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文档简介
ICS11.220
B41
备案号:71442-2020DB21
辽宁省地方标准
DB21/T3256—2020
非洲猪瘟病毒等温扩增快速检测方法
Loop-mediatedIsothermalAmplification(LAMP)forRapidDetectionforAfrican
SwineFeverVirus
DB21/T3256—2020
非洲猪瘟病毒等温扩增快速检测方法
1范围
本标准规定了非洲猪瘟病毒等温扩增快速检测方法的技术要求。
本标准适用于非洲猪瘟疫病的诊断、监测及流行病学调查,适用于猪血液、脾脏、淋巴结、肾脏等
组织样品中非洲猪瘟病毒核酸的快速检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB19489实验室生物安全通用要求
3原理
非洲猪瘟病毒是一种DNA病毒,该检测方法利用6条特异性引物和具有链置换能力的DNA聚合酶,在
等温环境下1h内完成扩增,用于非洲猪瘟病毒的核酸检测。
4仪器和器材
4.1高速台式冷冻离心机(离心范围0~20000r/min)
4.2冰箱:4℃±1℃冰箱,-20℃±1℃冰箱,-7℃±1℃冰箱
4.3恒温LAMP扩增仪(型号:Gene-8C)
4.4离心管:15ml离心管、1.5ml离心管和0.2mlPCR专用离心管
4.5微量移液器:1000μl,200μl,100μl,50μl,20μl,10μl,2μl
5试剂和引物
5.1样品处理剂
5.2ASFV-R-Mix
5.3Bstenzyme
5.4D-I矿物油
5.5阳性对照
5.6阴性对照
注:本技术规范中使用的试剂,除另有说明外,所有实验使用的试剂等级均为不含DNA或DNase的分析纯或生化试剂;
所有试剂均用无菌的容器分装。
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DB21/T3256—2020
6操作步骤
6.1样品的采集、前处理、存放与运输
6.1.1采样注意事项
采集样品及样品前处理过程中应戴一次性手套,样本间不得交叉污染。
6.1.2采样工具
15ml离心管和1.5ml离心管经121±1℃高压灭菌20min;剪刀、镊子经160℃干热灭菌2h,无
菌管(真空采血管)。
6.1.3组织病料的采集与前处理
采集疑似非洲猪瘟病毒感染猪的肺脏、肝脏、肾脏、脾脏等组织样品,用无菌的剪刀和镊子剪取待
检样品约10g于组织匀浆器或研钵中充分匀浆或研磨,加入0.3ml~0.5ml组织悬液混匀,60℃,30min
灭活后,将悬液转入无菌Eppendorf管中,4℃条件下5000r/min离心10min,编号备用。
6.1.4全血及血清样本的采集与前处理
使用含有抗凝血剂(EDTA-紫色盖)的无菌管(真空采血管)从耳静脉或前腔静脉采集血液3ml~5
ml,60℃,30min灭活后,可直接检测;若检测血清,可静置全血样本待血清析出后,直接吸取至无
菌Eppendorf管中,60℃,30min灭活后,编号备用。
6.1.5存放与运输
采集或处理的样品在2~8℃条件下保存应不超过24h;若需长期保存,应放置-70℃冰箱,但应
避免反复冻融(冻融不超过3次)。采集的样品密封后,采用保温壶或保温桶加冰密封,在8h之内运送
到实验室检测。按照《兽医实验室生物安全技术管理规范》进行样品的生物安全标识。
6.2样品DNA的提取
取10μl前处理过的样本加入无菌1.5ml离心管,加入10μl样品处理剂,混匀,94℃裂解2min,
瞬时离心,上清即为扩增模板。
6.3核酸扩增
6.3.1吸取22μlASFV-R-Mix和1μlBstenzyme加入同一个PCR管,吸取2μl步骤6.2处理的
核酸扩增模板加至PCR管,混匀,设置阴阳性对照;
6.3.2吸取10μlD-I矿物油轻轻加至PCR管液面,切勿震荡混匀;
6.3.3插入到恒温扩增仪反应槽中;
6.3.4设置恒温扩增仪器反应条件为:65℃反应12min,荧光采集周期20s。
7试验成立条件与结果判定
7.1试验成立条件
使用前用阴、阳性对照进行该检测方法评价,若阳性对照CT值≤40,阴性对照CT值>40,则检测结
果有效。
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DB21/T3256—2020
7.2结果判定
若CT值≤40,样品应判定为非洲猪瘟病毒核酸阳性;若CT值>40,样品应判定为非洲猪瘟病毒核酸
阴性
8实验室生物安全要求
按照GB19489实验室生物安全通用要求执行。
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AA
附录A
(规范性附录)
试剂配制
A.1样品处理剂的制备
量取80mlPBS(0.01mol/L,pH值7.4),加入10μlNP40(乙基苯基聚乙二醇),无菌纯化水
定容至100ml,定量分装,500μl/管,-20℃保存。
A.2ASFV-R-Mix的制备
A.2.1引物合成
根据非洲猪瘟病毒p72基因片段的保守结构域设计3对引物,包括1对内引物(FIP与BIP)、1对外引
物(F3与B3)和1对环引物(LF与LB),均由上海生工生物工程股份有限公司合成,序列为:
FIP:5'-TAACGCCACTATGCAGCCCACGGAAGAGCTGAATCTCTATCCT-3'
BIP:5'-CAACATGTGCGAACTTGTGCCACATACCTGGAACGTCTCC-3'
F3:5'-ATAGGTAATGCGATCGGATACA-3'
B3:5'-CCAACAATAACCGCCACGC-3'
LF:5'-TCGCCACGCAAAGATAAGC-3'
LB:5'-AGCCTCGGTGTTGATGCGGATT-3'
A.2.2引物混合物的制备
取3对引物(FIP、BIP、F3、B3、LF和LB)干粉,按引物说明书分别加入适量无菌纯化水,溶解混
匀,得到各引物溶液,置-20℃保存。
A.2.3ASFV-R-Mix的配制
称取2.4gTris,0.37g氯化钾,0.12g硫酸镁,100μl吐温-20,7.029g甜菜碱,溶于80ml
纯化水,依次加入终浓度为1.4mmol/LdNTPs溶液、0.2μmol/L外引物溶液、1.6μmol/L内引物溶液、
0.8μmol/L环引物溶液,加入无菌纯化水定容至100ml,经过0.22μm滤器过滤除菌,分装至2ml蓝
盖可立冻存管中,1.1ml/管,-20℃保存。
A.3Bstenzyme的制备
用于制备本试剂盒的Bstenzyme为商品化DNA聚合酶,按使用说明书用纯化水稀释至4×106/L,分
装至0.5ml白盖可立冻存管中,100/μl管,-20℃保存。
A.4D-I矿物油
用于制备本试剂盒的D-I矿物油为商品化矿物油,分装至2ml黄盖可立冻存管中,500μl/管,
-20℃保存。
A.5阳性对照
采用核酸蛋白质分析仪测定阳性质控品浓度,计算质粒拷贝数,用纯化水将其稀释为103拷贝/μl,
分装至0.5ml红盖可立冻存管中,100μl/管,-20℃保存。
A.6阴性对照
取纯化水,分装至0.5ml绿盖可立冻存管中,100μl/管,-20℃保存。
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_________________________________
5
DB21/XXXXX—XXXX
前言
本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。
本标准由辽宁省农业农村厅提出并归口管理。
本标准起草单位:辽宁省农业发展服务中心、中国科学院微生物研究所、洛阳莱普生信息科技有限
公司、辽宁佰瑞生物科技有限公司。
本标准主要起草人:杨作丰、周晨阳、李秀梅、王宏燕、杨利敏、董娜、刘文军、张皓淳、姚伟、
刘洋、刘近、吴洪涛、任雪建、赵培、李蓉、章春燕、吕园园、陈腾。
本标准发布实施后,任何单位和个人如有问题和意见建议,均可以通过来电和来函等方式进行反馈,
我们将及时答复并认真处理,根据实际情况依法进行评估及复审。
归口管理部门通讯地址:辽宁省农业农村厅(沈阳市和平区太原北街2号),联系电话
标准起草单位通讯地址:辽宁省动物及产品检疫中心(沈阳市沈河区万柳塘路105号甲),联系电
话
I
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