkTEEFKTEIfEMI?吧濒tMffl?*怔IEW3IWkW1.mRC3二gAMMLETTETTK;TESkFZCJl$测修1OMAN131niXIli:4rKAMs耐成Ben

6、nie.卿艘CTJ!.SOU心7EmiESTaS_STSTHi-ESCHEBTCFITaGOLLSiPH-JX;|I.|mH,:袖虹/V.wmLN.I*L炫IUY协州加fcTfflrK:-ftTEFHSTRBTULiL薜,用*EG:CSinillHim宙SENEDHt削咛皿g1OSSi选择windows版本,并安装(需要pay下载Pymol,并安装。点DOWNLOAD进入下载,money)。n-iorrwiPrgduitt等yipparlCQPEtKtPyMOL鼻dr母i顼iZTOan*抻xnl|fIfliF日-,i-击一行SchrodingwrdownloadL/PyMOLniMdpiBXO

7、NewsJi*Ldrj1i2D14.F-1;T3L心V:L湖TkUOLyfT版1ICM44I3Rilfw或到此网站下载:http:/www.lfd.uci.edU/gohlke/pythonlibs/#pymol选择win32,版本。并安装,需要python编程软件的支持,可从360软件管件直接安装。安装如图:使用详情参见教程,注意打开程序需要找到到PyMOL.exe文件,双击启动程序。python的安装目录:C:Python27PyMOL,找打开2DC3.pdbccw*?z?.tcjLtic*TLaErwcmacswi.-诏.5mE.LiTECE-.峋agtfctOTSliir&3fVIO4GNklMEQUX:tlZCdNlCCuIt!HLihSiMUbdMj!SFTUC*Euf?2H5ainef!|:S-*CT.ryi,QuF*sycrM4rcrsCMLlMliI/mrtiSiWinTftr-iTgr.cikm1瞅,pPliMan_3K1.PjrdL.,Kaux|4=土3-Bjton1/ahuieoh.UtRL牌PhlhRV-y5Pot4Ncfr耐5IESC-5b:f!1-IhiiClip

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