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文档简介
核酸适配体在临床输血中的研究
主要内容
一、核酸适配体筛选基本原理
二、以抗D为靶分子的筛选
第一部分
核酸适配体筛选基本原理
SELEX(SystematicEvolutionofLigandsbyExponentialEnrichment:组合化学技术)。
EllingtonAD,SxostakJW.InvitroselectionofRNAmoleculesthatbindspecificligands.Nature,1990,346(6287):818-822.
文库种类:随机RNA文库
随机单链DNA文库
化学修饰的文库
用途:与蛋白的结合力高于抗原抗
体之结合。用于诊断、治
疗等。需要忘掉的东西
1、碱基互补
2、PCR扩增单一序列产物需要建立的东西1、玩过积木拼图吗?2、扩增产物是一个库
VS
几个基本概念
1、单链核酸可形成立体结构
AGAGACGGACACAGGATGAGCGGTGCAGGGGGGGCGGAGAAGAGGTTGAGGGGAGCGGGTCCTTCCCCAAGACAGCATCCA
2、文库容量:
固定区(N随机序列)固定区至少>1013筛选的基础---结构互补特异性与亲和力的保证筛选压力(负向筛选、文库投入量等)筛选轮数最终达要达到的目的Antibodycoveredbyaptamer,andthereactionbetweenantibodyandantigenwasblockedScreeningProcess文库是怎样制成的?PCR扩增1、不对称PCR+凝胶回收2、对称PCR+链霉亲和素磁珠+碱处理+凝胶回收3、对称PCR+酶切+凝胶回收ssDNA文库的制备设计思路特点
1、简便
2、产量高
3、质量好
第二部分
以抗D为靶分子的筛选
首先要确定的几个关键因素
1、Anti-D(IgG)的固定
2、负向靶分子的选择
3、筛选压力
多轮筛选后,对筛选文库进行二代测序有效性验证
1、是否具体阻断抗原抗体反应的能力
2、亲和力如何
3、特异性如何以抗D为靶分子筛出的ssDNA-Aptamer可完全中和抗体将抗体标在微球上,以起到指示作用,便于直观地观察。10×40倍拓展:结构研究、分子间相互作用,等
实际应用应用一:抗体检测:简单情况--是否存在同种抗体
复杂情况--自身抗体存在掩盖同种抗体检测方法:
酶联法
流式法应用二:中和体内抗体,输注阳性血液(路漫漫~~)
适配体筛选遇到的困难
筛选依然是
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