如何使用好PubMed课件

认识PubMed——让它融入您的科研主要内容一、

认识PubMed二、PubMed

检索入门三、PubMed高级检索四、PubMed医学主题词表检索五、PubMed其他功能六、PubMed个性化服务WebofScience您的选择？GoogleScholarPubMedScopusgoogle一、认识PubMed/guide/一、认识PubMedPubMed与NCBI数据库的关系图一、认识PubMed标引质量高更新速度快信息量大使用方便选择PubMed的n个理由一、认识PubMedPubMedABDCMedlineOldMedlineIn

Process

CitationsRecordsuppliedbypublisher一、认识PubMedOLDMEDLINE:

收录了1950－1965年间的美国医学索引（IM）中的题录。InProcess

Citations

:是临时性的数据库，收录准备进行标引的题录和文摘信息，每天都在接受新的数据，进行文献的标引和加工，每周把加工好的数据加入到Medline中，同时从InProcessCitations库中删除。InProcessCitations中的记录标有[PubMed-inprocess]。Recordsuppliedbypublisher：出版商将期刊文献信息电子版提供给PubMed后，每条记录都标有[PubMed-assuppliedbypublisher]，这些记录每天都在不停地向InProcessCitations库中传送，加入到InProcessCitations后，原有的标记将改为[PubMed-inprocess]。Medline：是美国国立医学图书馆（U.S.NationalLibraryofMedicine）最重要的书目文摘数据库。收录了全世界70多个国家和地区的5000余种生物医学期刊，书目文摘条目1500万余条，时间起自1966年。标有[PubMed-indexedforMEDLINE]的标记一、认识PubMed一、认识PubMed/pubmed/检索提问区文献匹配临床研究特定主题咨询期刊检索主题检索高级检索一、认识PubMed2.1单著者检索2.1.1

键入著者姓氏全称和名字的首字母全写或缩写如: MichaelHeuser Heuser,Michael Heuser

M

MichaelHeuser[au]2.1.2利用高级检索中的“Author”检索,选下拉选项定位二、PubMed检索入门2.3.1直接输入您所要检索的关键词或主题词,英文单词或短语（大写或小写均可）,词汇自动转换功能进行检索，并将检索结果直接显示在主页下方。

如:acutemyeloidleukemia.2.2著者与主题联合检索2.2.1直接输入作者姓名与主题词,不用AND如:

MichaelHeuserIDH2.3

单主题检索二、PubMed检索入门2.4期刊检索2.4.1输入期刊名，ISSN，Medlinejounaltitleabbreviation

如:naturemedicine[TA]ORnatmed[TA]

1078-8956

2.4.2用singlecitationmatcher中的期刊名称检索2.4.3用journaldatabase检索二、PubMed检索入门2.5.1布尔逻辑运算符(AND,OR,NOT)

如：OncologyAND(treatmentORresearch)2.5.2

截词符(*)用于相同词根的词

如:

bacter*2.5.3

词组检索(“”)（必须是英文字符）

如:

“Singlecell”2.5.4

通配符(?)如:

“cell?”2.5组配/截词/短语检索二、PubMed检索入门2.9PubMed检索字段标识二、PubMed检索入门字段名称字段标积字段含义Affiliation[AD]第一著者单位、地址AllFields[ALL]所有字段Author[AU]著者CorporateAuthor[CN]团体著者FirstAuthorName[1AU]第一著者FullAuthorName[FAU]著者全名ISBN[ISBN]ISBNIssue[IP]期刊期号Journal[TA]期刊名称（含全称、缩写、ISSN号）Language[LA]语种LastAuthor[LASTAU]排名最后的著者MeSHMajorTopic[MAJR]主要MeSH主题词，用*表示MeSHSubheadings[SH]MeSH副主题词MeSHTerms[MH]MeSH主题词OtherTerm[OT]款目词（非MeSH主题词）Pagination[PG]文献起止页码PersonalNameasSubject[PS]作为文献主题的人名PharmacologicalAction[PA]药理作用概念PlaceofPublication[PL]期刊出版国别PublicationDate[DP]出版日期PublicationType[PT]文献类型Subset[SB]数据子集TextWords[TW]文本词，来自TI、AB、MH、SH、PT等字段Title[TI]题名Title/Abstract[TIAB]题名/摘要UID[PMID]PubMed文献唯一识别码Volume[VI]期刊卷号1默认SUMMARY（简要格式）显示2可标记后点击DisplaySettings键3默认每页显示20条4最多一次可保存10000条记录5可用浏览器的打印功能2.10PubMed检索结果显示及处理

二、PubMed检索入门二、PubMed检索入门二、PubMed检索入门2.11PubMed基本检索举例维生素C对于普通感冒的防治作用“VITAMINC”ANDCOMMONCOLD二、PubMed检索入门检索2000-2005年以后有关Crohn病药物治疗研究的文献"CrohnDisease"[mh]AND"drugtherapy"[Subheading]AND2000[EDAT]:2005[EDAT]检索事半功倍Clipboard

HistoryFilterDetails检索框三、PubMed高级检索3.1Filter在这里可以进行以下设定：

•

将搜索范围设定在一个特定的域。

•

将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围。

•

也可以将搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型,如综述•

设定只搜索包含摘要的文献。

•

设定搜索Entrez数据库或Publication数据库。

•

设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库（如AbridgedIndexMedicus或AIDS相关的条目）。……需要注意的是：限制了出版物类型、年龄、人或动物、性别中的任何一项，检索将只在Medline中进行检索（因为这些特征限制只有Medline中才有）。三、PubMed高级检索三、PubMed高级检索人或动物实验选择性别选择语种选择期刊分类选择：核心临床医学牙科期刊护理期刊Medline期刊年龄选择出版物类型选择三、PubMed高级检索看到最近100次的查询结果。如果两次查询内容相同，PubMed会将头一次的去除。当点击ClearHistory可以将History中的所有内容清除3.2

History三、PubMed高级检索3.3Clipboard

贴板可以帮助你保存或查看在一个或多个查询中选择的条目。可以打印、保存、订购剪贴板中的内容。条目复选框选中，单击“sendtoclipboard”就可以将其加入剪贴板中。剪贴板中最大的储存数是500条。剪贴板中的内容在8小时内没有任何操作，将会自动消失。三、PubMed高级检索

3.4Details

即在提问框中键入的检索词被PubMed自动地转换成了哪些词，并使用了什么样的检索规则和检索语法。三、PubMed高级检索Result区显示检索结果的记录总数，点击这个数字，可回到检索结果显示屏Translation区显示检索词转换的详细情况Database区显示检索的数据库UserQuery区显示用户键入的检索词或检索式对检索策略进行编辑

三、PubMed高级检索文献太多，如何保证查全和查准？四、PubMed医学主题词表检索何为MeSH？MeSH是MedicalSubjectHeadings的缩略词，即医学主题词，是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。论述文献中心的主题词称主要主题词论述主题某一方面的内容的词称为副主题词

Mesh词表帮助您！4.1MeSHDatabase的运用词义解释四、PubMed医学主题词表检索检出结果限定在主要主题词可提高查准率限制扩展检索，只需检索单个主题词副主题词4.2MeSH检索实例演示miRNA在肿瘤治疗方面的应用四、PubMed医学主题词表检索五、PubMed其他功能实现单篇文章的一对一检索实现多篇文章的一次性检索一次最多可检索PubMed中100条文献纪录,获得文献的PMID

检索结果更加贴近临床的需要五、PubMed其他功能五、PubMed其他功能临床研究系统回顾医学遗传学限定于各类不同的医学临床主题进行检索五、PubMed其他功能实现PubMed与核酸和蛋白质序列数据库、基因组数据库、分类学数据、图书等数据库之间的多向链接,多向查询五、PubMed其他功能与PubMed建立联系的网站，如某篇文献所对应期刊的出版商，文献全文、相关数据库及网站等。五、PubMed其他功能认识PubMed——让它融入您的科研五、PubMed其他功能免费期刊的获取PubMed提供了免费全文期刊网址

PubmedCentral

/pmc/journals/向作者索要作者主页

五、PubMed其他功能六、PubMed的个性化服务保存检索式(生成URL或HTML实现共享)检索结果的分类过滤特定功能的参数设置六、PubMed的个性化服务书目管理设置经由2000多位专家学者的评价推荐，提供目前世界上最重要的生物学论文资讯及研究趋势。特色是收录每篇具有科学价值的文献，而不考虑这些文献在哪在些期刊里发表PubMed里检索出最核心的文献——Facultyof1000与pubmed的完美结合六、PubMed的个性化服务目的:用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选举例:检索出关于“HepatitisC”并且所有影响因子大于10的文章用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选输入检索式，登陆MyNCBI（如果没有的话请注册）用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选临时注册的Testdxy，点击ManageFilters用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选点击Createcustomfilter用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选在弹出的对话框中输入包含所有影响因子大于10的期刊名的检索式用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选问题：检索式哪里来？自己输入岂不是要累死？答案：用EXCEL和WORD强大功能自动生成。首先，下载2011影响因子EXCEL文件。（丁香园中有，免叮当，链接：/search?keyword=2011%E5%BD%B1%E5%93%8D%E5%9B%A0%E5%AD%90&ext=3）或/detail/5089076或使用百度检索式（2013

影响因子xls）自行下载用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选文件打开后如下。按影响因子排列，

选择所有影响因子大于10的期刊名用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选新建WORD文档，开始菜单中选择性粘贴无格式的文本用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选Ctrl+H启用替换功能，在查找内容中输入^p（其含义是段落标记，也就是回车符），替换为中输入”[journal]or”（注意包括引号，引号必须是英文字符）。替换所有后，删除最后的or”，在段首如入一个英文引号”。到此包括所有影响因子大于10的期刊名的检索式输入完毕用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选输入前文提到的检索式输入框，将本Filter起名为IF>10，然后Save用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选重新回到pubmed主页面，输入检索式HepatitisC，选择刚才创建的IF>10Filter用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选56344篇文献精简为4662篇大于10分的文章。

大功告成！用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选其他另外，还可以自己创立影响因子大于5的Filter，以及包含自己专业主要期刊的Filter。用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选(“JAMSOCNEPHROL”[TA]or“KIDNEYINT”[TA]or“AMJKIDNEYDIS”[TA]or“NephrolDialTransplant”[TA])用PUBMED的SaveSearch功能实现关注最新文章membranousnephropathyand(“JAMSOCNEPHROL”[TA]or“KIDNEYINT”[TA]or“AMJKIDNEYDIS”[TA]or“NephrolDialTransplant”[TA])PubMed其实还有更加丰富多彩的内容等着你去挖掘/medlineplus/

查阅各种健康疾病相关的主题，医药信息。还有一部非常完善的在线医学词典。此外，你还可以浏览到很多有用的健康新闻。

六、PubMed的个性化服务认识PubMed——让它融入您的科研GoPubMed是德国Transinsight公司和德国德累斯顿大学合作，利用生物信息学相关知识开发的一个可以对PubMed检索结果进行探索、分析的工具。六、PubMed的个性化服务认识PubMed——让它融入您的科研四个“W”分析功能六、PubMed的个性化服务认识PubMed——让它融入您的科研时间分析国家分析六、PubMed的个性化服务认识PubMed——让它融入您的科研城市分析刊物分析六、PubMed的个性化服务认识PubMed——让它融入您的科研作者分析主题分析六、PubMed的个性化服务认识PubMed——让它融入您的科研研究态势地区分布图六、PubMed的个性化服务认识PubMed——让它融入您的科研研究人员关系网线条越多，线形越多，地位越重要六、PubMed的个性化服务附：文献检索经验谈查准找高水平论文-阅读introduction和discussion。找高水平综述-了解整体情况。查新：查找引用重要综述或重要论文的最新文章（webofscience）。查找大牛课题组发表达最新文章。利用PUBMED的SaveSearch功能了解常见杂志的影响因子

选择阅读最重要的文献NATMED 22.864JAMSOCNEPHROL ·

8.987NATREVNEPHROL 7.943KIDNEYINT 7.916CLINJAMSOCNEPHRO 5.068AMJKIDNEYDIS 5.294CURROPINNEPHROLHY 3.964AMJPHYSIOL-RENAL 3.612NEPHROLDIALTRANSPL 3.371/sci/如何查影响因子文献检索举例检索目的：miRNA21在肾脏纤维化中的作用。(microRNA-21ormiR-21)and(renalork