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文档简介

基因组的结构与功能第二章4/18/20231第一节原核生物基因组的结构与功能第二节真核生物基因组的结构与功能第三节病毒基因组的结构特点4/18/20232基因组(genome)

细胞或生物体中,一套完整单倍体的遗传物质的总和

结构

指不同的基因功能区域在核酸分子中的分布和排列情况

功能

贮存和表达遗传信息

4/18/20233第一节原核生物基因组的结构与功能一、原核生物染色体基因组的结构与功能二、原核生物中的质粒DNA4/18/20235(一)原核生物染色体DNA的基本结构与功能

环状双链DNA分子

与蛋白质形成复合物

●类核(nucleoid)

中央:RNA和支架蛋白组成。

外围:双链闭环的超螺旋DNA。

(1)基本结构特点一、原核生物染色体基因组的结构与功能4/18/20236原核生物染色体DNA通常与细胞膜相连,连接点的数量随细胞生长状况和不同的生活周期而异

4/18/20237原核生物DNA的高级结构---超螺旋结构4/18/20238(二)原核生物染色体基因组结构基因特征●

结构基因的编码是连续的●结构基因之间的编码序列不重叠●基因组中很少有重复序列●结构基因多为单拷贝基因(编码rRNA的基因除外)●结构基因在基因组中所占的比例(约占50%)远大于真核基因组,小于病毒基因组

4/18/202310(三)原核生物染色体基因组中结构基因与调控序列的组织形式

●操纵子(operon)4/18/202311二、原核生物中的质粒DNA1.质粒的基本特性●质粒的定义

质粒(plasmid)是细菌细胞内的、染色体外的共价闭合的环状DNA分子(covalentclosedcircularDNA,cccDNA)4/18/202313质粒的结构与功能特点●

能够独立于细胞的染色质DNA而进行复制●

对宿主细胞的生存不是必需的●

能赋予细菌特定的遗传性状4/18/2023142.质粒的遗传调控●质粒自身带有一个复制调控系统●

能使细胞分裂与质粒复制协调●

质粒在宿主菌中具有不相容性4/18/2023154.质粒拷贝方式●严谨型质粒(strigentplasmid)

低拷贝数质粒,一个细菌内仅含数个质粒。●

松弛型质粒(relaxedplasmid)即高拷贝质粒,每个细菌内的质粒数目可达10-60个或更多。4/18/2023175.质粒对宿主的适应性●

窄宿主谱质粒

仅能存在于一种或数种密切相关的宿主

广宿主谱质粒可以在不同科、属、种的细菌之间传递4/18/202318第二节真核生物基因组的结构与功能一、真核细胞染色质DNA的高级结构二、真核细胞核基因组结构和功能特点4/18/202319核心组蛋白结构特点非常保守原因:●绝大多数氨基酸都与DNA或其它组蛋白相互作用,不可置换●所有的生物中与组蛋白相互作用的DNA磷酸二酯骨架都是相同的

●球形部4/18/202321四种核心组蛋白的组成借精氨酸残基与磷酸二酯骨架间的静电作用使DNA分子缠绕在组蛋白核心周围,形成核小体

●尾部

含有大量赖氨酸和精氨酸残基,为组蛋白翻译后进行修饰的部位

.4/18/202322连接蛋白H1特点●

具有种属特异性●

具有组织特异性4/18/202323功能

●帮助DNA分子折叠

●协助启动DNA复制

控制基因转录,调节基因表达4/18/2023252.DNA与蛋白质的结合与染色体的组装●基本结构

八聚体核心组蛋白

↓核心颗粒

↓核心颗粒之间+连接区形成串珠样的结构

核小体是染色质的基本组成单位4/18/202326染色质的压缩过程4/18/202329二、真核细胞核基因组结构和功能特点

●大都为断裂基因

1.结构基因的结构与功能特点非编码区内含子编码区外显子●转录产物为单顺反子●结构基因所占区域远小于非编码区域4/18/2023302.基因组中的重复序列的结构及其功能(1)高度重复序列

重复频率可达106次(卫星DNA、反向重复序列等)

反向重复序列由两个相同顺序的互补拷贝在同一DNA链上反向排列而成

●卫星DNA这类序列的碱基组成不同于基因组的其他部份,可用等密度梯度离心法将其与主体DNA分开4/18/202331(1)高度重复序列功能

●参与复制水平的调节

存在于DNA复制起点区的附近,是一些蛋白质(包括酶)的结合位点

●参与基因表达的调控

可以形成发夹结构,有助于稳定RNA分子●参与染色体配对

同源染色体之间的联会可能依赖于具有染色体专一性的特定卫星DNA序列4/18/202332(2)中度重复序列

●短分散重复片段

平均长度约为300bp-500bp拷贝数可达10万左右,如Alu家族●长分散重复片段平均长度为3500bp-5000bp

重复数十至数万(<105)次4/18/202333●Alu家族

人基因组平均每5kbDNA就有一个Alu序列,长度约300bp,每个单位长度中有一个限制性内切酶Alu的切点(AG↓CT),故称为Alu序列(或Alu家族)。有种属的特异性

4/18/202334(3)单拷贝序列(低度重复序列)

在单倍体基因组中只出现一次或数次,单拷贝序列在基因组中占50-80%,储存了编码各种不同功能的蛋白质的遗传信息4/18/202335

3.多基因家族与假基因

●多基因家族(multigenefamily)

指由某一祖先基因经过重复和变异所产生的一组基因

分布特点

基因家族成簇地分布在某一条染色体上基因家族成簇地分布于不同染色体上

4/18/202336●

假基因(pseudogene)

多基因家族中并不产生有功能的基因产物的成员

特征缺少正常基因的内含子4/18/202337线粒体DNA(mitochondrial,mtDNA)

mtDNA是核外遗传物质●环状分子●结构特点与原核生物相同4/18/202338第三节病毒基因组的结构特点

4/18/2023391.病毒基因组的特点●基因组较小

不到大肠杆菌基因组大小的十分之一

●可以是DNA,也可以是RNA●可以是单链结构,也可以是双链结构

●可以是闭环分子,也可以是线性分子4/18/2023402.RNA病毒基因组

可以由不相连的几条RNA链构成,每个RNA分子都含有编码蛋白质分子的信息。DNA病毒无类似现象4/18/2023413.基因重叠●

同一DNA片段可以是2种甚至3种蛋

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