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文档简介
实验五
植物总DNA的提取
植物基因组DNA的提取琼脂糖凝胶电泳检测脱氧核糖核酸(DNA)、核糖核酸(RNA)
与蛋白质结合在一起以核蛋白(DNP)的形式存在。在制备核酸时通常破坏细胞壁及细胞膜来使核蛋白释放出来。植物总DNA包括细胞核DNA和细胞核外DNA,前者存在于细胞核内,后者存在于细胞质中有半自主性复制活性的细胞器内,例如线粒体DNA(mtDNA)和叶绿体DNA(ctDNA)。核酸的存在形式细胞破碎抽提去蛋白质沉淀核酸操作步骤①机械方法:超声波处理法、研磨法、匀浆法;②化学试剂法:用SDS处理细胞;③酶解法:加入溶菌酶或蜗牛酶,破坏细胞壁。
细胞破碎
SDS法SDS是有效的阴离子去垢剂,
细胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,SDS能够破坏这种价键。CTAB法CTAB是一种阳离子去垢剂,它可以溶解膜与脂膜,使细胞中的DNA-蛋白质复合物释放出来,并使蛋白质变性,使DNA与蛋白质分离。DNA提取实验材料
新鲜蔬菜叶片(去叶脉)试剂
2×CTAB抽提液TE缓冲液(pH=8.0)
氯仿:异戊醇(24:1)
材料与试剂①离心机②水浴锅③研钵④微量移液器仪器用具1.取2g清洗凉干的新鲜叶片于研钵中,加1/3药匙石英砂和4mL2倍的CTAB提取液,迅速研磨。2.将1mL研磨液转入1.5mL离心管中,置于65℃水浴中保温20min,其间颠倒混匀2-3次。破碎细胞3.12000r/min离心5min,取上清液700μL转到另一离心管中。加入等体积氯仿:异戊醇(24:1)混合液,充分颠倒混匀。12000r/min,离心5min。抽提去蛋白4.将上清液移入新的1.5mL离心管内,加600µL异丙醇。颠倒混匀,可见DNA絮状沉淀。沉淀核酸5.12000r/min,离心1min,倒掉上清液,将离心管倒置干燥。
将沉淀回溶于20µLTE缓冲液待测。操作步骤DNA分子在高于等电点的PH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。在一定电场强度下,DNA分子的迁移速度与相对分子质量的对数成反比。电泳原理琼脂糖是一种线性多糖聚合物。浓度越高,孔隙越小,其分辨能力就越强。琼脂糖浓度(%)线型DNA分子的分离范围(Kb)0.35~600.61~200.70.8~100.90.5~71.20.9~61.50.2~312.00.1~2仪器和试剂仪器电泳仪电泳槽灌胶模具等电泳指示剂溴酚兰在碱性液体中呈紫兰色,一般与蔗糖、甘油或聚蔗糖400组成上样缓冲液。作用:①增加样品比重,以确保DNA均匀沉入加样孔内。②形成肉眼可见的指示带,预测核酸电泳的速度和位置。③使样品呈色,使加样操作更方便。上样缓冲液溴化乙锭(EB)是一种荧光染料,EB分子可嵌入核酸双链的碱基对之间,在紫外线激发下,发出红色荧光。其荧光强度与DNA的含量成正比。据此可粗略估计样品DNA浓度。琼脂糖凝胶EB染色,肉眼可见核酸电泳带,其DNA量一般>5ng。核酸染色剂注意事项:EB是致癌物质,切勿用手接触,更不要污染环境。DNA分子量标准紫外仪上观察电泳带及其位置。绘制核酸电
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