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第页共页结合蛋白质互作与基因表达谱信息大范围预测蛋白质的精细功能结合蛋白质互作与基因表达谱信息大范围预测蛋白质的精细功能GESTs(geneexpressionsimilarityandtaxonomysimilarity)是结合基因表达相似性和基因功能分类体系GeneOntology(GO)中的功能概念相似性测度进展功能预测的新方法.将此预测算法推广应用于蛋白质互相作用数据,并提出了几种在蛋白质互作网络中为功能待测蛋白质挑选邻居的`方法.与已有的其它蛋白质功能预测方法不同,新方法在学习过程中自动地从功能分类体系中的各个功能类中选择最适宜的尽可能详细细致的功能类,利用注释于其相近功能类中的互作邻居蛋白质支持对此详细功能类的预测.使用MIPS提供的酵母蛋白质互作信息与一套基因表达谱数据,利用特别针对GO体系构造层次特点设计的3种测度,评价对GO知识体系中的生物过程分支进展蛋白质功能预测的效果.结果显示,利用文中的方法,可以大范围预测蛋白质的精细功能.此外,还利用此方法对2023年底GeneOntology上未知功能的蛋白质进展预测,其中局部预测结果在2023年4月发布的SGD注释数据中已经得到了证实.作者：高磊李霞郭政朱明珠李彦辉饶绍奇作者单位：高磊,朱明珠,李彦辉(哈尔滨医科大学生物信息学系,哈尔滨,150086)李霞,郭政(哈尔滨医科大学生物信息学系,哈尔滨,150086;同济大学生命科学与技术学院,上海,200092)饶绍奇(哈尔滨医科大学生物信息学系,哈尔滨,150086;DepartmentsofMolecularCardiologyandCardiovascularMedicine,theClevelandClinicFoundation,9500EuclidAvenue,Cleveland,Ohio44195,USA)刊名：中国科学C辑ISTICPKU英文刊名：SCIENCEINCHINA(SERIESC)年，卷(期)：202336(5)分类号：Q5【关键词】：^p：基因表达谱蛋
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