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文档简介
ICS65.020.20B16
DB37山 东 省 地 方 标 准DB37/T4101—2020苹果轮纹病菌快速检测方法Rapiddetectionofbotryosphaeriadothidea20202020083120201001山东省市场监督管理局发布前言本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。本标准由山东省农业农村厅提出并组织实施。本标准由山东省农业标准化技术委员会归口。本标准起草单位:山东省烟台市农业科学研究院。本标准主要起草人:王英姿、刘保友、汪少丽、王培松、石洁。苹果轮纹病菌快速检测方法范围本标准规定了用环介导等温扩增(LAMP)快速检测苹果轮纹病菌的测定方法。本标准适用于苹果叶片、枝条和果实中苹果轮纹病菌的快速检测。方法检出限:10-7ng/μL苹果轮纹病菌DNA。GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法GB/T27403实验室质量控制规范食品分子生物学检测原理ITSBstITS基DNASYBRGreenIDNADNA000倍。在不发生扩增反应时,SYBR染料分子的荧光信号不DNASYBRDNA缩略语下列缩略语适用于本文件。LAMP:环介导等温扩增(loop-mediatedisothermalamplification)DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)ITS:内转录间隔区(Internaltranscribedspacer)2×LampMasterMix:等温扩增PCR混合液Bst酶:BstDNA聚合酶(BstDNApolymerase)除有特殊说明外,所有实验用试剂均为分析纯;实验用水为GB/T6682中规定的一级水。42 CR(2amPRMaterMi1)40molLTi-C20mmol/(NH)SO、20mmol/LKC1(pH8.8)16mmol/LMgSO42.0mmol/LdNTPs、0.2Trion42 BstDNA8U/μLSYBRGreenI1000ITSbp,引物序列见附录ADNADNA-EZReagentsAll-DNA-Fast-Out2)5mol/L0.1mL、1.5mL70mm6.2mm9.5mm6.165±380℃±16.20.5μL~10μL10μL~100μL,100μL~1000μL(Valsamali)DNA(Botryosphaeriadothidea)DNADNA0.5cm×0.5cm(),1.5mLDNA100μLDNA1.5mL5min80±1510min~30minLAMPLAMP(上海认可。如果其他等效产品具有相同的效果,则可使用这些等效产品。(上海认可。如果其他等效产品具有相同的效果,则可使用这些等效产品。LAMP2DNA1μL表1LAMP组分工作液浓度加样量反应体系最终浓度外引物1(F3)10μmol/L0.5μL0.2μmol/L外引物2(B3)10μmol/L0.5μL0.2μmol/L内引物1(FIP)10μmol/L2μL0.8μmol/L内引物2(BIP)10μmol/L2μL0.8μmol/L环引物1(LF)10μmol/L1μL0.4μmol/L环引物2(LB)10μmol/L1μL0.4μmol/LLampPCRMasterMix2×12.5μL1×BstDNA聚合酶8U/μL0.5μL0.16U/μL甜菜碱5mol/L4μL0.8mmol/LDNA模板-1μL-水-补足至25.0μL-65±360min,80110min(7.5防污染措施环介导等温扩增检测过程的防污染措施应符合GB/T27403中附录D规定。8结果判定22附录A(资料性附录)苹果轮纹病菌ITS基因特异性序列ITS(accessionno.MN559436.1)1ATTGCGCCCTTTGGTATTCCGAAGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACAACCCTCAAGC61TCTGCTTGGTATTGGGCACCGTCCTTTGCGGGCGCGCCTCAAAGACCTCGGCGGTGGCGT121CTTGCCTCAAGCGTAGTAGAACATACATCTCGCTTCGGAGCGCAGGGCGTCGCCCGCCGG181ACGAACCTTCTGAACTTTTCTCAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATACCCGCTGAAC注:下划线所示部分为引物扩增匹配区段。1(F3,5’-3’):TGCCTGTTCGAGCGTCAT2(B3,5’-3’):TCCGAGGTCAACCTTGAGAAF1cF2B1cB2内引物2(BIP,5’-3’):GCGTCTTGCCTCAAGCGTAGTGTTCAGAAGGTTCGTCCGG环引物1(LF,5’-3’):G
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