基因工程-第四章-目的基因的分离和合成课件

1、第四章 目的基因的分离与合成通常我们把插入到载体内的那个特定的片段基因称为“外源基因”将那些已被或者准备要被分离、改造、扩增或表达的特定基因或DNA片段，称为“目的基因”。获得目的基因进行分子克隆，一方面为了获得表达产物，另一方面就是要获得大量拷贝，以便进行基因结构和功能的研究 10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新第四章 目的基因的分离与合成获得目的基因的方法：限制酶直接分离从基因组文库中筛选逆转录制备cDNA或从cDNA文库中筛选人工合成PCR扩增基因改造 10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新第四章 目的基因的分离与合成第一节 限制酶直接分离一、用于一些物理图谱已确定的、

2、背景资料比较清晰的原核生物基因的制备对已定序列的DNA分子只需用已知识别序列的限制酶进行一次或几次的切割，分离纯化所需的DNA片断，与适当的载体重组后转化受体菌后即可得到目的基因的克隆。对已知定位的目的基因只要根据目的基因两侧的已知酶切位点，用适当的酶切割，一次即可获得目的基因。10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新第一节 限制酶直接分离二、 用于一些物理图谱未确定的、背景资料不明的原核生物基因的制备采用鸟枪法（shot gun）：从细菌细胞中分离细菌染色体用机械切割或限制酶分解得到各种大小的基因片段用相同的限制酶酶切载体质粒，与染色体片断连接输入到受体细胞转化子的选择10/13/20

3、22苏州科技学院生物系 叶亚新A 鸟枪法鸟枪法克隆目的基因的基本战略鸟枪法操作的改进鸟枪法克隆目的基因的局限性10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新鸟枪法克隆目的基因的基本战略染色体DNA的切断 超声波处理：片段长度均一，大小可控，平头末端 全酶切： 片段长度不均一，粘性末端便于连接，但有可能使目的基因断开，大小不可控 部分酶切： 片段长度可控，含有粘性末端，目的基因完整 与载体连接 如果转化子采用菌落原位杂交法或限制性酶切图谱法筛选，则选择多拷贝克隆载体；如果转化子采用基因产物功能检测法筛选，则选择表达型载体如果转化子采用菌落原位杂交法或限制性酶切图谱法筛选，则选择大肠杆菌作为转化受

4、体细胞 受体细胞；如果转化子采用基因产物功能检测法筛选，则选择能使目的基因表达的受体细胞筛选含有目的基因的目的重组子 菌落原位杂交法、基因产物功能检测法（筛选模型的建立） 10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新鸟枪法操作的改进 使用这一改进方法的前提条件是：目的基因的酶切图谱已知。如果已知目的基因两端的酶切口，可用该酶处理染色体DNA，然后与载体拼接，这样可以保证目的基因的完整性，从而提高重组子中目的重组子的出现频率 使用特征性限制性内切酶切开染色体DNA 10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新鸟枪法操作的改进冻融法滤纸法吸附法低融点凝胶法溶解法凝胶DNA片段回收技术 10/1

5、3/2022苏州科技学院生物系 叶亚新鸟枪法克隆目的基因的局限性工作量较大，需要了解目的基因的背景知识不能获得最小长度的目的基因不能除去真核生物目的基因的内含子结构10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新基因文库的基本概念基因库（gene pool） 特定生物体全基因组的集合（天然存在） 基因文库（gene library or gene bank） 从特定生物个体中分离的全部基因，这些基因以克隆的形式基因组文库（含有全部基因） 存在（人工构建）。根据构建方法的不同，基因文库分为： cDNA文库（含有全部蛋白质编码的结构基因） 第二节 建立基因组文库10/13/2022苏州科技学院生物系

6、 叶亚新基因文库的完备性基因文库的完备性是指：在构建的基因文库中任一基因存在的概率，它与基因文库最低所含克隆数N之间的关系可用下式表示：N = ln ( 1 P ) / ln ( 1 f )其中： P = 任一基因被克隆（或存在于基因文库中）的概率 f = 克隆片段的平均大小 / 生物基因组的大小 例如，人的单倍体DNA总长为2.9 x 109 bp，基因文库中克隆片段的平均大小为15 kb，则构建一个完备性为0.9的基因文库至少需要45万个克隆；而当完备性提高到0.9999时，基因文库至少需要180万个克隆第二节 建立基因组文库10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新基因文库的基本概念

7、基因文库的质量标准除了尽可能高的完备性外，一个理想的基因文库应具备下列条件：重组克隆的总数不宜过大 以减轻筛选工作的压力载体的装载量最好大于基因的长度 避免基因被分隔克隆克隆与克隆之间必须存在足够长度的重叠区域 以利克隆排序克隆片段易于从载体分子上完整卸下重组克隆能稳定保存、扩增、筛选10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新基因文库的构建程序基因组DNA的切割 用于基因组文库构建的DNA片段的切割一般采用超声波处理和限制性内切酶部分酶切两种方法，其目的是： 第一，保证DNA片段之间存在部分重叠区 第二，保证DNA片段大小均一超声波处理后的DNA片段呈平头末端，需加装人工接头 部分酶切法一

8、般选用四对碱基识别序列的限制性内切酶，如：Sau3AI或MboI等，这样DNA酶解片段的大小可控 连接前，上述处理的DNA片段必须根据载体的装载量进行分级分离，以杜绝不相干的DNA片段随机连为一体！10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新基因文库的构建程序载体和受体的选择 出于压缩重组克隆的数量，用于基因组文库构建的载体通常选装载量较大的l-DNA或考斯质粒；对于大型基因组（如动植物和人类）需使用YAC或BAC载体l-DNA 由于绝大多数真核生物的mRNA小于10 kb，因此用于cDNA文库构建的载体通常选质粒 上述几种载体的最大装载量如下：质粒考斯质粒10 kb25 kb45 kbBA

9、C300 kbYAC400 kb 用于基因文库构建的受体则根据载体使用大肠杆菌或酵母菌10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新第二节 建立基因组文库三、建立基因组文库的主要步骤1、利用噬菌体获得目的基因的DNA片断基因组DNA片段化的方法物理学方法：机械力和超声波生物化学方法：限制酶（四个核甘酸序列识别位点的酶）与噬菌体克隆载体重组，体外包装成噬菌体颗粒转染宿主菌筛选培养10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新 不完全补平和磷酸化处理可抑制载体臂的自身连接，大大减少基因组DNA片段插入同一重组体的可能性10/13/2022苏州科技学院生

10、物系 叶亚新第二节 建立基因组文库三、建立基因组文库的主要步骤2、利用Cosmid基本与用噬菌体载体构建基因组文库相似。有如下不同：制备基因组DNA须特别小心必须保证DNA分子尽可能大载体的处理比较简单连接重组时，cosmid的量要比插入片段的量高10倍以上包装转染后在平板上出现的转化菌落，不是嗜菌斑10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新第二节 建立基因组文库三、建立基因组文库的主要步骤3、利用YAC选用限制酶EcoRI和BamHI对pYAC4载体作双酶消化选用适当的方法制备生物体完整的染色体DNA，并将其片段化收集纯化大片段DNA，并与YAC臂连接转化去壁酵母细胞，利用存在于两臂上的

11、选择标记，筛选含有YAC两臂的酵母细胞10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新第三节 cDNA基因文库的构建二、cDNA基因文库的构建细胞总RNA的制备及mRNA的分离cDNA第一条链的合成双链cDNA的合成cDNA与载体的连接，重组到相应的载体上，导入受体细胞增值10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新二、cDNA基因文库的构建细胞总RNA的制备及mRNA的分离总RNA：mRNA、tRNA、rRNAmRNA的分离纯化利用真核生物mRNA其3末端的poly（A）尾巴与oligo（dT）配对特性，制备oligo（dT）型纤维素亲和层析柱1

12、0/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新二、cDNA基因文库的构建以mRNA分子为模板，合成cDNA分子第一链Oligo（dT）引导的cDNA合成法随机引物引导的cDNA合成法10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新cDNA法克隆目的基因的基本战略mDNAcDNA第一链的合成 5ppp5G G AAAAAAAAAAAAAAOH 35ppp5G G AAAAAAAAAAAAAAOH 3TTTTTTTTTTTTTTp 55ppp5G G AAAAAAAAAAAAAAOH 3TTTTTTTTTTTT

13、TTp 5cDNA第一链引物退火逆转录酶dNTPs10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新二、cDNA基因文库的构建双链cDNA分子的合成自我引导合成法碱处理mRNA-cDNA杂交分子，降解mRNA单链cDNA在3端易发生自身环化形成发夹结构为cDNA第二链的合成提供引物在klenow酶的作用下合成cDNA第二链用S1酶切割除去单链发夹结构10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新cDNA第二链的合成 煮沸NaOH自身引导法：获得的双链cDNA 5端会有几对碱基缺失AAAAAAAAAAAAAA5ppp5G G AAAAAAAAAAAAAA

14、OH 3TTTTTTTTTTTTTTp 5TTTTTTTTTTTTTTp 5TTTTTTTTTTTTTTp 5AAAAAAAAAAAAAAOH 3TTTTTTTTTTTTTTOH 3KlenowdNTPsS110/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新二、cDNA基因文库的构建双链cDNA分子的合成置换合成法RNA酶H和E.coli DNA聚合酶I混合处理mRNA-cDNA杂交分子， RNA酶H在杂合双链mRNA链上产生缺口并形成部分cDNA单链区DNA聚合酶I以残存的mRNA作为引物合成cDNA第二链T4-DNA连接酶修复缺口10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新cDNA第二链的合

15、成 DNApol dNTPsRNaesH置换合成法：获得的双链cDNA 5端也会有几对碱基缺失5ppp5G G AAAAAAAAAAAAAAOH 3TTTTTTTTTTTTTTp 5AAAAAAAAAAAAAAp 55S1 AAAATTTOH 3TTTTTTTTTTTTTTp 55TTTTTTTTTTTTTTOH 3AAAAAAAAAAAAAA 55TTTTTTTTTTTTTT 33T4-DNA ligase10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新二、cDNA基因文库的构建双链cDNA分子的合成引

16、物合成法在第一链合成完毕后，变性残留的mRNA，用末端转移酶在cDNA游离的3羟基端添加同聚物（dC）末端将其与人工合成的oligo-dG退火，形成引物结构在klenow酶的作用下，合成第二条cDNA链。PCR法10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新cDNA第二链的合成 dCTPTdT引导合成法：获得的双链cDNA 能保留完整的5端序列5ppp5G G AAAAAOH 3TTTTTp 53 HO5ppp5G G AAAAACCCCCCCOH 33 HOCCCCCCCTTTTTp 53 HOCCCCCCCTTTTTp 53 HOCCCCCCCTTTTTp 55 pGGGGGGG3 HOC

17、CCCCCCTTTTTp 55 pGGGGGGGAAAAAOH 3NaOH退火KlenowdNTPs10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新二、cDNA基因文库的构建双链平头的cDNA通常可以使用下列三种方法克隆入载体中： 平头末端直接与载体连接，但插入的片段无法回收 平头两端分别接同聚物尾，最好是AT同聚物尾，这样重组分子可通过加热局部变性和S1核酸酶处理回收插入片段加装人工接头引入酶切口，以便插入片段回收 10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶

18、亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新二、cDNA基因文库的构建双链cDNA克隆的筛选探针原位杂交法差示杂交法10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新cDNA法克隆目的基因的局限性并非所有的mRNA分子都具有polyA结构 细菌或原核生物的mRNA半衰期很短mRNA在细胞中含量少，对酶和碱极为敏感，分离纯化困难仅限于克隆蛋白质编码基因 10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新三、PCR扩增法 PCR（Polymerase Chain

19、Reaction）法，又称为聚合酶链反应或PCR扩增技术，是一种高效快速的体外DNA聚合程序 使用PCR法克隆目的基因的前提条件是：已知待扩增目的基因或DNA片段两侧的序列，根据该序列化学合成聚合反应必 需的双引物 PCR法定向扩增目的基因的基本原理10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新四、基因的化学合成DNA的化学 DNA合成仪酶促法全片段酶促连接法人工合成组成一个完整基因的所有寡核甘酸片段，相邻的片段间有4-6个碱基的重叠互补相互互补的寡核甘酸片段复性，形成双链寡核甘酸片段用T4连接酶连接酶

20、促填充法10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新四、基因的化学合成DNA的化学 DNA合成仪酶促法全片段酶促连接法酶促填充法合成目的基因其中的一些片段，在这些相邻的片段的3端有一短的序列互补复性形成模板用klenow酶去填补互补片段间的单链区域10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新化学合成法的基本战略全基因合成化学合成目的基因的前提条件是基因的DNA序列已知，有三种战略：小片段粘接法： 混合退火根据目的基因全序列，分别合成12-15碱基长的单链DNA小片段T4-DNA连接酶连接克隆入合适的

21、载体 10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新化学合成法的基本战略全基因合成补钉延长法： 混合退火根据目的基因两条互补链全序列，分别合成12-15碱基长的单链DNA小片段以及20-30碱基长的单链DNA中片段T4-DNA连接酶连接克隆入合适的载体 Klenow酶聚合10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新化学合成法的基本战略全基因合成大片段酶促法： 混合退火根据目的基因的全序列，分别合成40-50碱基长的单链DNA片段T4-DNA连接酶连接克隆入合适的载体 Klenow酶聚合10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新化学合成法的基本战略全基因合成 上述三种方法各有利弊：化学合成

22、DNA的单片段愈短，收率就愈高，但由于化学合成的份额较大，成本较高；在大片段酶促法合成目的基因时，虽然化学合成的份额相对较小，成本较低，但大片段化学合成的收率极低，例如，每聚合一个单体的产物收率为95%则合成50个碱基长的DNA单链大片段的总收率只有7.7%10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新化学合成法的基本战略探针等寡聚核苷酸合成 在某些情况下，往往只知道目的基因编码产物的部分氨基酸序列，而基因序列未知，此时需要从已知的氨基酸序列推测为其编码的DNA序列，然后合成探针，筛选由鸟枪法或cDNA法得到的重组子，最终获得含有目的基因的目的重组子 由于大多数氨基酸拥有简并密码子，故在探针序

23、列的设计时必须考虑下列问题：生物体对简并密码子的偏爱性，合成系列探针探针应具有足够的长度，通常在17-20个核苷酸之间探针内部不应出现可能的互补区域10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新化学合成法的基本战略探针等寡聚核苷酸合成某段连续的氨基酸序列Cys Met Asp Glu Met Lys Arg Asn Ile所有可能的DNA序列TGT ATGGAC GAAATG AAAAGA AACATA C T GA TG G G T T C CGA CGG CGT CGC设计的简并探针序列TGTATGGACGAIATGATGTATGGATGAIATGATGCATGGACGAIATGATGCA

24、TGGATGAIATGA A G此外还可以参考各种生物体的EST数据库进行倾向性简并序列设计expressed sequence tag10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新化学合成的单元操作 化学合成DNA的实质是按照序列要求将脱氧核苷酸单体一个个接上去，每接一个单体就是一个循环反应，包括：基团保护、分离、缩合、分离、去保护五大操作单元。 从反应机理上来讲，DNA化学合成有磷酸二酯法、磷酸三酯法、亚磷酸液三酯法；具体操作过程又有液相合成和固相合成两种形式。前者操作繁琐，基本上已淘汰；后者反应中间物的分离程序简便，DNA合成仪就是根据固相亚磷酸液三酯法原理设计的10/13/2022苏州

25、科技学院生物系 叶亚新化学合成的单元操作OHGHHHHOCH2ODMTPOMeNCHMeMeCHMeMeHDMT： 二甲氧基三苯甲基激活缩合氧化脱取代基玻璃珠连接臂10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新DNA化学合成的用途合成天然基因修饰改造基因 设计新型基因 制备探针、引物、接头 如生长激素释放抑制素基因、脑啡肽基因、胰岛素基因、干扰素基因等如组织型纤溶酶原激活剂基因、尿激酶原基因等 10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新目的基因的分离目的基因的功能克隆根据特异蛋白分离目的基因基本过程：分离特异蛋白，测定特异蛋白的氨基酸顺序，推测该蛋白的核苷酸序列，合成探针分离特异蛋白，作为

26、抗原制备抗体，筛选cDNA表达文库10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新目的基因的分离目的基因的功能克隆根据特异蛋白分离目的基因注意事项：合成的探针必须特异的识别目的基因，充分考虑遗传密码的简并性利用抗体筛选目的基因时，应构建cDNA的表达文库10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新目的基因的分离目的基因的功能克隆功能互补法克隆基因利用被克隆的DNA片断与寄主细胞的染色体DNA在功能上的互补性来进行目的基因的直接分离酵母基因组酶切DNA片断噬菌体载体营养缺陷型菌株基本培养基重组体10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新1. 遗传互补法1)原理 当把一外源DNA片段引入一受体

27、细胞后，如果受体细胞获得某种新的性状，那么此片段上携带着决定新性状的遗传基因。 i. 营养缺陷型受体细胞+外源DNA 转化细胞涂布在合成培养基上 原养型细胞生长 ii. 受体细胞（无某种表型）+ 外源DNA 转化细胞涂布在特殊培养基上 具有新性状细胞 iii. 虽然有些受体细胞也能产生某种酶活性，但当转入目的基因后，该细胞可过量产生此酶活性，这亦可用于基因筛选。如酿酒酵母的MF基因就是如此筛选到的。10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新实例：基因组文库DNA 转化酿酒酵母细胞（leu2,Leu-） 转化细胞（leu2/LEU2，Leu+）LEU2基因 基因组文库DNA 转化E.coli

28、（无纤维素酶活性） 转化细胞可在纤维素平板上形成水解圈 纤维素酶基因 优点：简便，快速，可靠，是首选方法。获得的基因一定是完整基因。 缺点：适用范围较窄。 必备条件：外源基因不仅能在受体细胞表达，而且必须具备生物学活性。10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新2) 分离步骤 分离基因组文库重组DNA分子 转化适当宿主细胞 涂布在选择培养基上随机挑选阳性克隆，分离重组DNA分子 再转化相同受体细胞 高频转化子 基因的进一步证实和鉴定重组DNA转化细胞 SDS出现新蛋白质带原载体转化细胞(一) 分别制备无细胞抽提物 酶活测定酶活性出现非转化细胞（二） 免疫分析与特定抗原反应 10/13/20

29、22苏州科技学院生物系 叶亚新2核酸杂交法 1)原理 利用核酸探针与待分离DNA的同源序列可进行杂交的特点分离目的基因（同源序列不是完全相同序列）优点：不需要基因表达必备条件：合适的核酸探针或有关资料，外源DNA能在宿主细胞中扩增 2)核酸探针种类 i. DNA探针: 分离自某一种生物 ii.寡核苷酸探针: 根据目的基因编码蛋白质的部分氨基酸序列推测10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新如：Leu-Val-Phe-His-Asp-Ala 六肽 QUN-GUN-UUQ-CAQ-GAQ-GCN 对应mRNA N：ACGT/U CAN-AAP-GTP-CTP-CG 探针序列 Q：CT/U P

30、：AG 32种14聚体混合物，其中必有一种14聚体与待测DNA完全互补* 选择的肽段中氨基酸的简并密码子应最少。*这种探针最好用于目的cDNA分离。若用于分离基因，要事先考虑到此探针序列横跨内含子序列的可能。*此种探针亦可根据其他来源相同基因的保守序列设计。 iii. cDNA探针: 利用特异性 mRNA反转录而成，亦可用不同mRNA 混合物反转录而成 iv. PCR探针 v. RNA探针: 由T3或T7启动子和相应聚合酶转录其下游基因片段而得10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新 3) 分离步骤 基因(基因组或cDNA)文库 制备DNA样品膜与标记探针杂交 杂交斑点（阳性克隆）分离重

31、组DNA分子 作斑点杂交阳性克隆Southern杂交以确认杂交结果 DNA进一步证实和鉴定：核酸序列分析，与蛋白质一级结构比较；分离插入片段进行基因表达，用免疫方法或其他方法检测表达产物3. 免疫法 1) 原理 外源DNA引人宿主细胞后表达出蛋白质，以此为抗原与相应的抗体发生免疫反应, 然后利用二抗与一抗反应，用二抗偶联的酶反应筛选目的DNA10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新优点：不依赖于基因表达产物的生物学活性,只要抗原决定序列能被正确表达。 * 外源DNA可以是一个完整编码区，也可能是一个外显子，这些序列可以插入E.coli表达型载体。必备条件：待分离基因的表达产物蛋白质必须纯

32、化和用于制备相应抗体。 2)分离步骤 基因文库蛋白质样品膜制备免疫法筛选有色斑点（阳性克隆）进一步证实：分离阳性克隆无细胞抽提物，作斑点印迹，western印迹免疫分析；分离重组DNA，检测插入片段大小，测序等。10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新目的基因的分离目的基因的序列克隆法根据已知基因序列或同源基因序列分离目的基因用核酸探针进行杂交筛选：根据已知序列合成相应探针，再与基因组文库的克隆进行杂交，筛选阳性克隆，最后分离鉴定表达序列标签（EST）法分离目的基因表达序列标签（expressed sequence tag EST）:是指基因序列中一段能特异地标记或表征基因的序列。10/

33、13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新筛选目的基因片断的差别杂交及减法杂交技术差别杂交（differential hybridization）法应用前提：需要拥有两种不同的细胞群，即在一个细胞群中目的基因能正常生长，而在另一细胞群中目的基因不表达。Fig4-21减法杂交（subtractive hybridization）技术mRNA减法杂交 fig4-22基因组DNA减法杂交 fig4-2310/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/202

34、2苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新利用差示分析法分离目的基因克隆mRNA差别显示技术（DD-PCR,DDRT-PCR） fig 4-24抑制性减法杂交（SSH）技术该法是一种用于分离和鉴定差异表达基因的革命性方法，特别适宜于那些差异表达量很低的基因，其富集效率在1000倍以上。待测ds-cDNA（tester cDNA）和驱动ds-cDNA（driver cDNA）fig 4-2610/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系

35、 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新 4. 染色体巡查法(chromosome walking) 1) 原理 利用DNA探针筛选对应重组DNA，然后以插入片段两末端片段为探针选择对应重组DNA，此次筛选的DNA插入片段仅以一端为探针，继续和重复该过程，直至筛选到目的基因优点：可获得染色体中一段DNA的限制酶图谱，对基因组全序 列测定十分有用 缺点：工作量大，鉴定困难，当巡查高等真核生物染色体时，重复DNA序列区域难以跨越。必要条件：两基因间距离应清楚。 * 该法的两大难点：限制酶图制作和末端片段探针制备。前者可用改进的载体，后者可用RNA聚合酶合成末端探针 2) 操作步骤10/13/2022苏州科技学院生物系 叶亚新10/13/2022