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生物质谱信号处理和质量控制杨芃原教授复旦大学生物医学研究院复旦大学化学系年8月19日广州南方医科大学1/26那些是有用信号，那些是没有用信号2/26（1）95%置信限时判定蛋白质数据库搜索得分大于HLPP要求下限，和（2）被判定蛋白质可信性和检索数据库总容量以及被检索蛋白质长度成负相关，并符合HLPP要求标准，和（3）被判定蛋白质可信性和其肽段串联质谱（氨基酸序列谱）数据库搜索后匹配肽段数成正相关，并最少不低于HLPP要求标准--2个匹配肽段；或等同于（3）（4）被判定蛋白质可信性和其肽段质谱（肽谱）数据库搜索后匹配肽段数成正相关，并最少不低于HLPP要求标准—99%置信限时5个匹配肽。3/26<1milcounts<1bilcounts>1bilcounts二项式分布珀松分布高斯分布蛋白质/肽质谱信号测量4/26I02σx0信号测量误差5/26噪音分布信号分布噪音平均值A噪音近似值B信号和噪音完全分辨6/26噪音分布信号分布噪音平均值A噪音近似值B交盖信号和噪音不完全分辨，统计学变得主要7/26噪音分布信号分布ABH1H0P10P01ab信号和噪音分辨定义8/26噪音分布信号分布ABH1H0P10=5%a=b95%,2s信号置信限高，置信度也高，假阳性率低9/26噪音分布信号分布ABH1H0P10=50%95%,2s信号置信限高，置信度差，假阳性率高10/26增加信噪比11/26蛋白质长度决定假阳性概率Prand，氨基酸序列随机匹配12/26反转库搜索降低假阳性率13/26蛋白质数据库大小而产生新置信限Ndb为数据库序列数目

14/2615/26正常氨基酸序列信号16/26－[M＋H]＋，酸性条件－[M＋Na]＋，[M＋K]＋，盐体系－[M＋NH4]＋，铵盐缓冲体系－[M＋X]＋，X＝溶剂或缓冲液阳离子－[2M＋H]＋，高浓度时形成二聚体－[M＋H＋S]＋，溶剂添加物17/2618/2619/26分子重排20/26当为偶电子离子时，电荷不会转移。偶电子碎片反应时氢会发生重排21/26b,y离子产生和控制22/26蛋白质修饰23/26MyoglobinGLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQG测几个肽段序列？24

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